Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400000171
CDS Infomation

pacid=37438301 polypeptide=PGSC0003DMP400000128 locus=PGSC0003DMG400000052 ID=PGSC0003DMT400000171.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATTATCAAATATCGAATTATTCCAATTCCGACGATTTACTTCAATCAGCAGTTACTA
TTTCTATCGACCATTGTTGATACCTGTAGTTCACTTTTAGCTAGAGAGGAAGTTTCAGTT
AATAATGATTCATGTATTTCCAATGCCCTTAAAATTTCGGCGAAAATGGGCAATCTTGAT
GAAGGGAAATATATACATGGAAATGTTATTAAGTTGGGTATGACAAATGTTCTTTCCCTG
GGAAATCAGCTCTTGCAAGTTTATGTAAAATGCAGCGAGTTTGTTGATGCGTGCAAGGTG
TTCGATGAAATGTGTGTTAGAAATATTGTTACTTGGAATACGTTGATATGTGGTTTAAGG
TATTCTGTTGAGCGTTTCAAGACAAATGGTTATCTGGGGTTCTGTTATTTCAAGCAAATG
TTGATGGAATCGGTATCTCCTGATTGCATTACTTTCTGTGGGTTGCTCCGACTTTGTGTG
GAGTTAAAGGGTGGTGTTTGGTTGGCCAAGGAGTTGCATTGTGCTATCGTGAAGTTGGGA
TATGATCAAAGTTGTTTTCTTGGTGCCACTCTTGTTGATTTGTATGGGAAGATTGGGTTG
ATTGGAGAGGCTAGGTGTGTTCTTGATGGGGTTTTGGCACGTGATTTGGTGTTATGGAAT
GTTATGATTTCTTGCTATGTACTGAATGGTTTGGGTGAAGAGGCTTTTTGGTTATTCAGT
TTGATGAGATTGGAGGGGTTTGAGGGGGATGAGTTTACATTTGCTAGTCTACTTAATTCC
TGTGCTAGTTTGGGGCTTTATGAGACAGGTAGGCAGATCCAAGGACTTGTTATTAAAGTT
TGCCTTAACAAGGATGTGGTGGTTGAAAGTGCACTTGTTGATATGTATGCAAAGAATGAA
CATATAACCGATGCTCGCAAGGCTTTTGATGCAATGGCCTTCAGAAATGTAGTCTCTTGG
ACCACAATTATTGTAGGTTATGGACGCCGTGGAGATGGGAAGCAAGCTATGGAACTTCTA
AAAAGGATGGTAAGAGAGGATTTTGTTCCTGATGAGCTCACTTTGGCTAGTGTTCTTAGT
TCATGTGGTAACTTATCAATGGCCACTGAAACTGTACAAGTTCATGCTTATGCAGTTAAA
TATGTATTCTCAAATTCTATATCAATTGGAAATGCATTAATAAATGCGTACTCAAAGTGT
GGTAGTATAGCTCATGCTTACCAGTCCTTCAGCTCAATAAAAGCACCAGATCTTTTCTCA
TGGACCTCAATGATTGGAGCTTATGCATCCCATGGCTTTTCAAAGGAAGCTATTCAACTT
TTTGAGGAAATGTTGGTAAATGGTGTGAAGCCAGATAGTATTGTATTTCTAGAGGTTCTC
TCTGCCTGTAGCCATGGTGGTCTCTTTAGTAAAGGGCTGCAGTACTTCAGTTTGATGACT
AATTACTACCAAATTGTGCCAAGCTCAGAACACTTTGCCTGTCTCATAGATCTTTTTGGA
CGATTAGGCCTTCTAAATGAGGCTTATGAAGTTCTAAACTCAATGCCAATTGAATCCCAA
CCAGATGCCCTGAAGGCTTTCGTTGGCGCTTGTAGAATCCATGGAGATATGAAATTGGCA
AAATGGGCTGCAGAAAAGCTTTTCATGACAGATCCAAATGATACTGCTACTTACGTCCTG
ATGTCAAACTTGTGCGCCTCTGATAGTAATTGGCCTGATGCAGCCTTGATCTGGGAATTG
GCTAGAGAGCGGTTGCATAACAAATCACCAGGCTGTAGCATGGAAATTATTACTCATGGA
ATCAACACATTAGCATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400000128
PEP Infomation

pacid=37438301 transcript=PGSC0003DMT400000171 locus=PGSC0003DMG400000052 ID=PGSC0003DMT400000171.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MIIKYRIIPIPTIYFNQQLLFLSTIVDTCSSLLAREEVSVNNDSCISNALKISAKMGNLD
EGKYIHGNVIKLGMTNVLSLGNQLLQVYVKCSEFVDACKVFDEMCVRNIVTWNTLICGLR
YSVERFKTNGYLGFCYFKQMLMESVSPDCITFCGLLRLCVELKGGVWLAKELHCAIVKLG
YDQSCFLGATLVDLYGKIGLIGEARCVLDGVLARDLVLWNVMISCYVLNGLGEEAFWLFS
LMRLEGFEGDEFTFASLLNSCASLGLYETGRQIQGLVIKVCLNKDVVVESALVDMYAKNE
HITDARKAFDAMAFRNVVSWTTIIVGYGRRGDGKQAMELLKRMVREDFVPDELTLASVLS
SCGNLSMATETVQVHAYAVKYVFSNSISIGNALINAYSKCGSIAHAYQSFSSIKAPDLFS
WTSMIGAYASHGFSKEAIQLFEEMLVNGVKPDSIVFLEVLSACSHGGLFSKGLQYFSLMT
NYYQIVPSSEHFACLIDLFGRLGLLNEAYEVLNSMPIESQPDALKAFVGACRIHGDMKLA
KWAAEKLFMTDPNDTATYVLMSNLCASDSNWPDAALIWELARERLHNKSPGCSMEIITHG
INTLA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400000171
Transcript Infomation

pacid=37438301 locus=PGSC0003DMG400000052 ID=PGSC0003DMT400000171.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATTATCAAATATCGAATTATTCCAATTCCGACGATTTACTTCAATCAGCAGTTACTA
TTTCTATCGACCATTGTTGATACCTGTAGTTCACTTTTAGCTAGAGAGGAAGTTTCAGTT
AATAATGATTCATGTATTTCCAATGCCCTTAAAATTTCGGCGAAAATGGGCAATCTTGAT
GAAGGGAAATATATACATGGAAATGTTATTAAGTTGGGTATGACAAATGTTCTTTCCCTG
GGAAATCAGCTCTTGCAAGTTTATGTAAAATGCAGCGAGTTTGTTGATGCGTGCAAGGTG
TTCGATGAAATGTGTGTTAGAAATATTGTTACTTGGAATACGTTGATATGTGGTTTAAGG
TATTCTGTTGAGCGTTTCAAGACAAATGGTTATCTGGGGTTCTGTTATTTCAAGCAAATG
TTGATGGAATCGGTATCTCCTGATTGCATTACTTTCTGTGGGTTGCTCCGACTTTGTGTG
GAGTTAAAGGGTGGTGTTTGGTTGGCCAAGGAGTTGCATTGTGCTATCGTGAAGTTGGGA
TATGATCAAAGTTGTTTTCTTGGTGCCACTCTTGTTGATTTGTATGGGAAGATTGGGTTG
ATTGGAGAGGCTAGGTGTGTTCTTGATGGGGTTTTGGCACGTGATTTGGTGTTATGGAAT
GTTATGATTTCTTGCTATGTACTGAATGGTTTGGGTGAAGAGGCTTTTTGGTTATTCAGT
TTGATGAGATTGGAGGGGTTTGAGGGGGATGAGTTTACATTTGCTAGTCTACTTAATTCC
TGTGCTAGTTTGGGGCTTTATGAGACAGGTAGGCAGATCCAAGGACTTGTTATTAAAGTT
TGCCTTAACAAGGATGTGGTGGTTGAAAGTGCACTTGTTGATATGTATGCAAAGAATGAA
CATATAACCGATGCTCGCAAGGCTTTTGATGCAATGGCCTTCAGAAATGTAGTCTCTTGG
ACCACAATTATTGTAGGTTATGGACGCCGTGGAGATGGGAAGCAAGCTATGGAACTTCTA
AAAAGGATGGTAAGAGAGGATTTTGTTCCTGATGAGCTCACTTTGGCTAGTGTTCTTAGT
TCATGTGGTAACTTATCAATGGCCACTGAAACTGTACAAGTTCATGCTTATGCAGTTAAA
TATGTATTCTCAAATTCTATATCAATTGGAAATGCATTAATAAATGCGTACTCAAAGTGT
GGTAGTATAGCTCATGCTTACCAGTCCTTCAGCTCAATAAAAGCACCAGATCTTTTCTCA
TGGACCTCAATGATTGGAGCTTATGCATCCCATGGCTTTTCAAAGGAAGCTATTCAACTT
TTTGAGGAAATGTTGGTAAATGGTGTGAAGCCAGATAGTATTGTATTTCTAGAGGTTCTC
TCTGCCTGTAGCCATGGTGGTCTCTTTAGTAAAGGGCTGCAGTACTTCAGTTTGATGACT
AATTACTACCAAATTGTGCCAAGCTCAGAACACTTTGCCTGTCTCATAGATCTTTTTGGA
CGATTAGGCCTTCTAAATGAGGCTTATGAAGTTCTAAACTCAATGCCAATTGAATCCCAA
CCAGATGCCCTGAAGGCTTTCGTTGGCGCTTGTAGAATCCATGGAGATATGAAATTGGCA
AAATGGGCTGCAGAAAAGCTTTTCATGACAGATCCAAATGATACTGCTACTTACGTCCTG
ATGTCAAACTTGTGCGCCTCTGATAGTAATTGGCCTGATGCAGCCTTGATCTGGGAATTG
GCTAGAGAGCGGTTGCATAACAAATCACCAGGCTGTAGCATGGAAATTATTACTCATGGA
ATCAACACATTAGCATGA