Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400007127
CDS Infomation

pacid=37439040 polypeptide=PGSC0003DMP400004944 locus=PGSC0003DMG400002757 ID=PGSC0003DMT400007127.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAATGCAAGAAAGCTAGTTTCCCAAACTCAAATTCCTCAAACTATCAAGAACTCTCTT
CTTTGTGCTGCAATCGACCCACCCCATTCAAACCCACCATTTGTACCCAAGCCTCCTTCT
ATATTAGCAACTGGTCTTCTCAAGTCGTATTTTGAAAGGGGTCTGATTAGAGAAGCACGT
ACACTGTTCGATGAAATGCCTGAAAGAGATGTTGTTGCTTGGACGACCATGATTTCTGGG
TACACTTCATGTAATCTCCATGGACGTGCTTGGATGGTTTTCTGTGAAATGATGAGGTAT
ACGGATGTGCGCTACAATGAGTTCACGTTATCTAGTACGTTGAAGGCTTGTAAAGGGATC
AATTCGTACTCTCATGGAGCTTTGGTTCACGGTTTGGTTCTGAAGCAAGGCATGAGTGGA
AGTATTTATGTTTCGAATGCACTCTTGGATGTCTATGCTACGTGTTGTGTTGATATGGAA
GAAGCATCTGCGGTTTTTCAGGAGATTAGAGAGAAAAATGATGTGTCTTGGACTACATTA
ATCGCGGGATATACTCATCGTGGTGATGGCTATATGGGGCTTAATGTTTTTAGAAGAATG
TTATCGGAAGAGGGTGAATCAAACCCATTTAGCTTTTCAATAGCAGTCAGAGCTTGTGCC
TCGGTCCACTCATGTACATATGGGAAGCAACTTCATGCTGCAATCACCAAGCATGGATTG
GACTTTAATCTACCTGTAATGAATTCTATTTTAGATATGTATTGTAGGTGTAACAGCTTA
AATGATGCAAAGCAATGCTTCCATGAAATGACTCAAAGGGATTCAATCACCTGGAACACT
TTGATTGCTGGATATGAGAAGTCTGATCCATATGAATCTATCAGCACATACTCGCATATG
GAGCTTGAAGGTCTCAGCCCCAATTGCTTCACATTTTCCAGCATTATAGCAGCTGTGGCC
AATTTGGCAATTTTGAGTTGTGGAGAGCAGATTCATGGAAGAATCATAAAGAGAGGCCTC
GGAGGGAACTTGGAGTTGGACAATGCCTTAATAGACATGTACGCAAAGTCTGGAAATATT
GGAAGTGCACGTAGAATTTTTGATAAAATGCCCACGAAAAATCTGGTTTCGTGGACCTCA
ATGATGATTGGTTATGGAAGCCATGGATATGGAAATGAAGCTGTCAACTTTTTTGAAGAG
ATGGTTAAATTTAGAGTCAGGCCAGATAGGATAGCATTTGTGGCAGTTTTAAATGCATGT
AGTCATGCTGGGCTTGTAGATAAAGGTGTAAGGTATTTTATGTCAATGGTTGGTGATTAC
AACATAGCTCCAGATCCGGAGATTTTTGGGTGTTTAGTAGATTTGCTAGGACGCGCTGGA
AGAGTTGAGGAGGCTTTTAAGTTGATAGAGAGTATGCCATTTGATCCCGATGAATCTGTT
TGGGGAACACTCATAGGAGCATGTAAAACACACAATCATCCAGATTTGGGCACGCTGGCC
ATAAGAAAGGTGTTGGCATTGAAGCCGAAAATTGCAGCAACTTATGTAATTCTGTCAAAT
ATCTATGCAGCTGACGGTAAATGGGGTGACTCTGCAAAAATGAGGAAGTTGATGAGAAGG
ATGGCTACCAAGAAAGAGGCAGGGAGAAGTTCAGTAGAGATAAAGAATCAGAACTATAGT
TTTGTTGCTGGAGATAAAATGGGTTCACATATGGATTGTGTTGATGAAGTTGTAAAAATC
CTGGTCGAACATATGAGAGACACACGATATATTCCTGATTTGGACTTCTTTATACATAAC
TTAGAAGATGGAACTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400004944
PEP Infomation

pacid=37439040 transcript=PGSC0003DMT400007127 locus=PGSC0003DMG400002757 ID=PGSC0003DMT400007127.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MNARKLVSQTQIPQTIKNSLLCAAIDPPHSNPPFVPKPPSILATGLLKSYFERGLIREAR
TLFDEMPERDVVAWTTMISGYTSCNLHGRAWMVFCEMMRYTDVRYNEFTLSSTLKACKGI
NSYSHGALVHGLVLKQGMSGSIYVSNALLDVYATCCVDMEEASAVFQEIREKNDVSWTTL
IAGYTHRGDGYMGLNVFRRMLSEEGESNPFSFSIAVRACASVHSCTYGKQLHAAITKHGL
DFNLPVMNSILDMYCRCNSLNDAKQCFHEMTQRDSITWNTLIAGYEKSDPYESISTYSHM
ELEGLSPNCFTFSSIIAAVANLAILSCGEQIHGRIIKRGLGGNLELDNALIDMYAKSGNI
GSARRIFDKMPTKNLVSWTSMMIGYGSHGYGNEAVNFFEEMVKFRVRPDRIAFVAVLNAC
SHAGLVDKGVRYFMSMVGDYNIAPDPEIFGCLVDLLGRAGRVEEAFKLIESMPFDPDESV
WGTLIGACKTHNHPDLGTLAIRKVLALKPKIAATYVILSNIYAADGKWGDSAKMRKLMRR
MATKKEAGRSSVEIKNQNYSFVAGDKMGSHMDCVDEVVKILVEHMRDTRYIPDLDFFIHN
LEDGT*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400007127
Transcript Infomation

pacid=37439040 locus=PGSC0003DMG400002757 ID=PGSC0003DMT400007127.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAATGCAAGAAAGCTAGTTTCCCAAACTCAAATTCCTCAAACTATCAAGAACTCTCTT
CTTTGTGCTGCAATCGACCCACCCCATTCAAACCCACCATTTGTACCCAAGCCTCCTTCT
ATATTAGCAACTGGTCTTCTCAAGTCGTATTTTGAAAGGGGTCTGATTAGAGAAGCACGT
ACACTGTTCGATGAAATGCCTGAAAGAGATGTTGTTGCTTGGACGACCATGATTTCTGGG
TACACTTCATGTAATCTCCATGGACGTGCTTGGATGGTTTTCTGTGAAATGATGAGGTAT
ACGGATGTGCGCTACAATGAGTTCACGTTATCTAGTACGTTGAAGGCTTGTAAAGGGATC
AATTCGTACTCTCATGGAGCTTTGGTTCACGGTTTGGTTCTGAAGCAAGGCATGAGTGGA
AGTATTTATGTTTCGAATGCACTCTTGGATGTCTATGCTACGTGTTGTGTTGATATGGAA
GAAGCATCTGCGGTTTTTCAGGAGATTAGAGAGAAAAATGATGTGTCTTGGACTACATTA
ATCGCGGGATATACTCATCGTGGTGATGGCTATATGGGGCTTAATGTTTTTAGAAGAATG
TTATCGGAAGAGGGTGAATCAAACCCATTTAGCTTTTCAATAGCAGTCAGAGCTTGTGCC
TCGGTCCACTCATGTACATATGGGAAGCAACTTCATGCTGCAATCACCAAGCATGGATTG
GACTTTAATCTACCTGTAATGAATTCTATTTTAGATATGTATTGTAGGTGTAACAGCTTA
AATGATGCAAAGCAATGCTTCCATGAAATGACTCAAAGGGATTCAATCACCTGGAACACT
TTGATTGCTGGATATGAGAAGTCTGATCCATATGAATCTATCAGCACATACTCGCATATG
GAGCTTGAAGGTCTCAGCCCCAATTGCTTCACATTTTCCAGCATTATAGCAGCTGTGGCC
AATTTGGCAATTTTGAGTTGTGGAGAGCAGATTCATGGAAGAATCATAAAGAGAGGCCTC
GGAGGGAACTTGGAGTTGGACAATGCCTTAATAGACATGTACGCAAAGTCTGGAAATATT
GGAAGTGCACGTAGAATTTTTGATAAAATGCCCACGAAAAATCTGGTTTCGTGGACCTCA
ATGATGATTGGTTATGGAAGCCATGGATATGGAAATGAAGCTGTCAACTTTTTTGAAGAG
ATGGTTAAATTTAGAGTCAGGCCAGATAGGATAGCATTTGTGGCAGTTTTAAATGCATGT
AGTCATGCTGGGCTTGTAGATAAAGGTGTAAGGTATTTTATGTCAATGGTTGGTGATTAC
AACATAGCTCCAGATCCGGAGATTTTTGGGTGTTTAGTAGATTTGCTAGGACGCGCTGGA
AGAGTTGAGGAGGCTTTTAAGTTGATAGAGAGTATGCCATTTGATCCCGATGAATCTGTT
TGGGGAACACTCATAGGAGCATGTAAAACACACAATCATCCAGATTTGGGCACGCTGGCC
ATAAGAAAGGTGTTGGCATTGAAGCCGAAAATTGCAGCAACTTATGTAATTCTGTCAAAT
ATCTATGCAGCTGACGGTAAATGGGGTGACTCTGCAAAAATGAGGAAGTTGATGAGAAGG
ATGGCTACCAAGAAAGAGGCAGGGAGAAGTTCAGTAGAGATAAAGAATCAGAACTATAGT
TTTGTTGCTGGAGATAAAATGGGTTCACATATGGATTGTGTTGATGAAGTTGTAAAAATC
CTGGTCGAACATATGAGAGACACACGATATATTCCTGATTTGGACTTCTTTATACATAAC
TTAGAAGATGGAACTTGA