Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400002620
CDS Infomation

pacid=37466430 polypeptide=PGSC0003DMP400001907 locus=PGSC0003DMG400001006 ID=PGSC0003DMT400002620.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGATTACTTTCTAGGATGAAATCTACTGTTAACCAACTTCAGACTCCGGTGACTTCA
AACTGTGCTTTTGGTACTTATCTACTTCAAGACGGAGAGGAGAACATTGGCCAGTTTCTT
TATCTTGAAGGAATTGAATATCACATGTTTAATACGTATGATGTCCATTTTTATGCATCA
TATGCGCTATTAATGCTCTTCCCAAAACTTGAGCTGAGCATCCAAAGAGACTGTGCAATG
GCGGTAATGATGCATGATCCATCTAAAATGAAAATTATGAGTGATGGAACATGGGTCTCC
AGAAAGGTTCTTGGAGCTGTCCCTCATGATATTGGACTTAACGATCCATGGTTTGAAGTT
AATGCATACAATTTCTTCAACACAGATAGATGGAAGGACTTAAATTCGAAATTTGTCCTT
CAAGTTTATAGGGATTTTGTTGCTACCGGTGATAAATTTTTTGGAAAAGCTGTTTGGCCA
TCGGTATACATAGCTATAGCATATATGGATCAGTTTGATAAGGATGGAGATGGCATGATA
GAAAATGAAGGGTTCCCTGATCAAACGTACGATGCATGGACTGTTAGTGGTGTGAGCACA
TATAGTGGAGGGCTCTGGGTAGCAGCTGTACAAGCTGCCTCGGCAATGGCTCATGAGGTC
GGTGATGCTGCAGCTGCTGATTACCTTTGGGCTAAGTTTCAGAAGGCAAAGTCTGTATAT
GAGAAGTTATGGAATGGTTCTTACTTTAATTATGATAATAGTGGTCGAAGATCAAGTTCT
TCAATTCATGCTGATCAGTTGGCTGGTCAATGGTATGCTAGAGCGAGTGGTCTTTCACCT
ATTGCTGATGAAGAGAAGATAAGAACAGCTCTGAAGAAAATCTATGATTTCAATGTGTTA
AAGCACAAGGGAGGGATGTGTGGGGCTGTAAATGGGATGCTACCAAGTGGAAAACCTGAT
ATGTCAGCTCTGCAGTCGAGAGAAATATGGACAGGAGTTACGTATTCTCTTGCTGCTAAT
ATGATACAAGAGGGCTTGGTGGACATAGCATTTCAAACTGCAAGTGGAATACACTCGACA
GCTTGGTCAGATAAAGGTCTTGGGTTTGGTTTCCAAACGCCGGAAGGGTGGAACACATAT
GCTCACTATAGATCACTGTGTTATATGAGGCCGTTGGCGATTTGGGCAATGCAATGGGCT
CTATCAAAACCAAAGCTTCACAACCAGGAGATGAAGCAGATGAGTAGTAGTCTAAGTGAG
AATTCTTCCTATGTAAAACAGGATGCAGGATTTCAAGAGGTTGCTCGCCTTCTCAAGTTA
CCAAAACAACAAGCTTCTACAAGTTACATTCAGTCGTTGCATCAGTTTCTTTGTAACAAA
TTCTCAATTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400001907
PEP Infomation

pacid=37466430 transcript=PGSC0003DMT400002620 locus=PGSC0003DMG400001006 ID=PGSC0003DMT400002620.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGLLSRMKSTVNQLQTPVTSNCAFGTYLLQDGEENIGQFLYLEGIEYHMFNTYDVHFYAS
YALLMLFPKLELSIQRDCAMAVMMHDPSKMKIMSDGTWVSRKVLGAVPHDIGLNDPWFEV
NAYNFFNTDRWKDLNSKFVLQVYRDFVATGDKFFGKAVWPSVYIAIAYMDQFDKDGDGMI
ENEGFPDQTYDAWTVSGVSTYSGGLWVAAVQAASAMAHEVGDAAAADYLWAKFQKAKSVY
EKLWNGSYFNYDNSGRRSSSSIHADQLAGQWYARASGLSPIADEEKIRTALKKIYDFNVL
KHKGGMCGAVNGMLPSGKPDMSALQSREIWTGVTYSLAANMIQEGLVDIAFQTASGIHST
AWSDKGLGFGFQTPEGWNTYAHYRSLCYMRPLAIWAMQWALSKPKLHNQEMKQMSSSLSE
NSSYVKQDAGFQEVARLLKLPKQQASTSYIQSLHQFLCNKFSI*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400002620
Transcript Infomation

pacid=37466430 locus=PGSC0003DMG400001006 ID=PGSC0003DMT400002620.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGATTACTTTCTAGGATGAAATCTACTGTTAACCAACTTCAGACTCCGGTGACTTCA
AACTGTGCTTTTGGTACTTATCTACTTCAAGACGGAGAGGAGAACATTGGCCAGTTTCTT
TATCTTGAAGGAATTGAATATCACATGTTTAATACGTATGATGTCCATTTTTATGCATCA
TATGCGCTATTAATGCTCTTCCCAAAACTTGAGCTGAGCATCCAAAGAGACTGTGCAATG
GCGGTAATGATGCATGATCCATCTAAAATGAAAATTATGAGTGATGGAACATGGGTCTCC
AGAAAGGTTCTTGGAGCTGTCCCTCATGATATTGGACTTAACGATCCATGGTTTGAAGTT
AATGCATACAATTTCTTCAACACAGATAGATGGAAGGACTTAAATTCGAAATTTGTCCTT
CAAGTTTATAGGGATTTTGTTGCTACCGGTGATAAATTTTTTGGAAAAGCTGTTTGGCCA
TCGGTATACATAGCTATAGCATATATGGATCAGTTTGATAAGGATGGAGATGGCATGATA
GAAAATGAAGGGTTCCCTGATCAAACGTACGATGCATGGACTGTTAGTGGTGTGAGCACA
TATAGTGGAGGGCTCTGGGTAGCAGCTGTACAAGCTGCCTCGGCAATGGCTCATGAGGTC
GGTGATGCTGCAGCTGCTGATTACCTTTGGGCTAAGTTTCAGAAGGCAAAGTCTGTATAT
GAGAAGTTATGGAATGGTTCTTACTTTAATTATGATAATAGTGGTCGAAGATCAAGTTCT
TCAATTCATGCTGATCAGTTGGCTGGTCAATGGTATGCTAGAGCGAGTGGTCTTTCACCT
ATTGCTGATGAAGAGAAGATAAGAACAGCTCTGAAGAAAATCTATGATTTCAATGTGTTA
AAGCACAAGGGAGGGATGTGTGGGGCTGTAAATGGGATGCTACCAAGTGGAAAACCTGAT
ATGTCAGCTCTGCAGTCGAGAGAAATATGGACAGGAGTTACGTATTCTCTTGCTGCTAAT
ATGATACAAGAGGGCTTGGTGGACATAGCATTTCAAACTGCAAGTGGAATACACTCGACA
GCTTGGTCAGATAAAGGTCTTGGGTTTGGTTTCCAAACGCCGGAAGGGTGGAACACATAT
GCTCACTATAGATCACTGTGTTATATGAGGCCGTTGGCGATTTGGGCAATGCAATGGGCT
CTATCAAAACCAAAGCTTCACAACCAGGAGATGAAGCAGATGAGTAGTAGTCTAAGTGAG
AATTCTTCCTATGTAAAACAGGATGCAGGATTTCAAGAGGTTGCTCGCCTTCTCAAGTTA
CCAAAACAACAAGCTTCTACAAGTTACATTCAGTCGTTGCATCAGTTTCTTTGTAACAAA
TTCTCAATTTGA