Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400006474
CDS Infomation

pacid=37463910 polypeptide=PGSC0003DMP400004477 locus=PGSC0003DMG400002525 ID=PGSC0003DMT400006474.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAGAAAGTGACGGTGGGAGCCGCCGTGGTTGGTGCAGCTGCGGTGTGTGCAGTGGCG
GCGTTAATAGTGAACCACCGGATGCGGAAATCTAGTAAATGGGGTCGTGCTATGGCTATT
CTTCGTGAATTTGAGGAAAAGTGTAAGACTCAAGATGCAAAGCTTAAGCAAGTTGCTGAT
GCTATGACTGTTGAGATGCACGCCGGACTTGCTTCTGAAGGCGGCAGCAAGCTCAAGATG
CTTATCACCTATGTCGATAATCTCCCAACTGGTGATGAAGCTGGCGTCTTTTATGCATTG
GATCTTGGTGGAACAAATTTTCGAGTATTGCGTGTGCAATTGGGTGGAAAAGATGGTGGT
ATTATTCATCAAGAATTTGCTGAGGCATCAATTCCTCCAAGTTTGATGGTTGGGACTTCA
GATGCACTTTTTGATTATATTGCGGCTGAGCTTGCAAAATTTGTTGCTGCGGAAGAGGAA
AAATTTCATCAACCTCCTGGTAAGCAGAGAGAACTAGGTTTCACCTTCTCATTCCCAGTA
ATGCAGACTTCAATCAACTCTGGGACTATTATGCGGTGGACAAAAGGCTTCTCTATTGAT
GATGCGGTTGGCCAAGATGTTGTTGGAGAACTCACAAAAGCTATGAAAAGAAAAGGTGTC
GATATGCGGGTCTCAGCTCTGGTGAATGATACTGTTGGAACATTAGCTGGTGGTAAATAT
ACACAAAAGGATGTAGCTGTTGCTGTTATCTTAGGTACAGGGACCAATGCAGCTTATGTG
GAACGGGTGCAGGCAATTCCAAAGTGGCATGGTCCTGTGCCAAAATCTGGTGAAATGGTT
ATCAATATGGAATGGGGTAATTTTAGGTCATCCCATCTGCCCTTGACAGAGTATGATCAT
GCGTTGGATAACGAGAGTTTAAATCCTGGTGAACAGATATTTGAGAAGATGACTTCTGGC
ATGTACTTGGGAGAAATTTTACGCAGAGTTCTACTCAGGGTGGCTGAAGAAGCTGGCGTT
TTTGGTGATGAGGTCCCTCCGAAGCTCAAGGATTCATTTGTGTTAAGGACACCTGATATG
TCTGCTATGCATCATGACACATCCCCTGATCTGAAAGTGGTTGGTGAAAAGCTGAAGGAT
ATTTTAGAGATATCTAATACCTCCTTGAAGACAAGGAAATTAGTGGTTGAGCTGTGCAAT
ATCGTTGCAACACGTGGGGCAAGACTTGCAGCTGCAGGGGTATTGGGCATCTTGAAAAAG
ATGGGAAGAGATACGCCTAAGCAGGGTGGTTCAGAAAGGACGGTTATAGCCATGGATGGC
GGGTTGTATGAGCACTATACAGAATATAGAATGTGTTTAGAGAACTCTTTGAAGGACTTG
CTCGGAGAGGAATTGGCAACGAGCATCGTTTTTGTGCACTCCAATGATGGTTCTGGCATT
GGTGCTGCTCTTCTTGCTGCCTCTCATTCAATGTACCTTGAAGATCAAGCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400004477
PEP Infomation

pacid=37463910 transcript=PGSC0003DMT400006474 locus=PGSC0003DMG400002525 ID=PGSC0003DMT400006474.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MKKVTVGAAVVGAAAVCAVAALIVNHRMRKSSKWGRAMAILREFEEKCKTQDAKLKQVAD
AMTVEMHAGLASEGGSKLKMLITYVDNLPTGDEAGVFYALDLGGTNFRVLRVQLGGKDGG
IIHQEFAEASIPPSLMVGTSDALFDYIAAELAKFVAAEEEKFHQPPGKQRELGFTFSFPV
MQTSINSGTIMRWTKGFSIDDAVGQDVVGELTKAMKRKGVDMRVSALVNDTVGTLAGGKY
TQKDVAVAVILGTGTNAAYVERVQAIPKWHGPVPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEYDH
ALDNESLNPGEQIFEKMTSGMYLGEILRRVLLRVAEEAGVFGDEVPPKLKDSFVLRTPDM
SAMHHDTSPDLKVVGEKLKDILEISNTSLKTRKLVVELCNIVATRGARLAAAGVLGILKK
MGRDTPKQGGSERTVIAMDGGLYEHYTEYRMCLENSLKDLLGEELATSIVFVHSNDGSGI
GAALLAASHSMYLEDQA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400006474
Transcript Infomation

pacid=37463910 locus=PGSC0003DMG400002525 ID=PGSC0003DMT400006474.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAGAAAGTGACGGTGGGAGCCGCCGTGGTTGGTGCAGCTGCGGTGTGTGCAGTGGCG
GCGTTAATAGTGAACCACCGGATGCGGAAATCTAGTAAATGGGGTCGTGCTATGGCTATT
CTTCGTGAATTTGAGGAAAAGTGTAAGACTCAAGATGCAAAGCTTAAGCAAGTTGCTGAT
GCTATGACTGTTGAGATGCACGCCGGACTTGCTTCTGAAGGCGGCAGCAAGCTCAAGATG
CTTATCACCTATGTCGATAATCTCCCAACTGGTGATGAAGCTGGCGTCTTTTATGCATTG
GATCTTGGTGGAACAAATTTTCGAGTATTGCGTGTGCAATTGGGTGGAAAAGATGGTGGT
ATTATTCATCAAGAATTTGCTGAGGCATCAATTCCTCCAAGTTTGATGGTTGGGACTTCA
GATGCACTTTTTGATTATATTGCGGCTGAGCTTGCAAAATTTGTTGCTGCGGAAGAGGAA
AAATTTCATCAACCTCCTGGTAAGCAGAGAGAACTAGGTTTCACCTTCTCATTCCCAGTA
ATGCAGACTTCAATCAACTCTGGGACTATTATGCGGTGGACAAAAGGCTTCTCTATTGAT
GATGCGGTTGGCCAAGATGTTGTTGGAGAACTCACAAAAGCTATGAAAAGAAAAGGTGTC
GATATGCGGGTCTCAGCTCTGGTGAATGATACTGTTGGAACATTAGCTGGTGGTAAATAT
ACACAAAAGGATGTAGCTGTTGCTGTTATCTTAGGTACAGGGACCAATGCAGCTTATGTG
GAACGGGTGCAGGCAATTCCAAAGTGGCATGGTCCTGTGCCAAAATCTGGTGAAATGGTT
ATCAATATGGAATGGGGTAATTTTAGGTCATCCCATCTGCCCTTGACAGAGTATGATCAT
GCGTTGGATAACGAGAGTTTAAATCCTGGTGAACAGATATTTGAGAAGATGACTTCTGGC
ATGTACTTGGGAGAAATTTTACGCAGAGTTCTACTCAGGGTGGCTGAAGAAGCTGGCGTT
TTTGGTGATGAGGTCCCTCCGAAGCTCAAGGATTCATTTGTGTTAAGGACACCTGATATG
TCTGCTATGCATCATGACACATCCCCTGATCTGAAAGTGGTTGGTGAAAAGCTGAAGGAT
ATTTTAGAGATATCTAATACCTCCTTGAAGACAAGGAAATTAGTGGTTGAGCTGTGCAAT
ATCGTTGCAACACGTGGGGCAAGACTTGCAGCTGCAGGGGTATTGGGCATCTTGAAAAAG
ATGGGAAGAGATACGCCTAAGCAGGGTGGTTCAGAAAGGACGGTTATAGCCATGGATGGC
GGGTTGTATGAGCACTATACAGAATATAGAATGTGTTTAGAGAACTCTTTGAAGGACTTG
CTCGGAGAGGAATTGGCAACGAGCATCGTTTTTGTGCACTCCAATGATGGTTCTGGCATT
GGTGCTGCTCTTCTTGCTGCCTCTCATTCAATGTACCTTGAAGATCAAGCTTAG