Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400004496
CDS Infomation

pacid=37437411 polypeptide=PGSC0003DMP400003203 locus=PGSC0003DMG400001790 ID=PGSC0003DMT400004496.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCCTTAGTTTTTGGTTGCACTGTAAATTCTCAAGACCCTTCTGTCTTTCACAAAATC
CAGACCAGTAACTCAACCAAACAATTCAATTTCAATACTTTAATCACCAAAACTAGTTCC
CAACAGTCCCTTTACGCCAAAATCATATCTTTATGTTCTTCTTCAATACCCTCTAAGGAT
ATGAGCTATATCCACTCTCTTTTCACTCAAATGCATGACCCAGATATCGATGTTTATAAT
TCTTTAATCAAATGTGTTTTAAGTTCTAAATGTAAGGAAAATGCCTTACTTGCTTTGTTA
ATGTATGTTGAAATGATGTGTAAAGGGTTAGATTTGGATAAATACACGTACCCTCTTGTT
ATAAAGGCGTGTGTAGGGTTACGTGAGCTAAGATATGGCAGATTGGTTCATGCCCATGTG
ATAAAAAATGGGTTTGTGTTGGATTTGTATGTAGTGAACAATTTGATGCGTTTGTATGGT
GTTTGTGGGTGTGTTGGGAGTGTAAGGAAGGTGTTTGATAGAAGTTCTGTGAGAGACTTG
GTATCTTGGACTATTTTGATTCAGGGGTATGTGGACAATGGTTATTGGAAGGAAGGAGTG
GATTTGTTTTTTGAGATGGTAGATGACAGGTTAAGGGCTGACGAGAGGATGATGGTTGTT
GTGATATCTGCTTGTGCAAAATTAGGGGATTTGAGATTGGGACAGAAGTTGCACAAGTAT
GTGCAGAGTCGTAAGTTGAGTTTCGATGTGTTTCTTGGGAATGCATTGGTCGATATGTAC
TTAAAATGTGGTGAACGCGATGTTGCTCTTAATGTTTTCAGAGAGATGCCGATGAGAAAT
GTGATCTCTTGGAATACAGTAATATCTGGATTGGCTCAAAGAAAGGAGTTTAAACAGGCC
TTGAGTGTGTTTAATGAAATGCAGGATCAAGGAGTAAAGCCTGATGAGAATACTTTAGTT
GGTGTTCTAAACTGTTGTAGCAATTTAGGGGCGCTAGAAGTTGGGAAATGGGTGCACACA
TATATAGATAGAAATCGGATACAAGTAGCTGGGTTTGTGGGCAATGCTCTTGTAGATATG
TATGCAAAGTGTGGAAGCATGGACGATGCCCTTAGAGTTTTTGGAAGTATGACTACTAAA
GATGTTTATTCATACACATCCGTTATAGTTGGTTCGGCCACACATGGAAAGGCACGGATG
GCACTTAAGTTTTTCTATGAGATGCTTGATATTGGTATACAACCAAATGAAGTCACATTT
GTAGGTGTTCTCACAGCTTGCAGTCATGGAGGACTGGTGGAAGAGGGTCACAAGTTCTTT
ACAGATATGTGGAGAGTGCACAAGTTAAAACCTCGAATAGAGCATTATGGCTGTATGGTT
GATCTGTTGGGTCGTGCAGGTTTGATAGATGAAGCAATGGAGTTTGTGAAACACATGTCA
ATTGAACCTGATGCTTCTATTTGGGGATCGATATTAGCAGCATGTAGGATCCAAGGAAAA
GTTGATCTCGCTGAGCATGTGACTGAGATACTTGTCAATATGGAGTCTGAAAAAGATGGT
ACATACATACTGATGTCAAACACATATGCTTCAGTCAGTAAATGGAAAGATGCTTTAGAA
GTAAGAAAAGCAATGAAGAGACAGAAAATAAAGAAAGTCCCTGGATGTAGCTCCATTGAA
CTTGATGGTGTTGTTTCCGAATTTAGGAGATGCGACAAAGCCCATCCACGAAGTAAAGAC
ATATATGTGATGGTTGAGCAATTGACATTTCATCTAATTGGTACAGAGGCCTCATCAGAC
GGAAGTGAGTCTTGCATAGTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400003203
PEP Infomation

pacid=37437411 transcript=PGSC0003DMT400004496 locus=PGSC0003DMG400001790 ID=PGSC0003DMT400004496.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MALVFGCTVNSQDPSVFHKIQTSNSTKQFNFNTLITKTSSQQSLYAKIISLCSSSIPSKD
MSYIHSLFTQMHDPDIDVYNSLIKCVLSSKCKENALLALLMYVEMMCKGLDLDKYTYPLV
IKACVGLRELRYGRLVHAHVIKNGFVLDLYVVNNLMRLYGVCGCVGSVRKVFDRSSVRDL
VSWTILIQGYVDNGYWKEGVDLFFEMVDDRLRADERMMVVVISACAKLGDLRLGQKLHKY
VQSRKLSFDVFLGNALVDMYLKCGERDVALNVFREMPMRNVISWNTVISGLAQRKEFKQA
LSVFNEMQDQGVKPDENTLVGVLNCCSNLGALEVGKWVHTYIDRNRIQVAGFVGNALVDM
YAKCGSMDDALRVFGSMTTKDVYSYTSVIVGSATHGKARMALKFFYEMLDIGIQPNEVTF
VGVLTACSHGGLVEEGHKFFTDMWRVHKLKPRIEHYGCMVDLLGRAGLIDEAMEFVKHMS
IEPDASIWGSILAACRIQGKVDLAEHVTEILVNMESEKDGTYILMSNTYASVSKWKDALE
VRKAMKRQKIKKVPGCSSIELDGVVSEFRRCDKAHPRSKDIYVMVEQLTFHLIGTEASSD
GSESCIV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400004496
Transcript Infomation

pacid=37437411 locus=PGSC0003DMG400001790 ID=PGSC0003DMT400004496.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCCTTAGTTTTTGGTTGCACTGTAAATTCTCAAGACCCTTCTGTCTTTCACAAAATC
CAGACCAGTAACTCAACCAAACAATTCAATTTCAATACTTTAATCACCAAAACTAGTTCC
CAACAGTCCCTTTACGCCAAAATCATATCTTTATGTTCTTCTTCAATACCCTCTAAGGAT
ATGAGCTATATCCACTCTCTTTTCACTCAAATGCATGACCCAGATATCGATGTTTATAAT
TCTTTAATCAAATGTGTTTTAAGTTCTAAATGTAAGGAAAATGCCTTACTTGCTTTGTTA
ATGTATGTTGAAATGATGTGTAAAGGGTTAGATTTGGATAAATACACGTACCCTCTTGTT
ATAAAGGCGTGTGTAGGGTTACGTGAGCTAAGATATGGCAGATTGGTTCATGCCCATGTG
ATAAAAAATGGGTTTGTGTTGGATTTGTATGTAGTGAACAATTTGATGCGTTTGTATGGT
GTTTGTGGGTGTGTTGGGAGTGTAAGGAAGGTGTTTGATAGAAGTTCTGTGAGAGACTTG
GTATCTTGGACTATTTTGATTCAGGGGTATGTGGACAATGGTTATTGGAAGGAAGGAGTG
GATTTGTTTTTTGAGATGGTAGATGACAGGTTAAGGGCTGACGAGAGGATGATGGTTGTT
GTGATATCTGCTTGTGCAAAATTAGGGGATTTGAGATTGGGACAGAAGTTGCACAAGTAT
GTGCAGAGTCGTAAGTTGAGTTTCGATGTGTTTCTTGGGAATGCATTGGTCGATATGTAC
TTAAAATGTGGTGAACGCGATGTTGCTCTTAATGTTTTCAGAGAGATGCCGATGAGAAAT
GTGATCTCTTGGAATACAGTAATATCTGGATTGGCTCAAAGAAAGGAGTTTAAACAGGCC
TTGAGTGTGTTTAATGAAATGCAGGATCAAGGAGTAAAGCCTGATGAGAATACTTTAGTT
GGTGTTCTAAACTGTTGTAGCAATTTAGGGGCGCTAGAAGTTGGGAAATGGGTGCACACA
TATATAGATAGAAATCGGATACAAGTAGCTGGGTTTGTGGGCAATGCTCTTGTAGATATG
TATGCAAAGTGTGGAAGCATGGACGATGCCCTTAGAGTTTTTGGAAGTATGACTACTAAA
GATGTTTATTCATACACATCCGTTATAGTTGGTTCGGCCACACATGGAAAGGCACGGATG
GCACTTAAGTTTTTCTATGAGATGCTTGATATTGGTATACAACCAAATGAAGTCACATTT
GTAGGTGTTCTCACAGCTTGCAGTCATGGAGGACTGGTGGAAGAGGGTCACAAGTTCTTT
ACAGATATGTGGAGAGTGCACAAGTTAAAACCTCGAATAGAGCATTATGGCTGTATGGTT
GATCTGTTGGGTCGTGCAGGTTTGATAGATGAAGCAATGGAGTTTGTGAAACACATGTCA
ATTGAACCTGATGCTTCTATTTGGGGATCGATATTAGCAGCATGTAGGATCCAAGGAAAA
GTTGATCTCGCTGAGCATGTGACTGAGATACTTGTCAATATGGAGTCTGAAAAAGATGGT
ACATACATACTGATGTCAAACACATATGCTTCAGTCAGTAAATGGAAAGATGCTTTAGAA
GTAAGAAAAGCAATGAAGAGACAGAAAATAAAGAAAGTCCCTGGATGTAGCTCCATTGAA
CTTGATGGTGTTGTTTCCGAATTTAGGAGATGCGACAAAGCCCATCCACGAAGTAAAGAC
ATATATGTGATGGTTGAGCAATTGACATTTCATCTAATTGGTACAGAGGCCTCATCAGAC
GGAAGTGAGTCTTGCATAGTTTGA