Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400003408
CDS Infomation

pacid=37428903 polypeptide=PGSC0003DMP400002423 locus=PGSC0003DMG400001345 ID=PGSC0003DMT400003408.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCAGATGCCAACACCAATCCGAGCTCCTACATGGGTTTCAAGGCGAAGACACTTCGAG
CAGAAATTATGGGATTTAGATAAATGCAGAGACATTAACCAACTGAAGCAAATGCAGGCA
TTGGTATACAAATCCAATCTTGAACAAGACCCTTTCATTGCTCCAAAGCTAATTGCTGCT
TTCTCTAATTGTAGACAAATGGGTTCTGTTTTGAAGGTTTTTGATCAAGTGCGTGACCCT
AATGTGCATTTGTATAATGCTTTGATAAGAGCTCATATTTACAACTCTCAACCATCTCAA
GCTTTTGATACTTTCTTTGATATGCAGTCTTCTGGTATTTTTCCTGATAATTTTACCTTT
TCGTTTCTTCTAAAGGGTTGTTCGGGGAAGTGTTGGTTGAGTGTTGTGAGTATGATTCAT
ACCCATGTTGTGAAATGGGGGTTTGAGGATGATATATATGTGCCCAATTCGTTGATTGAT
GCTTATTCCAAGTGTGGGTTAGTTGGTGTCCGAATTGCAGGTCAGTTGTTTTGGGGAATG
AAGGAGAGAGATGTTGTTTCTTGGAATTCCATGATTAGTGCGTTGCTGAAAGTGGGGGAT
TTGAGTGAAGCGCGGAAGCTGTTCGATGAAATGCCTCAAAGAGATAGGGTTAGTTGGAAT
ACTATGTTAGATGGATATACCAAGGCTGAGCAAATGAGTGTGGCATTTGAGTTGTTTAAA
ACTATGCCACAGAGGGATGTCGTCTCTTGGTCCACCATGGTCTCGGGTTATTGCAAAGCT
GGGGATTTGGAGATGGCTCGGATGTTATTTGATAAGATGCCTTCCAAGAATTTGGTTTCT
TGGACAATAATGATATCAGGGTATGCTGAAAAGGGTCTTGTAAATGAGGCAATTCAGTTG
TTCATGCAAATGGAGGAGACAGGTTTGAGGCTTGATGTTGCGGCTTTTGTTAGCATTTTA
GCTGCCTGTGCAGAATCGGGCATGCTTAGTTTGGGTAAAAAAGTGCATGATTCTGTTGAA
AGGAGTACGTACAAGTGTAATACTTTAGTTTGTAATGCGTTGATTGATATGTATGCCAAG
TGTGGATGTTTGCATAAGGCTTATAAAGTCTTTAACGGGCTGGAAAAAAGAGACTTGGTA
TCTTGGAATGCTATGATACATGGGTTGGCTATGCATGGACGTGGAAAGAAGGCACTTGAG
CTTTTCTTTAGGATGAAGCAAGAAGGATTTGTGCCTGATAAAGTGACATTAGTTGGTATA
TTGTGTGCGTGCAATCATACAGGTTTGGTGGACGAGGGAATACTTTTTTTCTATTCCATG
GAGAAAGATTATGGGGTAAAACCTGAAGTAGAACATTATGGTTGTCTTATTGATCTTTTA
GGCCGTGGTGGCTATGTTAGAGAAGCTTTTGAACTTGCACGAAAGATGCCGCTTGAACCT
AATGTTAAAATTTGGGGTTCCCTTTTAGGGGCTTGCAGGATGCATAAAGATGTTGAACTT
GCAGATGATGTGCGTAGCCTCCTAGTTAAATTAGAGCCTAAAAATGCTGGAAAACTTTCT
GCATTGTCGAATATTTATGCTTCAGCAGGAGACTGGGATAATGTTGCCAACATAAGGTTG
ATGATGAAGAACATTGGCAGGCCAAATCAATCCGGTGCCAGCTTATTACTATTGAATGAT
GAATACCGTGAATTCACCGTGATGGATAAATCTCACGTCAAATCAGACAAGATTTATCAG
ATGGTAGACAGATTAGGTCAGCATCTTAAATTGCTTTCTCCTGTTCCAGCAGGTCTTTGC
GATGAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400002423
PEP Infomation

pacid=37428903 transcript=PGSC0003DMT400003408 locus=PGSC0003DMG400001345 ID=PGSC0003DMT400003408.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MQMPTPIRAPTWVSRRRHFEQKLWDLDKCRDINQLKQMQALVYKSNLEQDPFIAPKLIAA
FSNCRQMGSVLKVFDQVRDPNVHLYNALIRAHIYNSQPSQAFDTFFDMQSSGIFPDNFTF
SFLLKGCSGKCWLSVVSMIHTHVVKWGFEDDIYVPNSLIDAYSKCGLVGVRIAGQLFWGM
KERDVVSWNSMISALLKVGDLSEARKLFDEMPQRDRVSWNTMLDGYTKAEQMSVAFELFK
TMPQRDVVSWSTMVSGYCKAGDLEMARMLFDKMPSKNLVSWTIMISGYAEKGLVNEAIQL
FMQMEETGLRLDVAAFVSILAACAESGMLSLGKKVHDSVERSTYKCNTLVCNALIDMYAK
CGCLHKAYKVFNGLEKRDLVSWNAMIHGLAMHGRGKKALELFFRMKQEGFVPDKVTLVGI
LCACNHTGLVDEGILFFYSMEKDYGVKPEVEHYGCLIDLLGRGGYVREAFELARKMPLEP
NVKIWGSLLGACRMHKDVELADDVRSLLVKLEPKNAGKLSALSNIYASAGDWDNVANIRL
MMKNIGRPNQSGASLLLLNDEYREFTVMDKSHVKSDKIYQMVDRLGQHLKLLSPVPAGLC
DE*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400003408
Transcript Infomation

pacid=37428903 locus=PGSC0003DMG400001345 ID=PGSC0003DMT400003408.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCAGATGCCAACACCAATCCGAGCTCCTACATGGGTTTCAAGGCGAAGACACTTCGAG
CAGAAATTATGGGATTTAGATAAATGCAGAGACATTAACCAACTGAAGCAAATGCAGGCA
TTGGTATACAAATCCAATCTTGAACAAGACCCTTTCATTGCTCCAAAGCTAATTGCTGCT
TTCTCTAATTGTAGACAAATGGGTTCTGTTTTGAAGGTTTTTGATCAAGTGCGTGACCCT
AATGTGCATTTGTATAATGCTTTGATAAGAGCTCATATTTACAACTCTCAACCATCTCAA
GCTTTTGATACTTTCTTTGATATGCAGTCTTCTGGTATTTTTCCTGATAATTTTACCTTT
TCGTTTCTTCTAAAGGGTTGTTCGGGGAAGTGTTGGTTGAGTGTTGTGAGTATGATTCAT
ACCCATGTTGTGAAATGGGGGTTTGAGGATGATATATATGTGCCCAATTCGTTGATTGAT
GCTTATTCCAAGTGTGGGTTAGTTGGTGTCCGAATTGCAGGTCAGTTGTTTTGGGGAATG
AAGGAGAGAGATGTTGTTTCTTGGAATTCCATGATTAGTGCGTTGCTGAAAGTGGGGGAT
TTGAGTGAAGCGCGGAAGCTGTTCGATGAAATGCCTCAAAGAGATAGGGTTAGTTGGAAT
ACTATGTTAGATGGATATACCAAGGCTGAGCAAATGAGTGTGGCATTTGAGTTGTTTAAA
ACTATGCCACAGAGGGATGTCGTCTCTTGGTCCACCATGGTCTCGGGTTATTGCAAAGCT
GGGGATTTGGAGATGGCTCGGATGTTATTTGATAAGATGCCTTCCAAGAATTTGGTTTCT
TGGACAATAATGATATCAGGGTATGCTGAAAAGGGTCTTGTAAATGAGGCAATTCAGTTG
TTCATGCAAATGGAGGAGACAGGTTTGAGGCTTGATGTTGCGGCTTTTGTTAGCATTTTA
GCTGCCTGTGCAGAATCGGGCATGCTTAGTTTGGGTAAAAAAGTGCATGATTCTGTTGAA
AGGAGTACGTACAAGTGTAATACTTTAGTTTGTAATGCGTTGATTGATATGTATGCCAAG
TGTGGATGTTTGCATAAGGCTTATAAAGTCTTTAACGGGCTGGAAAAAAGAGACTTGGTA
TCTTGGAATGCTATGATACATGGGTTGGCTATGCATGGACGTGGAAAGAAGGCACTTGAG
CTTTTCTTTAGGATGAAGCAAGAAGGATTTGTGCCTGATAAAGTGACATTAGTTGGTATA
TTGTGTGCGTGCAATCATACAGGTTTGGTGGACGAGGGAATACTTTTTTTCTATTCCATG
GAGAAAGATTATGGGGTAAAACCTGAAGTAGAACATTATGGTTGTCTTATTGATCTTTTA
GGCCGTGGTGGCTATGTTAGAGAAGCTTTTGAACTTGCACGAAAGATGCCGCTTGAACCT
AATGTTAAAATTTGGGGTTCCCTTTTAGGGGCTTGCAGGATGCATAAAGATGTTGAACTT
GCAGATGATGTGCGTAGCCTCCTAGTTAAATTAGAGCCTAAAAATGCTGGAAAACTTTCT
GCATTGTCGAATATTTATGCTTCAGCAGGAGACTGGGATAATGTTGCCAACATAAGGTTG
ATGATGAAGAACATTGGCAGGCCAAATCAATCCGGTGCCAGCTTATTACTATTGAATGAT
GAATACCGTGAATTCACCGTGATGGATAAATCTCACGTCAAATCAGACAAGATTTATCAG
ATGGTAGACAGATTAGGTCAGCATCTTAAATTGCTTTCTCCTGTTCCAGCAGGTCTTTGC
GATGAATGA