Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Medicago truncatula ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Medicago truncatula

CDS Sequence

CDS ID

Medtr5g006570.1
CDS Infomation

| pentatricopeptide (PPR) repeat protein | HC | chr5:988953-991582 | 20140818
Sequence

ATGATTGTGTTGTCTCTTCCACCAATACCAATGGCTACTACTACTACAACCCTTCATCAA
TCTTCATCTCCTCTCTTACTTCCCACAACAACACAAAAGCCCAAAAATTCATCGCTTCAA
ACCTGCAAAACCCTCATTGAGCTCAAACAATTACACTGTAACATGTTAAAGAAAGGTGTT
TTTAACATCAACAAGCTCATTGCTGCTTGTGTCCAAATGGGTACCCATGAAAGCTTAAAC
TATGCTCTCAATGCTTTCAAGGAAGATGAAGGAACCAAGTGTTCACTTTATACTTGTAAT
ACTCTGATTAGAGGGTATGCTGCATCTGGGTTATGTAAAGAAGCAATTTTTATTTACCTT
CATATGATAATAGTGATGGGTATTGTTCCTGATAACTTCACTTTCCCATTTTTGCTTAGT
GCTTGTTCGAAGATTATGGCGTTTTCTGAGGGTGTTCAGGTTCATGGGGTGGTTGTTAAG
ATGGGTCTGGTGAAAGATTTGTTTGTTGCTAACTCTTTGATACATTTTTATGCGGCATGT
GGGAAGGTTGATTTGGGACGAAAGGTGTTTGATGAAATGCTTGAGAGAAATGTTGTGTCG
TGGACTAGTTTGATTAATGGGTATAGTGTGGTGAATATGGCTAAAGAGGCTGTCTGTTTG
TTCTTTGAGATGGTTGAGGTGGGTGTTGAACCGAATCCTGTGACTATGGTTTGTGCTATA
TCTGCTTGTGCTAAGTTGAAGGATCTTGAATTGGGTAAAAAAGTGTGCAATTTGATGACG
GAGTTGGGGGTGAAATCTAATACGCTTGTGGTGAATGCACTGCTCGATATGTACATGAAA
TGTGGAGACATGTACGCTGTGAGGGAAATTTTTGATGAATTTAGTGATAAGAATTTGGTT
ATGTACAATACTATCATGTCAAATTATGTGCAACATGGGTTGGCTGGTGAAGTGCTAGTT
GTTTTGGATGAAATGCTGCAGAAAGGACAGCGGCCAGATAAGGTGACTATGCTATCTACT
ATTGCAGCATGTGCACAGTTAGGTGATCTTTCTGTTGGGAAGTCATCTCATGCTTATGTC
TTCAGGAATGGACTAGAGAGGTTGGACAACATTTCTAATGCCATCATTGACATGTATATG
AAATGTGGCAAAAGAGAAGCTGCTTGCAAAGTTTTTGACAGTATGTCAAACAAGACGGTG
GTGACATGGAATTCGCTAATTGCAGGTTTGGTTAGAGACGGTGAGTTGGAATTAGCTTTG
AGAATCTTTGGTGAGATGCCAGAGAGTAATCTTGTATCTTGGAACACAATGATTGGTGCC
ATGGTTCAAGCAAGCATGTTTGAGGAAGCAATTGATTTACTCAGGGAGATGCAAAACCAA
GGGATTAAAGGAGATAGAGTGACAATGGTGGGTATTGCTTCTGCCTGTGGATATTTAGGA
GCTCTTGATCTTGCTAAGTGGATCTATACTTACATTGAGAAAAATGACATTCACATTGAC
ATGCAACTTGGCACAGCTTTGGTCGACATGTTTTCTAGATGTGGTGATCCTCTAAATGCT
ATGCGTGTTTTTGAAAATATGGAAAAACGCGACGTGTCTGCCTGGACTGCAGCCATCAGA
GTTAAGGCAGTGGAGGGTAATGCAAAAGGAGCTATTGAGCTTTTTGATGAGATGCTGAAG
CAAGATGTGAAAGCAGACGATTTTGTTTTTGTGGCACTATTGACAGCATTTAGTCATGGT
GGATATGTGGACCAGGGGAGACAACTTTTTTGGGCAATGGAGAAAATCCATGGAGTAAGT
CCTCAGATTGTCCACTATGGATGTATGGTTGATTTGCTTGGTCGAGCTGGGTTGTTGGAA
GAAGCTTTTGATCTCATGAAAAGCATGCCAATAAAACCGAATGATGTTATATGGGGATCT
TTTCTAGCAGCTTGTCGAAAACACAAAAATGTTGAATTTGCAAATTATGCAGATGAAAAG
ATAACTCAATTGGCCCCAGAAAAAGTTGGGATTCATGTGTTGCTATCCAATATCTATGCA
TCGGCTGGAAAATGGAATGATGTAGCAAGAGTGAGGTTGCAAATGAAAGAGAAAGGGTTC
CAGAAAGTAGCTGGATCAAGCTCAATAGAAGTTCACGGATTGATTCGCGAGTTCACATCT
GGTGACGAATCACACACAGAGAACGCCCAAATTGGATTAATGCTACAGGAAATAAACTGT
AGGATAAGCCAGGTGGGGTATGTTCCTGATACAACCAATGTCTTAGTTGATGTTGATGAG
CAGGAGAAAGAGCATTTGCTCAGCAGACATAGCGAAAAACTAGCCATGGCTTATGGATTA
ATCAATACCGGTAAAGGAATACCTATACGGGTAGTAAAAAATCTAAGAATGTGTTCTGAT
TGTCACTCATTTGCAAAATTAGTGTCAAAACTGTACGGTAGGGAAATAACTGTTAGGGAT
AATAACAGGTATCATTTTTTCAAGGAAGGATTTTGTTCTTGTAGAGATTTTTGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Medtr5g006570.1
PEP Infomation

| pentatricopeptide (PPR) repeat protein | HC | chr5:988953-991582 | 20140818
Sequence

MIVLSLPPIPMATTTTTLHQSSSPLLLPTTTQKPKNSSLQTCKTLIELKQLHCNMLKKGV
FNINKLIAACVQMGTHESLNYALNAFKEDEGTKCSLYTCNTLIRGYAASGLCKEAIFIYL
HMIIVMGIVPDNFTFPFLLSACSKIMAFSEGVQVHGVVVKMGLVKDLFVANSLIHFYAAC
GKVDLGRKVFDEMLERNVVSWTSLINGYSVVNMAKEAVCLFFEMVEVGVEPNPVTMVCAI
SACAKLKDLELGKKVCNLMTELGVKSNTLVVNALLDMYMKCGDMYAVREIFDEFSDKNLV
MYNTIMSNYVQHGLAGEVLVVLDEMLQKGQRPDKVTMLSTIAACAQLGDLSVGKSSHAYV
FRNGLERLDNISNAIIDMYMKCGKREAACKVFDSMSNKTVVTWNSLIAGLVRDGELELAL
RIFGEMPESNLVSWNTMIGAMVQASMFEEAIDLLREMQNQGIKGDRVTMVGIASACGYLG
ALDLAKWIYTYIEKNDIHIDMQLGTALVDMFSRCGDPLNAMRVFENMEKRDVSAWTAAIR
VKAVEGNAKGAIELFDEMLKQDVKADDFVFVALLTAFSHGGYVDQGRQLFWAMEKIHGVS
PQIVHYGCMVDLLGRAGLLEEAFDLMKSMPIKPNDVIWGSFLAACRKHKNVEFANYADEK
ITQLAPEKVGIHVLLSNIYASAGKWNDVARVRLQMKEKGFQKVAGSSSIEVHGLIREFTS
GDESHTENAQIGLMLQEINCRISQVGYVPDTTNVLVDVDEQEKEHLLSRHSEKLAMAYGL
INTGKGIPIRVVKNLRMCSDCHSFAKLVSKLYGREITVRDNNRYHFFKEGFCSCRDFW*

Transcript Sequence

Gene sequence data has not been registered.