Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400004512
CDS Infomation

pacid=37441331 polypeptide=PGSC0003DMP400003210 locus=PGSC0003DMG400001794 ID=PGSC0003DMT400004512.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTGGAACTTCCTTTTTCTCCAGTCCACCACTATACACTACTAGTACTAACACCAAG
TACAGCCATAGCCCGTCACCAGACAGACTTAAATTCTTGATAGACAAGTCAAAAAACATC
AGACAGCTTCTACAGATTCATGCATTTCTTATTCGCAATGGTTTGGAGAGTGACCCAGTC
TTGAATTTTAGGCTCCAACAATCATACTCTTCCCTTGGACACCTCCAACATTCTGTTACT
GTTTTTAAGCGCACTCATAGTCCAACTGTGTTCTCTTACACAGCCATTATCCATAATCAT
GTGATCAATGATCTCTATGAACAAGCCTATGTCTTATATATCCAAATGCTAACACAAAAT
ATTGAGCCTAATGCATTTACATTTTCTACGCTGCTTAAAACTTGCCCACTTGAATCAGGA
AAAGCCCTTCATTGTCAAGCCCTGAAACTCGGATATGAATCTGACACATACGTTCGAACT
GCTCTTGTAGATGTCTATGCAAGAGGCAGTGACATTGTGTCAGCTCGCAAACTCTTTGAC
ACTATGCCTGAAAGGTCCTTGGTGTCTTTAACAACAATGATTACTGGATATGCAAAGAAT
GGGCATGTCCAAGAAGCAAGAGAGTTGTTTGATGGGATGGAAGACAGGGATGTTGTTTGT
TGGAATGCCATGATTGATGGGTATGGCCAACATGGTAGACCTAGTGAAACTTTGGTTCTT
TTTAGGCAGATGTTACTGTCAAAAGTGAAACCTAATGAAGTAACCGTGGTGGCTGCTCTT
TCTGCTTGTGCGCAAATGGGAGTACTGGAATCAGGTCGTTGGATTCATGCTTATGTGAAA
AGTAACAGAATCCAAGTAAATAAACATGTAGGTACTGCTTTTATTGACATGTATAGCAAG
TCTGGGAGTTTAGAGGATGCAAGAATGGTGTTTGATCAGATGAGAGATAAGGATGTCATA
ACATGGAATTCGATGATTGTAGGATATGCGATGCATGGATTTAGCCTTGAAGCTTTGCAG
GTGTTCTATGAGATGTGTAAGTTGGGTCTCCAACCTACTGATATAACGTTTATTGGCATT
TTAAGTGCTTGTGCTAATGCCGGATTGGTGTCTGAAGGGTGGACTTATTTTCAGTTAATG
GAGAAGTATTTAATTGAGCCAAAGATTGAGCACTATGGTTGCATGGTGAATCTTCTTGGA
CGAGCTGGACAGCTAGAAAAAGCTTATGAATTTGTCAAAAGTATGAAGATTGATTCTGAT
CCTATTTTATGGGGAACTCTACTGACTGCTTGTAGGATTCATGGGGACGTAAGGCTTGCA
GAGAAAATTATGGAGTTCCTAGTCGAACAGGATCTTGCTACTTCAGGTACTTATGTTCTG
CTATCCAACATATATGCTGCTGCTGGTGATTGGGATGGGGTGGCAAAGGTGAGGGCATTG
ATGAAAAGAAGCGGGGTTGACAAGGAACCTGGCTGTAGCTCCATTGAGGTAAACAATAAA
GTGCACGAGTTCCTTGCGGGTGATATGAAGCATCCCAAAAGCAAAGAAATTTACATAATG
CTGGAGGAGATGAACAAGTGGCTCGAGGCTCATGGGTACTCACCGCAGATTGAAATAGTC
TTGCATAATCTTGGGGAAGTTGAGAAGCAGCAAGCACTTGCGGTTCATAGTGAAAGGCTA
GCCATTGCTTATGGACTAATTAGTACTCAGGCAGGAACTACAATCAAGATTGTCAAGAAT
CTACGTGTTTGTCCAGATTGCCATGCTGTCACAAAGCTCATTTCAAAAATCACAGGACGC
AAAATCATTGTTAGGGACCGGAATCGCTTTCATCATTTTGTAGATGGTTCATGTTCTTGT
GGTGATTTCTGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400003210
PEP Infomation

pacid=37441331 transcript=PGSC0003DMT400004512 locus=PGSC0003DMG400001794 ID=PGSC0003DMT400004512.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAGTSFFSSPPLYTTSTNTKYSHSPSPDRLKFLIDKSKNIRQLLQIHAFLIRNGLESDPV
LNFRLQQSYSSLGHLQHSVTVFKRTHSPTVFSYTAIIHNHVINDLYEQAYVLYIQMLTQN
IEPNAFTFSTLLKTCPLESGKALHCQALKLGYESDTYVRTALVDVYARGSDIVSARKLFD
TMPERSLVSLTTMITGYAKNGHVQEARELFDGMEDRDVVCWNAMIDGYGQHGRPSETLVL
FRQMLLSKVKPNEVTVVAALSACAQMGVLESGRWIHAYVKSNRIQVNKHVGTAFIDMYSK
SGSLEDARMVFDQMRDKDVITWNSMIVGYAMHGFSLEALQVFYEMCKLGLQPTDITFIGI
LSACANAGLVSEGWTYFQLMEKYLIEPKIEHYGCMVNLLGRAGQLEKAYEFVKSMKIDSD
PILWGTLLTACRIHGDVRLAEKIMEFLVEQDLATSGTYVLLSNIYAAAGDWDGVAKVRAL
MKRSGVDKEPGCSSIEVNNKVHEFLAGDMKHPKSKEIYIMLEEMNKWLEAHGYSPQIEIV
LHNLGEVEKQQALAVHSERLAIAYGLISTQAGTTIKIVKNLRVCPDCHAVTKLISKITGR
KIIVRDRNRFHHFVDGSCSCGDFW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400004512
Transcript Infomation

pacid=37441331 locus=PGSC0003DMG400001794 ID=PGSC0003DMT400004512.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTGGAACTTCCTTTTTCTCCAGTCCACCACTATACACTACTAGTACTAACACCAAG
TACAGCCATAGCCCGTCACCAGACAGACTTAAATTCTTGATAGACAAGTCAAAAAACATC
AGACAGCTTCTACAGATTCATGCATTTCTTATTCGCAATGGTTTGGAGAGTGACCCAGTC
TTGAATTTTAGGCTCCAACAATCATACTCTTCCCTTGGACACCTCCAACATTCTGTTACT
GTTTTTAAGCGCACTCATAGTCCAACTGTGTTCTCTTACACAGCCATTATCCATAATCAT
GTGATCAATGATCTCTATGAACAAGCCTATGTCTTATATATCCAAATGCTAACACAAAAT
ATTGAGCCTAATGCATTTACATTTTCTACGCTGCTTAAAACTTGCCCACTTGAATCAGGA
AAAGCCCTTCATTGTCAAGCCCTGAAACTCGGATATGAATCTGACACATACGTTCGAACT
GCTCTTGTAGATGTCTATGCAAGAGGCAGTGACATTGTGTCAGCTCGCAAACTCTTTGAC
ACTATGCCTGAAAGGTCCTTGGTGTCTTTAACAACAATGATTACTGGATATGCAAAGAAT
GGGCATGTCCAAGAAGCAAGAGAGTTGTTTGATGGGATGGAAGACAGGGATGTTGTTTGT
TGGAATGCCATGATTGATGGGTATGGCCAACATGGTAGACCTAGTGAAACTTTGGTTCTT
TTTAGGCAGATGTTACTGTCAAAAGTGAAACCTAATGAAGTAACCGTGGTGGCTGCTCTT
TCTGCTTGTGCGCAAATGGGAGTACTGGAATCAGGTCGTTGGATTCATGCTTATGTGAAA
AGTAACAGAATCCAAGTAAATAAACATGTAGGTACTGCTTTTATTGACATGTATAGCAAG
TCTGGGAGTTTAGAGGATGCAAGAATGGTGTTTGATCAGATGAGAGATAAGGATGTCATA
ACATGGAATTCGATGATTGTAGGATATGCGATGCATGGATTTAGCCTTGAAGCTTTGCAG
GTGTTCTATGAGATGTGTAAGTTGGGTCTCCAACCTACTGATATAACGTTTATTGGCATT
TTAAGTGCTTGTGCTAATGCCGGATTGGTGTCTGAAGGGTGGACTTATTTTCAGTTAATG
GAGAAGTATTTAATTGAGCCAAAGATTGAGCACTATGGTTGCATGGTGAATCTTCTTGGA
CGAGCTGGACAGCTAGAAAAAGCTTATGAATTTGTCAAAAGTATGAAGATTGATTCTGAT
CCTATTTTATGGGGAACTCTACTGACTGCTTGTAGGATTCATGGGGACGTAAGGCTTGCA
GAGAAAATTATGGAGTTCCTAGTCGAACAGGATCTTGCTACTTCAGGTACTTATGTTCTG
CTATCCAACATATATGCTGCTGCTGGTGATTGGGATGGGGTGGCAAAGGTGAGGGCATTG
ATGAAAAGAAGCGGGGTTGACAAGGAACCTGGCTGTAGCTCCATTGAGGTAAACAATAAA
GTGCACGAGTTCCTTGCGGGTGATATGAAGCATCCCAAAAGCAAAGAAATTTACATAATG
CTGGAGGAGATGAACAAGTGGCTCGAGGCTCATGGGTACTCACCGCAGATTGAAATAGTC
TTGCATAATCTTGGGGAAGTTGAGAAGCAGCAAGCACTTGCGGTTCATAGTGAAAGGCTA
GCCATTGCTTATGGACTAATTAGTACTCAGGCAGGAACTACAATCAAGATTGTCAAGAAT
CTACGTGTTTGTCCAGATTGCCATGCTGTCACAAAGCTCATTTCAAAAATCACAGGACGC
AAAATCATTGTTAGGGACCGGAATCGCTTTCATCATTTTGTAGATGGTTCATGTTCTTGT
GGTGATTTCTGGTAG