Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Medicago truncatula ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Medicago truncatula

CDS Sequence

CDS ID	Medtr3g011940.1
CDS Infomation	\| pentatricopeptide (PPR) repeat protein \| HC \| chr3:3127058-3124158 \| 20140818
Sequence	ATGAGCTCTCAGCTCGTTCCCAACACAACAACCTTAATCCCTACAAATATCTACAAACAC CCTTCACCTAGTCTCTTAGACCACTGCACTTCCACAAAACACCTTCATCAAATCCTTCCC TTAATCATCAAAACTGGTTCCTACTACAATGACCACTTGTTCCAAACCAAGCTCATAAAC ATGTTCTTCAAACATGGCAGCATCAATGAAGCATCTCTTGTCTTTGACACTGTTGAACAT AAACAAGATGTTCTTTACCATGCCATGCTTAAAGGGTATGCAAAAAACTCATCTTTATGT GATGCTTTATGTTTTTATCATAGAATGCAAAATGATGGTGTTAGGCCAGTTGTGTATGAT TTTGCTTATTTGTTGCAATTGTGTGGGAAAAAATTTGAACTTGAAAAGGGTAGAGAGATT CATGGTCAGGTGATAGTTAATGGGTTTGAGTATGATTTGTTTTCAATGATTGGTGTTATG GGCTTTTATGTCAAATGTGGGGAGATCGATGATGCGTTTAAGGTTTTTGAGAGATTGTCG GAGAAGGATTTGGTGTCTTGGACTAGTTTGATTGCGGGATATGCGCAGAATGGTTATCCC AAGAGAGCTTTGGATTTGTTTTATCGGATGCAGGAAGCTGGCTTAAAGGCGGATTCTGTT ACATTGGTTAGTATTTTGCCAGCTGTGGCAGATATTAAGGATTTGAGAATTGGAAAGTCT ATTCATGGTTATGCTCTTAGATTGGGATTTGAGTCGAAGGTTAGTGTTATAAATGCGCTT TTGTATATGTACTTTGAATGCGGGTGTGAAAGGATTGCGAGGTTGGTTTTTGAGGGGATG ATTAACAAGTGTGCGGTTTCGTGGAATACAATGATTGATGGTTATGCACAAATTGGTAAA TCTGAGGAAGCGTTTGCTACTTTTTTGAAGATGTTGGATGAAGGAGTTGAACCTACACGA GTTGCAATAATGGCGGCTTTGACCGCTTGTGCTGATTTAGGTGATCTTGAACGGGGGAGA TTTGTTCATAAATTAGTGCTTCAGAAGAAACTTGATTTTGAAGTGCCTGTTATGAATTCT TTATTATCCATGTATTCAAAGTGTAAGAGAGTTGACCTTGCAGCCTCAATCTTTGAGAAT TTGAAGAAGAAAACAAACGTCACGTGGAATGCCATGATATTAGGTTATGCTCAAAATGGA TGCGTTAATGAGGCTTTATATCTGTTTTGTGTGATGCAATCTCAAGAAGTTAAACCTGAC TGCTTTACTTTAGTGGCTGTAATTACTGCTCTCGCTGATTTATCGGTTAACCGGATGGCC AAGTGGATTCATGGACTTGCAATAAGGACTTTTATGGACAATGATGTCTATGTTGCTACT GCTCTTATTGACATGTATGCAAAATGTGGAGCCACTCAAACTGCGAGGAAGCTTTTCGAC ATGATGCATGAACGACATGTGATAACATGGAATGCGATGATAGATGGATATGGCACACAT GGCCTTGGAAAAGAAGCTATTGATATCTTTGACAATATGCAGAAAGAAGCCGTTATACCA AATGATACAACATTTTTGTCTGTTATCTCGGCTTGTAGTCACTCGGGTTTCGTGGAAGAG GGTCTCCATTTCTTTCAAAGCATGAAGGAAGATTATGGCCTGGAGCCTTCAATGGATCAC TATAGTGCTGTGGTCGATCTCCTTGGTCGTGCCGGAAAGTTACATGGTGCTTGGAATTTA ATTGAAGAGATGCCTATCAAACCAGGGATTACCGTTTTAGGTGCAATGCTCGGTGCTTGC AAAATTCATAAAAATGTCGAATTGGGCGAAAAAGCAGCAGACAAACTATTTGAGTTAGAT CCAGATGAGGGTGGGTATCATGTTCTGCTAGCAAACATGTATGTCTCTGCATCAATGTGG GACAAAGTGGCCAAGGTTAGAACAGCCATGGAGAAAAAGGGTATCCACAAAACTCCAGGT TGTAGTTTTGTTGAATTGAGAAATGAAGTTCACACATTCTACTCAGGAAGTACGAATCAT CCTCAAGCGAAGAAAATCTACGCTTTTCTTGAGGCTCTTGGAGATAAGATCAGGGATGCT GGTTACATACCTGACACCAATTCTATTCATGACGTGGAGGAAAAAGTGAAGGAGCAATTG CTCAGTAGCCATAGTGAGAGGCTTGCTATTGCATTTGGACTTTTAAACACAAACCATGGT ACACCAATACATGTAAGGAAGAATCTAAGAGTTTGTGGAGACTGCCATGATGTTACCAAG TACATTTCACTTGTGACAGGGAGGGAAATTATAGTGCGTGATTTACGTGAGCAATCAGGA AGCAGTGGATGTTGCTTGTCATTGTTGTGTAGGGAACAAGTTAATTATCATAACCGCGGA GAAGGTTACATTGATGCTACTCTTCGACAACAAAAGAAAACTTTGAAGAGAATATACACA GCGCTTTTGCTGGTGCCATGTAAGTGTTGCGGCTACATTGATTCGTGTTCATTTACTGTG AAGCTCCTTTATCTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Medtr3g011940.1
PEP Infomation	\| pentatricopeptide (PPR) repeat protein \| HC \| chr3:3127058-3124158 \| 20140818
Sequence	MSSQLVPNTTTLIPTNIYKHPSPSLLDHCTSTKHLHQILPLIIKTGSYYNDHLFQTKLIN MFFKHGSINEASLVFDTVEHKQDVLYHAMLKGYAKNSSLCDALCFYHRMQNDGVRPVVYD FAYLLQLCGKKFELEKGREIHGQVIVNGFEYDLFSMIGVMGFYVKCGEIDDAFKVFERLS EKDLVSWTSLIAGYAQNGYPKRALDLFYRMQEAGLKADSVTLVSILPAVADIKDLRIGKS IHGYALRLGFESKVSVINALLYMYFECGCERIARLVFEGMINKCAVSWNTMIDGYAQIGK SEEAFATFLKMLDEGVEPTRVAIMAALTACADLGDLERGRFVHKLVLQKKLDFEVPVMNS LLSMYSKCKRVDLAASIFENLKKKTNVTWNAMILGYAQNGCVNEALYLFCVMQSQEVKPD CFTLVAVITALADLSVNRMAKWIHGLAIRTFMDNDVYVATALIDMYAKCGATQTARKLFD MMHERHVITWNAMIDGYGTHGLGKEAIDIFDNMQKEAVIPNDTTFLSVISACSHSGFVEE GLHFFQSMKEDYGLEPSMDHYSAVVDLLGRAGKLHGAWNLIEEMPIKPGITVLGAMLGAC KIHKNVELGEKAADKLFELDPDEGGYHVLLANMYVSASMWDKVAKVRTAMEKKGIHKTPG CSFVELRNEVHTFYSGSTNHPQAKKIYAFLEALGDKIRDAGYIPDTNSIHDVEEKVKEQL LSSHSERLAIAFGLLNTNHGTPIHVRKNLRVCGDCHDVTKYISLVTGREIIVRDLREQSG SSGCCLSLLCREQVNYHNRGEGYIDATLRQQKKTLKRIYTALLLVPCKCCGYIDSCSFTV KLLYL*

Transcript Sequence

Gene sequence data has not been registered.