Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400007762
CDS Infomation

pacid=37467345 polypeptide=PGSC0003DMP400005396 locus=PGSC0003DMG400003000 ID=PGSC0003DMT400007762.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGTGGATTCAACTATGGTATCGGAATCCGATCACGATCCGACTGTTCAGAATGAT
AGTTCGACGTCGGAACAACAGCTTAATGATGAATCTTCAACTTCGTTGCAGCAGCAAAGT
TCACAAACTCAGCAACAGCAGCAGCAAAGTAGTAGTAGTAGTAGTCCTGCTGTTGCGGGA
CCAAGGTGTGCTCCGACTTATTCGGTGGTGCACGAAGTGATAGAGAAAAAGGAGGATGGT
CCAGGGCCGAGGTGTGGGCATACGTTAACGGCTGTACCAGCTGTTGGTGAAGAAGGTTCT
CCTAATTATATTGGTCCTAGGCTTATTCTTTTTGGTGGTGCTACTGCTCTTGAGGGAAAT
TCGGCTGCTTCTGGAACTCCGTCATCTGCTGGAAGTGCTGGAATTCGCTTAGCAGGGGCT
ACTGCTGATGTGCACTGTTATGATGTTTTGACGAATAAATGGTCTAGGATCACTCCCATT
GGAGAGCCACCCACACCAAGGGCTGCACATGTTGCTACAGCTGTGGGAACTATGGTTGTT
ATTCAGGGTGGAATCGGTCCAGCTGGTTTGTCAGCTGAGGATCTTCACGTTCTGGACCTT
ACTCAACAACGGCCAAGATGGCACAGGGTTGTGGTGCAAGGACCTGGTCCAGGTCCGCGT
TATGGACACGTCATGGCTTTGGTAGGGCAAAGATATCTCATGGCAATTGGCGGAAATGAT
GGAAAACGGCCTCTAGCGGATGTTTGGGCTTTGGACACGGCTGCCAAACCATATGAATGG
CGGAAGTTGGAACCGGAGGGTGAAGGTCCACCTCCTTGCATGTATGCAACTGCAAGTGCA
CGTTCAGATGGTCTTCTTCTCCTCTGTGGAGGGAGGGATGCCAATAGCGTGCCTCTGGCA
AGTGCTTATGGACTTGCCAAACATAGAGATGGACGTTGGGAATGGGCCATTGCCCCTGGT
GTGTCACCCTCCCCCAGATATCAACATGCTGCAGTTTTTGTTAATGCTCGGCTGCATGTA
TCTGGAGGGGCACTTGGTGGTGGACGCATGGTGGAGGACTCATCCAGTGTTGCGGTTCTT
GATACAGCTGCAGGAGTGTGGTGTGACACAAAATCTGTTGTGACTAGTCCTAGGACTGGC
AGATTCAGTGCAGATGCAGCTGGTGGAGATGCTGCTGTTGAATTGACCAGACGCTGTAGG
CATGCAGCTGCTGCTGTTGGGGACTTGATATTTATCTATGGTGGTCTACGTGGCGGTGTA
CTGCTGGATGACTTGCTTGTTGCTGAAGACTTGGCTGCCGCAGAAACAACAAGTGCTGCT
TCACATGCCGCAGCTGCTGCCGCCAATCTACAAGATGGCAGGCTTGCTGGGAGGTATGGT
TTTGGTGATGAAAGAACGAGGCAAACAGTTCCTGATGCAGTTAATGATGGTTCTGTTGTA
CTGGGAAATGCTGTTGCTCCCCCTGTAAATGGCGATATGTATACTGATATAAGTACTGAG
AATGTCATGCTTCAAGGATCTCGGAGACTCAGCAAAGGTGTTGAATATTTAGTGGAGGCC
TCTGCAGCAGAAGCTGAGGCTATTACTGCTACACTAGCAGCTGCCAAAGCTCGACAGCAA
GGTAATGGAGAAGTCGAACTTCCTGATAGGGATGGTGGAGCAGAGGCTACACCAAGTGGA
AAAGCAGCATCTACTTCGATCAATTTAGATTCTTCCGGATCGAATAATTCTGCCCCAACT
GGAGTCCGTCTTCATCATCGTGCAATAGTTGTAGCTGCAGAGACTGGTGGTGCTCTTGGT
GGTATGGTACGACAGCTTTCTATCGATCAATTTGAAAATGAAGGCCGGCGAGTCAGTTAT
GGAACCCCAGAAAATGTCACGGCAGCACGAAAACTTTTGGATCGACAAATGTCCATCAAC
AGTGTTCCAAAAAAGCTGATCACCCATCTTTTGAAGCCTCGGGGTTGGAAGCCGCCTGTG
CGACGAGAGTTTTTTTTGGACTGCAATGAGATCGCCGATCTTTGTGATAGTGCCGAAAGA
ATATTTGCTAGTGAACCTACTGTTTTACAGCTAAGGGCTCCTATTAAGATATTTGGTGAC
TTACATGGGCAATTTGGGGATCTCATGCGTCTTTTTGACGAGTATGGTTCCCCGTCAACT
GCTGGGGATATTGCGTATATTGATTACCTCTTCTTGGGAGATTATGTTGATAGGGGCCAG
CACAGCTTGGAGACCATTACTCTTCTCCTTGCTTTAAAGGTCGAGTATCCTCACAATATA
CATTTAATACGTGGGAACCATGAAGCTTCAGATATAAATGCGCTCTTTGGCTTTCGAATT
GAGTGCATTGAACGCCTGGGTGAGAGAGATGGAATCTGGGCATGGCATCGGATTAATAGA
TTGTTCAACTGGCTTCCTCTGGCTGCCCTGATTGAGAAAAAAATCATCTGTATGCATGGT
GGGATTGGAAGGTCCATTAATCACGTTGAGCAAATAGAGAGTATCCAGCGTCCTATCACT
ATGGAAGCTGGCTCAATCGTTCTGATGGATTTGTTGTGGTCTGACCCAACAGAAAATGAT
AGTGTTGAAGGACTAAGACCAAATGCAAGAGGCCCTGGCTTGGTAACTTTTGGGCCCGAT
CGTGTGATGGAGTTTTGCAACAACAATGATCTTCAACTAATAGTCCGTGCCCACGAATGT
GTGATGGATGGCTTTGAAAGATTTGCTCAGGGGCATTTAATTACGCTTTTTTCAGCCACC
AATTACTGTGGTACTGCTAACAATGCTGGTGCCATTTTGGTATTGGGTAGAGATCTTGTT
GTGGTTCCAAAACTTATCCACCCAATTCCGCCAGTTTCATCGCCTGAAAATTCACCTGAG
CGGCATATAGAAGACACTTGGATGCAGGAGTTAAATGCTAACAGACCCCCTACACCAACC
AGAGGCCGTCCCCAAGTTGCCAACGATCGAGTGATATGTACATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400005396
PEP Infomation

pacid=37467345 transcript=PGSC0003DMT400007762 locus=PGSC0003DMG400003000 ID=PGSC0003DMT400007762.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDVDSTMVSESDHDPTVQNDSSTSEQQLNDESSTSLQQQSSQTQQQQQQSSSSSSPAVAG
PRCAPTYSVVHEVIEKKEDGPGPRCGHTLTAVPAVGEEGSPNYIGPRLILFGGATALEGN
SAASGTPSSAGSAGIRLAGATADVHCYDVLTNKWSRITPIGEPPTPRAAHVATAVGTMVV
IQGGIGPAGLSAEDLHVLDLTQQRPRWHRVVVQGPGPGPRYGHVMALVGQRYLMAIGGND
GKRPLADVWALDTAAKPYEWRKLEPEGEGPPPCMYATASARSDGLLLLCGGRDANSVPLA
SAYGLAKHRDGRWEWAIAPGVSPSPRYQHAAVFVNARLHVSGGALGGGRMVEDSSSVAVL
DTAAGVWCDTKSVVTSPRTGRFSADAAGGDAAVELTRRCRHAAAAVGDLIFIYGGLRGGV
LLDDLLVAEDLAAAETTSAASHAAAAAANLQDGRLAGRYGFGDERTRQTVPDAVNDGSVV
LGNAVAPPVNGDMYTDISTENVMLQGSRRLSKGVEYLVEASAAEAEAITATLAAAKARQQ
GNGEVELPDRDGGAEATPSGKAASTSINLDSSGSNNSAPTGVRLHHRAIVVAAETGGALG
GMVRQLSIDQFENEGRRVSYGTPENVTAARKLLDRQMSINSVPKKLITHLLKPRGWKPPV
RREFFLDCNEIADLCDSAERIFASEPTVLQLRAPIKIFGDLHGQFGDLMRLFDEYGSPST
AGDIAYIDYLFLGDYVDRGQHSLETITLLLALKVEYPHNIHLIRGNHEASDINALFGFRI
ECIERLGERDGIWAWHRINRLFNWLPLAALIEKKIICMHGGIGRSINHVEQIESIQRPIT
MEAGSIVLMDLLWSDPTENDSVEGLRPNARGPGLVTFGPDRVMEFCNNNDLQLIVRAHEC
VMDGFERFAQGHLITLFSATNYCGTANNAGAILVLGRDLVVVPKLIHPIPPVSSPENSPE
RHIEDTWMQELNANRPPTPTRGRPQVANDRVICT*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400007762
Transcript Infomation

pacid=37467345 locus=PGSC0003DMG400003000 ID=PGSC0003DMT400007762.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGTGGATTCAACTATGGTATCGGAATCCGATCACGATCCGACTGTTCAGAATGAT
AGTTCGACGTCGGAACAACAGCTTAATGATGAATCTTCAACTTCGTTGCAGCAGCAAAGT
TCACAAACTCAGCAACAGCAGCAGCAAAGTAGTAGTAGTAGTAGTCCTGCTGTTGCGGGA
CCAAGGTGTGCTCCGACTTATTCGGTGGTGCACGAAGTGATAGAGAAAAAGGAGGATGGT
CCAGGGCCGAGGTGTGGGCATACGTTAACGGCTGTACCAGCTGTTGGTGAAGAAGGTTCT
CCTAATTATATTGGTCCTAGGCTTATTCTTTTTGGTGGTGCTACTGCTCTTGAGGGAAAT
TCGGCTGCTTCTGGAACTCCGTCATCTGCTGGAAGTGCTGGAATTCGCTTAGCAGGGGCT
ACTGCTGATGTGCACTGTTATGATGTTTTGACGAATAAATGGTCTAGGATCACTCCCATT
GGAGAGCCACCCACACCAAGGGCTGCACATGTTGCTACAGCTGTGGGAACTATGGTTGTT
ATTCAGGGTGGAATCGGTCCAGCTGGTTTGTCAGCTGAGGATCTTCACGTTCTGGACCTT
ACTCAACAACGGCCAAGATGGCACAGGGTTGTGGTGCAAGGACCTGGTCCAGGTCCGCGT
TATGGACACGTCATGGCTTTGGTAGGGCAAAGATATCTCATGGCAATTGGCGGAAATGAT
GGAAAACGGCCTCTAGCGGATGTTTGGGCTTTGGACACGGCTGCCAAACCATATGAATGG
CGGAAGTTGGAACCGGAGGGTGAAGGTCCACCTCCTTGCATGTATGCAACTGCAAGTGCA
CGTTCAGATGGTCTTCTTCTCCTCTGTGGAGGGAGGGATGCCAATAGCGTGCCTCTGGCA
AGTGCTTATGGACTTGCCAAACATAGAGATGGACGTTGGGAATGGGCCATTGCCCCTGGT
GTGTCACCCTCCCCCAGATATCAACATGCTGCAGTTTTTGTTAATGCTCGGCTGCATGTA
TCTGGAGGGGCACTTGGTGGTGGACGCATGGTGGAGGACTCATCCAGTGTTGCGGTTCTT
GATACAGCTGCAGGAGTGTGGTGTGACACAAAATCTGTTGTGACTAGTCCTAGGACTGGC
AGATTCAGTGCAGATGCAGCTGGTGGAGATGCTGCTGTTGAATTGACCAGACGCTGTAGG
CATGCAGCTGCTGCTGTTGGGGACTTGATATTTATCTATGGTGGTCTACGTGGCGGTGTA
CTGCTGGATGACTTGCTTGTTGCTGAAGACTTGGCTGCCGCAGAAACAACAAGTGCTGCT
TCACATGCCGCAGCTGCTGCCGCCAATCTACAAGATGGCAGGCTTGCTGGGAGGTATGGT
TTTGGTGATGAAAGAACGAGGCAAACAGTTCCTGATGCAGTTAATGATGGTTCTGTTGTA
CTGGGAAATGCTGTTGCTCCCCCTGTAAATGGCGATATGTATACTGATATAAGTACTGAG
AATGTCATGCTTCAAGGATCTCGGAGACTCAGCAAAGGTGTTGAATATTTAGTGGAGGCC
TCTGCAGCAGAAGCTGAGGCTATTACTGCTACACTAGCAGCTGCCAAAGCTCGACAGCAA
GGTAATGGAGAAGTCGAACTTCCTGATAGGGATGGTGGAGCAGAGGCTACACCAAGTGGA
AAAGCAGCATCTACTTCGATCAATTTAGATTCTTCCGGATCGAATAATTCTGCCCCAACT
GGAGTCCGTCTTCATCATCGTGCAATAGTTGTAGCTGCAGAGACTGGTGGTGCTCTTGGT
GGTATGGTACGACAGCTTTCTATCGATCAATTTGAAAATGAAGGCCGGCGAGTCAGTTAT
GGAACCCCAGAAAATGTCACGGCAGCACGAAAACTTTTGGATCGACAAATGTCCATCAAC
AGTGTTCCAAAAAAGCTGATCACCCATCTTTTGAAGCCTCGGGGTTGGAAGCCGCCTGTG
CGACGAGAGTTTTTTTTGGACTGCAATGAGATCGCCGATCTTTGTGATAGTGCCGAAAGA
ATATTTGCTAGTGAACCTACTGTTTTACAGCTAAGGGCTCCTATTAAGATATTTGGTGAC
TTACATGGGCAATTTGGGGATCTCATGCGTCTTTTTGACGAGTATGGTTCCCCGTCAACT
GCTGGGGATATTGCGTATATTGATTACCTCTTCTTGGGAGATTATGTTGATAGGGGCCAG
CACAGCTTGGAGACCATTACTCTTCTCCTTGCTTTAAAGGTCGAGTATCCTCACAATATA
CATTTAATACGTGGGAACCATGAAGCTTCAGATATAAATGCGCTCTTTGGCTTTCGAATT
GAGTGCATTGAACGCCTGGGTGAGAGAGATGGAATCTGGGCATGGCATCGGATTAATAGA
TTGTTCAACTGGCTTCCTCTGGCTGCCCTGATTGAGAAAAAAATCATCTGTATGCATGGT
GGGATTGGAAGGTCCATTAATCACGTTGAGCAAATAGAGAGTATCCAGCGTCCTATCACT
ATGGAAGCTGGCTCAATCGTTCTGATGGATTTGTTGTGGTCTGACCCAACAGAAAATGAT
AGTGTTGAAGGACTAAGACCAAATGCAAGAGGCCCTGGCTTGGTAACTTTTGGGCCCGAT
CGTGTGATGGAGTTTTGCAACAACAATGATCTTCAACTAATAGTCCGTGCCCACGAATGT
GTGATGGATGGCTTTGAAAGATTTGCTCAGGGGCATTTAATTACGCTTTTTTCAGCCACC
AATTACTGTGGTACTGCTAACAATGCTGGTGCCATTTTGGTATTGGGTAGAGATCTTGTT
GTGGTTCCAAAACTTATCCACCCAATTCCGCCAGTTTCATCGCCTGAAAATTCACCTGAG
CGGCATATAGAAGACACTTGGATGCAGGAGTTAAATGCTAACAGACCCCCTACACCAACC
AGAGGCCGTCCCCAAGTTGCCAACGATCGAGTGATATGTACATAG