Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400002350
CDS Infomation	pacid=37466733 polypeptide=PGSC0003DMP400001703 locus=PGSC0003DMG400000897 ID=PGSC0003DMT400002350.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGCTACCTTTCTTGTTCCTCTTGTTGAGCTTTAGTTTCATCCATCCCACAACTTCAAAA TCTACTATTGAACCATGTTCCAACTCTGATACTTGTTCTTCCCTTCTTGGCTACTCTCTT TATACTGACCTTAAGGTTTCTGAAGTGGCTTCACTCTTCCAGACAGACCCAATATCTCTT CTTACTACTAATGCTATTGATATCTCATATCCAGATGTTGAAAATCACATACTTCCAGCT AAACTGTTCCTTAAGGTCCCTGTTACTTGTTCTTGTGTTGATGGGATCTTTAAGTCTGCC TTTGTTCATTACAAGACTAGGCCTTCTGATACTCTGTCTATGATTGCTGACACAATATAT GGTGGTCTTGTTTCTGCTGACCAGATCAAGGAAGGAAACCCCAATGCTGTTGGTCCTGAC CCTTCAGTGTTAAATGTTGGGACTAATCTTTGGATTCCTCTTCCTTGCACTTGCTTTAAT GGGACTGACAATAATCTTCCTGCTATTTATATGTCATATGTTGTTAGAGCTGTAGATACT CTTGCAGGGATTGCTGCTAGGTACTCTACCACTCTTACTGACCTTATGAATGTTAATGCT TTGGGAGGTCCTTCTATTAAGGAGGGTGACATTCTTTCCATTCCTCTGTCTGCTTGTACA TCTAGCTTCCCAAGATCTGCCTCAGATTATGGCTTATCTGTTGCGAATGGGAGCTATTCT ATTACAGCTAGCCACTGTGTGCAATGCAGTTGTGGACCAGGGGGTCGGAATTTGTACTGC ATGCCAGCTTCCTTAGCAGTTTCTTGCTCAAGCATGCAGTGCAAGAACAGCAATCTCATG CTCGGAAATGTTACCATACAACAGACTGGTGGTGGTTGCAATGTGACTTCTTGCAATTAC GGTGGCCTTGTTAATGGAACCATCATCACTACATTATCCACTTCTCTTCAACCTCGATGC CCTGGACCCCAACAATTTCCTCCACTTGTTGCCCCACCTACATCAGTAGGCCCCGACTCG ATGTTTGCTCCTGCCCCTTCACCTTCTGAATCTGGTGGTGCTCCGATGGATGGTCCACAT TCTTCTATAGTGCCTGCATCTGGCTCAGTCATAGCATTTCCACCTTCAGGTGGACCAAGT GGAAGTGCATCTTCCGCTTGCTCGTTGAACCCTTTCGTTAGTTTTCCTATGGCAGTTTTC TTGTGTTTGTCTATGAAATACGCGATCTCACTTCCTTTATAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400001703
PEP Infomation	pacid=37466733 transcript=PGSC0003DMT400002350 locus=PGSC0003DMG400000897 ID=PGSC0003DMT400002350.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MLPFLFLLLSFSFIHPTTSKSTIEPCSNSDTCSSLLGYSLYTDLKVSEVASLFQTDPISL LTTNAIDISYPDVENHILPAKLFLKVPVTCSCVDGIFKSAFVHYKTRPSDTLSMIADTIY GGLVSADQIKEGNPNAVGPDPSVLNVGTNLWIPLPCTCFNGTDNNLPAIYMSYVVRAVDT LAGIAARYSTTLTDLMNVNALGGPSIKEGDILSIPLSACTSSFPRSASDYGLSVANGSYS ITASHCVQCSCGPGGRNLYCMPASLAVSCSSMQCKNSNLMLGNVTIQQTGGGCNVTSCNY GGLVNGTIITTLSTSLQPRCPGPQQFPPLVAPPTSVGPDSMFAPAPSPSESGGAPMDGPH SSIVPASGSVIAFPPSGGPSGSASSACSLNPFVSFPMAVFLCLSMKYAISLPL*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400002350
Transcript Infomation	pacid=37466733 locus=PGSC0003DMG400000897 ID=PGSC0003DMT400002350.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGCTACCTTTCTTGTTCCTCTTGTTGAGCTTTAGTTTCATCCATCCCACAACTTCAAAA TCTACTATTGAACCATGTTCCAACTCTGATACTTGTTCTTCCCTTCTTGGCTACTCTCTT TATACTGACCTTAAGGTTTCTGAAGTGGCTTCACTCTTCCAGACAGACCCAATATCTCTT CTTACTACTAATGCTATTGATATCTCATATCCAGATGTTGAAAATCACATACTTCCAGCT AAACTGTTCCTTAAGGTCCCTGTTACTTGTTCTTGTGTTGATGGGATCTTTAAGTCTGCC TTTGTTCATTACAAGACTAGGCCTTCTGATACTCTGTCTATGATTGCTGACACAATATAT GGTGGTCTTGTTTCTGCTGACCAGATCAAGGAAGGAAACCCCAATGCTGTTGGTCCTGAC CCTTCAGTGTTAAATGTTGGGACTAATCTTTGGATTCCTCTTCCTTGCACTTGCTTTAAT GGGACTGACAATAATCTTCCTGCTATTTATATGTCATATGTTGTTAGAGCTGTAGATACT CTTGCAGGGATTGCTGCTAGGTACTCTACCACTCTTACTGACCTTATGAATGTTAATGCT TTGGGAGGTCCTTCTATTAAGGAGGGTGACATTCTTTCCATTCCTCTGTCTGCTTGTACA TCTAGCTTCCCAAGATCTGCCTCAGATTATGGCTTATCTGTTGCGAATGGGAGCTATTCT ATTACAGCTAGCCACTGTGTGCAATGCAGTTGTGGACCAGGGGGTCGGAATTTGTACTGC ATGCCAGCTTCCTTAGCAGTTTCTTGCTCAAGCATGCAGTGCAAGAACAGCAATCTCATG CTCGGAAATGTTACCATACAACAGACTGGTGGTGGTTGCAATGTGACTTCTTGCAATTAC GGTGGCCTTGTTAATGGAACCATCATCACTACATTATCCACTTCTCTTCAACCTCGATGC CCTGGACCCCAACAATTTCCTCCACTTGTTGCCCCACCTACATCAGTAGGCCCCGACTCG ATGTTTGCTCCTGCCCCTTCACCTTCTGAATCTGGTGGTGCTCCGATGGATGGTCCACAT TCTTCTATAGTGCCTGCATCTGGCTCAGTCATAGCATTTCCACCTTCAGGTGGACCAAGT GGAAGTGCATCTTCCGCTTGCTCGTTGAACCCTTTCGTTAGTTTTCCTATGGCAGTTTTC TTGTGTTTGTCTATGAAATACGCGATCTCACTTCCTTTATAA