Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400003302
CDS Infomation

pacid=37426414 polypeptide=PGSC0003DMP400002346 locus=PGSC0003DMG403001309 ID=PGSC0003DMT400003302.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTAAGTGGGGTTGAGAAAAGTGCAAATCTTGGAGCTTTTTGTCAGTCAGAGAAGAAG
AAAGAGAAAGACAAGAAAAAGAAGATGAAGATGAAGATGAAGAAGGAGAAGGAGGAGGAA
AGTGTCGGGAAGAAGATAACTATTGGTGTTTGTGTAATGGAAAAGAAGGTATTTTCAGCG
CCAATGGAACAGATTCTTGAAAGATTGCAGTGTTTTGGGGAATTTGAGGTTGTGTACTTT
GGGGACAAAGCTATTCTTGAGGATCCAATTGAGTGCTGGCCGTTATGCGACTGCTTGATT
GCCTTCTACTCCAGTGGATATCCTTTGAAGAAGGCAGAAGCATATGCTTCATTAAGAAAG
CCTTTCCTTGTGAATGAATTGGAACCACAATACCTTCTTCATGATCGGAGGAAAGTATAC
GAGCGTCTTGAGATGTTTGGAATCCCTGTGCCAAGGTATGCTTGCGTTCACAGAGAAGTA
CCTAACCAACATTTGGATTATTTTGTTGAAGACGATGACTTTGTTGAAGTTCATGGGAAT
CGCTTTTGGAAACCTTTTGTGGAAAAGCCTGTCAATGCTGATGACCACAGAATAATGATT
TACTATCCTAGTTCAGCTGGTGGGGGAATGAAGGAATTGTTCCGTAAGGTTGGTAACCGC
TCAAGTGAGTTCCATCCAGAGGTTAGAAGAGTAAGACGTGAAGGATCCTACATATATGAG
GAATTCATGCCCACTGGAGGAACAGATGTTAAGGTGTATACAGTTGGTCCAGATTATGCA
CATGCAGAGGCAAGGAAATCTCCTGTTGTTGATGGTGTTGTTATGAGAAATCCTGATGGG
AAAGAAGTTCGGTATCCTGTTCTACTTACCCCTGCAGAGAAGCAAATGGCCAGAGAAGTT
TGCATAGCCTTTAGGCAAGCAGTTTGTGGCTTCGATCTATTGCGTAGTGAGGGGCGTTCA
TATGTTTGTGATGTAAATGGCTGGAGCTTTGTGAAGAACTCTTACAAGTACTATGACGAT
GCTGCTTGTGTGTTGAGGAAGATGTTTCTAGATGCAAAAGCTCCACATCTTTCATCGACA
ATCCCACCAATTTTACCATGGAAAGTCAGTGAACCAGTTCAGCCTTCTGAGGGGTTAACA
CGTCAAGGAAGTGGGCTGATTGGCACATTTGGACAAGCAGAGGAACTACGATGTGTTGTT
ACAATTGTTCGGCATGGTGATAGAACTCCAAAACAAAAAGTGAAGTTGAAGGTTACTGAG
GAAAAACTCTTAAATTTGATGTTAAAATACAATGGCGGTAAACCTAGATCAGAGACAAAG
CTCAAAACTGCTGTGCAGTTGCAAGATCTTTTGGATGCCACCAGAGCCTTAGTGCCACGT
TCTAGGCCTGGTCGGGAAAGTGATAGTGAAGCTGAAGACATTGAGCATGCTGAGAAACTT
CGTCAAGTAAAAGCTGTTCTTGAGGAGGGGGGACATTTTTCTGGAATTTATAGAAAAGTT
CAGCTAAAGCCACTAAAGTGGGCTAAAGTTGCCAAGTCAAATGGTGAAGGTGAAGAAGAA
CGGCCTGTTGAAGCTCTTATGGTTCTGAAATATGGAGGTGTTCTCACTCACGCTGGCAGA
AAGCAGGCTGAAGAACTTGGAAGATACTTCCGTAATAACATGTATCCAGGTGAAGGTACA
GGCCTCCTTCGCCTCCATAGTACATATCGCCATGACCTAAAAATATACAGCTCTGATGAG
GGCCGTGTGCAGATGTCTGCAGCTGCATTTGCTAAAGGTCTACTTGACTTGGAAGGACAA
TTGACACCTATCCTGGTATCGCTGGTTAGCAAAGATTCTTCAATGCTTGATGGACTTGAC
AATGCCAGTATCGAAATGGAAGATGCTAAGGCAAGGTTGAATGACATAATTACTTCTGGA
ACAAGGACACTTCATAAAAATGGATCAGCAGAGAAACCTTGGATGGTTGATGGAGCAGGA
CTCCCTCCCAATGCATCTGAACTTCTGCCCAAATTGGTGAAATTTACTAAGAAGGTGACA
GAGCAAGTGAGGCTTCTTGCTAAGGATGAGGATGAAGAACTTGCAGAGGCTAGTCCATAT
GATGTAATTCCACCTTATGATCAAGCTAAAGCGCTTGGTAAAACAAATATTGATGTTGAT
CGTATTGCTGCGGGTTTACCTTGTGGTAGCGAGGGATTTCTACTCATGTATGCAAGATGG
AGAAAACTAGAGAGGGATTTATATAACGAACGGAAAGACCGTTTTGATATCACGCAAATT
CCAGATGTTTATGACTCGTGCAAGTACGACCTCTTGCACAATTCACATCTGAATCTAGGG
GGCTTGAATGAACTTTTTAAGGTTGCTCAGCTACTTGCAGATGGTGTTATTCCAAATGAA
TATGGGATAAATCCAAAGCAGAAATTAAAGATTGGATCAAAGGTTGCTCGCCGCTTGTTG
GGTAAAATTATGATTGATCTAAGGAATACCCGTGAAGAAGCTCTAAGTGTGGCCGAATTG
AAAGGTAGTCAAGACAATTTAGCAGTGAATAAGACAACAAAGGAAGATACAGAGTATCAT
ACCAAGCCTCACACTCGTAATGAAGAGTCTCGAAGAACTAGCTTCAATAGTGAGAGATCC
ATGGATCAAGATGATGATGACGACAAAGAGCCTAAGTACCGCTTAGATCCAAAGTATGCA
AATGTCAGAACACCTGAAAGACATGTGCGAACACGCCTGTACTTCACATCAGAGTCACAT
ATCCATTCCTTGATGAATGTTCTTCGTTATTGCAACCTGGATGAGTCTCTTCAAGGAGAG
GACAGCCTTGTGTGCGATAATGCTTTGGATCGCTTGTACAAAACCAAGGAGCTAGATTAC
ATGAGTTATATTGTATTGAGGATGTTCGAGAACACAGAGGTGGCTCTGGAAGACCTTAAA
AGGTTCCGCATAGAGCTAACTTTTAGTCGTGGTGCCGATCTATCACCACTTGAGGTAAAT
GATGAGATAGCTGCTTCATTGCATCAAGAGCACACACTGCCAATAATGGGTCCTGAAAGG
CTTCAAGAAGTTGGGTCATATCTTACGTTGGCAAACATGGAAAAACTGGTGCGTCCATTT
GCCATGCCAGCTGAAGATTTCCCACCACCGTCAACTCCTCAAGGGTTTTCTGGATATTTC
TCGAAAAGTGCATCGGTTTTAGAGCGCCTGGCAAAGATTTGGCCCTTCCACAAGCATGTG
AACAACAATGGGAAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400002346
PEP Infomation

pacid=37426414 transcript=PGSC0003DMT400003302 locus=PGSC0003DMG403001309 ID=PGSC0003DMT400003302.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVSGVEKSANLGAFCQSEKKKEKDKKKKMKMKMKKEKEEESVGKKITIGVCVMEKKVFSA
PMEQILERLQCFGEFEVVYFGDKAILEDPIECWPLCDCLIAFYSSGYPLKKAEAYASLRK
PFLVNELEPQYLLHDRRKVYERLEMFGIPVPRYACVHREVPNQHLDYFVEDDDFVEVHGN
RFWKPFVEKPVNADDHRIMIYYPSSAGGGMKELFRKVGNRSSEFHPEVRRVRREGSYIYE
EFMPTGGTDVKVYTVGPDYAHAEARKSPVVDGVVMRNPDGKEVRYPVLLTPAEKQMAREV
CIAFRQAVCGFDLLRSEGRSYVCDVNGWSFVKNSYKYYDDAACVLRKMFLDAKAPHLSST
IPPILPWKVSEPVQPSEGLTRQGSGLIGTFGQAEELRCVVTIVRHGDRTPKQKVKLKVTE
EKLLNLMLKYNGGKPRSETKLKTAVQLQDLLDATRALVPRSRPGRESDSEAEDIEHAEKL
RQVKAVLEEGGHFSGIYRKVQLKPLKWAKVAKSNGEGEEERPVEALMVLKYGGVLTHAGR
KQAEELGRYFRNNMYPGEGTGLLRLHSTYRHDLKIYSSDEGRVQMSAAAFAKGLLDLEGQ
LTPILVSLVSKDSSMLDGLDNASIEMEDAKARLNDIITSGTRTLHKNGSAEKPWMVDGAG
LPPNASELLPKLVKFTKKVTEQVRLLAKDEDEELAEASPYDVIPPYDQAKALGKTNIDVD
RIAAGLPCGSEGFLLMYARWRKLERDLYNERKDRFDITQIPDVYDSCKYDLLHNSHLNLG
GLNELFKVAQLLADGVIPNEYGINPKQKLKIGSKVARRLLGKIMIDLRNTREEALSVAEL
KGSQDNLAVNKTTKEDTEYHTKPHTRNEESRRTSFNSERSMDQDDDDDKEPKYRLDPKYA
NVRTPERHVRTRLYFTSESHIHSLMNVLRYCNLDESLQGEDSLVCDNALDRLYKTKELDY
MSYIVLRMFENTEVALEDLKRFRIELTFSRGADLSPLEVNDEIAASLHQEHTLPIMGPER
LQEVGSYLTLANMEKLVRPFAMPAEDFPPPSTPQGFSGYFSKSASVLERLAKIWPFHKHV
NNNGK*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400003302
Transcript Infomation

pacid=37426414 locus=PGSC0003DMG403001309 ID=PGSC0003DMT400003302.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTAAGTGGGGTTGAGAAAAGTGCAAATCTTGGAGCTTTTTGTCAGTCAGAGAAGAAG
AAAGAGAAAGACAAGAAAAAGAAGATGAAGATGAAGATGAAGAAGGAGAAGGAGGAGGAA
AGTGTCGGGAAGAAGATAACTATTGGTGTTTGTGTAATGGAAAAGAAGGTATTTTCAGCG
CCAATGGAACAGATTCTTGAAAGATTGCAGTGTTTTGGGGAATTTGAGGTTGTGTACTTT
GGGGACAAAGCTATTCTTGAGGATCCAATTGAGTGCTGGCCGTTATGCGACTGCTTGATT
GCCTTCTACTCCAGTGGATATCCTTTGAAGAAGGCAGAAGCATATGCTTCATTAAGAAAG
CCTTTCCTTGTGAATGAATTGGAACCACAATACCTTCTTCATGATCGGAGGAAAGTATAC
GAGCGTCTTGAGATGTTTGGAATCCCTGTGCCAAGGTATGCTTGCGTTCACAGAGAAGTA
CCTAACCAACATTTGGATTATTTTGTTGAAGACGATGACTTTGTTGAAGTTCATGGGAAT
CGCTTTTGGAAACCTTTTGTGGAAAAGCCTGTCAATGCTGATGACCACAGAATAATGATT
TACTATCCTAGTTCAGCTGGTGGGGGAATGAAGGAATTGTTCCGTAAGGTTGGTAACCGC
TCAAGTGAGTTCCATCCAGAGGTTAGAAGAGTAAGACGTGAAGGATCCTACATATATGAG
GAATTCATGCCCACTGGAGGAACAGATGTTAAGGTGTATACAGTTGGTCCAGATTATGCA
CATGCAGAGGCAAGGAAATCTCCTGTTGTTGATGGTGTTGTTATGAGAAATCCTGATGGG
AAAGAAGTTCGGTATCCTGTTCTACTTACCCCTGCAGAGAAGCAAATGGCCAGAGAAGTT
TGCATAGCCTTTAGGCAAGCAGTTTGTGGCTTCGATCTATTGCGTAGTGAGGGGCGTTCA
TATGTTTGTGATGTAAATGGCTGGAGCTTTGTGAAGAACTCTTACAAGTACTATGACGAT
GCTGCTTGTGTGTTGAGGAAGATGTTTCTAGATGCAAAAGCTCCACATCTTTCATCGACA
ATCCCACCAATTTTACCATGGAAAGTCAGTGAACCAGTTCAGCCTTCTGAGGGGTTAACA
CGTCAAGGAAGTGGGCTGATTGGCACATTTGGACAAGCAGAGGAACTACGATGTGTTGTT
ACAATTGTTCGGCATGGTGATAGAACTCCAAAACAAAAAGTGAAGTTGAAGGTTACTGAG
GAAAAACTCTTAAATTTGATGTTAAAATACAATGGCGGTAAACCTAGATCAGAGACAAAG
CTCAAAACTGCTGTGCAGTTGCAAGATCTTTTGGATGCCACCAGAGCCTTAGTGCCACGT
TCTAGGCCTGGTCGGGAAAGTGATAGTGAAGCTGAAGACATTGAGCATGCTGAGAAACTT
CGTCAAGTAAAAGCTGTTCTTGAGGAGGGGGGACATTTTTCTGGAATTTATAGAAAAGTT
CAGCTAAAGCCACTAAAGTGGGCTAAAGTTGCCAAGTCAAATGGTGAAGGTGAAGAAGAA
CGGCCTGTTGAAGCTCTTATGGTTCTGAAATATGGAGGTGTTCTCACTCACGCTGGCAGA
AAGCAGGCTGAAGAACTTGGAAGATACTTCCGTAATAACATGTATCCAGGTGAAGGTACA
GGCCTCCTTCGCCTCCATAGTACATATCGCCATGACCTAAAAATATACAGCTCTGATGAG
GGCCGTGTGCAGATGTCTGCAGCTGCATTTGCTAAAGGTCTACTTGACTTGGAAGGACAA
TTGACACCTATCCTGGTATCGCTGGTTAGCAAAGATTCTTCAATGCTTGATGGACTTGAC
AATGCCAGTATCGAAATGGAAGATGCTAAGGCAAGGTTGAATGACATAATTACTTCTGGA
ACAAGGACACTTCATAAAAATGGATCAGCAGAGAAACCTTGGATGGTTGATGGAGCAGGA
CTCCCTCCCAATGCATCTGAACTTCTGCCCAAATTGGTGAAATTTACTAAGAAGGTGACA
GAGCAAGTGAGGCTTCTTGCTAAGGATGAGGATGAAGAACTTGCAGAGGCTAGTCCATAT
GATGTAATTCCACCTTATGATCAAGCTAAAGCGCTTGGTAAAACAAATATTGATGTTGAT
CGTATTGCTGCGGGTTTACCTTGTGGTAGCGAGGGATTTCTACTCATGTATGCAAGATGG
AGAAAACTAGAGAGGGATTTATATAACGAACGGAAAGACCGTTTTGATATCACGCAAATT
CCAGATGTTTATGACTCGTGCAAGTACGACCTCTTGCACAATTCACATCTGAATCTAGGG
GGCTTGAATGAACTTTTTAAGGTTGCTCAGCTACTTGCAGATGGTGTTATTCCAAATGAA
TATGGGATAAATCCAAAGCAGAAATTAAAGATTGGATCAAAGGTTGCTCGCCGCTTGTTG
GGTAAAATTATGATTGATCTAAGGAATACCCGTGAAGAAGCTCTAAGTGTGGCCGAATTG
AAAGGTAGTCAAGACAATTTAGCAGTGAATAAGACAACAAAGGAAGATACAGAGTATCAT
ACCAAGCCTCACACTCGTAATGAAGAGTCTCGAAGAACTAGCTTCAATAGTGAGAGATCC
ATGGATCAAGATGATGATGACGACAAAGAGCCTAAGTACCGCTTAGATCCAAAGTATGCA
AATGTCAGAACACCTGAAAGACATGTGCGAACACGCCTGTACTTCACATCAGAGTCACAT
ATCCATTCCTTGATGAATGTTCTTCGTTATTGCAACCTGGATGAGTCTCTTCAAGGAGAG
GACAGCCTTGTGTGCGATAATGCTTTGGATCGCTTGTACAAAACCAAGGAGCTAGATTAC
ATGAGTTATATTGTATTGAGGATGTTCGAGAACACAGAGGTGGCTCTGGAAGACCTTAAA
AGGTTCCGCATAGAGCTAACTTTTAGTCGTGGTGCCGATCTATCACCACTTGAGGTAAAT
GATGAGATAGCTGCTTCATTGCATCAAGAGCACACACTGCCAATAATGGGTCCTGAAAGG
CTTCAAGAAGTTGGGTCATATCTTACGTTGGCAAACATGGAAAAACTGGTGCGTCCATTT
GCCATGCCAGCTGAAGATTTCCCACCACCGTCAACTCCTCAAGGGTTTTCTGGATATTTC
TCGAAAAGTGCATCGGTTTTAGAGCGCCTGGCAAAGATTTGGCCCTTCCACAAGCATGTG
AACAACAATGGGAAGTAG