Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400008173
CDS Infomation

pacid=37459761 polypeptide=PGSC0003DMP400005696 locus=PGSC0003DMG400003152 ID=PGSC0003DMT400008173.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACAATTGCAGCAGACTTTTATGATGAGCAGGATTCAGTGTTTTGTTCAAAGAGAGTT
TGTGTGATGGATGCTGCTGGTCAGCTGGGATCTGCAATTGTCCATCAGCTCTTGCTCAGA
GGTTATACAGTCCACGCCGCTTTTCAAAACCATGATGAAATGCAATGTTTTAAGATGAAA
TATGGTTGTGGCAATGATGACAGCAAAAGCAAGAAGTTGATATGTTTCCATGCTGACCCC
TTGGATTATCATAGCATAGTAGATGCTCTCAAAGGCTGTTGTGGTCTGTTTTACTCATTC
GAGACCCCCTCTGACTATCCGACCTACGACGAATTGATGGGAGAAATGGAAGTCAGAGCA
GCTCACAATGTGATGGAAGCCTGTGCACAAACAGACACCTTAAACAAGGTTGTTTTTACA
TCATCTGCAACAGCTGTGTTATGGGGTACAAGGAAGAGGGACCAACATGACTCTCCTGTG
GCTTCCCATTCTCATTCCTATGTCGATGAAAGAGATTGGACTGACATCAACTTTTGCAAA
AAGTACAAGTTATGGCACGGCCTATCAAAGACACAAGCGGAGAAAGCAGCATGGGCATTG
GCAATGGACAGAGAAGTGAACATGGTGTCTATAAATGGAGGGTTGTTAATTCATCCAGAC
CTCAATATAAGAGAACCTTACTTGAAGGGAGCTGCAGAAATGTATGAAGATGGTGTGTTT
GTTGCAGTGGACCTCAAGTTCTTGGTAGATGCCCATATGTGTGTGTTTGAGGATGTTTCC
TCTTACGGACGATACTTATGCTTCAACAGAGTCATAAACACCACTAAAGATGCTACCACA
CTAGCCAATATGCTTCTGCCTCCTTCAGCGTCATCAGAAACACAAAGATTGGAGGACGAT
ACTGTATATGAGCAAAGGATTAGCAACAAGAAACTGAACAAACTGATGCTAGGATTTGAT
ACTGGATTGGAAGTCCAAGTGAATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400005696
PEP Infomation

pacid=37459761 transcript=PGSC0003DMT400008173 locus=PGSC0003DMG400003152 ID=PGSC0003DMT400008173.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MTIAADFYDEQDSVFCSKRVCVMDAAGQLGSAIVHQLLLRGYTVHAAFQNHDEMQCFKMK
YGCGNDDSKSKKLICFHADPLDYHSIVDALKGCCGLFYSFETPSDYPTYDELMGEMEVRA
AHNVMEACAQTDTLNKVVFTSSATAVLWGTRKRDQHDSPVASHSHSYVDERDWTDINFCK
KYKLWHGLSKTQAEKAAWALAMDREVNMVSINGGLLIHPDLNIREPYLKGAAEMYEDGVF
VAVDLKFLVDAHMCVFEDVSSYGRYLCFNRVINTTKDATTLANMLLPPSASSETQRLEDD
TVYEQRISNKKLNKLMLGFDTGLEVQVN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400008173
Transcript Infomation

pacid=37459761 locus=PGSC0003DMG400003152 ID=PGSC0003DMT400008173.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACAATTGCAGCAGACTTTTATGATGAGCAGGATTCAGTGTTTTGTTCAAAGAGAGTT
TGTGTGATGGATGCTGCTGGTCAGCTGGGATCTGCAATTGTCCATCAGCTCTTGCTCAGA
GGTTATACAGTCCACGCCGCTTTTCAAAACCATGATGAAATGCAATGTTTTAAGATGAAA
TATGGTTGTGGCAATGATGACAGCAAAAGCAAGAAGTTGATATGTTTCCATGCTGACCCC
TTGGATTATCATAGCATAGTAGATGCTCTCAAAGGCTGTTGTGGTCTGTTTTACTCATTC
GAGACCCCCTCTGACTATCCGACCTACGACGAATTGATGGGAGAAATGGAAGTCAGAGCA
GCTCACAATGTGATGGAAGCCTGTGCACAAACAGACACCTTAAACAAGGTTGTTTTTACA
TCATCTGCAACAGCTGTGTTATGGGGTACAAGGAAGAGGGACCAACATGACTCTCCTGTG
GCTTCCCATTCTCATTCCTATGTCGATGAAAGAGATTGGACTGACATCAACTTTTGCAAA
AAGTACAAGTTATGGCACGGCCTATCAAAGACACAAGCGGAGAAAGCAGCATGGGCATTG
GCAATGGACAGAGAAGTGAACATGGTGTCTATAAATGGAGGGTTGTTAATTCATCCAGAC
CTCAATATAAGAGAACCTTACTTGAAGGGAGCTGCAGAAATGTATGAAGATGGTGTGTTT
GTTGCAGTGGACCTCAAGTTCTTGGTAGATGCCCATATGTGTGTGTTTGAGGATGTTTCC
TCTTACGGACGATACTTATGCTTCAACAGAGTCATAAACACCACTAAAGATGCTACCACA
CTAGCCAATATGCTTCTGCCTCCTTCAGCGTCATCAGAAACACAAAGATTGGAGGACGAT
ACTGTATATGAGCAAAGGATTAGCAACAAGAAACTGAACAAACTGATGCTAGGATTTGAT
ACTGGATTGGAAGTCCAAGTGAATTGA