Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400000486
CDS Infomation

pacid=37440408 polypeptide=PGSC0003DMP400000368 locus=PGSC0003DMG400000169 ID=PGSC0003DMT400000486.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCATCAGAGATGCAGAGATATGATACAAACGAAGATGACGAAGAGATGGGAATGGAT
GTGAAAGAAGAAGATGATGAGGATGAGGACGATGAAGAGAAGAATGCTGCCATGCATGCA
ATAGCAGGTTTTGATGGGGTACATGGATCTAGCAGCAGTAATAGGTTTCAACACCATCAG
CAATATCACGAGCAACCAACCCCAGGGGGATCCCGTAGATGTAGGCCATTAGAAGAGAAG
GAAAGAACAAAGCTTAGGGAGCGACAGCGAAGAGCTATTACTGCAAAGATCTTGGCTGGA
CTCCGAAGGCATGGGAACTATAACCTTAGAGTTAGGGCCGATATCAATGATGTAATTGCT
GCTTTGGCAAGGGAAGCAGGTTGGGTTGTTCTTCCAGATGGAACCACCTTTCCCTCAAGA
TCACAACCACAGGGCACAGGTACTGCTGGTGGAACACCCACCACAATGGTGACTTCATCA
TCTTCACATATACCTACACAACATACTCCACCTGGTTCGTTGAAAGATGTGCCTTCCGGG
TTTCAGAACACAGACGATCAGAGTGCCTGTCAAATGAAAAGTGTTTTTGTACCTACTTCA
TCCCCTTATGATTCATCATCCACTGCGCGATCACATACTTCAGCCATGGTGGCAGATGGA
CTAGACACACAAAATGACCCATTTCTTGTAGGGTCTGTAGATTCAATCGACAAGCAGGTT
GTTGACATGCACACAAAACTACAGGAGCGTGATTTTGCTGGGACACCCTACATTCCTGTT
TATGTTATGCTACCTTTAGGAGTTATTAATATGAAGTCTGAGCTTGTTGATGCGGATGGT
CTAGTGAAGCAGTTGAGAGTGCTAAAATCAATAAATGTCGATGGTGTGATGGTGGATTGC
TGGTGGGGCATAGTAGAGGCAAATGCTCCACAGGATTATAACTGGAATGGATATAAAAGG
CTTTTTCAAGTTGTGAGGGAGCATAAACTCAAAATAAAGGTTGTGATGTCTTTCCACGAA
TGTGGAGGTAACATTGGTGATGATGTTTGCATTCCACTGCCTCACTGGGTATCCGAAATC
GGTCGAAGCAATCCTGATATATATTTTACAGACAGAGCAGGACGACGGAACCCTGAATGT
CTCTCATGGGGAATAGACAAAGAACGAGTTTTGAGAAGCCGCACCGCTGTAGAGGTCTAC
TTTGATTATATGAGAAGCTTTCGAGTGGAATTTGATGAGTTCTTTGAGGATGGTATTATT
TCCATGGTTGAAGTTGGACTAGGACCATGTGGGGAGCTAAGATATCCCTCTAATCCTGTA
AAGCATGGCTGGAGGTATCCTGGAGTTGGTGAATTCCAGTGTTATGACCAGTATCTGCTG
AAAAACCTGCGGAAGGCGGCTGAAGCAAGAGGACACTCATTCTGGGCACGAGGACCCGAT
AATGCTGGTTCTTACAATTCACGGCCACAAGAGACTGGATTTTTTTGTGACGGGGGTGAC
TATGATGGGTATTATGGTAGGTTTTTCCTGAATTGGTACTCTCAAGTTATGATTGACCAT
GCAGATCGCGTGCTTTCTTTGGCCAAGTTAGCTTTTGATGGGACATGCATTGCTGCAAAG
GAATTCATTGGTGGTATAAGACAGCTAGCCATGCTGCTGAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400000368
PEP Infomation

pacid=37440408 transcript=PGSC0003DMT400000486 locus=PGSC0003DMG400000169 ID=PGSC0003DMT400000486.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MASEMQRYDTNEDDEEMGMDVKEEDDEDEDDEEKNAAMHAIAGFDGVHGSSSSNRFQHHQ
QYHEQPTPGGSRRCRPLEEKERTKLRERQRRAITAKILAGLRRHGNYNLRVRADINDVIA
ALAREAGWVVLPDGTTFPSRSQPQGTGTAGGTPTTMVTSSSSHIPTQHTPPGSLKDVPSG
FQNTDDQSACQMKSVFVPTSSPYDSSSTARSHTSAMVADGLDTQNDPFLVGSVDSIDKQV
VDMHTKLQERDFAGTPYIPVYVMLPLGVINMKSELVDADGLVKQLRVLKSINVDGVMVDC
WWGIVEANAPQDYNWNGYKRLFQVVREHKLKIKVVMSFHECGGNIGDDVCIPLPHWVSEI
GRSNPDIYFTDRAGRRNPECLSWGIDKERVLRSRTAVEVYFDYMRSFRVEFDEFFEDGII
SMVEVGLGPCGELRYPSNPVKHGWRYPGVGEFQCYDQYLLKNLRKAAEARGHSFWARGPD
NAGSYNSRPQETGFFCDGGDYDGYYGRFFLNWYSQVMIDHADRVLSLAKLAFDGTCIAAK
EFIGGIRQLAMLLN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400000486
Transcript Infomation

pacid=37440408 locus=PGSC0003DMG400000169 ID=PGSC0003DMT400000486.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCATCAGAGATGCAGAGATATGATACAAACGAAGATGACGAAGAGATGGGAATGGAT
GTGAAAGAAGAAGATGATGAGGATGAGGACGATGAAGAGAAGAATGCTGCCATGCATGCA
ATAGCAGGTTTTGATGGGGTACATGGATCTAGCAGCAGTAATAGGTTTCAACACCATCAG
CAATATCACGAGCAACCAACCCCAGGGGGATCCCGTAGATGTAGGCCATTAGAAGAGAAG
GAAAGAACAAAGCTTAGGGAGCGACAGCGAAGAGCTATTACTGCAAAGATCTTGGCTGGA
CTCCGAAGGCATGGGAACTATAACCTTAGAGTTAGGGCCGATATCAATGATGTAATTGCT
GCTTTGGCAAGGGAAGCAGGTTGGGTTGTTCTTCCAGATGGAACCACCTTTCCCTCAAGA
TCACAACCACAGGGCACAGGTACTGCTGGTGGAACACCCACCACAATGGTGACTTCATCA
TCTTCACATATACCTACACAACATACTCCACCTGGTTCGTTGAAAGATGTGCCTTCCGGG
TTTCAGAACACAGACGATCAGAGTGCCTGTCAAATGAAAAGTGTTTTTGTACCTACTTCA
TCCCCTTATGATTCATCATCCACTGCGCGATCACATACTTCAGCCATGGTGGCAGATGGA
CTAGACACACAAAATGACCCATTTCTTGTAGGGTCTGTAGATTCAATCGACAAGCAGGTT
GTTGACATGCACACAAAACTACAGGAGCGTGATTTTGCTGGGACACCCTACATTCCTGTT
TATGTTATGCTACCTTTAGGAGTTATTAATATGAAGTCTGAGCTTGTTGATGCGGATGGT
CTAGTGAAGCAGTTGAGAGTGCTAAAATCAATAAATGTCGATGGTGTGATGGTGGATTGC
TGGTGGGGCATAGTAGAGGCAAATGCTCCACAGGATTATAACTGGAATGGATATAAAAGG
CTTTTTCAAGTTGTGAGGGAGCATAAACTCAAAATAAAGGTTGTGATGTCTTTCCACGAA
TGTGGAGGTAACATTGGTGATGATGTTTGCATTCCACTGCCTCACTGGGTATCCGAAATC
GGTCGAAGCAATCCTGATATATATTTTACAGACAGAGCAGGACGACGGAACCCTGAATGT
CTCTCATGGGGAATAGACAAAGAACGAGTTTTGAGAAGCCGCACCGCTGTAGAGGTCTAC
TTTGATTATATGAGAAGCTTTCGAGTGGAATTTGATGAGTTCTTTGAGGATGGTATTATT
TCCATGGTTGAAGTTGGACTAGGACCATGTGGGGAGCTAAGATATCCCTCTAATCCTGTA
AAGCATGGCTGGAGGTATCCTGGAGTTGGTGAATTCCAGTGTTATGACCAGTATCTGCTG
AAAAACCTGCGGAAGGCGGCTGAAGCAAGAGGACACTCATTCTGGGCACGAGGACCCGAT
AATGCTGGTTCTTACAATTCACGGCCACAAGAGACTGGATTTTTTTGTGACGGGGGTGAC
TATGATGGGTATTATGGTAGGTTTTTCCTGAATTGGTACTCTCAAGTTATGATTGACCAT
GCAGATCGCGTGCTTTCTTTGGCCAAGTTAGCTTTTGATGGGACATGCATTGCTGCAAAG
GAATTCATTGGTGGTATAAGACAGCTAGCCATGCTGCTGAATTAA