Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400008367
CDS Infomation

pacid=37460598 polypeptide=PGSC0003DMP400005821 locus=PGSC0003DMG400003229 ID=PGSC0003DMT400008367.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGAAAATCACCTTTCTATGTTGCTAATGGCTCCGAAGCATCTCTTTCATCTTTTCCG
TTAATACCAGGTTCTACGATATTATCTACGCCTTCACATACCCCTTCCGATTTCAATTCC
AGTTTGCCGTTGCCGGATCCATACTCAAATTCTACTTTCCTTTTTCCTTCTGCTCCTGTT
GTTGACGGAACCTTTGATTTCGTAACAATTTGTTTTATTTCCGGTCTTCTTCTTCTTTCT
CTACTTTCGTTTGTGTTTATCTTCCATCTCCGTCTCAGATCTCGTCAATATCCGCATCTT
AAAAATTTCAATTCTCTGTGGACCGTCCGTTTACTCCTTGTTTCCTTCGCTATTCTTTGG
GCGTTAAACGAAGTTTTCCGGCTGCATTTCATTCGCCGGAATTACATTCTCCCTTTCTTT
CCACCTCTAACCCTAAATCAACAAGCAAATCTGTGTAAAGTTCATGTGGTTCTCTCCGTA
GGCTTATTTGAACCGGCGTTCTTAACCACCCTTCTTTTCTTAGTAAACGTGTCCATTAAG
AAACATAGTCCAAGTGGAATTTGGGCTGTCATCGTCGTCTGGCCGATTTGTTTACCTCTT
TTGTTGCTTCAGATCCTTGCTGTGTTCTTCTCCCCATTGCAGAAGCATCTACCGATATAC
CTGCATTCTAGCTCCTTCGTTTCAACAGATATCTTGGGGAACCAGACGGTTCTCTGTACT
TACCCTGTGTATAGTTCTATTTTGTTTGGGGGATTTACTGTTGCTTACTTGTTAGCCTTT
GTAATTTCGTGTTGGAGAGTTATCTCCTTTGTAATTAACAGAAAAATTCAGGTACGGGTG
AATTTGCTGGCGACTTCTTTCATGATTGCGTTGCCTTTGCAGATTCTGTGCTTAGTATCA
TTACCAATTCGGCCGCCGGATGATCCATTCCACGGTGTTTCCATGATGGTGATGTTCTTG
GCTGTTGCGTGGTGTATAACGGTTGGGGAGGTTACTTTGGTAATTAAGCCGATTGCAGAT
GCATTTCTCGCTGGTAGAGCAAGTAGCTGCCGTTTGAATCCCGGAACTACGTTAGGACAT
CCGAACGGTGATGGAGGAAGAGTGGAAGGACGGAGTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400005821
PEP Infomation

pacid=37460598 transcript=PGSC0003DMT400008367 locus=PGSC0003DMG400003229 ID=PGSC0003DMT400008367.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MRKSPFYVANGSEASLSSFPLIPGSTILSTPSHTPSDFNSSLPLPDPYSNSTFLFPSAPV
VDGTFDFVTICFISGLLLLSLLSFVFIFHLRLRSRQYPHLKNFNSLWTVRLLLVSFAILW
ALNEVFRLHFIRRNYILPFFPPLTLNQQANLCKVHVVLSVGLFEPAFLTTLLFLVNVSIK
KHSPSGIWAVIVVWPICLPLLLLQILAVFFSPLQKHLPIYLHSSSFVSTDILGNQTVLCT
YPVYSSILFGGFTVAYLLAFVISCWRVISFVINRKIQVRVNLLATSFMIALPLQILCLVS
LPIRPPDDPFHGVSMMVMFLAVAWCITVGEVTLVIKPIADAFLAGRASSCRLNPGTTLGH
PNGDGGRVEGRS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400008367
Transcript Infomation

pacid=37460598 locus=PGSC0003DMG400003229 ID=PGSC0003DMT400008367.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGAAAATCACCTTTCTATGTTGCTAATGGCTCCGAAGCATCTCTTTCATCTTTTCCG
TTAATACCAGGTTCTACGATATTATCTACGCCTTCACATACCCCTTCCGATTTCAATTCC
AGTTTGCCGTTGCCGGATCCATACTCAAATTCTACTTTCCTTTTTCCTTCTGCTCCTGTT
GTTGACGGAACCTTTGATTTCGTAACAATTTGTTTTATTTCCGGTCTTCTTCTTCTTTCT
CTACTTTCGTTTGTGTTTATCTTCCATCTCCGTCTCAGATCTCGTCAATATCCGCATCTT
AAAAATTTCAATTCTCTGTGGACCGTCCGTTTACTCCTTGTTTCCTTCGCTATTCTTTGG
GCGTTAAACGAAGTTTTCCGGCTGCATTTCATTCGCCGGAATTACATTCTCCCTTTCTTT
CCACCTCTAACCCTAAATCAACAAGCAAATCTGTGTAAAGTTCATGTGGTTCTCTCCGTA
GGCTTATTTGAACCGGCGTTCTTAACCACCCTTCTTTTCTTAGTAAACGTGTCCATTAAG
AAACATAGTCCAAGTGGAATTTGGGCTGTCATCGTCGTCTGGCCGATTTGTTTACCTCTT
TTGTTGCTTCAGATCCTTGCTGTGTTCTTCTCCCCATTGCAGAAGCATCTACCGATATAC
CTGCATTCTAGCTCCTTCGTTTCAACAGATATCTTGGGGAACCAGACGGTTCTCTGTACT
TACCCTGTGTATAGTTCTATTTTGTTTGGGGGATTTACTGTTGCTTACTTGTTAGCCTTT
GTAATTTCGTGTTGGAGAGTTATCTCCTTTGTAATTAACAGAAAAATTCAGGTACGGGTG
AATTTGCTGGCGACTTCTTTCATGATTGCGTTGCCTTTGCAGATTCTGTGCTTAGTATCA
TTACCAATTCGGCCGCCGGATGATCCATTCCACGGTGTTTCCATGATGGTGATGTTCTTG
GCTGTTGCGTGGTGTATAACGGTTGGGGAGGTTACTTTGGTAATTAAGCCGATTGCAGAT
GCATTTCTCGCTGGTAGAGCAAGTAGCTGCCGTTTGAATCCCGGAACTACGTTAGGACAT
CCGAACGGTGATGGAGGAAGAGTGGAAGGACGGAGTTAG