Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400006978
CDS Infomation	pacid=37458157 polypeptide=PGSC0003DMP400004844 locus=PGSC0003DMG403002701 ID=PGSC0003DMT400006978.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGAGTACCTTCCTGTTGAGGTGATTGGGAACATTTTGTCCCGTGTTGGAGCTGCGCGA GATGTTGTGATAGCATCTTCTACTTGTCAGAAGTGGCGAGAGGCTTGGAGGAATCATCTT CATACACTCATGTTTAACTCGAATGACTGGCCTGTTTATCATGAGCTCACAAGGAGCAGA CTTGAGATAATTGTAACTCAGACGATTTTCCAGACTAATGGACTGCATTGCCTTTCGATC ATCATGGATGATGTCGACGAGTTCTCTGCTGCTCCGGTAATAGCTTGGCTAATGTATACC AGAGAAACGTTACGACAGTTACATTACAATGTCAGGACTACCCCAAACATTAATATACTC GAAAAATGTGGTCGCCAGAGACTAGAAGTGTTGGCTCTTGCACACAATACAATCACAGGT GTTGAACCTAGTTACCAAAAGTTTCCTTGTTTGAGGTCTCTTTCACTAAGTTATGTTAGT ATATCGGCTTTAGACCTGAGTCTTTTCCTCACAGCCTGCCCAAAAGTTGAGGTCTTGAGT CTTGTTAGTATAGACATTGTTATGTCTGATCCACAGGCAACGATGGAGCTGACAAGTAAC TCGTTGAAAGATATCTATGTTGAAGCCATTAGTTTGGATAAAATCATTCTGGAAGCGGAT AGTCTTGAGAAGCTGCATCTGAAAGATTGTACACTTGAGGTCTTTGAGCTTGTTAGCAAG GGTTCATTGAGTCACCTTAAGATTGATGATGTTAGTGTCATCCATCTTGATATTGGCGAG AGTGCTGAAGATCTCGAGATTGTGGATGTCAGTAATTTCACAATCATGTGGTCCAAGTTC CATCACATGATAGCAAAATCATCGAAGCTGAAAAGACTGAGGCTATGGGGAGTTGTGTTT GACGATGAGGATGAGGCTGTGGATATTGAGACGATTTCCGCTTGCTTTCCACAATTAAGT CATCTATCATTGAGCTATGAACTAAGAGAGACAGCACTTCATTATGGATCGCAAGATTCT TTTCAATTGGAAAATGTAGTCGTCTTGGAGCTTGGATGGATGGTCATTGGCGACCTGTTC TCCCATTGGGTTGCAGGACTACTGGAAAGGTGCCCTAACCTGAGGAAGTTGGTAATCTAC GGAGTCGTCTCAGAAACCAAAACACACGAAGAATGCCATACATTAGCCAACTTCACATCC TTTATTGTAAGGCTTATGAGGAAGTATTTGCATGTAGATGTTCAGTTCGAATATGAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400004844
PEP Infomation	pacid=37458157 transcript=PGSC0003DMT400006978 locus=PGSC0003DMG403002701 ID=PGSC0003DMT400006978.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MEYLPVEVIGNILSRVGAARDVVIASSTCQKWREAWRNHLHTLMFNSNDWPVYHELTRSR LEIIVTQTIFQTNGLHCLSIIMDDVDEFSAAPVIAWLMYTRETLRQLHYNVRTTPNINIL EKCGRQRLEVLALAHNTITGVEPSYQKFPCLRSLSLSYVSISALDLSLFLTACPKVEVLS LVSIDIVMSDPQATMELTSNSLKDIYVEAISLDKIILEADSLEKLHLKDCTLEVFELVSK GSLSHLKIDDVSVIHLDIGESAEDLEIVDVSNFTIMWSKFHHMIAKSSKLKRLRLWGVVF DDEDEAVDIETISACFPQLSHLSLSYELRETALHYGSQDSFQLENVVVLELGWMVIGDLF SHWVAGLLERCPNLRKLVIYGVVSETKTHEECHTLANFTSFIVRLMRKYLHVDVQFEYE*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400006978
Transcript Infomation	pacid=37458157 locus=PGSC0003DMG403002701 ID=PGSC0003DMT400006978.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGAGTACCTTCCTGTTGAGGTGATTGGGAACATTTTGTCCCGTGTTGGAGCTGCGCGA GATGTTGTGATAGCATCTTCTACTTGTCAGAAGTGGCGAGAGGCTTGGAGGAATCATCTT CATACACTCATGTTTAACTCGAATGACTGGCCTGTTTATCATGAGCTCACAAGGAGCAGA CTTGAGATAATTGTAACTCAGACGATTTTCCAGACTAATGGACTGCATTGCCTTTCGATC ATCATGGATGATGTCGACGAGTTCTCTGCTGCTCCGGTAATAGCTTGGCTAATGTATACC AGAGAAACGTTACGACAGTTACATTACAATGTCAGGACTACCCCAAACATTAATATACTC GAAAAATGTGGTCGCCAGAGACTAGAAGTGTTGGCTCTTGCACACAATACAATCACAGGT GTTGAACCTAGTTACCAAAAGTTTCCTTGTTTGAGGTCTCTTTCACTAAGTTATGTTAGT ATATCGGCTTTAGACCTGAGTCTTTTCCTCACAGCCTGCCCAAAAGTTGAGGTCTTGAGT CTTGTTAGTATAGACATTGTTATGTCTGATCCACAGGCAACGATGGAGCTGACAAGTAAC TCGTTGAAAGATATCTATGTTGAAGCCATTAGTTTGGATAAAATCATTCTGGAAGCGGAT AGTCTTGAGAAGCTGCATCTGAAAGATTGTACACTTGAGGTCTTTGAGCTTGTTAGCAAG GGTTCATTGAGTCACCTTAAGATTGATGATGTTAGTGTCATCCATCTTGATATTGGCGAG AGTGCTGAAGATCTCGAGATTGTGGATGTCAGTAATTTCACAATCATGTGGTCCAAGTTC CATCACATGATAGCAAAATCATCGAAGCTGAAAAGACTGAGGCTATGGGGAGTTGTGTTT GACGATGAGGATGAGGCTGTGGATATTGAGACGATTTCCGCTTGCTTTCCACAATTAAGT CATCTATCATTGAGCTATGAACTAAGAGAGACAGCACTTCATTATGGATCGCAAGATTCT TTTCAATTGGAAAATGTAGTCGTCTTGGAGCTTGGATGGATGGTCATTGGCGACCTGTTC TCCCATTGGGTTGCAGGACTACTGGAAAGGTGCCCTAACCTGAGGAAGTTGGTAATCTAC GGAGTCGTCTCAGAAACCAAAACACACGAAGAATGCCATACATTAGCCAACTTCACATCC TTTATTGTAAGGCTTATGAGGAAGTATTTGCATGTAGATGTTCAGTTCGAATATGAGTAG