Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400008541
CDS Infomation	pacid=37476479 polypeptide=PGSC0003DMP400005933 locus=PGSC0003DMG400003302 ID=PGSC0003DMT400008541.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGAATCGAGGATTTGCTTTCTTGGAGTTCTCTTCACGTTCAGAGGCCATGGATGCTTTT AAGCGGTTACAGAAGAGAGATGTTGTATTTGGAGTTGATAGGCCTGCAAAGGTTTCTTTT GAGGATTCATTCATTGATCCTGGGGATGAAATCATGTCACAGGTTAAAACAGTGTTTATT GATGGTCTTGCTGTATCCTGGAACGAGGACCATGTACGGGAACTTCTTAAAGAATATGGA AAGATTAGAAAAGTTGAGCTTGCCAGAAATAGGCCTTCAGCCAAGAGAAAGGACTTTGGA TTTGTCACCTTTGACACTCATGAGGCTGCAGTTACATGTGCTAAAAGCATTAATAATGAG GAATTGGGTGAAGGAGATAACAAGGTTAAAGTAAGGGCCAGACTATCGAGACCCCTGCAT ATGGGTAGAGGGAAATACGGTGGACGAGGAGAGTTCCGACCTTGGCGTATGCCTATGCAT GGTTCCCATGCCCCTTGGGGTCGTACAGCGCCATATAGTCGTTCTATCCGAGGGACTAGA GTTAGTACGTGTATGCCTCCCGTAGTTGGTCGTGGTTTCAAACGACCTGCAGCATTGAGA GATAGACATGCAGAGATGGCTTTGTCTCCTAGGGGAAGATTTATGGCTTCACCACCCAGG AGGTCATATGACCGGAGACCACCTGTTTCCTCATATCCAAAGAGTAACTTCAAGAGGGAG TATGGACGGCGCGAGGAAATCTCTCCTTCTAGAAGCAGAGCAATAGCTGAGTATCCTTCG AGGGTTCATTCTGACAGACGTATATCCTATAGGGATGAATATTCTTCGCGTGGCTCTGGT TACCCTGAATTACCTAGAGGTACTCACTCTGCAGCAAGGAGAGCTTATGTTGATGATGGA TATGGGCAACGGTTTGAAAGACCCCCTCCATCTTACCGTGAGGGACGTGGTCGTGAATAT GATTCTGTCTCTGGTTCGAAACGTCCATACACTGCAGTGGATGATGTTCATCCACACTAC GCTGAGGCAGGAATGCGGCATTCGCGTGCTCGTTTGGATTATGAATTAGGCAGTGGAAGT GGCTCCCATTATGGAGATGCATATGGTGACAGTAGACTCGGGAGATCAAATCTTGGATAT GGCGGCAACAGGAGCTCCATTTCTAGGCAAGATTCTCATGGGATATACAGCAGTCGTCAG GGTATGGGCTATGGTGGAGGTTCCTATGGTGGAAGTGATGTAGGTGGAATGTATTCGTCC AGCTATGGTGGTGACTACATGTCTCGTGGCAGTGATGTTGGCTCCTCGGTTTATTCTAGT CGTGGTATGGGTGGCAGTGGCTATATGGGAAGTGGTGGTTCTGGATCTTACTACTAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400005933
PEP Infomation	pacid=37476479 transcript=PGSC0003DMT400008541 locus=PGSC0003DMG400003302 ID=PGSC0003DMT400008541.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MNRGFAFLEFSSRSEAMDAFKRLQKRDVVFGVDRPAKVSFEDSFIDPGDEIMSQVKTVFI DGLAVSWNEDHVRELLKEYGKIRKVELARNRPSAKRKDFGFVTFDTHEAAVTCAKSINNE ELGEGDNKVKVRARLSRPLHMGRGKYGGRGEFRPWRMPMHGSHAPWGRTAPYSRSIRGTR VSTCMPPVVGRGFKRPAALRDRHAEMALSPRGRFMASPPRRSYDRRPPVSSYPKSNFKRE YGRREEISPSRSRAIAEYPSRVHSDRRISYRDEYSSRGSGYPELPRGTHSAARRAYVDDG YGQRFERPPPSYREGRGREYDSVSGSKRPYTAVDDVHPHYAEAGMRHSRARLDYELGSGS GSHYGDAYGDSRLGRSNLGYGGNRSSISRQDSHGIYSSRQGMGYGGGSYGGSDVGGMYSS SYGGDYMSRGSDVGSSVYSSRGMGGSGYMGSGGSGSYY*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400008541
Transcript Infomation	pacid=37476479 locus=PGSC0003DMG400003302 ID=PGSC0003DMT400008541.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGAATCGAGGATTTGCTTTCTTGGAGTTCTCTTCACGTTCAGAGGCCATGGATGCTTTT AAGCGGTTACAGAAGAGAGATGTTGTATTTGGAGTTGATAGGCCTGCAAAGGTTTCTTTT GAGGATTCATTCATTGATCCTGGGGATGAAATCATGTCACAGGTTAAAACAGTGTTTATT GATGGTCTTGCTGTATCCTGGAACGAGGACCATGTACGGGAACTTCTTAAAGAATATGGA AAGATTAGAAAAGTTGAGCTTGCCAGAAATAGGCCTTCAGCCAAGAGAAAGGACTTTGGA TTTGTCACCTTTGACACTCATGAGGCTGCAGTTACATGTGCTAAAAGCATTAATAATGAG GAATTGGGTGAAGGAGATAACAAGGTTAAAGTAAGGGCCAGACTATCGAGACCCCTGCAT ATGGGTAGAGGGAAATACGGTGGACGAGGAGAGTTCCGACCTTGGCGTATGCCTATGCAT GGTTCCCATGCCCCTTGGGGTCGTACAGCGCCATATAGTCGTTCTATCCGAGGGACTAGA GTTAGTACGTGTATGCCTCCCGTAGTTGGTCGTGGTTTCAAACGACCTGCAGCATTGAGA GATAGACATGCAGAGATGGCTTTGTCTCCTAGGGGAAGATTTATGGCTTCACCACCCAGG AGGTCATATGACCGGAGACCACCTGTTTCCTCATATCCAAAGAGTAACTTCAAGAGGGAG TATGGACGGCGCGAGGAAATCTCTCCTTCTAGAAGCAGAGCAATAGCTGAGTATCCTTCG AGGGTTCATTCTGACAGACGTATATCCTATAGGGATGAATATTCTTCGCGTGGCTCTGGT TACCCTGAATTACCTAGAGGTACTCACTCTGCAGCAAGGAGAGCTTATGTTGATGATGGA TATGGGCAACGGTTTGAAAGACCCCCTCCATCTTACCGTGAGGGACGTGGTCGTGAATAT GATTCTGTCTCTGGTTCGAAACGTCCATACACTGCAGTGGATGATGTTCATCCACACTAC GCTGAGGCAGGAATGCGGCATTCGCGTGCTCGTTTGGATTATGAATTAGGCAGTGGAAGT GGCTCCCATTATGGAGATGCATATGGTGACAGTAGACTCGGGAGATCAAATCTTGGATAT GGCGGCAACAGGAGCTCCATTTCTAGGCAAGATTCTCATGGGATATACAGCAGTCGTCAG GGTATGGGCTATGGTGGAGGTTCCTATGGTGGAAGTGATGTAGGTGGAATGTATTCGTCC AGCTATGGTGGTGACTACATGTCTCGTGGCAGTGATGTTGGCTCCTCGGTTTATTCTAGT CGTGGTATGGGTGGCAGTGGCTATATGGGAAGTGGTGGTTCTGGATCTTACTACTAA