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All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

orange1.1t04543.4
CDS Infomation

gene=orange1.1t04543
Sequence

ATGGATAACAACAGTAACAAACTCCAACTCTTCCTCCTCTCACTCTTCCTCCTTGCGATC
AGTGCCGTCCACCCGAGATCCGTCCCCTATTCTACGCCGTCCGATCTGATCTCCGATGGG
ATCAACAGCAACAATAACCACAACCAACGGGGCCCGCAGTACTTACTGCTCAATCCGTTC
ATTAAGGCAGAGGAGGAATCGTCTTCCTCCACGTGCGAGCAGACCTACGGGTTCTTGCCT
TGCACCACCACGGTGTTGGGGAACTTGTTTTTGATTATTGTTTATGGCTATCTCATGTAC
GTGGCGGCTACTTATTTGTCCAATGGCAGTGAGCTTTTGCTCGAGATTCTCGGCCCCGGT
GTCGTCGGTGGATTGTTTCTTCCCATCCTCGGCGCCCTTCCTGATGCAATGCTCATTCTC
GTATCTGGACTCTCTGGAACTAAAGAAACTGCTCAAAGTCAGGTCTCAGTGGGAATGGGC
TTGCTAGCTGGGTCAACTGTCATGCTTAGTACAGTAATATGGGGAACCTGTGTTGTTGTG
GGGAAGTGTGACCTTCGCGAGTCAGATTCAGTCGCGATAGATGGCCAAAACACGAAAGGA
TTCCGCTTAACTGGTACTGGTGTTAGTACTGATGTTTGGACTTGCTATGCTGCTAGGATA
ATGGCTATCTCTGTCATCCCATTTGTTGTTGTTCAACTACCACAGATGCTCAATTCAACC
TCAGGAAGACACTTAGCAGTCTTGATTGCACTTATTTTATCTGTCTCAATGCTGATTTCT
TATTGCCTCTATCAGGTCTTTCAGCCTTGGATTCAGAAGAGGCGTCTTGCTTTTGCAAAG
CATAAGCATGTGATATCAGGAATTTTGAAACATCTGAGACAGCGTGCTTTGGGAAGACTC
CTGACTGATAGTGGAGAACCTAACATAGATGTTATTAAAAAATTATTTGATGCAATAGAT
GAGAATAAAGATGAGCGTCTTTCGGCTTCTGAACTAAAAGCATTGATCATAGGAATTCGG
TTTGAAGAGATAGACTTGGATCAGGATGATGCTGTCAGCAAAGTATTGAGCGACTTTGAT
ACCTCTAATGATAGTCACATTGATATCAAAGAGTTCATCAATGGCATTGAGAAATGGCTT
AATGAGGCAATGCAAGCTAGAACTGGTTCTGCTGATCCCGGTCCCCACACAATGAAATTT
TTAGATGACTTTCACCTGGTAAGTTGCAGAATTGTGTGTCCGTTCTACCTCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

orange1.1t04543.4
PEP Infomation
Sequence

MDNNSNKLQLFLLSLFLLAISAVHPRSVPYSTPSDLISDGINSNNNHNQRGPQYLLLNPF
IKAEEESSSSTCEQTYGFLPCTTTVLGNLFLIIVYGYLMYVAATYLSNGSELLLEILGPG
VVGGLFLPILGALPDAMLILVSGLSGTKETAQSQVSVGMGLLAGSTVMLSTVIWGTCVVV
GKCDLRESDSVAIDGQNTKGFRLTGTGVSTDVWTCYAARIMAISVIPFVVVQLPQMLNST
SGRHLAVLIALILSVSMLISYCLYQVFQPWIQKRRLAFAKHKHVISGILKHLRQRALGRL
LTDSGEPNIDVIKKLFDAIDENKDERLSASELKALIIGIRFEEIDLDQDDAVSKVLSDFD
TSNDSHIDIKEFINGIEKWLNEAMQARTGSADPGPHTMKFLDDFHLVSCRIVCPFYL*

Transcript Sequence

Transcript ID

orange1.1t04543.4
Transcript Infomation

gene=orange1.1t04543 CDS=232-1485
Sequence

CATTTTCCGTTGCTGCCTTTAATATTTAAAAGTCACTAGCTTCTAACAGTAACAAACTAA
CGAATGATACGACACTGTTTCTCCTCGGTATCTCACAGTCATTCGGCACGGCCATTGCGC
GGCTTCAACGCGCTCTCACTCTCTCTCTCTCTATCCAGTAGATTATCGTAAATTAATGTT
GTAGTCTCATCAAATTCATCCACAACTCAACAAAGGAAAAAAAGAAAGGCGATGGATAAC
AACAGTAACAAACTCCAACTCTTCCTCCTCTCACTCTTCCTCCTTGCGATCAGTGCCGTC
CACCCGAGATCCGTCCCCTATTCTACGCCGTCCGATCTGATCTCCGATGGGATCAACAGC
AACAATAACCACAACCAACGGGGCCCGCAGTACTTACTGCTCAATCCGTTCATTAAGGCA
GAGGAGGAATCGTCTTCCTCCACGTGCGAGCAGACCTACGGGTTCTTGCCTTGCACCACC
ACGGTGTTGGGGAACTTGTTTTTGATTATTGTTTATGGCTATCTCATGTACGTGGCGGCT
ACTTATTTGTCCAATGGCAGTGAGCTTTTGCTCGAGATTCTCGGCCCCGGTGTCGTCGGT
GGATTGTTTCTTCCCATCCTCGGCGCCCTTCCTGATGCAATGCTCATTCTCGTATCTGGA
CTCTCTGGAACTAAAGAAACTGCTCAAAGTCAGGTCTCAGTGGGAATGGGCTTGCTAGCT
GGGTCAACTGTCATGCTTAGTACAGTAATATGGGGAACCTGTGTTGTTGTGGGGAAGTGT
GACCTTCGCGAGTCAGATTCAGTCGCGATAGATGGCCAAAACACGAAAGGATTCCGCTTA
ACTGGTACTGGTGTTAGTACTGATGTTTGGACTTGCTATGCTGCTAGGATAATGGCTATC
TCTGTCATCCCATTTGTTGTTGTTCAACTACCACAGATGCTCAATTCAACCTCAGGAAGA
CACTTAGCAGTCTTGATTGCACTTATTTTATCTGTCTCAATGCTGATTTCTTATTGCCTC
TATCAGGTCTTTCAGCCTTGGATTCAGAAGAGGCGTCTTGCTTTTGCAAAGCATAAGCAT
GTGATATCAGGAATTTTGAAACATCTGAGACAGCGTGCTTTGGGAAGACTCCTGACTGAT
AGTGGAGAACCTAACATAGATGTTATTAAAAAATTATTTGATGCAATAGATGAGAATAAA
GATGAGCGTCTTTCGGCTTCTGAACTAAAAGCATTGATCATAGGAATTCGGTTTGAAGAG
ATAGACTTGGATCAGGATGATGCTGTCAGCAAAGTATTGAGCGACTTTGATACCTCTAAT
GATAGTCACATTGATATCAAAGAGTTCATCAATGGCATTGAGAAATGGCTTAATGAGGCA
ATGCAAGCTAGAACTGGTTCTGCTGATCCCGGTCCCCACACAATGAAATTTTTAGATGAC
TTTCACCTGGTAAGTTGCAGAATTGTGTGTCCGTTCTACCTCTAGAGCTTACTACTACTG
AGTCCATGATATCTTGCAAATCATGTGCAGCAAACAAAGAGGGAGCATGCTTTGTTAGGA
GCAGAGGAGGAAAGTGACGAGGTCGCTGAGGGGGTTGAAAACCCGAAGTGGGTTTCCTTT
AAAGCGGTTTTGATGCTGTTGATTGGAACCATTATTGCTGCCGCATTTGCTGATCCACTT
GTAGATGCTGTTGATAACTTTTCAGCAGCAACAAGTATTCCTTCATTCTTCATCTCATTT
ATTGCATTGCCTTTTGCCACCAACTCAAGTGAAGCGGTATCAGCAATTATTTTTGCCAGC
CGTAAGAAGATTAGAACTGCCTCATTGACGTTTTCTGAGCTATATGGAGCCGTAACAATG
AATAACATCCTCTGCTTATCAGTTTTCTTAGCTCTTGTCTACGCAAGAGGATTGACGTGG
GACTTCTCATCTGAAGTCCTTGTTATTCTTATAGTTTGCTTAGTGATGGGTGCCTTTGCC
AGTTTCCGAACCAATTTCCCCCTTTGGACATGCTCAATTGCCTACGCCCTTTACCCGTTT
TCCTTGGCGCTGGTTTACGTTCTTGATTACTTCTTTGGTTGGTCGTAGATCATGAAATTC
AGTACCTGTACTGTTGTTTTACTTTTTGTACTTTTTATCGGATGGTACCATTCTGTTTGA
TATGAGACAGTTGAATTTTCTAATTCGATGCTTTATGGATTTGGTCTAAGTTTTATCAAC
CTTGTTTTTAGTTGGGCATATAGATTAGTCATTACTTATACTCCCCTTGTAATTACTTTT
CCTGTGTATCGTTGTTTTACTTTTGTACTTTAATCGAAAGGTACCGTTCTGTTTGATATG
AGACAGTTGCATTTTGTAATTTGATTTTTACAGTGTGTGCTGGGTTACAAAAAA