Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400003005
CDS Infomation

pacid=37428912 polypeptide=PGSC0003DMP400002169 locus=PGSC0003DMG400001184 ID=PGSC0003DMT400003005.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGTAATGGTTCAATATCTCTAGCACTTGAATCCTCTTCTTCCCTTTTCACCAAAATA
CTCCATTACACTCGATCCAAAAACATTCCAAAAGGTCAATCTCTTCACGCTCATCTCCTT
AAAACTGGTTCTTCATCTTCTTGCATTTACCTATCTAACAGTATTGTCAACTTATATGCC
AAGTGCCACCGTTTGTCGGACGCCCATCTCGCTTTCCAAGAAATACAGAGCAAAGACGTT
GTCTCATGGAACTGTCTCATCAATGGCTATTCTCAATTGGGTCGTCGAGATTCTTCTCTT
TCCGTTCTCAATCTCTTCAAGTTAATGAGACAAGAAAATGCCCTCCCAAATCCTCACACC
TTTGCTGGCATTTTTACCTCTGTTTCGACTTTGGGGGATTCCTTTACTGGGAAGCAAGCA
CATTGTCTTGCGTTCAAACTCGGTTACCTTTCTGATGTATTTGTGGGTAGTTCTTTGTTG
AATGTGTATTGTAAGGCTGGTCATTATCTTGGTGATGCCCGCAAGATGTTTGATGAAATG
CCTGAGAGAAATTCTGTTTCTTGGACTACGATGATATCTGGATATGCGTTGCAGAGGATG
GTTAAGGAGGCTGTGGGAGTGTTTAGTGTGATGCTGTGGGAGAGAGGGGAAGATGTGAAT
GAGTTTGTCTTTACTAGTGTTCTTAGTGCTATTGCATTGCCTGAGTTTGTTTATGTTGGA
AAGCAAATTCATTGTCTTTCTCTGAAGAATGGATTTTTGTGGGCTGTTTCTGTTGCTAAT
GCTACTGTGACTATGTATGCGAAGTGTGGGAGTTTGGATGATGCGTGTTGGGCGTTCGAG
CTCTCCTCTGAAAAGAATTCTATAACTTGGTCTGCGTTAATTACTGGTTACGCACAGAAT
GGGGATTGTGAGAAGGCGTTGAAGTTGTTCTCTGAGATGCATTACTGTGGGATGAATCCC
AGTGAGTACACTCTGGTTGGGGTGCTTAATGCTTGTAGTGATTTTGATGCACTTAGAGAA
GGAAAACAGGTGCATGGATATCTGTTGAAGTTGGGATTTGAGCCTCAAATGTATATTCTG
ACTGCGTTAGTGGACATGTATGCTAAATGTGGTAATATAAGTGATGCAAGAAGAGGTTTC
GATTATTTGAAAGAACCCGACATAGTCTTATGGACTTCCATGATAGCAGGATATGTAAAG
AATGGGGATAATGAAAGTGCTATGGGTATGTATTGTAGAATGCTGATGGAGGGTGTTATA
CCCAATGAGTTGACAATGGCGAGCGTGTTAAAAGCCTGTTCTAGTCTTGCTGCTTTGGAA
CAGGGGAAGCAGATTCATGCTCACATAGTCAAGCATGGGTTTAATCTTGAAGTTCCAATT
GGAAGTGCTCTGTCAACTATGTACGCAAAATCTGGAAGCCTCCATGACGGTAATCTAGTC
TTTAGGCGAATGCCTGCTAGAGACTTAGTGTCATGGAACTCAATGATGTCAGGTCTTTCT
CAGAACGGCTGCGGGACTGAAGCCCTTGAACTTTTTGAGGAAATGCTTCATGAGGGAACA
AGACCAGATTATGTTACTTTTGTAAACATTCTTTCAGCTTGTAGTCACATGGGTTTGGTA
AAGAGAGGGTGGAGTATTTTCAAAATGATGTCTGATGAGTTCGGGATAGAACCAAGGCTA
GAGCATTTCGCGTGTATGGTAGATATGTTTGGTCGTGCTGGAGAACTCTACGAAGCAAAA
GAATTTATCGAGTCAGCAGCAAGTCATGTTGACCATGGTCTGTGTTTGTGGCGTATCTTG
CTAAGTGCTTGCAGGAACTACAGAAACTATGAACTAGGCGCATACGCTGGAGAGAAGTTA
ATGGAATTAGGTTCACAAGAGTCATCTGCTTATGTGTTACTCTCTAGTATTTACTCAGCT
CTAGGAAGATTGGAGGACGTTGAACGCGTGAGAAGGTTGATGAATCTCCGCGGAGTAAGC
AAGGAGCCGGGATGTAGCTGGATTGAGCTGAAGAGTCAGTTTCATGTATTTGTTGTTGGA
GATCAGTTGCATCCACAAATCATACATATACGCGACGAGTTATGGAAGTTAAGTAAGCTC
ATGAAAGATGAGGGATACAAACCAGATTTTGATCCTTGCTTAGAGTTAAAGGGAGTAATG
GACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400002169
PEP Infomation

pacid=37428912 transcript=PGSC0003DMT400003005 locus=PGSC0003DMG400001184 ID=PGSC0003DMT400003005.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSNGSISLALESSSSLFTKILHYTRSKNIPKGQSLHAHLLKTGSSSSCIYLSNSIVNLYA
KCHRLSDAHLAFQEIQSKDVVSWNCLINGYSQLGRRDSSLSVLNLFKLMRQENALPNPHT
FAGIFTSVSTLGDSFTGKQAHCLAFKLGYLSDVFVGSSLLNVYCKAGHYLGDARKMFDEM
PERNSVSWTTMISGYALQRMVKEAVGVFSVMLWERGEDVNEFVFTSVLSAIALPEFVYVG
KQIHCLSLKNGFLWAVSVANATVTMYAKCGSLDDACWAFELSSEKNSITWSALITGYAQN
GDCEKALKLFSEMHYCGMNPSEYTLVGVLNACSDFDALREGKQVHGYLLKLGFEPQMYIL
TALVDMYAKCGNISDARRGFDYLKEPDIVLWTSMIAGYVKNGDNESAMGMYCRMLMEGVI
PNELTMASVLKACSSLAALEQGKQIHAHIVKHGFNLEVPIGSALSTMYAKSGSLHDGNLV
FRRMPARDLVSWNSMMSGLSQNGCGTEALELFEEMLHEGTRPDYVTFVNILSACSHMGLV
KRGWSIFKMMSDEFGIEPRLEHFACMVDMFGRAGELYEAKEFIESAASHVDHGLCLWRIL
LSACRNYRNYELGAYAGEKLMELGSQESSAYVLLSSIYSALGRLEDVERVRRLMNLRGVS
KEPGCSWIELKSQFHVFVVGDQLHPQIIHIRDELWKLSKLMKDEGYKPDFDPCLELKGVM
D*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400003005
Transcript Infomation

pacid=37428912 locus=PGSC0003DMG400001184 ID=PGSC0003DMT400003005.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGTAATGGTTCAATATCTCTAGCACTTGAATCCTCTTCTTCCCTTTTCACCAAAATA
CTCCATTACACTCGATCCAAAAACATTCCAAAAGGTCAATCTCTTCACGCTCATCTCCTT
AAAACTGGTTCTTCATCTTCTTGCATTTACCTATCTAACAGTATTGTCAACTTATATGCC
AAGTGCCACCGTTTGTCGGACGCCCATCTCGCTTTCCAAGAAATACAGAGCAAAGACGTT
GTCTCATGGAACTGTCTCATCAATGGCTATTCTCAATTGGGTCGTCGAGATTCTTCTCTT
TCCGTTCTCAATCTCTTCAAGTTAATGAGACAAGAAAATGCCCTCCCAAATCCTCACACC
TTTGCTGGCATTTTTACCTCTGTTTCGACTTTGGGGGATTCCTTTACTGGGAAGCAAGCA
CATTGTCTTGCGTTCAAACTCGGTTACCTTTCTGATGTATTTGTGGGTAGTTCTTTGTTG
AATGTGTATTGTAAGGCTGGTCATTATCTTGGTGATGCCCGCAAGATGTTTGATGAAATG
CCTGAGAGAAATTCTGTTTCTTGGACTACGATGATATCTGGATATGCGTTGCAGAGGATG
GTTAAGGAGGCTGTGGGAGTGTTTAGTGTGATGCTGTGGGAGAGAGGGGAAGATGTGAAT
GAGTTTGTCTTTACTAGTGTTCTTAGTGCTATTGCATTGCCTGAGTTTGTTTATGTTGGA
AAGCAAATTCATTGTCTTTCTCTGAAGAATGGATTTTTGTGGGCTGTTTCTGTTGCTAAT
GCTACTGTGACTATGTATGCGAAGTGTGGGAGTTTGGATGATGCGTGTTGGGCGTTCGAG
CTCTCCTCTGAAAAGAATTCTATAACTTGGTCTGCGTTAATTACTGGTTACGCACAGAAT
GGGGATTGTGAGAAGGCGTTGAAGTTGTTCTCTGAGATGCATTACTGTGGGATGAATCCC
AGTGAGTACACTCTGGTTGGGGTGCTTAATGCTTGTAGTGATTTTGATGCACTTAGAGAA
GGAAAACAGGTGCATGGATATCTGTTGAAGTTGGGATTTGAGCCTCAAATGTATATTCTG
ACTGCGTTAGTGGACATGTATGCTAAATGTGGTAATATAAGTGATGCAAGAAGAGGTTTC
GATTATTTGAAAGAACCCGACATAGTCTTATGGACTTCCATGATAGCAGGATATGTAAAG
AATGGGGATAATGAAAGTGCTATGGGTATGTATTGTAGAATGCTGATGGAGGGTGTTATA
CCCAATGAGTTGACAATGGCGAGCGTGTTAAAAGCCTGTTCTAGTCTTGCTGCTTTGGAA
CAGGGGAAGCAGATTCATGCTCACATAGTCAAGCATGGGTTTAATCTTGAAGTTCCAATT
GGAAGTGCTCTGTCAACTATGTACGCAAAATCTGGAAGCCTCCATGACGGTAATCTAGTC
TTTAGGCGAATGCCTGCTAGAGACTTAGTGTCATGGAACTCAATGATGTCAGGTCTTTCT
CAGAACGGCTGCGGGACTGAAGCCCTTGAACTTTTTGAGGAAATGCTTCATGAGGGAACA
AGACCAGATTATGTTACTTTTGTAAACATTCTTTCAGCTTGTAGTCACATGGGTTTGGTA
AAGAGAGGGTGGAGTATTTTCAAAATGATGTCTGATGAGTTCGGGATAGAACCAAGGCTA
GAGCATTTCGCGTGTATGGTAGATATGTTTGGTCGTGCTGGAGAACTCTACGAAGCAAAA
GAATTTATCGAGTCAGCAGCAAGTCATGTTGACCATGGTCTGTGTTTGTGGCGTATCTTG
CTAAGTGCTTGCAGGAACTACAGAAACTATGAACTAGGCGCATACGCTGGAGAGAAGTTA
ATGGAATTAGGTTCACAAGAGTCATCTGCTTATGTGTTACTCTCTAGTATTTACTCAGCT
CTAGGAAGATTGGAGGACGTTGAACGCGTGAGAAGGTTGATGAATCTCCGCGGAGTAAGC
AAGGAGCCGGGATGTAGCTGGATTGAGCTGAAGAGTCAGTTTCATGTATTTGTTGTTGGA
GATCAGTTGCATCCACAAATCATACATATACGCGACGAGTTATGGAAGTTAAGTAAGCTC
ATGAAAGATGAGGGATACAAACCAGATTTTGATCCTTGCTTAGAGTTAAAGGGAGTAATG
GACTGA