Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400003662
CDS Infomation	pacid=37427458 polypeptide=PGSC0003DMP400002618 locus=PGSC0003DMG400001446 ID=PGSC0003DMT400003662.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGAAGATGCTGGTGTTGACGCTGATTGTGCCACTGTGCTTTCCGTGTTGCCTGCGTGT GGGTGTCTGAAGGACTTTGAGATGGGCAGAGAGGTTCACTCACTGATTGAACAAGTAGGT TTTTGGGACAATTTGTCAGTTCGGAATGCTGTCGTTGATATGTACGTCAAGTGTGGAAGA ATAGATGAAGCAAGGTTGGTTTTTGAGAAGATGATAGATAGAGATGTGGTTACTTGGACT ACAATGATCCACGGTTTCATTTCAGATGGTGACATAAAAAATGCACTATGGTTTTCTCAA AGGATGCAGCTTGAAGGTGTAAAGCCGAATGCAGTAACTCTGTCATCCCTTCTTGCTGCA TGTGCCAGTTTGCCTCATTTGAGGCTTGGTAAATGTCTGCATGGCTGGGCTATCAGGCAG GACCTTCAGGCTGATGTTAATGTAGAAACTGGCCTTATTGACATGTATGCTAAATGCAAT TGTTTTAGACTAGGCTATCAGGTGTTTACAAAGACTAGCAAGAAGAGGACTGTCCCATGG AATGCAATTTTGTCTGGGTGCCTTCATAATGAGCTTGCAAGAGAAGCGATAGAGCTTTTC AAGTTCATGTTGTCAGAGGCTGTCAAACCTAATGATGCAACCCTGAAAAGTGTACTTCCT GCATTTGCCATTGAAGCTGATCTAAGGCAAGTGTTGAGCATGCACAGCTATCTTGTAAGA TCCGGATTTGTTACAAGAACTGAGGTAGCTACTGGTTTAGTTGATATATACTCGAAATGT GGAAACTTAGATAATGGTCACAAGATTTTCAATGGGATACCCAAGAAAGAAAGGGACATA ATCTTGTGGAGTACGTTAATTGCTGGTTATGGGATGCATGGGCATGGCGAGACTTCTTTG TCACTGTTTAATGAGATGGTGCAATCTGGAGTCAAACCTAACGAAGTCACTTTCACCTCG GTTTTGCATGCTTGTGGTCATGCTGGTTTGGTGGATGACGGTCTTTGTTTGTTTAATTTT ATGCTTAGAAATCACTCTGGTAGTCTTAGAACAGATCATTATACCTGTATGGTTGATCTT CTTGGTCGAGCTGGCCGACTTGAGGAGGCATATGAACTTATTAAAACTATGACTTTTGAA CCAAGTCATGCCATCTGGGGTGCACTACTTGGTGCCTGTGTGATACATGAAAATGTGGAA CTGGGAGAATTGTCTGCAAGGTGGCTGTTTAAGGTGGAGCCAGAGAACACAGGAAATTAT ATACTGTTGGGAAAGATCTATTCTGCAGTTGGAAGATGGAAAGATGCAGAGAATGTGAGA CTTTTGATGAATGAAATCGGACTGATAAAGGCGCCAGCTCAAAGTGTCATTGGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400002618
PEP Infomation	pacid=37427458 transcript=PGSC0003DMT400003662 locus=PGSC0003DMG400001446 ID=PGSC0003DMT400003662.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MEDAGVDADCATVLSVLPACGCLKDFEMGREVHSLIEQVGFWDNLSVRNAVVDMYVKCGR IDEARLVFEKMIDRDVVTWTTMIHGFISDGDIKNALWFSQRMQLEGVKPNAVTLSSLLAA CASLPHLRLGKCLHGWAIRQDLQADVNVETGLIDMYAKCNCFRLGYQVFTKTSKKRTVPW NAILSGCLHNELAREAIELFKFMLSEAVKPNDATLKSVLPAFAIEADLRQVLSMHSYLVR SGFVTRTEVATGLVDIYSKCGNLDNGHKIFNGIPKKERDIILWSTLIAGYGMHGHGETSL SLFNEMVQSGVKPNEVTFTSVLHACGHAGLVDDGLCLFNFMLRNHSGSLRTDHYTCMVDL LGRAGRLEEAYELIKTMTFEPSHAIWGALLGACVIHENVELGELSARWLFKVEPENTGNY ILLGKIYSAVGRWKDAENVRLLMNEIGLIKAPAQSVIG*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400003662
Transcript Infomation	pacid=37427458 locus=PGSC0003DMG400001446 ID=PGSC0003DMT400003662.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGAAGATGCTGGTGTTGACGCTGATTGTGCCACTGTGCTTTCCGTGTTGCCTGCGTGT GGGTGTCTGAAGGACTTTGAGATGGGCAGAGAGGTTCACTCACTGATTGAACAAGTAGGT TTTTGGGACAATTTGTCAGTTCGGAATGCTGTCGTTGATATGTACGTCAAGTGTGGAAGA ATAGATGAAGCAAGGTTGGTTTTTGAGAAGATGATAGATAGAGATGTGGTTACTTGGACT ACAATGATCCACGGTTTCATTTCAGATGGTGACATAAAAAATGCACTATGGTTTTCTCAA AGGATGCAGCTTGAAGGTGTAAAGCCGAATGCAGTAACTCTGTCATCCCTTCTTGCTGCA TGTGCCAGTTTGCCTCATTTGAGGCTTGGTAAATGTCTGCATGGCTGGGCTATCAGGCAG GACCTTCAGGCTGATGTTAATGTAGAAACTGGCCTTATTGACATGTATGCTAAATGCAAT TGTTTTAGACTAGGCTATCAGGTGTTTACAAAGACTAGCAAGAAGAGGACTGTCCCATGG AATGCAATTTTGTCTGGGTGCCTTCATAATGAGCTTGCAAGAGAAGCGATAGAGCTTTTC AAGTTCATGTTGTCAGAGGCTGTCAAACCTAATGATGCAACCCTGAAAAGTGTACTTCCT GCATTTGCCATTGAAGCTGATCTAAGGCAAGTGTTGAGCATGCACAGCTATCTTGTAAGA TCCGGATTTGTTACAAGAACTGAGGTAGCTACTGGTTTAGTTGATATATACTCGAAATGT GGAAACTTAGATAATGGTCACAAGATTTTCAATGGGATACCCAAGAAAGAAAGGGACATA ATCTTGTGGAGTACGTTAATTGCTGGTTATGGGATGCATGGGCATGGCGAGACTTCTTTG TCACTGTTTAATGAGATGGTGCAATCTGGAGTCAAACCTAACGAAGTCACTTTCACCTCG GTTTTGCATGCTTGTGGTCATGCTGGTTTGGTGGATGACGGTCTTTGTTTGTTTAATTTT ATGCTTAGAAATCACTCTGGTAGTCTTAGAACAGATCATTATACCTGTATGGTTGATCTT CTTGGTCGAGCTGGCCGACTTGAGGAGGCATATGAACTTATTAAAACTATGACTTTTGAA CCAAGTCATGCCATCTGGGGTGCACTACTTGGTGCCTGTGTGATACATGAAAATGTGGAA CTGGGAGAATTGTCTGCAAGGTGGCTGTTTAAGGTGGAGCCAGAGAACACAGGAAATTAT ATACTGTTGGGAAAGATCTATTCTGCAGTTGGAAGATGGAAAGATGCAGAGAATGTGAGA CTTTTGATGAATGAAATCGGACTGATAAAGGCGCCAGCTCAAAGTGTCATTGGGTGA