Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400005841
CDS Infomation

pacid=37471284 polypeptide=PGSC0003DMP400004056 locus=PGSC0003DMG400002275 ID=PGSC0003DMT400005841.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAATACTTATTAATGTTGTGGGTGGCTTTGTTGTTGAGGTCGGAAAGTTTGTATGT
AAATGCATCTATCCTAAGATTGAAAATATTGTCCGTTTCTCGTCAAAAGTTGAAAATCTA
AGGGAGGAAATGGAGAAAATAACAAAGTTAAGAGATGATATCAAAGGAAAGACGGAAAAA
GCTAAGGGAGAAGGCTATAAACCAAAACCAGATGTTATCAAGTGGATCGAAGATGTTTGT
GAGCTGGAGGATGAATGGGAAACTATGCAAGAAAACATTGCAACGGCTAAGACACGTAAA
TATACGTGTTGTCCAAATTGCAGCCTCCGCTCGGAGGTCTGCACTCAAGTGCAGAACATC
CGAGATCAACTTTGCAGGCTTAAAGAGGTCGGAGAAAACTTTGGATCCAATTTAATGGTA
GAAAATTACCAGGTGAAAAAAGTTGAGTTTATCCCGGGACCATCAATAGAAGGCCAGTCC
GCAGCAACAAGGAATCTCAACAAAATCCTACGACTATTGGAAGATGATAAGGTTGGCATC
ATCGGAGTGTGGGGTGCAGGAGGAATTGGGAAAACTACTTTGGTGAAGAATTTGAACAAT
GAGCTTAAACAGATTGACGTGTCAATTAGGTCTAAACTGTCTTTTGGTGTTGTGATATGG
GTTACAGTACCCAAACCGCCAATAGACATAAGAAAGGTTCAAGCACAAATTGCTGACAGA
TTAAGCCTAGAGGTAAATACTGATCAGGGAAGTGAAGAGAGGAATGCCAGCAAAGTCTAT
CAAAGGCTTAAGCAGGAAAAGAGTTTCCTTGTGATACTAGATGATGTTTGGGAAGCTATA
GATTTGGATCATGTAGGTGTGCCCCAACCAAAAGATCACGCAGGAAGCAAGGTTATTATA
ACTTCTCGTTTTTTGGATGTTTGTAACCAAATGGAAATTGACATCGAAATGAAGGTTTAC
ACATTGGATGAGAATGAATCTTGGGCTCTGTTTATCAAAAATGTGGGAGATGTTGCCAAT
TGGCCGGTGGATATTCAGCCAGTGGCAATGGAAATTGCAAGAGAGTGTGATGGTTTACCT
TTAGCAATCACAGTTATTGGAGCATCTATGAGAGGGAAGAACATGGCCGAGCAATGGAAA
GATGCTTTGGAATCACTTAGAAAGTCTGAACCTAATGCCACATATGTAAGAGATAAGGTT
TACAAGGTCATCAAATGGAGTGTTGATTCTTTAGAGCAAAGAGGCAATAGAAGTGACATT
AAAAGTTGTTTCTTGTATTGCTCCTTATATCCAGCGTCTATTCCAACAAATGATCTCATA
CATTGCTGGTGGGCAGAGGGGTTCCTTGGTGAACATGACACATATGAAAAGGCTTACAAC
AGGGGAATCACAATTATCGAGGATCTAAAAAATGTCTGCTTACTAGAAGAAGCCCATGAG
AAGGATTGTGTGAAGATGCATGATGTGGTTCGTGATGTTGCTATATGGATAGATAAATCC
ATTTCACATAATGTCAAGAGAATGTCTTTCATAAGCAACAAAATTAAGCATCTTACTGAT
AACCTCACGGAATACCCAGAGACAACAACTTTACTATTGCAAGACAATTATAGCCTTAGG
GAAATTCCCCATGAATTCTTTTTGTCATTTCCAGCTCTAAGAGTTGTGAATCTGAGTGAA
ACTGGTATTAGAGCACTGCCTTGTTCCATCAGGAGTTTATGTCAATTACGTACTCTAATA
CTACAAAGGTGCCGCATGTTGAACGAGTTACCAGCTATTGGTAATCTTTGCAATTTGCAG
TTGCTTGATTGTGATAGGACAGAGTTATGTTGTCTGCCGGAAGGAATGGACAAGTTGACA
AATCTGAGGCTATTAAATATGACTTTAGGTAGGTTGAAGGAGAGCATCGACCTGGGGGTT
TTCCACGAGTTGCAAAGGCTTGAAATGTTACAGCTACGCATAAGAAGTGGAGGTGTTGTT
GGAGCAACTTCTTTTGATGAGATATCACATCTACCCAATCTGACATCACTTTTTATTTAC
TTGGATAGCTCATCAATTTCAATTTCGAAAAGTGACCAGTACACCTGGATGAAAAGATTG
AAAAGATTTCACATTACAGTTGGGAATACTTCAACTCATGATGAGGTACCATTCAACAAG
TCAACAAGGGCGATATGCCTCACAGGTTTTGACATTTTCAAAAGCAAAGTCTGGCTCTCA
AGCATGTTGCAGTTTGCTTCAGATTTGTACTTGGAAGAATGCATGGGTCTCACGGAGTTC
ATTCGGAACAACAGTTTTGATGGATTAAAATCACTATACATTTTTGGCTGCTCTTATGAT
TTTGGACCATCCATAGAAGGAAGTGGACAGTTTGATGATCCTATGCCAAATCTGGAATAT
CTCAGATTCTATTCTGTAGATAATTTAAAGAGTGTTTCTGATTTCGGTCATTTTCTGGGT
CTAAGATTTTCTAAATTACGCAAACTGGATATATCCCATTGTCGTAATTTAACATGTCTT
TTTAATGTTGGTGGAGCTTTTTCTGTACCCAGGCACTTGGAAGAAATTACACTTTCCTAT
TGTTTTAAGCTGACAACAGAGTTACTGGCACAATGCGGCTCAAGTCAGACGACATTCGTT
AGCTCAGAAATTCCAAGAGTCCGAAAGTTACTCTTGTATAGTTTAAACGCATTAAGAACG
TTTGGGGAGCCAGAGAGTATGTGGGAACACCTGGAGGAACTTGAGGTGATATCTTGCAAT
GGAATAAGGAAGTTGCCTCTCTCTATTCAAACCTCCAACAAAATCAAAAAAATAAGAGGA
AGATCAGAATGGTGGAGCAGCCTGGAGTGGGATGACGAAAAATACAAGTCAAATTTAGAG
AATTGTTTCACTAACATATTATAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400004056
PEP Infomation

pacid=37471284 transcript=PGSC0003DMT400005841 locus=PGSC0003DMG400002275 ID=PGSC0003DMT400005841.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEILINVVGGFVVEVGKFVCKCIYPKIENIVRFSSKVENLREEMEKITKLRDDIKGKTEK
AKGEGYKPKPDVIKWIEDVCELEDEWETMQENIATAKTRKYTCCPNCSLRSEVCTQVQNI
RDQLCRLKEVGENFGSNLMVENYQVKKVEFIPGPSIEGQSAATRNLNKILRLLEDDKVGI
IGVWGAGGIGKTTLVKNLNNELKQIDVSIRSKLSFGVVIWVTVPKPPIDIRKVQAQIADR
LSLEVNTDQGSEERNASKVYQRLKQEKSFLVILDDVWEAIDLDHVGVPQPKDHAGSKVII
TSRFLDVCNQMEIDIEMKVYTLDENESWALFIKNVGDVANWPVDIQPVAMEIARECDGLP
LAITVIGASMRGKNMAEQWKDALESLRKSEPNATYVRDKVYKVIKWSVDSLEQRGNRSDI
KSCFLYCSLYPASIPTNDLIHCWWAEGFLGEHDTYEKAYNRGITIIEDLKNVCLLEEAHE
KDCVKMHDVVRDVAIWIDKSISHNVKRMSFISNKIKHLTDNLTEYPETTTLLLQDNYSLR
EIPHEFFLSFPALRVVNLSETGIRALPCSIRSLCQLRTLILQRCRMLNELPAIGNLCNLQ
LLDCDRTELCCLPEGMDKLTNLRLLNMTLGRLKESIDLGVFHELQRLEMLQLRIRSGGVV
GATSFDEISHLPNLTSLFIYLDSSSISISKSDQYTWMKRLKRFHITVGNTSTHDEVPFNK
STRAICLTGFDIFKSKVWLSSMLQFASDLYLEECMGLTEFIRNNSFDGLKSLYIFGCSYD
FGPSIEGSGQFDDPMPNLEYLRFYSVDNLKSVSDFGHFLGLRFSKLRKLDISHCRNLTCL
FNVGGAFSVPRHLEEITLSYCFKLTTELLAQCGSSQTTFVSSEIPRVRKLLLYSLNALRT
FGEPESMWEHLEELEVISCNGIRKLPLSIQTSNKIKKIRGRSEWWSSLEWDDEKYKSNLE
NCFTNIL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400005841
Transcript Infomation

pacid=37471284 locus=PGSC0003DMG400002275 ID=PGSC0003DMT400005841.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAATACTTATTAATGTTGTGGGTGGCTTTGTTGTTGAGGTCGGAAAGTTTGTATGT
AAATGCATCTATCCTAAGATTGAAAATATTGTCCGTTTCTCGTCAAAAGTTGAAAATCTA
AGGGAGGAAATGGAGAAAATAACAAAGTTAAGAGATGATATCAAAGGAAAGACGGAAAAA
GCTAAGGGAGAAGGCTATAAACCAAAACCAGATGTTATCAAGTGGATCGAAGATGTTTGT
GAGCTGGAGGATGAATGGGAAACTATGCAAGAAAACATTGCAACGGCTAAGACACGTAAA
TATACGTGTTGTCCAAATTGCAGCCTCCGCTCGGAGGTCTGCACTCAAGTGCAGAACATC
CGAGATCAACTTTGCAGGCTTAAAGAGGTCGGAGAAAACTTTGGATCCAATTTAATGGTA
GAAAATTACCAGGTGAAAAAAGTTGAGTTTATCCCGGGACCATCAATAGAAGGCCAGTCC
GCAGCAACAAGGAATCTCAACAAAATCCTACGACTATTGGAAGATGATAAGGTTGGCATC
ATCGGAGTGTGGGGTGCAGGAGGAATTGGGAAAACTACTTTGGTGAAGAATTTGAACAAT
GAGCTTAAACAGATTGACGTGTCAATTAGGTCTAAACTGTCTTTTGGTGTTGTGATATGG
GTTACAGTACCCAAACCGCCAATAGACATAAGAAAGGTTCAAGCACAAATTGCTGACAGA
TTAAGCCTAGAGGTAAATACTGATCAGGGAAGTGAAGAGAGGAATGCCAGCAAAGTCTAT
CAAAGGCTTAAGCAGGAAAAGAGTTTCCTTGTGATACTAGATGATGTTTGGGAAGCTATA
GATTTGGATCATGTAGGTGTGCCCCAACCAAAAGATCACGCAGGAAGCAAGGTTATTATA
ACTTCTCGTTTTTTGGATGTTTGTAACCAAATGGAAATTGACATCGAAATGAAGGTTTAC
ACATTGGATGAGAATGAATCTTGGGCTCTGTTTATCAAAAATGTGGGAGATGTTGCCAAT
TGGCCGGTGGATATTCAGCCAGTGGCAATGGAAATTGCAAGAGAGTGTGATGGTTTACCT
TTAGCAATCACAGTTATTGGAGCATCTATGAGAGGGAAGAACATGGCCGAGCAATGGAAA
GATGCTTTGGAATCACTTAGAAAGTCTGAACCTAATGCCACATATGTAAGAGATAAGGTT
TACAAGGTCATCAAATGGAGTGTTGATTCTTTAGAGCAAAGAGGCAATAGAAGTGACATT
AAAAGTTGTTTCTTGTATTGCTCCTTATATCCAGCGTCTATTCCAACAAATGATCTCATA
CATTGCTGGTGGGCAGAGGGGTTCCTTGGTGAACATGACACATATGAAAAGGCTTACAAC
AGGGGAATCACAATTATCGAGGATCTAAAAAATGTCTGCTTACTAGAAGAAGCCCATGAG
AAGGATTGTGTGAAGATGCATGATGTGGTTCGTGATGTTGCTATATGGATAGATAAATCC
ATTTCACATAATGTCAAGAGAATGTCTTTCATAAGCAACAAAATTAAGCATCTTACTGAT
AACCTCACGGAATACCCAGAGACAACAACTTTACTATTGCAAGACAATTATAGCCTTAGG
GAAATTCCCCATGAATTCTTTTTGTCATTTCCAGCTCTAAGAGTTGTGAATCTGAGTGAA
ACTGGTATTAGAGCACTGCCTTGTTCCATCAGGAGTTTATGTCAATTACGTACTCTAATA
CTACAAAGGTGCCGCATGTTGAACGAGTTACCAGCTATTGGTAATCTTTGCAATTTGCAG
TTGCTTGATTGTGATAGGACAGAGTTATGTTGTCTGCCGGAAGGAATGGACAAGTTGACA
AATCTGAGGCTATTAAATATGACTTTAGGTAGGTTGAAGGAGAGCATCGACCTGGGGGTT
TTCCACGAGTTGCAAAGGCTTGAAATGTTACAGCTACGCATAAGAAGTGGAGGTGTTGTT
GGAGCAACTTCTTTTGATGAGATATCACATCTACCCAATCTGACATCACTTTTTATTTAC
TTGGATAGCTCATCAATTTCAATTTCGAAAAGTGACCAGTACACCTGGATGAAAAGATTG
AAAAGATTTCACATTACAGTTGGGAATACTTCAACTCATGATGAGGTACCATTCAACAAG
TCAACAAGGGCGATATGCCTCACAGGTTTTGACATTTTCAAAAGCAAAGTCTGGCTCTCA
AGCATGTTGCAGTTTGCTTCAGATTTGTACTTGGAAGAATGCATGGGTCTCACGGAGTTC
ATTCGGAACAACAGTTTTGATGGATTAAAATCACTATACATTTTTGGCTGCTCTTATGAT
TTTGGACCATCCATAGAAGGAAGTGGACAGTTTGATGATCCTATGCCAAATCTGGAATAT
CTCAGATTCTATTCTGTAGATAATTTAAAGAGTGTTTCTGATTTCGGTCATTTTCTGGGT
CTAAGATTTTCTAAATTACGCAAACTGGATATATCCCATTGTCGTAATTTAACATGTCTT
TTTAATGTTGGTGGAGCTTTTTCTGTACCCAGGCACTTGGAAGAAATTACACTTTCCTAT
TGTTTTAAGCTGACAACAGAGTTACTGGCACAATGCGGCTCAAGTCAGACGACATTCGTT
AGCTCAGAAATTCCAAGAGTCCGAAAGTTACTCTTGTATAGTTTAAACGCATTAAGAACG
TTTGGGGAGCCAGAGAGTATGTGGGAACACCTGGAGGAACTTGAGGTGATATCTTGCAAT
GGAATAAGGAAGTTGCCTCTCTCTATTCAAACCTCCAACAAAATCAAAAAAATAAGAGGA
AGATCAGAATGGTGGAGCAGCCTGGAGTGGGATGACGAAAAATACAAGTCAAATTTAGAG
AATTGTTTCACTAACATATTATAA