Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400002144
CDS Infomation

pacid=37443669 polypeptide=PGSC0003DMP400001563 locus=PGSC0003DMG400000818 ID=PGSC0003DMT400002144.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTTCATCTTCTCCTCCACCAGCTCCAAAGGAAGTTCCTTCAGATGAAAAATGGGCA
GAAGATGGTCCACCTCGCGAAGCGAAATGGTGGTATTCGACGTTTCATACTGTCACTGCC
ATGGTTGGTGCTGGTGTTCTTAGCCTACCTTATGCCATGGCTTACTTAGGATGGGGTCCA
GGGATAGTAGTGATGATCTTATCATGGTGTATAACTTTGAACACAATGTGGCAAATGATT
CAACTCCATGAATGTGTGCCCGGGGTTCGTTTTGATCGATACAAGGACCTTGGAAAACAT
GTTTTTGGACCAAAACTTGGGGCATGGATTGTGCTTCCACAACAACTGATAGTTCAGGTT
GGTTGTGACATAGTGTACATGGTTACTGGAGGAAAATGTTTGATGAAATTCATGGAGATT
GCTTGTACTAATTGCACTCGAATTCGACAATCTTATTGGATTTGCATCTTTGGTGCCATT
CATTTCTTTCTTTCACAATTGCCAAATTTCAATGCTGTTTCTGGTGTTTCATTAGCTGCT
GCAATCATGTCTCTAAGCTATTCAACTATAGCATGGGTGGGTTGTGTGGGAAAAGGCAGA
GTCCCTAACGTGAGCTACGCGTACAAGGCAACAAGTCCAGTGGACTACATGTTCCGTGTC
TTCAACGCGTTAGGCCAAGTATCGTTTGCTTATGCAGGCCACGCGGTTGTCCTTGAGATT
CAGGCTACAATTCCATCAACACCTGAAAAGCCTTCCAGAGTACCAATGTGGAAAGGTGCT
GTATGGGCTTATTTTGTCAATGCCCTGTGTTATTTCCCTGTTGCATTCATCGGGTACTGG
GCGTTTGGTCAAGATGTCAATGACAACGTGCTCGTGGGACTTGAAAGGCCATCTTGGCTC
ATTGCAGCTGCTAACTTAATGGTGGTTGTCCATGTCATAGGCAGCTATCAGGTTTATGCT
ATGCCAGTATTTGATCTGATGGAGCAAAAATTGGTGAAAACATGGAATTTCCCACCTGGT
GTACTGCTGAGATTCATCGTTCGTACTACATACGTTGCTTTCACTTTGTTTTTTGGTGTA
ACATTCCCTTTCTTTGGTGATCTTCTTGGTTTCTTTGGAGGATTTGGATTTGCTCCTACT
TCTTACTTTCTCCCAAGCATAATGTGGCTTAAGGTCAAGAAACCAAGAAGATTCAGTACC
TCATGGTGGATAAATTGGGCATGCATATTTATTGGAGTATTTATTATGATAGCCTCCACA
GTTGGTGGATTGAGAAATATTGTTGCTGATTCATCCTCCTATGAGTTCTATTCATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400001563
PEP Infomation

pacid=37443669 transcript=PGSC0003DMT400002144 locus=PGSC0003DMG400000818 ID=PGSC0003DMT400002144.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVSSSPPPAPKEVPSDEKWAEDGPPREAKWWYSTFHTVTAMVGAGVLSLPYAMAYLGWGP
GIVVMILSWCITLNTMWQMIQLHECVPGVRFDRYKDLGKHVFGPKLGAWIVLPQQLIVQV
GCDIVYMVTGGKCLMKFMEIACTNCTRIRQSYWICIFGAIHFFLSQLPNFNAVSGVSLAA
AIMSLSYSTIAWVGCVGKGRVPNVSYAYKATSPVDYMFRVFNALGQVSFAYAGHAVVLEI
QATIPSTPEKPSRVPMWKGAVWAYFVNALCYFPVAFIGYWAFGQDVNDNVLVGLERPSWL
IAAANLMVVVHVIGSYQVYAMPVFDLMEQKLVKTWNFPPGVLLRFIVRTTYVAFTLFFGV
TFPFFGDLLGFFGGFGFAPTSYFLPSIMWLKVKKPRRFSTSWWINWACIFIGVFIMIAST
VGGLRNIVADSSSYEFYS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400002144
Transcript Infomation

pacid=37443669 locus=PGSC0003DMG400000818 ID=PGSC0003DMT400002144.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTTCATCTTCTCCTCCACCAGCTCCAAAGGAAGTTCCTTCAGATGAAAAATGGGCA
GAAGATGGTCCACCTCGCGAAGCGAAATGGTGGTATTCGACGTTTCATACTGTCACTGCC
ATGGTTGGTGCTGGTGTTCTTAGCCTACCTTATGCCATGGCTTACTTAGGATGGGGTCCA
GGGATAGTAGTGATGATCTTATCATGGTGTATAACTTTGAACACAATGTGGCAAATGATT
CAACTCCATGAATGTGTGCCCGGGGTTCGTTTTGATCGATACAAGGACCTTGGAAAACAT
GTTTTTGGACCAAAACTTGGGGCATGGATTGTGCTTCCACAACAACTGATAGTTCAGGTT
GGTTGTGACATAGTGTACATGGTTACTGGAGGAAAATGTTTGATGAAATTCATGGAGATT
GCTTGTACTAATTGCACTCGAATTCGACAATCTTATTGGATTTGCATCTTTGGTGCCATT
CATTTCTTTCTTTCACAATTGCCAAATTTCAATGCTGTTTCTGGTGTTTCATTAGCTGCT
GCAATCATGTCTCTAAGCTATTCAACTATAGCATGGGTGGGTTGTGTGGGAAAAGGCAGA
GTCCCTAACGTGAGCTACGCGTACAAGGCAACAAGTCCAGTGGACTACATGTTCCGTGTC
TTCAACGCGTTAGGCCAAGTATCGTTTGCTTATGCAGGCCACGCGGTTGTCCTTGAGATT
CAGGCTACAATTCCATCAACACCTGAAAAGCCTTCCAGAGTACCAATGTGGAAAGGTGCT
GTATGGGCTTATTTTGTCAATGCCCTGTGTTATTTCCCTGTTGCATTCATCGGGTACTGG
GCGTTTGGTCAAGATGTCAATGACAACGTGCTCGTGGGACTTGAAAGGCCATCTTGGCTC
ATTGCAGCTGCTAACTTAATGGTGGTTGTCCATGTCATAGGCAGCTATCAGGTTTATGCT
ATGCCAGTATTTGATCTGATGGAGCAAAAATTGGTGAAAACATGGAATTTCCCACCTGGT
GTACTGCTGAGATTCATCGTTCGTACTACATACGTTGCTTTCACTTTGTTTTTTGGTGTA
ACATTCCCTTTCTTTGGTGATCTTCTTGGTTTCTTTGGAGGATTTGGATTTGCTCCTACT
TCTTACTTTCTCCCAAGCATAATGTGGCTTAAGGTCAAGAAACCAAGAAGATTCAGTACC
TCATGGTGGATAAATTGGGCATGCATATTTATTGGAGTATTTATTATGATAGCCTCCACA
GTTGGTGGATTGAGAAATATTGTTGCTGATTCATCCTCCTATGAGTTCTATTCATGA