Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400010147
CDS Infomation

pacid=37467227 polypeptide=PGSC0003DMP400007078 locus=PGSC0003DMG400003976 ID=PGSC0003DMT400010147.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGACGATGGACACTAGTGGAAGGCTTATTGCTGGTTCTCACATTAGAAATGAGTTT
GTGCTTATCAAAGCTGATGAATTTGGAAGGGTAGAGTCTGTGCATGCGCTCAGTGCACGA
ATGTGCCAGATTTGTGGGGATGAACTTGAGATTACTGATGGAGAGCTGTTTGTTGCCTGC
AATGAATGTGCTTTCCCTGTTTGTAGACTTTGCTATGAGTATGAAAGAAGAGAAGGAAAC
CAAGCTTGCCCTCAGTGCAAAACTAGATACAAGCGGATTAAAGGTAGTCCGCGTGTTGAG
GGTGATGAGGAAGAAGATGATACTGATGACATAGAGCACGAGTTTGATTATGGCGTTGGG
ATTTTACGCCAAGGTTCAGGTCCAGTTTCCTTTGTTTATGGCGGAAGTGGTCATGCTGGT
TCATATGAAAATGGCTCGTCCTCGAGACAAGGTTCATCAACTGATGGTATGGAAATACCT
CTTTTGACCTATGGTGAAGAGGATTCTCAGATTTCTTCCAATCAGCATGCTCTCATAGTG
CCTCCATCGAATGGCTTTGGAAATGGGGTTTATCTAAATCGTCATACTGAGTCATCGGTA
TCCTTGCTTCCGAGGCCAATGGTTCCAGAGAAAGACATTGCGCTATATGGCTATGGAAGT
GTTTCTTGGAAGGACAGAATGGAAGACTGGAAGAAAAAGCAGAATGAGAATCTCCCGGTG
GTCAAGCATCAAGGAGATGGTGGTGGGAGCTTTCATGGGGATTATCCTTATTTGCCCATG
ATGGATGAAGGAAGGCAGCCACTATCAAGAAAGTTGCCCATATCTTCAAGCAAGATTAAC
CCGTACAGAATTCTAATCATACTCCGTCTCACAATTCTTGGCCTCTTCTTCCATTATAGA
ATTCTTCATCCGGTAAATGATGCAATTGGCCTGTGGTTGACATCAGTTGTTTGTGAGATA
TGGTTTGCTGCTTCATGGATTCTTGATCAGTTCCCAAAGTGGTGCCCTATAGTTAGAGAA
ACATACCTTGATCGGCTTTCACTCAGGTATGAAAAAGAAGGAAAGCCTTCAGAGTTAGCT
CCTATTGACATTTTTGTCAGCACAGTCGATCCCTTGAAAGAACCACCATTAATCACTGCA
AACACTGTTCTATCCATTCTTGCTGTGGATTATCCAGTGGACAAAGTTACATGCTATGTG
TCAGATGATGGTGCAGCAATGCTTACTTTTGAAGCCCTTTCTGAGACATCTAACTTTGCG
AGAAAATGGGTTCCTTTCTGCAAGAAGTATAATATTGAACCTCGTGCTCCAGAATGGTAT
TTTTCACTAAAGATGGACTATCTGAAAAATAAAGTTCATCCTGCATTTGTAAGGGAACGG
CGTGCCATGAAGAGAGAATATGAAGAGTTTAAAGTCAATATAAATAGTCTTGTGGCAACT
GCTCAAAAGGTTCCTGAGGACGGTTGGACGATGCAGGATGGCACAGTATGGCCCGGGAAC
AATGTACGAGACCATCCTGGTATGATCCAGGTATTAATGGGTCATGATGGTGTCCACGAT
GTTGAAGGAGATGATTTACCTCGCCTGGTTTATGTTTCCCGTGAAAAGAGGCCTGGGTTT
GATCACCATAAAAAAGCAGGCGCCATGAATGCTTTGATGAGGGTTTCAGCTGTCATATCA
AATGCTCCTTTCTTGTTAAATGTTGATTGTGATCACTACATCAACAATAGCAAGGCATTG
AGGGAAGCCATGTGTTTCTTGATGGACCCCATTTCAGGAAAGAAAATCTGCTATGTGCAG
TTTCCACAAAGGTTTGATGGGATTGATCGTCATGACAGATACTCAAACAGAAATGTTGTG
TTCTTTGATATTAACATGAAAGGTTTGGATGGTATACAAGGACCAATATATGTTGGTACG
GGGTGTGTTTTCAGAAGGCATGCACTTTATGGATATGATGCTCCTGCCAAGAAGAAGCGA
CCTAGCAAGACCTGCAACTGCTTGCCAAAATTGTGCTCTTGCTGTTGCTGTTTCAGATCG
AAAACGAACAAGAAAGGGAAAACAAAGAAAGAGAAGAAGCCAAAGCACTGGGAGGCATCA
AGTCAAATACATGCTCTTGAAACCATTGAAGAAGGAGTTGAAGAAGCTAATGTGGATTCA
CGCCCGACTTCCCAAGTGAAACTAGAGAAAAGATTTGGGCAGTCTTCTGTTTTTGTTGCC
TCAACACTTCTAGAAAATGGTGGTGTTCCAAAGGAAGCCAGTGCCTCATCACTTTTGCAG
GAAGCCGTTCATGTTATTTGCTGTGGTTATGAAGATAAAACAGAATGGGGGAAGGAGGTT
GGCTGGATTTATGGCTCTGTCACAGAAGATATCTTGACTGGATTCAAGATGCATTGCCAT
GGATGGAGGTCCGTGTATTGTATGCCTCAGCTGCCTGCTTTCAAGGGTTCAGCCCCTATA
AATCTTTCAGACCGTCTCCATCAGGTTCTAAGATGGGCGCTGGGATCAGTTGAAATTTTG
TTGAGCAAGCATTGCCCGATCTGGTATGGCTATGGTGGTGGATTGAAGTGGCTGGAGCGG
CTCTCTTACATAAACTCTGTTGTGTATCCTTTGACGTCCATTCCCTTGATTGTCTACTGT
TCCTTGCCGGCTATCTGCCTTATCACTGGAAAATTCATTGTTCCTGAGATCAGTAATTAT
GCCAGCATTATATTCATCGCGCTCTTCATCTCTATTGCTGCCACCGGTATCCTTGAGATG
CAGTGGGGTGGTGTTGGTATAGATGATTGGTGGAGAAATGAGCAGTTTTGGGTTATTGGA
GGTGCTTCTGCACACTTTTTTGCTCTCTTTCAAGGATTGTTCAAGGTTTTAGCTGGTGTG
GAAACAAGATTCACTGTCACCACCAAAGCAGGTGACGATGGAGAATTTTCGGAGCTCTAT
ATGTTCAAGTGGACATCATTATTGATCCCACCAACGACTTTGCTAATAATGAACATAGTT
GGAGTTGTGGTTGGTATCTCGGATGCAATAAACAACGGTTATGACTCTTGGGGACCCTTG
TTTGGTAGGCTATTCTTTGCCTTGTGGGTTATTATTCATCTCTACCCATTCCTAAAAGGA
TTGATGGGAAGGCAAGAACGAACCCCAACCATAGTCATCGTATGGTCTATTCTTCTTGCT
TCAGTCTTGACATTATTGTGGGTACGAGTCAATCCGTTTGTCTCAAAAGATGGTCCTCTC
CTAGAAGTCTGCGGATTGGATTGTGACAATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400007078
PEP Infomation

pacid=37467227 transcript=PGSC0003DMT400010147 locus=PGSC0003DMG400003976 ID=PGSC0003DMT400010147.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MATMDTSGRLIAGSHIRNEFVLIKADEFGRVESVHALSARMCQICGDELEITDGELFVAC
NECAFPVCRLCYEYERREGNQACPQCKTRYKRIKGSPRVEGDEEEDDTDDIEHEFDYGVG
ILRQGSGPVSFVYGGSGHAGSYENGSSSRQGSSTDGMEIPLLTYGEEDSQISSNQHALIV
PPSNGFGNGVYLNRHTESSVSLLPRPMVPEKDIALYGYGSVSWKDRMEDWKKKQNENLPV
VKHQGDGGGSFHGDYPYLPMMDEGRQPLSRKLPISSSKINPYRILIILRLTILGLFFHYR
ILHPVNDAIGLWLTSVVCEIWFAASWILDQFPKWCPIVRETYLDRLSLRYEKEGKPSELA
PIDIFVSTVDPLKEPPLITANTVLSILAVDYPVDKVTCYVSDDGAAMLTFEALSETSNFA
RKWVPFCKKYNIEPRAPEWYFSLKMDYLKNKVHPAFVRERRAMKREYEEFKVNINSLVAT
AQKVPEDGWTMQDGTVWPGNNVRDHPGMIQVLMGHDGVHDVEGDDLPRLVYVSREKRPGF
DHHKKAGAMNALMRVSAVISNAPFLLNVDCDHYINNSKALREAMCFLMDPISGKKICYVQ
FPQRFDGIDRHDRYSNRNVVFFDINMKGLDGIQGPIYVGTGCVFRRHALYGYDAPAKKKR
PSKTCNCLPKLCSCCCCFRSKTNKKGKTKKEKKPKHWEASSQIHALETIEEGVEEANVDS
RPTSQVKLEKRFGQSSVFVASTLLENGGVPKEASASSLLQEAVHVICCGYEDKTEWGKEV
GWIYGSVTEDILTGFKMHCHGWRSVYCMPQLPAFKGSAPINLSDRLHQVLRWALGSVEIL
LSKHCPIWYGYGGGLKWLERLSYINSVVYPLTSIPLIVYCSLPAICLITGKFIVPEISNY
ASIIFIALFISIAATGILEMQWGGVGIDDWWRNEQFWVIGGASAHFFALFQGLFKVLAGV
ETRFTVTTKAGDDGEFSELYMFKWTSLLIPPTTLLIMNIVGVVVGISDAINNGYDSWGPL
FGRLFFALWVIIHLYPFLKGLMGRQERTPTIVIVWSILLASVLTLLWVRVNPFVSKDGPL
LEVCGLDCDN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400010147
Transcript Infomation

pacid=37467227 locus=PGSC0003DMG400003976 ID=PGSC0003DMT400010147.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGACGATGGACACTAGTGGAAGGCTTATTGCTGGTTCTCACATTAGAAATGAGTTT
GTGCTTATCAAAGCTGATGAATTTGGAAGGGTAGAGTCTGTGCATGCGCTCAGTGCACGA
ATGTGCCAGATTTGTGGGGATGAACTTGAGATTACTGATGGAGAGCTGTTTGTTGCCTGC
AATGAATGTGCTTTCCCTGTTTGTAGACTTTGCTATGAGTATGAAAGAAGAGAAGGAAAC
CAAGCTTGCCCTCAGTGCAAAACTAGATACAAGCGGATTAAAGGTAGTCCGCGTGTTGAG
GGTGATGAGGAAGAAGATGATACTGATGACATAGAGCACGAGTTTGATTATGGCGTTGGG
ATTTTACGCCAAGGTTCAGGTCCAGTTTCCTTTGTTTATGGCGGAAGTGGTCATGCTGGT
TCATATGAAAATGGCTCGTCCTCGAGACAAGGTTCATCAACTGATGGTATGGAAATACCT
CTTTTGACCTATGGTGAAGAGGATTCTCAGATTTCTTCCAATCAGCATGCTCTCATAGTG
CCTCCATCGAATGGCTTTGGAAATGGGGTTTATCTAAATCGTCATACTGAGTCATCGGTA
TCCTTGCTTCCGAGGCCAATGGTTCCAGAGAAAGACATTGCGCTATATGGCTATGGAAGT
GTTTCTTGGAAGGACAGAATGGAAGACTGGAAGAAAAAGCAGAATGAGAATCTCCCGGTG
GTCAAGCATCAAGGAGATGGTGGTGGGAGCTTTCATGGGGATTATCCTTATTTGCCCATG
ATGGATGAAGGAAGGCAGCCACTATCAAGAAAGTTGCCCATATCTTCAAGCAAGATTAAC
CCGTACAGAATTCTAATCATACTCCGTCTCACAATTCTTGGCCTCTTCTTCCATTATAGA
ATTCTTCATCCGGTAAATGATGCAATTGGCCTGTGGTTGACATCAGTTGTTTGTGAGATA
TGGTTTGCTGCTTCATGGATTCTTGATCAGTTCCCAAAGTGGTGCCCTATAGTTAGAGAA
ACATACCTTGATCGGCTTTCACTCAGGTATGAAAAAGAAGGAAAGCCTTCAGAGTTAGCT
CCTATTGACATTTTTGTCAGCACAGTCGATCCCTTGAAAGAACCACCATTAATCACTGCA
AACACTGTTCTATCCATTCTTGCTGTGGATTATCCAGTGGACAAAGTTACATGCTATGTG
TCAGATGATGGTGCAGCAATGCTTACTTTTGAAGCCCTTTCTGAGACATCTAACTTTGCG
AGAAAATGGGTTCCTTTCTGCAAGAAGTATAATATTGAACCTCGTGCTCCAGAATGGTAT
TTTTCACTAAAGATGGACTATCTGAAAAATAAAGTTCATCCTGCATTTGTAAGGGAACGG
CGTGCCATGAAGAGAGAATATGAAGAGTTTAAAGTCAATATAAATAGTCTTGTGGCAACT
GCTCAAAAGGTTCCTGAGGACGGTTGGACGATGCAGGATGGCACAGTATGGCCCGGGAAC
AATGTACGAGACCATCCTGGTATGATCCAGGTATTAATGGGTCATGATGGTGTCCACGAT
GTTGAAGGAGATGATTTACCTCGCCTGGTTTATGTTTCCCGTGAAAAGAGGCCTGGGTTT
GATCACCATAAAAAAGCAGGCGCCATGAATGCTTTGATGAGGGTTTCAGCTGTCATATCA
AATGCTCCTTTCTTGTTAAATGTTGATTGTGATCACTACATCAACAATAGCAAGGCATTG
AGGGAAGCCATGTGTTTCTTGATGGACCCCATTTCAGGAAAGAAAATCTGCTATGTGCAG
TTTCCACAAAGGTTTGATGGGATTGATCGTCATGACAGATACTCAAACAGAAATGTTGTG
TTCTTTGATATTAACATGAAAGGTTTGGATGGTATACAAGGACCAATATATGTTGGTACG
GGGTGTGTTTTCAGAAGGCATGCACTTTATGGATATGATGCTCCTGCCAAGAAGAAGCGA
CCTAGCAAGACCTGCAACTGCTTGCCAAAATTGTGCTCTTGCTGTTGCTGTTTCAGATCG
AAAACGAACAAGAAAGGGAAAACAAAGAAAGAGAAGAAGCCAAAGCACTGGGAGGCATCA
AGTCAAATACATGCTCTTGAAACCATTGAAGAAGGAGTTGAAGAAGCTAATGTGGATTCA
CGCCCGACTTCCCAAGTGAAACTAGAGAAAAGATTTGGGCAGTCTTCTGTTTTTGTTGCC
TCAACACTTCTAGAAAATGGTGGTGTTCCAAAGGAAGCCAGTGCCTCATCACTTTTGCAG
GAAGCCGTTCATGTTATTTGCTGTGGTTATGAAGATAAAACAGAATGGGGGAAGGAGGTT
GGCTGGATTTATGGCTCTGTCACAGAAGATATCTTGACTGGATTCAAGATGCATTGCCAT
GGATGGAGGTCCGTGTATTGTATGCCTCAGCTGCCTGCTTTCAAGGGTTCAGCCCCTATA
AATCTTTCAGACCGTCTCCATCAGGTTCTAAGATGGGCGCTGGGATCAGTTGAAATTTTG
TTGAGCAAGCATTGCCCGATCTGGTATGGCTATGGTGGTGGATTGAAGTGGCTGGAGCGG
CTCTCTTACATAAACTCTGTTGTGTATCCTTTGACGTCCATTCCCTTGATTGTCTACTGT
TCCTTGCCGGCTATCTGCCTTATCACTGGAAAATTCATTGTTCCTGAGATCAGTAATTAT
GCCAGCATTATATTCATCGCGCTCTTCATCTCTATTGCTGCCACCGGTATCCTTGAGATG
CAGTGGGGTGGTGTTGGTATAGATGATTGGTGGAGAAATGAGCAGTTTTGGGTTATTGGA
GGTGCTTCTGCACACTTTTTTGCTCTCTTTCAAGGATTGTTCAAGGTTTTAGCTGGTGTG
GAAACAAGATTCACTGTCACCACCAAAGCAGGTGACGATGGAGAATTTTCGGAGCTCTAT
ATGTTCAAGTGGACATCATTATTGATCCCACCAACGACTTTGCTAATAATGAACATAGTT
GGAGTTGTGGTTGGTATCTCGGATGCAATAAACAACGGTTATGACTCTTGGGGACCCTTG
TTTGGTAGGCTATTCTTTGCCTTGTGGGTTATTATTCATCTCTACCCATTCCTAAAAGGA
TTGATGGGAAGGCAAGAACGAACCCCAACCATAGTCATCGTATGGTCTATTCTTCTTGCT
TCAGTCTTGACATTATTGTGGGTACGAGTCAATCCGTTTGTCTCAAAAGATGGTCCTCTC
CTAGAAGTCTGCGGATTGGATTGTGACAATTGA