Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400006162
CDS Infomation

pacid=37468191 polypeptide=PGSC0003DMP400004269 locus=PGSC0003DMG400002396 ID=PGSC0003DMT400006162.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACTTCAAGATCCTTTAAAGCCTCTGATTCCCAACAGGGCAAGCATTCTGGTGTCACC
TTTGCAAGGAGGACCTCATCGGGTCGGTATGTGAACTTATCGAGGGAATCTCTGGATAGT
GAGATTAGTGGCATTGAATTTGCAAACTACACAGTGCATATCCCTCCAACCCCTGATAAT
CAACCTATGGATCCTTCAATTTCTCAAAGGGTGGAAGAGCAGTATGTGTCAAATTCCTTG
TTTACTGGTGGTTATAACAGTGTAACTCGTGCTCACTTGATGGATAAGGTAATTGAATCA
GAAACTAACCATCCTCAGATGGCTGGTGCTAAAGGTTCTTCTTGTGCTATACCGGGTTGT
GATGGTAAAGTCATGAGTGATGAAAGGGGTGAAGATATTCTTCCTTGTGAGTGTGATTTT
AAAATTTGCCGGGATTGTTATGTTGATGCTGTCAAAACTGGTGATGGGATATGTCCTGGT
TGTAAAGAGCCTTACAAGAGCACTGATTTGGCTGAGAATGCTGTAGATCCTTCTGGACGG
CCTCTGACTTTACCTTCAAATGTTAGTATGTCTAAAATGGAAAGGAGGCTGTCGTTGATG
CGATCAGGTAATAAATCAGCGATAATAAGAAGTCACTCAGGGTTGATGAGGAGTCAGACA
GGGGATTTTGATCACAATAAATGGTTATTTGAGACAAAAGGGACGTATGGCTATGGAAAT
GCTATATGGCCAAAGGATGGGGGGATTGGAAATGACAAAGAAGATCAAGGTGGTGAGCCT
TCTGAACTTCTGAACAAGCCTTGGAGGCCGCTTACACGTAAACTGAAGATACCCGCTGGA
GTTATTAGCCCATACCGGCTCTTGATTCTTATTCGCGTAGTTGTTCTTGGACTATTTCTT
CAATGGAGGATTACCAATCCGAACAATGATGCTATATGGTTATGGTATATGTCCATAATC
TGTGAGGTTTGGTTTGCAATCTCTTGGCTGCTTGACCAGCTTCCAAAGTTATGCCCCGTT
AACCGTGCTACCGATCTTAATGTCTTGAAAGAAAAATTTGAAACACCAACCCCTACCAAT
CCCACAGGAAAATCTGATCTTCCAGGCATAGACATATTTGTCTCTACTGCAGATCCTGAG
AAAGAGCCACCGCTGGTCACTGCAAACACGATTCTATCTATCCTTGCTGCTAATTACCCC
GTTGAAAAGCTTTCGTGCTATATTTCTGATGATGGAGGTGCTCTTCTGACATTTGAAGCA
ATGGCAGAAGCTGCAAGTTTTGCCAACATTTGGGTTCCATTTTGTCGTAAACATATTATT
GAACCAAGGAACCCAGAAACCTACTTCAGCTTGAAGAAAGACCCTTACAAGAATAAAGTA
CGTCAAGATTTTGTTAAGGACCGCAGACGGGTGAAACGTGAATATGATGAATTTAAGGTT
CGAATTAATAGCCTCCCTGATTCAATTCGTCGGCGTTCTGATGCCTACAACGCTCGAGAA
GAAATCAAGGCCATGAAACTTCAGCGAGAGGCAGCTGGGGATGATCTTTTGGAACCCATT
AAGATAACTAAGGCCACTTGGATGGCAGATGGAACCCACTGGCCTGGTACTTGGATGATT
TCTGCTCCCGAGCACTCTAGGGGTGATCACGCAGGAATCATACAGGTTATGTTAAAACCC
CCAAGTGATGAACCCTTACATGGAACCTCTTCTGATGACGGTCTAATTGATTCAACAGAA
GTTGATATTCGTCTCCCCTTGCTGGTGTATGTCTCTCGTGAAAAGCGTCCTGGCTATGAT
CATAACAAAAAGGCTGGAGCCATGAATGCCTTGGTCCGAGCCTCTGCCATTATGTCTAAT
GGCCCCTTTATCCTCAACCTTGATTGTGATCACTACATCTACAACTCCGAGGCAATCAGG
GAGGGAATGTGTTTTATGATGGACCGCGGTGGAGATAGGATCTGTTATGTTCAGTTTCCT
CAACGTTTTGAGGGAATTGATCCTTCTGACCGTTATGCAAACCACAATACTGTTTTCTTT
GATGTCAACATGCGTGCCCTTGATGGCCTTCAAGGTCCAATGTATGTTGGGACTGGTTGT
CTCTTCCGGAGGACTGCTCTTTATGGTTTTGACCCACCACGAAACAAGGAATACCACCCT
GGTTGCTGCAGCTGTTGTTTTGGTCGGCGCAAGAATAATGCCACTGTGTCTTCTGTCTCT
GATGACAACAGGGCGCTTCGAATGGGGGATTTTGATGACGAGGAGATGAATCTTGCTTCC
TTTCCTAAAAGGTTTGGTAACTCAAGTTTCCTCATTGATTCCATTCCAGTTGCAGAATTC
CAAGGTAGACCACTTGCTGATCACCCTGCAGTAAAGAATGGACGACCGCCTGGTGCTCTA
ACTATTCCAAGGGAACTTCTTGATGCCTCCACTGTTGCTGAAGCGATCAGTGTCATTTCG
TGCTGGTACGAGGACAAAACTGAATGGGGTAATAGAGTTGGATGGATTTATGGGTCTGTT
ACTGAAGATGTGGTGACGGGGTATAGGATGCATAATAGAGGTTGGAGATCTATTTACTGT
GTGACAAAGAGAGATGCATTCCGTGGCACTGCCCCAATCAATCTGACTGACAGGCTTCAC
CAAGTGCTTCGATGGGCTACTGGTTCTGTTGAAATCTTCTTCTCTCGCAACAATGCTTTT
TTGGCTAGTCCTAAGATGAAAATTTTGCAGCGGATTGCCTACCTCAATTGTGGCATCTAC
CCTTTCACCTCAATATTCCTAATTGTATACTGCTTCCTCCCAGCACTTTCACTATTCTCT
GGTCAGTTCATCGTCCAGTCCCTGAACGTCACCTTCCTCACATATCTCCTGGTGATCACA
TTGACTCTCTGTGCACTCGCAGTGCTTGAGATCAAGTGGTCCGGCATTGCCCTGGAAGAG
TGGTGGCGTAATGAGCAATTTTGGTTAATTGGAGGCACAAGTGCCCATCTTGCTGCTGTG
CTTCAGGGGCTGTTAAAAGTGATTGCTGGCATTGAAATTTCATTTACACTGACATCAAAA
TCAGCCACTGATGATGATGATGAATTTGCTGATCTCTATATCATCAAATGGAGTTCCCTG
ATGATCCCACCTATTGTTATCATGATGACCAACTTGATCGCGATAGCTGTTGGTGTAAGC
CGGACAATATACAGCACAATACCACAATGGAGCCGTTTGCTCGGAGGGGTTTTCTTCAGT
TTTTGGGTCCTTGCTCATCTCTATCCTTTCGCAAAGGGACTGATGGGAAGACGCGGAAGG
ACACCAACCATCGTATTTGTCTGGTCAGGACTTATCGCCATCACCATTTCGCTCCTGTGG
GTTGCGATTAACCCCCCTGCTGGTGCCAGTGAAATTGGAGGGTCATTCCAGTTCCCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400004269
PEP Infomation

pacid=37468191 transcript=PGSC0003DMT400006162 locus=PGSC0003DMG400002396 ID=PGSC0003DMT400006162.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MTSRSFKASDSQQGKHSGVTFARRTSSGRYVNLSRESLDSEISGIEFANYTVHIPPTPDN
QPMDPSISQRVEEQYVSNSLFTGGYNSVTRAHLMDKVIESETNHPQMAGAKGSSCAIPGC
DGKVMSDERGEDILPCECDFKICRDCYVDAVKTGDGICPGCKEPYKSTDLAENAVDPSGR
PLTLPSNVSMSKMERRLSLMRSGNKSAIIRSHSGLMRSQTGDFDHNKWLFETKGTYGYGN
AIWPKDGGIGNDKEDQGGEPSELLNKPWRPLTRKLKIPAGVISPYRLLILIRVVVLGLFL
QWRITNPNNDAIWLWYMSIICEVWFAISWLLDQLPKLCPVNRATDLNVLKEKFETPTPTN
PTGKSDLPGIDIFVSTADPEKEPPLVTANTILSILAANYPVEKLSCYISDDGGALLTFEA
MAEAASFANIWVPFCRKHIIEPRNPETYFSLKKDPYKNKVRQDFVKDRRRVKREYDEFKV
RINSLPDSIRRRSDAYNAREEIKAMKLQREAAGDDLLEPIKITKATWMADGTHWPGTWMI
SAPEHSRGDHAGIIQVMLKPPSDEPLHGTSSDDGLIDSTEVDIRLPLLVYVSREKRPGYD
HNKKAGAMNALVRASAIMSNGPFILNLDCDHYIYNSEAIREGMCFMMDRGGDRICYVQFP
QRFEGIDPSDRYANHNTVFFDVNMRALDGLQGPMYVGTGCLFRRTALYGFDPPRNKEYHP
GCCSCCFGRRKNNATVSSVSDDNRALRMGDFDDEEMNLASFPKRFGNSSFLIDSIPVAEF
QGRPLADHPAVKNGRPPGALTIPRELLDASTVAEAISVISCWYEDKTEWGNRVGWIYGSV
TEDVVTGYRMHNRGWRSIYCVTKRDAFRGTAPINLTDRLHQVLRWATGSVEIFFSRNNAF
LASPKMKILQRIAYLNCGIYPFTSIFLIVYCFLPALSLFSGQFIVQSLNVTFLTYLLVIT
LTLCALAVLEIKWSGIALEEWWRNEQFWLIGGTSAHLAAVLQGLLKVIAGIEISFTLTSK
SATDDDDEFADLYIIKWSSLMIPPIVIMMTNLIAIAVGVSRTIYSTIPQWSRLLGGVFFS
FWVLAHLYPFAKGLMGRRGRTPTIVFVWSGLIAITISLLWVAINPPAGASEIGGSFQFP*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400006162
Transcript Infomation

pacid=37468191 locus=PGSC0003DMG400002396 ID=PGSC0003DMT400006162.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACTTCAAGATCCTTTAAAGCCTCTGATTCCCAACAGGGCAAGCATTCTGGTGTCACC
TTTGCAAGGAGGACCTCATCGGGTCGGTATGTGAACTTATCGAGGGAATCTCTGGATAGT
GAGATTAGTGGCATTGAATTTGCAAACTACACAGTGCATATCCCTCCAACCCCTGATAAT
CAACCTATGGATCCTTCAATTTCTCAAAGGGTGGAAGAGCAGTATGTGTCAAATTCCTTG
TTTACTGGTGGTTATAACAGTGTAACTCGTGCTCACTTGATGGATAAGGTAATTGAATCA
GAAACTAACCATCCTCAGATGGCTGGTGCTAAAGGTTCTTCTTGTGCTATACCGGGTTGT
GATGGTAAAGTCATGAGTGATGAAAGGGGTGAAGATATTCTTCCTTGTGAGTGTGATTTT
AAAATTTGCCGGGATTGTTATGTTGATGCTGTCAAAACTGGTGATGGGATATGTCCTGGT
TGTAAAGAGCCTTACAAGAGCACTGATTTGGCTGAGAATGCTGTAGATCCTTCTGGACGG
CCTCTGACTTTACCTTCAAATGTTAGTATGTCTAAAATGGAAAGGAGGCTGTCGTTGATG
CGATCAGGTAATAAATCAGCGATAATAAGAAGTCACTCAGGGTTGATGAGGAGTCAGACA
GGGGATTTTGATCACAATAAATGGTTATTTGAGACAAAAGGGACGTATGGCTATGGAAAT
GCTATATGGCCAAAGGATGGGGGGATTGGAAATGACAAAGAAGATCAAGGTGGTGAGCCT
TCTGAACTTCTGAACAAGCCTTGGAGGCCGCTTACACGTAAACTGAAGATACCCGCTGGA
GTTATTAGCCCATACCGGCTCTTGATTCTTATTCGCGTAGTTGTTCTTGGACTATTTCTT
CAATGGAGGATTACCAATCCGAACAATGATGCTATATGGTTATGGTATATGTCCATAATC
TGTGAGGTTTGGTTTGCAATCTCTTGGCTGCTTGACCAGCTTCCAAAGTTATGCCCCGTT
AACCGTGCTACCGATCTTAATGTCTTGAAAGAAAAATTTGAAACACCAACCCCTACCAAT
CCCACAGGAAAATCTGATCTTCCAGGCATAGACATATTTGTCTCTACTGCAGATCCTGAG
AAAGAGCCACCGCTGGTCACTGCAAACACGATTCTATCTATCCTTGCTGCTAATTACCCC
GTTGAAAAGCTTTCGTGCTATATTTCTGATGATGGAGGTGCTCTTCTGACATTTGAAGCA
ATGGCAGAAGCTGCAAGTTTTGCCAACATTTGGGTTCCATTTTGTCGTAAACATATTATT
GAACCAAGGAACCCAGAAACCTACTTCAGCTTGAAGAAAGACCCTTACAAGAATAAAGTA
CGTCAAGATTTTGTTAAGGACCGCAGACGGGTGAAACGTGAATATGATGAATTTAAGGTT
CGAATTAATAGCCTCCCTGATTCAATTCGTCGGCGTTCTGATGCCTACAACGCTCGAGAA
GAAATCAAGGCCATGAAACTTCAGCGAGAGGCAGCTGGGGATGATCTTTTGGAACCCATT
AAGATAACTAAGGCCACTTGGATGGCAGATGGAACCCACTGGCCTGGTACTTGGATGATT
TCTGCTCCCGAGCACTCTAGGGGTGATCACGCAGGAATCATACAGGTTATGTTAAAACCC
CCAAGTGATGAACCCTTACATGGAACCTCTTCTGATGACGGTCTAATTGATTCAACAGAA
GTTGATATTCGTCTCCCCTTGCTGGTGTATGTCTCTCGTGAAAAGCGTCCTGGCTATGAT
CATAACAAAAAGGCTGGAGCCATGAATGCCTTGGTCCGAGCCTCTGCCATTATGTCTAAT
GGCCCCTTTATCCTCAACCTTGATTGTGATCACTACATCTACAACTCCGAGGCAATCAGG
GAGGGAATGTGTTTTATGATGGACCGCGGTGGAGATAGGATCTGTTATGTTCAGTTTCCT
CAACGTTTTGAGGGAATTGATCCTTCTGACCGTTATGCAAACCACAATACTGTTTTCTTT
GATGTCAACATGCGTGCCCTTGATGGCCTTCAAGGTCCAATGTATGTTGGGACTGGTTGT
CTCTTCCGGAGGACTGCTCTTTATGGTTTTGACCCACCACGAAACAAGGAATACCACCCT
GGTTGCTGCAGCTGTTGTTTTGGTCGGCGCAAGAATAATGCCACTGTGTCTTCTGTCTCT
GATGACAACAGGGCGCTTCGAATGGGGGATTTTGATGACGAGGAGATGAATCTTGCTTCC
TTTCCTAAAAGGTTTGGTAACTCAAGTTTCCTCATTGATTCCATTCCAGTTGCAGAATTC
CAAGGTAGACCACTTGCTGATCACCCTGCAGTAAAGAATGGACGACCGCCTGGTGCTCTA
ACTATTCCAAGGGAACTTCTTGATGCCTCCACTGTTGCTGAAGCGATCAGTGTCATTTCG
TGCTGGTACGAGGACAAAACTGAATGGGGTAATAGAGTTGGATGGATTTATGGGTCTGTT
ACTGAAGATGTGGTGACGGGGTATAGGATGCATAATAGAGGTTGGAGATCTATTTACTGT
GTGACAAAGAGAGATGCATTCCGTGGCACTGCCCCAATCAATCTGACTGACAGGCTTCAC
CAAGTGCTTCGATGGGCTACTGGTTCTGTTGAAATCTTCTTCTCTCGCAACAATGCTTTT
TTGGCTAGTCCTAAGATGAAAATTTTGCAGCGGATTGCCTACCTCAATTGTGGCATCTAC
CCTTTCACCTCAATATTCCTAATTGTATACTGCTTCCTCCCAGCACTTTCACTATTCTCT
GGTCAGTTCATCGTCCAGTCCCTGAACGTCACCTTCCTCACATATCTCCTGGTGATCACA
TTGACTCTCTGTGCACTCGCAGTGCTTGAGATCAAGTGGTCCGGCATTGCCCTGGAAGAG
TGGTGGCGTAATGAGCAATTTTGGTTAATTGGAGGCACAAGTGCCCATCTTGCTGCTGTG
CTTCAGGGGCTGTTAAAAGTGATTGCTGGCATTGAAATTTCATTTACACTGACATCAAAA
TCAGCCACTGATGATGATGATGAATTTGCTGATCTCTATATCATCAAATGGAGTTCCCTG
ATGATCCCACCTATTGTTATCATGATGACCAACTTGATCGCGATAGCTGTTGGTGTAAGC
CGGACAATATACAGCACAATACCACAATGGAGCCGTTTGCTCGGAGGGGTTTTCTTCAGT
TTTTGGGTCCTTGCTCATCTCTATCCTTTCGCAAAGGGACTGATGGGAAGACGCGGAAGG
ACACCAACCATCGTATTTGTCTGGTCAGGACTTATCGCCATCACCATTTCGCTCCTGTGG
GTTGCGATTAACCCCCCTGCTGGTGCCAGTGAAATTGGAGGGTCATTCCAGTTCCCTTGA