Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400002454
CDS Infomation

pacid=37434910 polypeptide=PGSC0003DMP400001780 locus=PGSC0003DMG400000935 ID=PGSC0003DMT400002454.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTAGTTCAGGAGATGCATGGAAATTGAAGGACCATCCTAAGCTTCCTAAGGGAAAG
ACTGTTGCTGTTATTGTTTTGGATGGTTGGGGTGAGGCTAAACCTAATGAGTATAACGCT
ATCTCTGTTGCTGAAACTCCTGTTATGGACTCCCTCAAGCAGGGTGCTCCTGAACATTGG
AGATTGATTAAGGCACATGGAAATGCTGTGGGGCTTCCCACAGAGGATGATATGGGTAAC
AGTGAAGTTGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGAAGGATCTTTGCTCAAGGTGCAAAGCTT
GTTGACCTAGCCCTTGCCTCTGGGAAAATCTATGATGGAGAAGGTTTCAAATACGTTCAA
GAATGTTTTGAGAAAGGAACTCTGCACCTTATTGGTCTCGTGAGTGATGGGGGTGTCCAC
TCCAGGCTTGACCAATTGCTGTTGTTGCTGAAAGGTGCTGCTGAGCGCGGTGCCAAAAGA
ATTTGTGTCCATGCCCTCACCGATGGACGTGATGTTCTGGATGGTTCTAGTGTGGGCTTC
ATGGAGACCCTCGAGAATGATCTAGCAAAATTACGTGAACAAGGTGTTGATGCCCGGGTT
GCATCTGGTGGAGGTCGCATGTATGTTACCATGGATCGTTATGAGAATGACTGGGATGTC
GTAAAAAGAGGTTGGGATGCACAAATTCTTGGTGAGGCTCCACACCACTTCAAGGATCCC
GTTGAGGCAATTAAGAAGTTGAGGCAGGAACCCAATGCCACTGATCAGTACTTGGCCCCT
TTTGTGATTGTTGATGATAATGGAAAGCCTGTTGGGCCTATTTTGGATGGTGATGCTGTT
GTGACTTTCAACTTCAGAGCAGATCGTATGGTCATGCTTGCAAAGGCCCTTGAATACGAA
GATTTTGACAAATTTGATCGTGTACGAGTCCCTAAAATCCATTATGCTGGTATGCTCCAA
TATGATGGTGAATTGAAGCTTCCAAACAAATACCTTGTTTCTCCTCCAGAGATTGACCGG
ACATCTGGGGAGTATCTAGTGCGCAATGGTGTTAGGACTTTTGCTTGCAGTGAGACTGTT
AAATTTGGTCATGTCACCTTCTTTTGGAATGGAAACCGTTCTGGGTATTTTGACGAGAAA
TTGGAAGAGTATGTGGAAATTCCAAGTGACAGTGGGATTACATTTAATGTTAAGCCAAAA
ATGAAGGCACTGGAGATTGCTGAAAGGACTAGGGATGCCATCCTTAGCCACAAATTTGAC
CAGGTACGGGTGAACATACCTAATAGTGATATGGTGGGGCATACTGGTGACATTAAAGCA
ACAATTGAAGCTTGCAAGGCTGCTGATGACGGCGTCAAGATGATCCTTGAAGCTATTGAA
CAAGTGGGTGGAATATTTCTAGTTACTGCTGACCATGGAAATGCTGAGGATATGGTCAAG
AGAAACAAGAAGGGCGAGCCATTACTTGACAAGAATGGAAACATTCAGATTCTCACTTCT
CACACTCTCGAGCCTGTTCCTATTGCAATTGGTGGTCCTGGACTCTTACCTGGTGTGAGA
TTCCGCACAGATCTCCCCACCGGTGGACTTGCAAATGTGGCTGCAACCTTTATGAATCTG
CACGGATTTGAGGCACCTAGCGATTACGAGCCAACCTTGATCGAGGTTGTTGACAACTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400001780
PEP Infomation

pacid=37434910 transcript=PGSC0003DMT400002454 locus=PGSC0003DMG400000935 ID=PGSC0003DMT400002454.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGSSGDAWKLKDHPKLPKGKTVAVIVLDGWGEAKPNEYNAISVAETPVMDSLKQGAPEHW
RLIKAHGNAVGLPTEDDMGNSEVGHNALGAGRIFAQGAKLVDLALASGKIYDGEGFKYVQ
ECFEKGTLHLIGLVSDGGVHSRLDQLLLLLKGAAERGAKRICVHALTDGRDVLDGSSVGF
METLENDLAKLREQGVDARVASGGGRMYVTMDRYENDWDVVKRGWDAQILGEAPHHFKDP
VEAIKKLRQEPNATDQYLAPFVIVDDNGKPVGPILDGDAVVTFNFRADRMVMLAKALEYE
DFDKFDRVRVPKIHYAGMLQYDGELKLPNKYLVSPPEIDRTSGEYLVRNGVRTFACSETV
KFGHVTFFWNGNRSGYFDEKLEEYVEIPSDSGITFNVKPKMKALEIAERTRDAILSHKFD
QVRVNIPNSDMVGHTGDIKATIEACKAADDGVKMILEAIEQVGGIFLVTADHGNAEDMVK
RNKKGEPLLDKNGNIQILTSHTLEPVPIAIGGPGLLPGVRFRTDLPTGGLANVAATFMNL
HGFEAPSDYEPTLIEVVDN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400002454
Transcript Infomation

pacid=37434910 locus=PGSC0003DMG400000935 ID=PGSC0003DMT400002454.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTAGTTCAGGAGATGCATGGAAATTGAAGGACCATCCTAAGCTTCCTAAGGGAAAG
ACTGTTGCTGTTATTGTTTTGGATGGTTGGGGTGAGGCTAAACCTAATGAGTATAACGCT
ATCTCTGTTGCTGAAACTCCTGTTATGGACTCCCTCAAGCAGGGTGCTCCTGAACATTGG
AGATTGATTAAGGCACATGGAAATGCTGTGGGGCTTCCCACAGAGGATGATATGGGTAAC
AGTGAAGTTGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGAAGGATCTTTGCTCAAGGTGCAAAGCTT
GTTGACCTAGCCCTTGCCTCTGGGAAAATCTATGATGGAGAAGGTTTCAAATACGTTCAA
GAATGTTTTGAGAAAGGAACTCTGCACCTTATTGGTCTCGTGAGTGATGGGGGTGTCCAC
TCCAGGCTTGACCAATTGCTGTTGTTGCTGAAAGGTGCTGCTGAGCGCGGTGCCAAAAGA
ATTTGTGTCCATGCCCTCACCGATGGACGTGATGTTCTGGATGGTTCTAGTGTGGGCTTC
ATGGAGACCCTCGAGAATGATCTAGCAAAATTACGTGAACAAGGTGTTGATGCCCGGGTT
GCATCTGGTGGAGGTCGCATGTATGTTACCATGGATCGTTATGAGAATGACTGGGATGTC
GTAAAAAGAGGTTGGGATGCACAAATTCTTGGTGAGGCTCCACACCACTTCAAGGATCCC
GTTGAGGCAATTAAGAAGTTGAGGCAGGAACCCAATGCCACTGATCAGTACTTGGCCCCT
TTTGTGATTGTTGATGATAATGGAAAGCCTGTTGGGCCTATTTTGGATGGTGATGCTGTT
GTGACTTTCAACTTCAGAGCAGATCGTATGGTCATGCTTGCAAAGGCCCTTGAATACGAA
GATTTTGACAAATTTGATCGTGTACGAGTCCCTAAAATCCATTATGCTGGTATGCTCCAA
TATGATGGTGAATTGAAGCTTCCAAACAAATACCTTGTTTCTCCTCCAGAGATTGACCGG
ACATCTGGGGAGTATCTAGTGCGCAATGGTGTTAGGACTTTTGCTTGCAGTGAGACTGTT
AAATTTGGTCATGTCACCTTCTTTTGGAATGGAAACCGTTCTGGGTATTTTGACGAGAAA
TTGGAAGAGTATGTGGAAATTCCAAGTGACAGTGGGATTACATTTAATGTTAAGCCAAAA
ATGAAGGCACTGGAGATTGCTGAAAGGACTAGGGATGCCATCCTTAGCCACAAATTTGAC
CAGGTACGGGTGAACATACCTAATAGTGATATGGTGGGGCATACTGGTGACATTAAAGCA
ACAATTGAAGCTTGCAAGGCTGCTGATGACGGCGTCAAGATGATCCTTGAAGCTATTGAA
CAAGTGGGTGGAATATTTCTAGTTACTGCTGACCATGGAAATGCTGAGGATATGGTCAAG
AGAAACAAGAAGGGCGAGCCATTACTTGACAAGAATGGAAACATTCAGATTCTCACTTCT
CACACTCTCGAGCCTGTTCCTATTGCAATTGGTGGTCCTGGACTCTTACCTGGTGTGAGA
TTCCGCACAGATCTCCCCACCGGTGGACTTGCAAATGTGGCTGCAACCTTTATGAATCTG
CACGGATTTGAGGCACCTAGCGATTACGAGCCAACCTTGATCGAGGTTGTTGACAACTAG