Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400005759
CDS Infomation	pacid=37444012 polypeptide=PGSC0003DMP400004024 locus=PGSC0003DMG400002250 ID=PGSC0003DMT400005759.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGGGACCTGCTGTAACAGTAGCACAGTTCTCAAGCTTTGTTTTTTGTGGCTACAACTA ATCTGTGTGCAATGCCATGGAAGGATACTCAAGGATGATACTTCCTCATCTGATCAGTTT AAGAACAGATTTCAAAAGATTTTTCTGAGTATACTTTTTGGTATGTTTACAGGATTGATT TGTGCACTTGTTTTTGCTTGGCTTGTTCGGAGTTTTGTTCGTTACATTAACAAAGCCCCA ATTCTCAAAGGCCCTGTTGTATTCTCTCCTAAAATTCCATCCAAAACTCTGCAATCAGCT CTTGCTAATGATACCCAGTTGATAGGGTCAAGTAGTTCTGGAAAATACTACAGAACTGTT CTTGATAATGGGCTTACTGTTGCAGTTAAGAGAATGGAACCTGGTTCTCCACAGTTACAT ACCAAGTCATTTAAGAGAAGAATACAACACGAACTTGAACTTATTGCTAGTTTGAGGCAT AGGAATTTGATGAGTTTAAGGGCTTATGTTCGTGAATCGAATACGTTCTTTCTGGTTTAC GATTATGTAAACACTGGCAGTCTTGAAGATGTAATGAACAAAGTTAGGGAAAATCAATTG CAACTTACCTGGGAAGTCAGGCTCCGAATTGCAGTTGGGATTGTTAAGGCTCTTCAGTAT CTTCATTTCTCTTGTAACCCCACAGTTTTGCATCGGAATTTGAAACCCACAAATGTAATG TTGGATGCTGAGTTTGAGCCTAGGTTGGCTGATTGTGGTTTGGCTAAAATCATTCCCACT TTAAATCTCCCTGCTGCATCAAACTATGGTCCTCCAGAATCATTCCAGAGTTGCAGCAGG TATACCGATAAAAGTGATGTATTTAGCTTTGGGGTTATATTGGGTGTTCTATTAACTGGA AAGTACCCAACAGATCCCTTCTTTGGGGATACATCTACTGGAGGAAGTCTAGCACGTTGG CTTCAACGCTTGCAGGAAGCAGGCGATGCTCGAGAAGCATTGGATAAGAGTATTCTAGGG GAAGAGGTTGAGGAAGATGAGATGTTAATGGCAGTAAAAATAGCAGTGGTATGCTTATCA GACATGCCTGCTGATCGACCTTCCAGTGATGAGCTCGTTTCCATGCTCACCCAATTAAAT AGCTTCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400004024
PEP Infomation	pacid=37444012 transcript=PGSC0003DMT400005759 locus=PGSC0003DMG400002250 ID=PGSC0003DMT400005759.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MGTCCNSSTVLKLCFLWLQLICVQCHGRILKDDTSSSDQFKNRFQKIFLSILFGMFTGLI CALVFAWLVRSFVRYINKAPILKGPVVFSPKIPSKTLQSALANDTQLIGSSSSGKYYRTV LDNGLTVAVKRMEPGSPQLHTKSFKRRIQHELELIASLRHRNLMSLRAYVRESNTFFLVY DYVNTGSLEDVMNKVRENQLQLTWEVRLRIAVGIVKALQYLHFSCNPTVLHRNLKPTNVM LDAEFEPRLADCGLAKIIPTLNLPAASNYGPPESFQSCSRYTDKSDVFSFGVILGVLLTG KYPTDPFFGDTSTGGSLARWLQRLQEAGDAREALDKSILGEEVEEDEMLMAVKIAVVCLS DMPADRPSSDELVSMLTQLNSF*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400005759
Transcript Infomation	pacid=37444012 locus=PGSC0003DMG400002250 ID=PGSC0003DMT400005759.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGGGACCTGCTGTAACAGTAGCACAGTTCTCAAGCTTTGTTTTTTGTGGCTACAACTA ATCTGTGTGCAATGCCATGGAAGGATACTCAAGGATGATACTTCCTCATCTGATCAGTTT AAGAACAGATTTCAAAAGATTTTTCTGAGTATACTTTTTGGTATGTTTACAGGATTGATT TGTGCACTTGTTTTTGCTTGGCTTGTTCGGAGTTTTGTTCGTTACATTAACAAAGCCCCA ATTCTCAAAGGCCCTGTTGTATTCTCTCCTAAAATTCCATCCAAAACTCTGCAATCAGCT CTTGCTAATGATACCCAGTTGATAGGGTCAAGTAGTTCTGGAAAATACTACAGAACTGTT CTTGATAATGGGCTTACTGTTGCAGTTAAGAGAATGGAACCTGGTTCTCCACAGTTACAT ACCAAGTCATTTAAGAGAAGAATACAACACGAACTTGAACTTATTGCTAGTTTGAGGCAT AGGAATTTGATGAGTTTAAGGGCTTATGTTCGTGAATCGAATACGTTCTTTCTGGTTTAC GATTATGTAAACACTGGCAGTCTTGAAGATGTAATGAACAAAGTTAGGGAAAATCAATTG CAACTTACCTGGGAAGTCAGGCTCCGAATTGCAGTTGGGATTGTTAAGGCTCTTCAGTAT CTTCATTTCTCTTGTAACCCCACAGTTTTGCATCGGAATTTGAAACCCACAAATGTAATG TTGGATGCTGAGTTTGAGCCTAGGTTGGCTGATTGTGGTTTGGCTAAAATCATTCCCACT TTAAATCTCCCTGCTGCATCAAACTATGGTCCTCCAGAATCATTCCAGAGTTGCAGCAGG TATACCGATAAAAGTGATGTATTTAGCTTTGGGGTTATATTGGGTGTTCTATTAACTGGA AAGTACCCAACAGATCCCTTCTTTGGGGATACATCTACTGGAGGAAGTCTAGCACGTTGG CTTCAACGCTTGCAGGAAGCAGGCGATGCTCGAGAAGCATTGGATAAGAGTATTCTAGGG GAAGAGGTTGAGGAAGATGAGATGTTAATGGCAGTAAAAATAGCAGTGGTATGCTTATCA GACATGCCTGCTGATCGACCTTCCAGTGATGAGCTCGTTTCCATGCTCACCCAATTAAAT AGCTTCTGA