Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400002768
CDS Infomation

pacid=37446944 polypeptide=PGSC0003DMP400002002 locus=PGSC0003DMG400001072 ID=PGSC0003DMT400002768.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAGGAGAAAACTCAAACACCCATTTGCTCTCTGTTTTTTCTTGTGCTCTGTTTTTTG
TGTTCAGTTTTTACTGAACACACAAATGCTGAGTTTACTGTCTCTGAAAATGGCCCTTTA
ACTGATTCTGAAGCTCAGTTCATCAAACACAGGCAGCTTTTGTATTACAGAGATGAGTTT
GGTGATAGAGGTGAAAATGTGAAAATTGATCCATCTATGGTGTTTGAGAATGATAGAATC
AAGAATGCTTATATTGCTTTACAAGCATGGAAACAAGCTATCATTTCAGATCCCTTTAAT
ATCACTCTCAATTGGGTTGGTCCTAATGTATGCAGCTACACCGGAATCTTCTGTGCTCCG
GCTTTGGATAACCCCAAAATCCGTACAGTTGCCGGCATTGACCTTAACCATGGTGACATT
GCAGGGTACCTCCCGGAAGAGCTTGGGCTTCTTACAGATCTTGGGATTTTCCATATCAAT
TCAAACCGTTTCTGTGGTACAATACCAAGAAAATTCAGCAAGTTGAAGATACTGTTCGAG
CTGGATCTGAGTAATAACAGGTTTGCTGGGAAGTTTCCTTATGTTGTTTTGAGTTTACCC
AAGTTGATATTTTTGGATATTAGGTTCAATGAATTTGAAGGTAATGTACCTTCACAGCTT
TTTGATAAGCCATTAGACGCCATTTTTATTAATCATAATCGATTTGCGTTTGAGTTGCCG
GAGAATTTTGGGAATTCGCCGGTTTCTGTGATAGTTCTGGCGAGTAACAGTTTCCATGGG
TGTCTTCCGGCGAGTATTGGGAATATGAGTAATCTTAATGAAGCGATTTTAATGAATAAT
GGGTTGCGTTCTTGTTTGCCGGCGGAGATTGGGGTGTTGAAAAATTTGACTGTATTTGAT
GTGAGCTTTAATCAGTTGATGGGTCCGTTGCCGGAGAATTTTGGTGATTTGGTGAATTTG
GAGCAATTGAATGTGGCACATAATATGCTTTCTGGGACAATTCCGAAAAGTATTTGTCAG
CTTCCTAAGCTTGAGAATTTTACGTATTCTTATAATTTCTTCACTGGTGAACCGCCGGTG
TGTTTGGGGTTGCCGGAGTTTCATGATGAACGGAATTGTTTGCCCAACAGACCGGTGCAA
CGCTCTCCGGGACAGTGTAAGGCCTTTTTGTCTAAAAAAATTCATTGTAGTGCTTTCAGG
TGTCATAAATTTGTTCCTGTTTTGCCACCTCCTCCGCCACTTTCACCGCCCTTGCCTGCC
CCTCCGCCACCTGTTTATTCGCCTCCGCCACCAGTTTATACTCCTCCTTCTCCTTCCCCA
CCACCTCCTCCACCTCCAGTTTATTCACCACCGCCACCACCACCCTCTCCACCTCCTCCA
TCACCTCCCCCGCCTCCACCACCAGTCTATTCACCTCCACCCCCACCTCCATCTCCTCCT
CCACCATCACCTCCACCACCACCCCCGCCATCTCCACCTCCACCACCAGTTTATTCATCA
CCACCACCGCCACCATCTCCCCCTCCACCATCACCTCCACCTCCTCCCCCACCCGTTTAT
TCGCCACCACCATCTCCACCTCCTCCATCACCATTGCCTTATTGTATACGCTCACCTCCA
CCACCAAATTCCCCACCTCCTAATTCTCCACCTCCACCGCTTGCTCACTCGCCTCCACCC
CCTTCACCTTACTATTACAATTCACCACCACCTCCGCCCCCAAATTCGCCTCCTCCTCCA
CCAGTATACATATACTCATCACCTCCGCCACCAAATTCACCTCCTCCTCCACCGCCAACA
TACGTATATTCTTCACCTCCTCCACCTCCTTCCCCATTGCCTTGTATAGAACCCCCTCCA
CCACCTCCTCCTTGCATTGAACCACCCCCACCCCCCTCCCCTTCACCATCTCCTCCTCCA
CCACCGGTTTATCATTACAATTCTCCGCCCCCACCATCTCCATCACCTCCACCACCAGTT
TATTATCATTACAATTCTCCGCCCCCACCATCTCCATCACCTCCACCACCAGTTTATTAT
TACAATTCTCCACCACCACCATCACCACCGCCTACTCCAGTATACGAAGGGCCATTACCA
CCAGTAATAGGAGTTCAATATGCTTCACCACCTCCACCACCCTTTTATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400002002
PEP Infomation

pacid=37446944 transcript=PGSC0003DMT400002768 locus=PGSC0003DMG400001072 ID=PGSC0003DMT400002768.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MKEKTQTPICSLFFLVLCFLCSVFTEHTNAEFTVSENGPLTDSEAQFIKHRQLLYYRDEF
GDRGENVKIDPSMVFENDRIKNAYIALQAWKQAIISDPFNITLNWVGPNVCSYTGIFCAP
ALDNPKIRTVAGIDLNHGDIAGYLPEELGLLTDLGIFHINSNRFCGTIPRKFSKLKILFE
LDLSNNRFAGKFPYVVLSLPKLIFLDIRFNEFEGNVPSQLFDKPLDAIFINHNRFAFELP
ENFGNSPVSVIVLASNSFHGCLPASIGNMSNLNEAILMNNGLRSCLPAEIGVLKNLTVFD
VSFNQLMGPLPENFGDLVNLEQLNVAHNMLSGTIPKSICQLPKLENFTYSYNFFTGEPPV
CLGLPEFHDERNCLPNRPVQRSPGQCKAFLSKKIHCSAFRCHKFVPVLPPPPPLSPPLPA
PPPPVYSPPPPVYTPPSPSPPPPPPPVYSPPPPPPSPPPPSPPPPPPPVYSPPPPPPSPP
PPSPPPPPPPSPPPPPVYSSPPPPPSPPPPSPPPPPPPVYSPPPSPPPPSPLPYCIRSPP
PPNSPPPNSPPPPLAHSPPPPSPYYYNSPPPPPPNSPPPPPVYIYSSPPPPNSPPPPPPT
YVYSSPPPPPSPLPCIEPPPPPPPCIEPPPPPSPSPSPPPPPVYHYNSPPPPSPSPPPPV
YYHYNSPPPPSPSPPPPVYYYNSPPPPSPPPTPVYEGPLPPVIGVQYASPPPPPFY*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400002768
Transcript Infomation

pacid=37446944 locus=PGSC0003DMG400001072 ID=PGSC0003DMT400002768.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAGGAGAAAACTCAAACACCCATTTGCTCTCTGTTTTTTCTTGTGCTCTGTTTTTTG
TGTTCAGTTTTTACTGAACACACAAATGCTGAGTTTACTGTCTCTGAAAATGGCCCTTTA
ACTGATTCTGAAGCTCAGTTCATCAAACACAGGCAGCTTTTGTATTACAGAGATGAGTTT
GGTGATAGAGGTGAAAATGTGAAAATTGATCCATCTATGGTGTTTGAGAATGATAGAATC
AAGAATGCTTATATTGCTTTACAAGCATGGAAACAAGCTATCATTTCAGATCCCTTTAAT
ATCACTCTCAATTGGGTTGGTCCTAATGTATGCAGCTACACCGGAATCTTCTGTGCTCCG
GCTTTGGATAACCCCAAAATCCGTACAGTTGCCGGCATTGACCTTAACCATGGTGACATT
GCAGGGTACCTCCCGGAAGAGCTTGGGCTTCTTACAGATCTTGGGATTTTCCATATCAAT
TCAAACCGTTTCTGTGGTACAATACCAAGAAAATTCAGCAAGTTGAAGATACTGTTCGAG
CTGGATCTGAGTAATAACAGGTTTGCTGGGAAGTTTCCTTATGTTGTTTTGAGTTTACCC
AAGTTGATATTTTTGGATATTAGGTTCAATGAATTTGAAGGTAATGTACCTTCACAGCTT
TTTGATAAGCCATTAGACGCCATTTTTATTAATCATAATCGATTTGCGTTTGAGTTGCCG
GAGAATTTTGGGAATTCGCCGGTTTCTGTGATAGTTCTGGCGAGTAACAGTTTCCATGGG
TGTCTTCCGGCGAGTATTGGGAATATGAGTAATCTTAATGAAGCGATTTTAATGAATAAT
GGGTTGCGTTCTTGTTTGCCGGCGGAGATTGGGGTGTTGAAAAATTTGACTGTATTTGAT
GTGAGCTTTAATCAGTTGATGGGTCCGTTGCCGGAGAATTTTGGTGATTTGGTGAATTTG
GAGCAATTGAATGTGGCACATAATATGCTTTCTGGGACAATTCCGAAAAGTATTTGTCAG
CTTCCTAAGCTTGAGAATTTTACGTATTCTTATAATTTCTTCACTGGTGAACCGCCGGTG
TGTTTGGGGTTGCCGGAGTTTCATGATGAACGGAATTGTTTGCCCAACAGACCGGTGCAA
CGCTCTCCGGGACAGTGTAAGGCCTTTTTGTCTAAAAAAATTCATTGTAGTGCTTTCAGG
TGTCATAAATTTGTTCCTGTTTTGCCACCTCCTCCGCCACTTTCACCGCCCTTGCCTGCC
CCTCCGCCACCTGTTTATTCGCCTCCGCCACCAGTTTATACTCCTCCTTCTCCTTCCCCA
CCACCTCCTCCACCTCCAGTTTATTCACCACCGCCACCACCACCCTCTCCACCTCCTCCA
TCACCTCCCCCGCCTCCACCACCAGTCTATTCACCTCCACCCCCACCTCCATCTCCTCCT
CCACCATCACCTCCACCACCACCCCCGCCATCTCCACCTCCACCACCAGTTTATTCATCA
CCACCACCGCCACCATCTCCCCCTCCACCATCACCTCCACCTCCTCCCCCACCCGTTTAT
TCGCCACCACCATCTCCACCTCCTCCATCACCATTGCCTTATTGTATACGCTCACCTCCA
CCACCAAATTCCCCACCTCCTAATTCTCCACCTCCACCGCTTGCTCACTCGCCTCCACCC
CCTTCACCTTACTATTACAATTCACCACCACCTCCGCCCCCAAATTCGCCTCCTCCTCCA
CCAGTATACATATACTCATCACCTCCGCCACCAAATTCACCTCCTCCTCCACCGCCAACA
TACGTATATTCTTCACCTCCTCCACCTCCTTCCCCATTGCCTTGTATAGAACCCCCTCCA
CCACCTCCTCCTTGCATTGAACCACCCCCACCCCCCTCCCCTTCACCATCTCCTCCTCCA
CCACCGGTTTATCATTACAATTCTCCGCCCCCACCATCTCCATCACCTCCACCACCAGTT
TATTATCATTACAATTCTCCGCCCCCACCATCTCCATCACCTCCACCACCAGTTTATTAT
TACAATTCTCCACCACCACCATCACCACCGCCTACTCCAGTATACGAAGGGCCATTACCA
CCAGTAATAGGAGTTCAATATGCTTCACCACCTCCACCACCCTTTTATTAA