Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400006654
CDS Infomation

pacid=37461752 polypeptide=PGSC0003DMP400004621 locus=PGSC0003DMG400002590 ID=PGSC0003DMT400006654.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTTGTAAGCTTATACTAATGTTGAATGTGTTGTTTGTGTTGTTGGGTTCATGGGTT
TTTTCTGGAACAGCTTCTGTTTCATATGACCATAGGGCTATTATTGTAAATGGACAGAGA
AGAATACTTATTTCTGGTTCTGTTCATTACCCAAGAAGCACTCCTGAGATGTGGCCAGGT
ATTATTCAAAAGGCTAAAGAAGGAGGTGTGGATGTGATTCAGACTTATGTTTTCTGGAAT
GGTCATGAGCCTCAACAAGGGAAATATTATTTTGAAGGGAGATATGATTTAGTGAAGTTT
ATTAAGCTGGTGCACCAAGCAGGACTTTATGTCCATCTTAGAGTTGGACCTTATGCTTGT
GCTGAATGGAATTTTGGGGGTTTTCCTGTTTGGCTCAAATATGTTCCAGGTATCAGTTTC
AGAACAAATAATGGACCTTTCAAGGCTGCAATGCAAAAATTCACTACCAAGATTGTCAAT
ATGATGAAAGCGGAACGTTTGTATGAAACTCAAGGGGGGCCAATAATTCTATCTCAGATT
GAGAATGAATATGGACCCATGGAATGGGAACTGGGAGCACCCGGTAAATCTTACGCACAG
TGGGCAGCCAAAATGGCTGTGGGTCTTGACACTGGTGTCCCATGGGTTATGTGCAAGCAA
GACGATGCTCCTGATCCTATTATAAATGCTTGCAATGGCTTCTACTGTGACTACTTTTCT
CCAAACAAGGCTTATAAACCAAAGATATGGACTGAAGCCTGGACTGCATGGTTTACTGGT
TTTGGAAATCCAGTTCCTTACCGTCCTGCTGAGGACTTGGCATTTGCTGTTGCAAAATTT
ATACAGAAGGGAGGTTCCTTCATCAATTATTACATGTATCATGGAGGAACAAACTTTGGA
CGGACTGCTGGTGGTCCATTTATTGCTACTAGTTATGACTATGATGCACCACTTGATGAA
TATGGATTATTGCGACAACCTAAATGGGGTCACCTGAAAGATCTGCATAGAGCAATAAAG
CTTTGTGAACCAGCTTTAGTCTCTGGAGATCCAGCTGTGACAGCACTTGGACACCAGCAG
GAGGCCCATGTTTTTAGGTCGAAGTCTGGCTCTTGTGCTGCATTCCTTGCAAACTATGAC
CAACACTCTTTTGCTACCGTGTCATTTGCAAACAGGCATTACAACTTGCCACCATGGTCA
ATCAGCATTCTTCCCGACTGCAAGAACACTGTATTTAATACAGCACGGATTGGTGCTCAA
AGCGCTCAGATGAAGATGACTCCAGTCAGCAGAGGATTGCCCTGGCAGTCATTCAATGAA
GAGACATCATCTTATGAAGACAGTAGTTTTACAGTTGTTGGGCTATTGGAACAGATAAAT
ACAACAAGAGATGTGTCTGATTATTTGTGGTATTCAACCGATGTCAAGATTGATTCAAGA
GAAGAGTTTTTGAGAGGCGGAAAATGGCCTTGGCTTACGATCATGTCAGCTGGCCATGCA
TTGCATGTTTTTGTGAATGGTCAATTAGCAGGAACTGCATATGGAAGTTTAGAAAAACCA
AAACTAAGTTTCAGTAAAGCTGTAAATCTGAGAGCAGGTGTTAACAAGATTTCTCTGCTG
AGCATTGCTGTTGGCCTTCCGAATATTGGCCCACATTTTGAGACATGGAATGCTGGTGTT
CTTGGTCCAGTTTCACTCAGTGGTCTTGACGAGGGGAAAAGAGATTTAACATGGCAGAAA
TGGTCTTACAAGGTTGGTCTGAAAGGAGAGGCCTTGAGCCTTCATTCACTCAGTGGTAGC
TCGTCCGTTGAATGGGTCGAGGGCTCTTTGGTGGCTCAGAGACAGCCACTCACTTGGTAC
AAGAGCACTTTCAATGCTCCAGCTGGAAATGATCCTTTGGCTTTAGACTTGAATACCATG
GGCAAAGGACAAGTGTGGATAAATGGTCAAAGCCTCGGACGCTACTGGCCTGGATATAAA
GCATCTGGTAACTGCGGTGCCTGTAACTATGCAGGCTGGTTTAATGAGAAAAAATGCCTT
AGTAACTGTGGAGAGGCTTCACAACGAATGTATCATGTTCCTCGTTCTTGGCTGTATCCT
ACTGGAAATTTGTTAGTTCTATTTGAGGAATCGGGAGGAGAGCCTCATGGAATCTCTTTG
GTAAAAAGAGAAGTTGCAAGTGTTTGTGCAGATATAAACGAATGGCAACCACAGTTGATG
AATTGGCAAATGCAAGCATCTGGTAAAGTTGACAAACCACTGAGGCCTAAAGCTCACCTC
TCGTGTGCTTCTGGTCAGAAGATTACGTCAATCAAATTTGCAAGCTTTGGAACACCACAG
GGGGTCTGCGGAAGCTTCCGTGAAGGAAGCTGCCATGCCTTCCACTCATATGATGCTTTT
GAAAGGTATTGCATTGGGCAAAACTCGTGCTCAGTACCTGTAACACCAGAGATTTTTGGA
GGTGATCCATGTCCACATGTTATGAAGAAACTCTCAGTTGAGGTTATTTGCAGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400004621
PEP Infomation

pacid=37461752 transcript=PGSC0003DMT400006654 locus=PGSC0003DMG400002590 ID=PGSC0003DMT400006654.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGCKLILMLNVLFVLLGSWVFSGTASVSYDHRAIIVNGQRRILISGSVHYPRSTPEMWPG
IIQKAKEGGVDVIQTYVFWNGHEPQQGKYYFEGRYDLVKFIKLVHQAGLYVHLRVGPYAC
AEWNFGGFPVWLKYVPGISFRTNNGPFKAAMQKFTTKIVNMMKAERLYETQGGPIILSQI
ENEYGPMEWELGAPGKSYAQWAAKMAVGLDTGVPWVMCKQDDAPDPIINACNGFYCDYFS
PNKAYKPKIWTEAWTAWFTGFGNPVPYRPAEDLAFAVAKFIQKGGSFINYYMYHGGTNFG
RTAGGPFIATSYDYDAPLDEYGLLRQPKWGHLKDLHRAIKLCEPALVSGDPAVTALGHQQ
EAHVFRSKSGSCAAFLANYDQHSFATVSFANRHYNLPPWSISILPDCKNTVFNTARIGAQ
SAQMKMTPVSRGLPWQSFNEETSSYEDSSFTVVGLLEQINTTRDVSDYLWYSTDVKIDSR
EEFLRGGKWPWLTIMSAGHALHVFVNGQLAGTAYGSLEKPKLSFSKAVNLRAGVNKISLL
SIAVGLPNIGPHFETWNAGVLGPVSLSGLDEGKRDLTWQKWSYKVGLKGEALSLHSLSGS
SSVEWVEGSLVAQRQPLTWYKSTFNAPAGNDPLALDLNTMGKGQVWINGQSLGRYWPGYK
ASGNCGACNYAGWFNEKKCLSNCGEASQRMYHVPRSWLYPTGNLLVLFEESGGEPHGISL
VKREVASVCADINEWQPQLMNWQMQASGKVDKPLRPKAHLSCASGQKITSIKFASFGTPQ
GVCGSFREGSCHAFHSYDAFERYCIGQNSCSVPVTPEIFGGDPCPHVMKKLSVEVICS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400006654
Transcript Infomation

pacid=37461752 locus=PGSC0003DMG400002590 ID=PGSC0003DMT400006654.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTTGTAAGCTTATACTAATGTTGAATGTGTTGTTTGTGTTGTTGGGTTCATGGGTT
TTTTCTGGAACAGCTTCTGTTTCATATGACCATAGGGCTATTATTGTAAATGGACAGAGA
AGAATACTTATTTCTGGTTCTGTTCATTACCCAAGAAGCACTCCTGAGATGTGGCCAGGT
ATTATTCAAAAGGCTAAAGAAGGAGGTGTGGATGTGATTCAGACTTATGTTTTCTGGAAT
GGTCATGAGCCTCAACAAGGGAAATATTATTTTGAAGGGAGATATGATTTAGTGAAGTTT
ATTAAGCTGGTGCACCAAGCAGGACTTTATGTCCATCTTAGAGTTGGACCTTATGCTTGT
GCTGAATGGAATTTTGGGGGTTTTCCTGTTTGGCTCAAATATGTTCCAGGTATCAGTTTC
AGAACAAATAATGGACCTTTCAAGGCTGCAATGCAAAAATTCACTACCAAGATTGTCAAT
ATGATGAAAGCGGAACGTTTGTATGAAACTCAAGGGGGGCCAATAATTCTATCTCAGATT
GAGAATGAATATGGACCCATGGAATGGGAACTGGGAGCACCCGGTAAATCTTACGCACAG
TGGGCAGCCAAAATGGCTGTGGGTCTTGACACTGGTGTCCCATGGGTTATGTGCAAGCAA
GACGATGCTCCTGATCCTATTATAAATGCTTGCAATGGCTTCTACTGTGACTACTTTTCT
CCAAACAAGGCTTATAAACCAAAGATATGGACTGAAGCCTGGACTGCATGGTTTACTGGT
TTTGGAAATCCAGTTCCTTACCGTCCTGCTGAGGACTTGGCATTTGCTGTTGCAAAATTT
ATACAGAAGGGAGGTTCCTTCATCAATTATTACATGTATCATGGAGGAACAAACTTTGGA
CGGACTGCTGGTGGTCCATTTATTGCTACTAGTTATGACTATGATGCACCACTTGATGAA
TATGGATTATTGCGACAACCTAAATGGGGTCACCTGAAAGATCTGCATAGAGCAATAAAG
CTTTGTGAACCAGCTTTAGTCTCTGGAGATCCAGCTGTGACAGCACTTGGACACCAGCAG
GAGGCCCATGTTTTTAGGTCGAAGTCTGGCTCTTGTGCTGCATTCCTTGCAAACTATGAC
CAACACTCTTTTGCTACCGTGTCATTTGCAAACAGGCATTACAACTTGCCACCATGGTCA
ATCAGCATTCTTCCCGACTGCAAGAACACTGTATTTAATACAGCACGGATTGGTGCTCAA
AGCGCTCAGATGAAGATGACTCCAGTCAGCAGAGGATTGCCCTGGCAGTCATTCAATGAA
GAGACATCATCTTATGAAGACAGTAGTTTTACAGTTGTTGGGCTATTGGAACAGATAAAT
ACAACAAGAGATGTGTCTGATTATTTGTGGTATTCAACCGATGTCAAGATTGATTCAAGA
GAAGAGTTTTTGAGAGGCGGAAAATGGCCTTGGCTTACGATCATGTCAGCTGGCCATGCA
TTGCATGTTTTTGTGAATGGTCAATTAGCAGGAACTGCATATGGAAGTTTAGAAAAACCA
AAACTAAGTTTCAGTAAAGCTGTAAATCTGAGAGCAGGTGTTAACAAGATTTCTCTGCTG
AGCATTGCTGTTGGCCTTCCGAATATTGGCCCACATTTTGAGACATGGAATGCTGGTGTT
CTTGGTCCAGTTTCACTCAGTGGTCTTGACGAGGGGAAAAGAGATTTAACATGGCAGAAA
TGGTCTTACAAGGTTGGTCTGAAAGGAGAGGCCTTGAGCCTTCATTCACTCAGTGGTAGC
TCGTCCGTTGAATGGGTCGAGGGCTCTTTGGTGGCTCAGAGACAGCCACTCACTTGGTAC
AAGAGCACTTTCAATGCTCCAGCTGGAAATGATCCTTTGGCTTTAGACTTGAATACCATG
GGCAAAGGACAAGTGTGGATAAATGGTCAAAGCCTCGGACGCTACTGGCCTGGATATAAA
GCATCTGGTAACTGCGGTGCCTGTAACTATGCAGGCTGGTTTAATGAGAAAAAATGCCTT
AGTAACTGTGGAGAGGCTTCACAACGAATGTATCATGTTCCTCGTTCTTGGCTGTATCCT
ACTGGAAATTTGTTAGTTCTATTTGAGGAATCGGGAGGAGAGCCTCATGGAATCTCTTTG
GTAAAAAGAGAAGTTGCAAGTGTTTGTGCAGATATAAACGAATGGCAACCACAGTTGATG
AATTGGCAAATGCAAGCATCTGGTAAAGTTGACAAACCACTGAGGCCTAAAGCTCACCTC
TCGTGTGCTTCTGGTCAGAAGATTACGTCAATCAAATTTGCAAGCTTTGGAACACCACAG
GGGGTCTGCGGAAGCTTCCGTGAAGGAAGCTGCCATGCCTTCCACTCATATGATGCTTTT
GAAAGGTATTGCATTGGGCAAAACTCGTGCTCAGTACCTGTAACACCAGAGATTTTTGGA
GGTGATCCATGTCCACATGTTATGAAGAAACTCTCAGTTGAGGTTATTTGCAGTTGA