Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400006166
CDS Infomation	pacid=37468772 polypeptide=PGSC0003DMP400004272 locus=PGSC0003DMG402002397 ID=PGSC0003DMT400006166.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGGTTGTTGTATATCTCAGTTGGCAGCAAAATTTGCTTTCTTTCCTCCATCACCAGCT ACATACCAAGTCAAGAAAAAGGATGATGGAAGACTTGTTGCTGTTTCTACTACATCTTCT ATGCCTATTTCTGGTGCTGCTGATGATCTTTCTCTTGATGTGCTCTTGGTTGACACCAAA AGGGGCAACAAGATTGTAGCTTTTTACTTGAAAAATCCATATGCTAAACTTACTGTGCTT TACTCACACGGCAATGCTGCTGATCTGGGACAGCTATATGACTTGTTTGTTCAGCTTAAA GCTAATCTCAGAGTCAACCTTATGGGATATGACTATTCTGGCTATGGAGCATCTACAGGA AAGCCAAGCGAATTTGATACATACGCGGACATAGAAGCGGTCTATGACTGCCTTCAAACA GAGTATGGAATTAGCCAGGAAGATTTGATTCTCTATGGACAATCTGTTGGAAGTGGCCCA ACATTACATTTGGCAGCTAAATTACCACGTTTGAGAGGTGTGGTTCTGCACAGTGGCATT CTTTCTGGCCTTCGTGTGCTTTGCCATGCAAACTTCACTTTTTGCTTTGACATTTATAAG AATTTAAACAAGATTCAGAAGGTGAAAAGCCCTGTGCTTGTTATACATGGCACAGAGGAT GATGTGGTCAATTGGCTACACGGTAATGGACTTTGGAAAATGTCGAGGGATCCATATGAG CCCTTATGGATCAAAGGAGGCGGCCACTGCAACTTGGAACTTTACCCGGATTACATCCGC CACCTTTGCAGGTTTATCCAAGAAATGGAGTGCATGACCACTGAAATCAGGCTGAAAAAG ATCAAGCAAACGCTACGTCTGCCCAAGAGATCAGACACCACCATTTCTACCAACTGCTGT TGTCAAGTCAAATGCAGACTACCTAATTGTCTAAATTGCTCAAAAGTGAGCTGCACAAAA TGTTGCTATTGGCCCAAATTCCCTAAATGGAAACCAAAATGCTTGGTATGTTGGAAACCT AGTTGCCTCGGATGTTCATGCACGTTACCAAAATGTTCATGCGCGTGCCCAGAATGTTCA TGTGCATGCCCAAAATGTTCATTTACGTGCCCAAAATGTTCGTGCACATGTCCAAAATGC TGTTGTTGGAGCGTAAAATGTTCGTGTTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400004272
PEP Infomation	pacid=37468772 transcript=PGSC0003DMT400006166 locus=PGSC0003DMG402002397 ID=PGSC0003DMT400006166.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MGCCISQLAAKFAFFPPSPATYQVKKKDDGRLVAVSTTSSMPISGAADDLSLDVLLVDTK RGNKIVAFYLKNPYAKLTVLYSHGNAADLGQLYDLFVQLKANLRVNLMGYDYSGYGASTG KPSEFDTYADIEAVYDCLQTEYGISQEDLILYGQSVGSGPTLHLAAKLPRLRGVVLHSGI LSGLRVLCHANFTFCFDIYKNLNKIQKVKSPVLVIHGTEDDVVNWLHGNGLWKMSRDPYE PLWIKGGGHCNLELYPDYIRHLCRFIQEMECMTTEIRLKKIKQTLRLPKRSDTTISTNCC CQVKCRLPNCLNCSKVSCTKCCYWPKFPKWKPKCLVCWKPSCLGCSCTLPKCSCACPECS CACPKCSFTCPKCSCTCPKCCCWSVKCSCW*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400006166
Transcript Infomation	pacid=37468772 locus=PGSC0003DMG402002397 ID=PGSC0003DMT400006166.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGGTTGTTGTATATCTCAGTTGGCAGCAAAATTTGCTTTCTTTCCTCCATCACCAGCT ACATACCAAGTCAAGAAAAAGGATGATGGAAGACTTGTTGCTGTTTCTACTACATCTTCT ATGCCTATTTCTGGTGCTGCTGATGATCTTTCTCTTGATGTGCTCTTGGTTGACACCAAA AGGGGCAACAAGATTGTAGCTTTTTACTTGAAAAATCCATATGCTAAACTTACTGTGCTT TACTCACACGGCAATGCTGCTGATCTGGGACAGCTATATGACTTGTTTGTTCAGCTTAAA GCTAATCTCAGAGTCAACCTTATGGGATATGACTATTCTGGCTATGGAGCATCTACAGGA AAGCCAAGCGAATTTGATACATACGCGGACATAGAAGCGGTCTATGACTGCCTTCAAACA GAGTATGGAATTAGCCAGGAAGATTTGATTCTCTATGGACAATCTGTTGGAAGTGGCCCA ACATTACATTTGGCAGCTAAATTACCACGTTTGAGAGGTGTGGTTCTGCACAGTGGCATT CTTTCTGGCCTTCGTGTGCTTTGCCATGCAAACTTCACTTTTTGCTTTGACATTTATAAG AATTTAAACAAGATTCAGAAGGTGAAAAGCCCTGTGCTTGTTATACATGGCACAGAGGAT GATGTGGTCAATTGGCTACACGGTAATGGACTTTGGAAAATGTCGAGGGATCCATATGAG CCCTTATGGATCAAAGGAGGCGGCCACTGCAACTTGGAACTTTACCCGGATTACATCCGC CACCTTTGCAGGTTTATCCAAGAAATGGAGTGCATGACCACTGAAATCAGGCTGAAAAAG ATCAAGCAAACGCTACGTCTGCCCAAGAGATCAGACACCACCATTTCTACCAACTGCTGT TGTCAAGTCAAATGCAGACTACCTAATTGTCTAAATTGCTCAAAAGTGAGCTGCACAAAA TGTTGCTATTGGCCCAAATTCCCTAAATGGAAACCAAAATGCTTGGTATGTTGGAAACCT AGTTGCCTCGGATGTTCATGCACGTTACCAAAATGTTCATGCGCGTGCCCAGAATGTTCA TGTGCATGCCCAAAATGTTCATTTACGTGCCCAAAATGTTCGTGCACATGTCCAAAATGC TGTTGTTGGAGCGTAAAATGTTCGTGTTGGTGA