Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400009301
CDS Infomation

pacid=37427891 polypeptide=PGSC0003DMP400006454 locus=PGSC0003DMG400003611 ID=PGSC0003DMT400009301.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTTCACTTGCTCGGAAGCTGATCGCATCAAGGAACCCTATTCCAACACCCAGAAGC
TACGAGCTCGGAAACCCAGAAGTTTTCCATCCCTTCGTCCCATTTTCCCGGCTTCAAGAG
ACAAAACTCTTAGAATCTCATCTAGTTTCACTTCTTGACAACTGTAGCAGCCTAAATCAG
GTCAAACAAGTACATGCTCACGTTATCTGCAGAGGTCTTGACCAATGCTGCTATGTTCTC
GCAAAGCTACTCCGTATGCTCACAAAAATAAATGTCCCAATGGACCCATATCCCCGTCTT
GTGTTTCATCAAGTGGAATACCGCAACCCTTTTTTATGGACCGCGTTAATTCGCGGTTAT
TCAATTCAAGGACCATTGAAAGAGGCAGTGTGTTTGTATAATGCTATGAGAAGGGAAAGT
ATATCGCCTGTTTCTTTTACTTTGACGGCTTTGCTCAAGGGTTCTAGCGATGAACTTGAG
TTGAATTTAGGTAGGCAGATCCATTGTCAGAGCATAAAGCTTGGTGGGTTCTGTAAAGAT
TTGTTTGTTCATAATATTTTGATTGATATGTATGTAAAATGTGGCTGGTTGGATTGTGGT
CGAAAGGTGTTCGATGAAATGTCTGAGAGGGATGTGATTTCGTGGACTTCGTTAATTGTT
GCATATTCAAAGTCTGGAGACATGGCGGCAGCTGCTGAGCTGTTTGAGAGATTGCCTGTG
AAAGATTTGGTTGCATGGACGGCTATGGTGTCAGGTTTTGCACAGAATGCTAAACCAAGG
GAGGCATTGGAGTTCTTCCATAGAATGCAGTCTGAAGGTGTTGAGACTGATGAGTTGACA
TTAGTTGGGGTTATTTCAGCTTGTGCACAGTTAGGGGCTGCTAAGTATGCAAATTGGGTT
CGTGATATGGCTGAGGGATATGGTATTGGACCTGTCAATCATGTTATGGTGGGTTCTGCA
TTGATTGATATGTACTCCAAGTGTGGGAATGTGGAGGAAGCGTACAAGGTTTTCAAGAAG
ATGAAGGAAAAGAATGTGTTCTCATATAGTTCGATGATTATGGGTTTTGCAATGCATGGA
TGTGCGAATGCTGCACTAGATTTATTTGAAGAAATGGTAAAAACTGAGGTAAAGCCTAAT
AAGGTGACATTCATTGGTGTTCTTATGGCTTGTACTCATGCAGGTTTGGTAGAACGGGGT
CGACACCTGTTTGATAAAATGGAGAAACATTATGGCGTTGAACCATCAGTAGAACACTAT
GCTTGCATGATTGATCTCCTTGGCAGGGCTGGGCAACTACAAGAAGCTCTTGAGCTTATC
AAAGCTATGCCAATGGACCCTAATAGTGGTGTCTGGGGAGCCCTGCTAGGAGCTTGTCGG
ATTCATGGTAATCCTGATATTGCAGAAGTTGCTGCCAACCGTCTATTTGAGCTTGAACCT
GATAGCATTGGTAACTATGTCTTGCTTGCCAATACATATGCTTCAGCTGGAAGGTGGGAA
GATGTTTTAAGGGTAAGAAAATCAATAAAACAAAAACTGCTGAGAAAGGACCCTTCACGC
AGCTGGATTGAAGGCAAAGAGGGAGTGATTCATGAGTTCTATGCTGGTGATATGACCCAC
CCAAACTCGAAAGAGATTAAGGAAGCACTTGAGGATCTTATTGGTCGGCTTAAGTCACAT
GGCTACGAGCCAAACTTAAGCTCTGTGCCTTATGATCTGAATGAAGAACATAAAAGGCGA
ATACTTCTCACACATAGTGAGAAGCTGGCTTTGGCATATGGGCTGCTCATCACTGATTCT
GCTGGGTCTACCATCAGGATCATGAAAAATCTAAGAATCTGCGAAGATTGCCACTCATTC
ATGTGCGGTGCATCTCAAATCACTGGCAGGGAGATTATTGTAAGGGATAACAAGAGATTT
CACCATTTCCATAATGGTGTATGCTCTTGTGGTAACTTTTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400006454
PEP Infomation

pacid=37427891 transcript=PGSC0003DMT400009301 locus=PGSC0003DMG400003611 ID=PGSC0003DMT400009301.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVSLARKLIASRNPIPTPRSYELGNPEVFHPFVPFSRLQETKLLESHLVSLLDNCSSLNQ
VKQVHAHVICRGLDQCCYVLAKLLRMLTKINVPMDPYPRLVFHQVEYRNPFLWTALIRGY
SIQGPLKEAVCLYNAMRRESISPVSFTLTALLKGSSDELELNLGRQIHCQSIKLGGFCKD
LFVHNILIDMYVKCGWLDCGRKVFDEMSERDVISWTSLIVAYSKSGDMAAAAELFERLPV
KDLVAWTAMVSGFAQNAKPREALEFFHRMQSEGVETDELTLVGVISACAQLGAAKYANWV
RDMAEGYGIGPVNHVMVGSALIDMYSKCGNVEEAYKVFKKMKEKNVFSYSSMIMGFAMHG
CANAALDLFEEMVKTEVKPNKVTFIGVLMACTHAGLVERGRHLFDKMEKHYGVEPSVEHY
ACMIDLLGRAGQLQEALELIKAMPMDPNSGVWGALLGACRIHGNPDIAEVAANRLFELEP
DSIGNYVLLANTYASAGRWEDVLRVRKSIKQKLLRKDPSRSWIEGKEGVIHEFYAGDMTH
PNSKEIKEALEDLIGRLKSHGYEPNLSSVPYDLNEEHKRRILLTHSEKLALAYGLLITDS
AGSTIRIMKNLRICEDCHSFMCGASQITGREIIVRDNKRFHHFHNGVCSCGNFW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400009301
Transcript Infomation

pacid=37427891 locus=PGSC0003DMG400003611 ID=PGSC0003DMT400009301.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTTCACTTGCTCGGAAGCTGATCGCATCAAGGAACCCTATTCCAACACCCAGAAGC
TACGAGCTCGGAAACCCAGAAGTTTTCCATCCCTTCGTCCCATTTTCCCGGCTTCAAGAG
ACAAAACTCTTAGAATCTCATCTAGTTTCACTTCTTGACAACTGTAGCAGCCTAAATCAG
GTCAAACAAGTACATGCTCACGTTATCTGCAGAGGTCTTGACCAATGCTGCTATGTTCTC
GCAAAGCTACTCCGTATGCTCACAAAAATAAATGTCCCAATGGACCCATATCCCCGTCTT
GTGTTTCATCAAGTGGAATACCGCAACCCTTTTTTATGGACCGCGTTAATTCGCGGTTAT
TCAATTCAAGGACCATTGAAAGAGGCAGTGTGTTTGTATAATGCTATGAGAAGGGAAAGT
ATATCGCCTGTTTCTTTTACTTTGACGGCTTTGCTCAAGGGTTCTAGCGATGAACTTGAG
TTGAATTTAGGTAGGCAGATCCATTGTCAGAGCATAAAGCTTGGTGGGTTCTGTAAAGAT
TTGTTTGTTCATAATATTTTGATTGATATGTATGTAAAATGTGGCTGGTTGGATTGTGGT
CGAAAGGTGTTCGATGAAATGTCTGAGAGGGATGTGATTTCGTGGACTTCGTTAATTGTT
GCATATTCAAAGTCTGGAGACATGGCGGCAGCTGCTGAGCTGTTTGAGAGATTGCCTGTG
AAAGATTTGGTTGCATGGACGGCTATGGTGTCAGGTTTTGCACAGAATGCTAAACCAAGG
GAGGCATTGGAGTTCTTCCATAGAATGCAGTCTGAAGGTGTTGAGACTGATGAGTTGACA
TTAGTTGGGGTTATTTCAGCTTGTGCACAGTTAGGGGCTGCTAAGTATGCAAATTGGGTT
CGTGATATGGCTGAGGGATATGGTATTGGACCTGTCAATCATGTTATGGTGGGTTCTGCA
TTGATTGATATGTACTCCAAGTGTGGGAATGTGGAGGAAGCGTACAAGGTTTTCAAGAAG
ATGAAGGAAAAGAATGTGTTCTCATATAGTTCGATGATTATGGGTTTTGCAATGCATGGA
TGTGCGAATGCTGCACTAGATTTATTTGAAGAAATGGTAAAAACTGAGGTAAAGCCTAAT
AAGGTGACATTCATTGGTGTTCTTATGGCTTGTACTCATGCAGGTTTGGTAGAACGGGGT
CGACACCTGTTTGATAAAATGGAGAAACATTATGGCGTTGAACCATCAGTAGAACACTAT
GCTTGCATGATTGATCTCCTTGGCAGGGCTGGGCAACTACAAGAAGCTCTTGAGCTTATC
AAAGCTATGCCAATGGACCCTAATAGTGGTGTCTGGGGAGCCCTGCTAGGAGCTTGTCGG
ATTCATGGTAATCCTGATATTGCAGAAGTTGCTGCCAACCGTCTATTTGAGCTTGAACCT
GATAGCATTGGTAACTATGTCTTGCTTGCCAATACATATGCTTCAGCTGGAAGGTGGGAA
GATGTTTTAAGGGTAAGAAAATCAATAAAACAAAAACTGCTGAGAAAGGACCCTTCACGC
AGCTGGATTGAAGGCAAAGAGGGAGTGATTCATGAGTTCTATGCTGGTGATATGACCCAC
CCAAACTCGAAAGAGATTAAGGAAGCACTTGAGGATCTTATTGGTCGGCTTAAGTCACAT
GGCTACGAGCCAAACTTAAGCTCTGTGCCTTATGATCTGAATGAAGAACATAAAAGGCGA
ATACTTCTCACACATAGTGAGAAGCTGGCTTTGGCATATGGGCTGCTCATCACTGATTCT
GCTGGGTCTACCATCAGGATCATGAAAAATCTAAGAATCTGCGAAGATTGCCACTCATTC
ATGTGCGGTGCATCTCAAATCACTGGCAGGGAGATTATTGTAAGGGATAACAAGAGATTT
CACCATTTCCATAATGGTGTATGCTCTTGTGGTAACTTTTGGTAA