Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400006638
CDS Infomation

pacid=37462652 polypeptide=PGSC0003DMP400004609 locus=PGSC0003DMG400002582 ID=PGSC0003DMT400006638.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATTATGTAGCTGAACAAAATGTCTCAGAAGAGCAGGAACGAAACGATGGTAGTGCA
GGACATGAATTAAAGCATTCACTCGATGATTCTTCTGCAGGAAAGCTTTTCGTCGGAGGC
ATTGCTTGGGAGACCAGAGAAGAATCTTTTAGGAAGTATTTCAGCAGGTTTGGAGAGATA
ACAGATTGTGTAATAATGATGGATAAGGTCTCTGGAAGGCCACGGGGATTTGGCTTTGTA
ACATTTGCGGACCCAGAAGCTGCAAATAAGGTTTTAGAGGAAGAGCACATCATAGACGGT
AGAACGGTGGAAGTGAAGAGGACAGTACCTAAGGAGGACATGCAAGTTAAAGGATCTCCG
AAAACAAAGAAAATTTTTGTCGGCGGTCTTCCATTAACTTTAACTGAAGATGAGTTGAAG
GAATATTTTTCTTCTTATGGCCATGTTCTGGAGCAACAAATCATGCTGGACCGTGAGAGT
GGTCGATCCCGAGGCTTTGGCTTCATTACTTTTGATAGTGAAAATGCCGTTGAAAAAGTT
TTAAACAATGGCCGTATGCATGAAATCCATGGCAAACAAGTTGAAATTAAGAGGGCTGAG
CCAAAAAGAGCTGGTGCTGAAAATGCAATTGAGAGCAGGCAGCATCGTGGTGGCAGTGGT
TCGAGATCGTATAATAACTTTGGTGGGTCTGAAGGAGGGTATGGTGGTGGATACGGTAGA
GGGTATGGTGGATATGGAGGCTATGGCGGTGGCACTGGTTATGGTGGTGGCGGCGGCGGC
GCCGCTGGTTATGGCGGTGCCGGCGCTGGCGCTGGCTATGGTGGTTATGGAAACATTGGA
GGAAGTTATGGCGGAGGTGGTGCAGGATATTTCTCTGGATATGGTGGATATGGTTATGGA
TTTGGGTTTAGTGGACCTATGTATGGGGCAGCTGGATACGGAGGCACTAGCTATGGTGCT
CCTGGTAGCTATGGTGGTGCTGCTGGGTATGCTAGCGGTAGAGGATACACAAGCAGTGAT
GATGGTAGCTGGTATGGTGGGGCTAGAAGCTCTGCATCTTTCAATGCTAAAGGGTATGAC
ACCGGGGGTAGCACTGGAGGTGCTAAAGCATATGGTAATGGTGGTGCTGCAGGTGGAAGG
TTTCATCCTTACAGGAATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400004609
PEP Infomation

pacid=37462652 transcript=PGSC0003DMT400006638 locus=PGSC0003DMG400002582 ID=PGSC0003DMT400006638.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDYVAEQNVSEEQERNDGSAGHELKHSLDDSSAGKLFVGGIAWETREESFRKYFSRFGEI
TDCVIMMDKVSGRPRGFGFVTFADPEAANKVLEEEHIIDGRTVEVKRTVPKEDMQVKGSP
KTKKIFVGGLPLTLTEDELKEYFSSYGHVLEQQIMLDRESGRSRGFGFITFDSENAVEKV
LNNGRMHEIHGKQVEIKRAEPKRAGAENAIESRQHRGGSGSRSYNNFGGSEGGYGGGYGR
GYGGYGGYGGGTGYGGGGGGAAGYGGAGAGAGYGGYGNIGGSYGGGGAGYFSGYGGYGYG
FGFSGPMYGAAGYGGTSYGAPGSYGGAAGYASGRGYTSSDDGSWYGGARSSASFNAKGYD
TGGSTGGAKAYGNGGAAGGRFHPYRN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400006638
Transcript Infomation

pacid=37462652 locus=PGSC0003DMG400002582 ID=PGSC0003DMT400006638.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATTATGTAGCTGAACAAAATGTCTCAGAAGAGCAGGAACGAAACGATGGTAGTGCA
GGACATGAATTAAAGCATTCACTCGATGATTCTTCTGCAGGAAAGCTTTTCGTCGGAGGC
ATTGCTTGGGAGACCAGAGAAGAATCTTTTAGGAAGTATTTCAGCAGGTTTGGAGAGATA
ACAGATTGTGTAATAATGATGGATAAGGTCTCTGGAAGGCCACGGGGATTTGGCTTTGTA
ACATTTGCGGACCCAGAAGCTGCAAATAAGGTTTTAGAGGAAGAGCACATCATAGACGGT
AGAACGGTGGAAGTGAAGAGGACAGTACCTAAGGAGGACATGCAAGTTAAAGGATCTCCG
AAAACAAAGAAAATTTTTGTCGGCGGTCTTCCATTAACTTTAACTGAAGATGAGTTGAAG
GAATATTTTTCTTCTTATGGCCATGTTCTGGAGCAACAAATCATGCTGGACCGTGAGAGT
GGTCGATCCCGAGGCTTTGGCTTCATTACTTTTGATAGTGAAAATGCCGTTGAAAAAGTT
TTAAACAATGGCCGTATGCATGAAATCCATGGCAAACAAGTTGAAATTAAGAGGGCTGAG
CCAAAAAGAGCTGGTGCTGAAAATGCAATTGAGAGCAGGCAGCATCGTGGTGGCAGTGGT
TCGAGATCGTATAATAACTTTGGTGGGTCTGAAGGAGGGTATGGTGGTGGATACGGTAGA
GGGTATGGTGGATATGGAGGCTATGGCGGTGGCACTGGTTATGGTGGTGGCGGCGGCGGC
GCCGCTGGTTATGGCGGTGCCGGCGCTGGCGCTGGCTATGGTGGTTATGGAAACATTGGA
GGAAGTTATGGCGGAGGTGGTGCAGGATATTTCTCTGGATATGGTGGATATGGTTATGGA
TTTGGGTTTAGTGGACCTATGTATGGGGCAGCTGGATACGGAGGCACTAGCTATGGTGCT
CCTGGTAGCTATGGTGGTGCTGCTGGGTATGCTAGCGGTAGAGGATACACAAGCAGTGAT
GATGGTAGCTGGTATGGTGGGGCTAGAAGCTCTGCATCTTTCAATGCTAAAGGGTATGAC
ACCGGGGGTAGCACTGGAGGTGCTAAAGCATATGGTAATGGTGGTGCTGCAGGTGGAAGG
TTTCATCCTTACAGGAATTGA