Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400008963
CDS Infomation

pacid=37476675 polypeptide=PGSC0003DMP400006202 locus=PGSC0003DMG400003492 ID=PGSC0003DMT400008963.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCCTCCAAAATCAGCGAGAAAGACACCTACAGGTTCTGGATCCAAAAGAGGTGGCCGT
ACATCTCGTGCCACGCCAAAGTCTCTTGAGGAACCAATGGAAGAAGAGAGTAAGGATAAC
GCGGTGGAGCTCAAACAAGAATTCAAAGTCCCTGAAGAAAAGCTGGAGCCTGAGCAACCG
TTGAATGCCAAAGCTGTACAGAACAAGATGCTCAGTTCAGACAAGAAGGTGGATGATGTG
AAAGAGTCAGTCGATCAATATGAAAAGGGTGAGCGATTAGATTTGGAGGATAATGACCCT
GAATATGACCCTGAAGAGTATGGCACTGTTGATTATGATGAGAGAGGAATTGAAAATGAT
GATATTCAGGAAGAGGGAGATGAAATAGAGGAAGAACCTGAAGAGGTAGATGTTGATGAA
GAGGAAGAGGGTGATATGGTGGAAGAGGATGTTGAAGGTGTTCATGAGGAAATTGAGGGC
GATGAAGAAGATGAGCATGCTGGGGAGGAGCATGCTGAGATGGTTCATGCCGCTGAGGAG
GAAGAACATCATGAAGTTGTTAAAGAAAGGCGTAAGCGGAAGGAAATTGAAATATTTGTT
GGTGGTTTGGACAAGGATGCTACTGAGGATGATCTCAGGAAGGTCTTCAGTAAAGTTGGC
GAGGTTACTGAAGTGAGGCTTATGATGAATTCTTATACAAAGAAGAATAAGGGATTTGCA
TTCCTGCGATTTGCCACTGTGGAACAAGCAAAACGAGCTTGTACTGAGCTGAAAAATCCA
GTGATCAATGGAAAACAGTGTGGTGTCTCTCCAAGTCAAGACAATGATACTCTGTTTTTG
GGTAACATATGCAAGACCTGGACAAAAGAAGCTTTAAAAGAGAAGCTGAAGCATTATGGT
GTTGACAATATTGAGGATTTGACGTTGGTCGAAGACACTAATAATGAGGGAATGAATCGA
GGATTTGCTTTCTTGGAGTTCTCTTCACGTTCAGAGGCCATGGATGCTTTTAAGCGGTTA
CAAAAGAGAGATGTTATGTTTGGTGTTGATAGGCCCGCAAAGGTTTCTTTTGAGGATTCA
TTCATTGATCCTGGGGATGAAATCATGTCACAGGTCAAAACAGTGTTTGTTGATGGCCTT
TCTGCATCCTGGGACGAGGATCGTGTGCGGGAGTTTCTTAAAGAATATGGGAAGATTGAA
AAAGTTGAGCTTGCCAGAAATATGCCTTCAGCCAAGAGAAAGGACTTCGGATTTGTCACC
TTCGACACCCATGAGGCTGCAGTTACTTGTGCTAAAAGTATTAATAATGAGGAATTGGGT
GAAGGAGATAACAAGGTTAAAGTTAGGGCCAGATTATCAAGACCCCTTGAGAGGGGCAGA
GGGAAATATGGTGGACGAGGAGATTTGCGACCTTGGCGTATGTCCATGCATGGTCCCCGT
GCCCCTTGGGGTCGTATAGTGCCACATAGTCATGCTATTCGAGGGACTAGAGTTAGTACA
CGCATGCCTCCTGTAGTTGGTCGTGGTTTCAAACGACCTGCAGGATCGAGAGATAGACGG
GCAGTGATGGATTTGCCTCCTAGGGGAAGACCCACAGCTCCACCATCTAGCAGGTCATAT
GACCGAAGACCACCTGTTCCCTCATATCCAAAGAGTAGCTTGAAGAGGGAGTATGGACGG
CGAGAGGAAATCCCTCCTCCCAAAAGTAGAGCAGTAGCTGAGTATCCTTCGAGGGTTCAT
TCTGACAGACGTGCATCCTATAGGGATGAGTATTCTTCCCGTGGGTCTGGTTACCCTGAA
TTGCCTAGAGGTACTCACTCTGCAGCAAGGAGAGCTTATGTTGATGATGGATATGGGCAA
CGGTTTGAAAGGCCCCCTCCATCTTACCGCGAGGGACGTGGTCGTGAATATGACTCTGCG
TCTGGTTCAAAACGTCCATACACTGCAGTGGATGATGTTCATCCCCGCTATGCTGAGGCA
GGAGTGCGGCATTCTCGTGCTCGTTTGGATTACGAACTAGGCAGTGGAAGTGGCTCCCAT
TATGGAGATGCATATGCTGACAGACTTGGGAGATCAAATCTTGGATATGGTGGCAGTAGG
GGCTCCCTTTCAGGTCAAGATTCTCATGGGATGTATAGCAGTCGTCAGGATATGGGTTAT
GGTGGAGGCTCCTATGGTGGAAGTGATGTAGGTGGAATGTATTCATCCAGCTATGGTAGT
GATTACATGTCTCGTGGCAGCGATGTTGACTCGGTTTATTCTAGTCGTGGTATGGGTGGC
AGTGGTTATACGGGAAGTGGTGGTTCTGGATCATACTACTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400006202
PEP Infomation

pacid=37476675 transcript=PGSC0003DMT400008963 locus=PGSC0003DMG400003492 ID=PGSC0003DMT400008963.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MPPKSARKTPTGSGSKRGGRTSRATPKSLEEPMEEESKDNAVELKQEFKVPEEKLEPEQP
LNAKAVQNKMLSSDKKVDDVKESVDQYEKGERLDLEDNDPEYDPEEYGTVDYDERGIEND
DIQEEGDEIEEEPEEVDVDEEEEGDMVEEDVEGVHEEIEGDEEDEHAGEEHAEMVHAAEE
EEHHEVVKERRKRKEIEIFVGGLDKDATEDDLRKVFSKVGEVTEVRLMMNSYTKKNKGFA
FLRFATVEQAKRACTELKNPVINGKQCGVSPSQDNDTLFLGNICKTWTKEALKEKLKHYG
VDNIEDLTLVEDTNNEGMNRGFAFLEFSSRSEAMDAFKRLQKRDVMFGVDRPAKVSFEDS
FIDPGDEIMSQVKTVFVDGLSASWDEDRVREFLKEYGKIEKVELARNMPSAKRKDFGFVT
FDTHEAAVTCAKSINNEELGEGDNKVKVRARLSRPLERGRGKYGGRGDLRPWRMSMHGPR
APWGRIVPHSHAIRGTRVSTRMPPVVGRGFKRPAGSRDRRAVMDLPPRGRPTAPPSSRSY
DRRPPVPSYPKSSLKREYGRREEIPPPKSRAVAEYPSRVHSDRRASYRDEYSSRGSGYPE
LPRGTHSAARRAYVDDGYGQRFERPPPSYREGRGREYDSASGSKRPYTAVDDVHPRYAEA
GVRHSRARLDYELGSGSGSHYGDAYADRLGRSNLGYGGSRGSLSGQDSHGMYSSRQDMGY
GGGSYGGSDVGGMYSSSYGSDYMSRGSDVDSVYSSRGMGGSGYTGSGGSGSYY*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400008963
Transcript Infomation

pacid=37476675 locus=PGSC0003DMG400003492 ID=PGSC0003DMT400008963.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCCTCCAAAATCAGCGAGAAAGACACCTACAGGTTCTGGATCCAAAAGAGGTGGCCGT
ACATCTCGTGCCACGCCAAAGTCTCTTGAGGAACCAATGGAAGAAGAGAGTAAGGATAAC
GCGGTGGAGCTCAAACAAGAATTCAAAGTCCCTGAAGAAAAGCTGGAGCCTGAGCAACCG
TTGAATGCCAAAGCTGTACAGAACAAGATGCTCAGTTCAGACAAGAAGGTGGATGATGTG
AAAGAGTCAGTCGATCAATATGAAAAGGGTGAGCGATTAGATTTGGAGGATAATGACCCT
GAATATGACCCTGAAGAGTATGGCACTGTTGATTATGATGAGAGAGGAATTGAAAATGAT
GATATTCAGGAAGAGGGAGATGAAATAGAGGAAGAACCTGAAGAGGTAGATGTTGATGAA
GAGGAAGAGGGTGATATGGTGGAAGAGGATGTTGAAGGTGTTCATGAGGAAATTGAGGGC
GATGAAGAAGATGAGCATGCTGGGGAGGAGCATGCTGAGATGGTTCATGCCGCTGAGGAG
GAAGAACATCATGAAGTTGTTAAAGAAAGGCGTAAGCGGAAGGAAATTGAAATATTTGTT
GGTGGTTTGGACAAGGATGCTACTGAGGATGATCTCAGGAAGGTCTTCAGTAAAGTTGGC
GAGGTTACTGAAGTGAGGCTTATGATGAATTCTTATACAAAGAAGAATAAGGGATTTGCA
TTCCTGCGATTTGCCACTGTGGAACAAGCAAAACGAGCTTGTACTGAGCTGAAAAATCCA
GTGATCAATGGAAAACAGTGTGGTGTCTCTCCAAGTCAAGACAATGATACTCTGTTTTTG
GGTAACATATGCAAGACCTGGACAAAAGAAGCTTTAAAAGAGAAGCTGAAGCATTATGGT
GTTGACAATATTGAGGATTTGACGTTGGTCGAAGACACTAATAATGAGGGAATGAATCGA
GGATTTGCTTTCTTGGAGTTCTCTTCACGTTCAGAGGCCATGGATGCTTTTAAGCGGTTA
CAAAAGAGAGATGTTATGTTTGGTGTTGATAGGCCCGCAAAGGTTTCTTTTGAGGATTCA
TTCATTGATCCTGGGGATGAAATCATGTCACAGGTCAAAACAGTGTTTGTTGATGGCCTT
TCTGCATCCTGGGACGAGGATCGTGTGCGGGAGTTTCTTAAAGAATATGGGAAGATTGAA
AAAGTTGAGCTTGCCAGAAATATGCCTTCAGCCAAGAGAAAGGACTTCGGATTTGTCACC
TTCGACACCCATGAGGCTGCAGTTACTTGTGCTAAAAGTATTAATAATGAGGAATTGGGT
GAAGGAGATAACAAGGTTAAAGTTAGGGCCAGATTATCAAGACCCCTTGAGAGGGGCAGA
GGGAAATATGGTGGACGAGGAGATTTGCGACCTTGGCGTATGTCCATGCATGGTCCCCGT
GCCCCTTGGGGTCGTATAGTGCCACATAGTCATGCTATTCGAGGGACTAGAGTTAGTACA
CGCATGCCTCCTGTAGTTGGTCGTGGTTTCAAACGACCTGCAGGATCGAGAGATAGACGG
GCAGTGATGGATTTGCCTCCTAGGGGAAGACCCACAGCTCCACCATCTAGCAGGTCATAT
GACCGAAGACCACCTGTTCCCTCATATCCAAAGAGTAGCTTGAAGAGGGAGTATGGACGG
CGAGAGGAAATCCCTCCTCCCAAAAGTAGAGCAGTAGCTGAGTATCCTTCGAGGGTTCAT
TCTGACAGACGTGCATCCTATAGGGATGAGTATTCTTCCCGTGGGTCTGGTTACCCTGAA
TTGCCTAGAGGTACTCACTCTGCAGCAAGGAGAGCTTATGTTGATGATGGATATGGGCAA
CGGTTTGAAAGGCCCCCTCCATCTTACCGCGAGGGACGTGGTCGTGAATATGACTCTGCG
TCTGGTTCAAAACGTCCATACACTGCAGTGGATGATGTTCATCCCCGCTATGCTGAGGCA
GGAGTGCGGCATTCTCGTGCTCGTTTGGATTACGAACTAGGCAGTGGAAGTGGCTCCCAT
TATGGAGATGCATATGCTGACAGACTTGGGAGATCAAATCTTGGATATGGTGGCAGTAGG
GGCTCCCTTTCAGGTCAAGATTCTCATGGGATGTATAGCAGTCGTCAGGATATGGGTTAT
GGTGGAGGCTCCTATGGTGGAAGTGATGTAGGTGGAATGTATTCATCCAGCTATGGTAGT
GATTACATGTCTCGTGGCAGCGATGTTGACTCGGTTTATTCTAGTCGTGGTATGGGTGGC
AGTGGTTATACGGGAAGTGGTGGTTCTGGATCATACTACTAA