Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

orange1.1t04379.2

CDS Infomation

gene=orange1.1t04379

Sequence

ATGCAGAAGTCTCCACAAGCTATAGACTTTGCTCTGAAGGAAACCTCCCCCAAGATTGGT
GCGGGGTCTATCACAGGCGATAAGCTTTCATGCACCTATGACCTTGTCGAACAAATGCAA
TACCTTTATGTCCGGGTTGTCAAGGCAAAGGATTTACCTGGAAAAGATGTTACTGGTAGC
TGTGATCCCTATGTTGAAGTAAAACTCGGAAACTATAAGGGAACTACGAAGCATTTTGAG
AAGAAGTCCAATCCTGAATGGAATCAGTGTTTTGCTTTCTCGAAAGATAGGATTCAGGCT
TCAGTTTTGGAAGTGTTGGTGAAGGACAAGGATGTTGTTTTGGATGATTTAATTGGCAGG
GTAATGTTTGACCTCAATGAAGTGCCGAAAAGGATTCCTCCAGACAGTCCTTTGGCACCC
CAGTGGTACAGATTGGAAGATCGTAAGGGAGATAAGGTTAAAACTGGAGAGCTGATGTTG
GCTGTTTGGATGGGAACTCAAGCAGATGAGGCGTTTCCTGATGCATGGCACTCAGATGCA
GCAACAGTCAGCGGTGAAGGAGTTGCAAATATTCGATCAAAGGTATATCTATCCCCCAAG
CTTTGGTATGTGAGGGTCAACATTATTGAAGCTCAGGACCTGCTACCTAGTGATAAAAGT
AGGTTTCCTGAAGTTTTTGTGAAGGCTATCCTCGGAAATCAGGCATCGAGAACTAGAATT
TCTCCAAGTAAGACTATAAACCCAATGTGGAATGAAGATTTGATGTTTGTAGCAGCCGAG
CCTTTTGAGGAACCCTTGATTCTGACCGTCGAAGATAGGGTAGCACCAAACAAGGATGAA
GTGTTAGGTAAGTGTCTGATCCCATTGCAGGCAGTGCAGAGGAGGTTGGACCATAAGCCT
GTGAACACTAGGTGGTTTAACCTTGAGAAGCATGTTATTGTAGACGGGGAAAAGAAAGAG
ACTAAATTTTCCAGCAGAATTCATCTGAGGATATGTCTGGATGGTGGATATCATGTTTTG
GATGAATCGACCCACTACAGCAGTGATCTGAGGCCAACTGCAAAACAGTTGTGGAAACCC
AGCATTGGAATATTGGAGCTTGGCGTTCTCAGTGCTCATGGGCTGACGCCAATGAAGACA
AAAGATGGACGAGGAACCACAGATGCTTATTGTGTGGCCAAATATGGGCAGAAATGGGTG
CGAACACGGACAATTGTTGACAGCTTCGGGCCACGATGGAATGAGCAGTACACTTGGGAA
GTTTTTGACCCATGTACTGTCATTACTGTAGGGGTATTTGATAATGGCCACATCCATGGA
CAAGGTGGCGGTGGGAAGGATTCAAGAATTGGTAAAGTGAGGATTCGATTATCAACACTT
GAAACTGATAGGGTTTACACACACTCTTATCCTCTTTTAGTTTTGCATCCTTCAGGGGTG
AGGAAAATGGGCGAGGTTCAATTGGCCGTGAGGTTTACTTGCTCGTCTTTGATTAACATG
CTGCATATGTACTCACAACCATTGCTGCCCAAAATGCACTACATTCATCCATTGTCTGTT
ATTCAGCTTGATAGCTTGAGGCACCAGGCTATGCAGATTGTCTCCATTAGGCTGAACCGA
GCTGAGCCACCATTGAGGAAAGAGGTTGTGGAGTACATGCTTGATGTAGACTCTCATATG
TGGAGTATGAGGAGAAGCAAGGCTAATTTCTTTAGAATAATGGGTGTTCTAAGTTCGTTG
ATTTCTGTTGGTAAATGGTTCGATCAAATCTGCAATTGGAAAAACCCTCTTACAACCATT
TTGATTCACATCCTTTTCATCATATTGGTCCTTTATCCTGAGCTCATACTCCCCACCGTA
TTTCTCTACCTTTTCTTGATTGGCATTTGGAACTTCCGTTGGAGGCCAAGGCACCCTCCT
CACATGGACACTCGATTGTCGCATGCCGAAGCTGCTCACCCTGATGAACTAGATGAAGAA
TTCGACACATTCCCCACTACCAAGGGATCAGACATTGTTCGCATGAGATATGACCGCCTG
AGAAGCATAGCAGGGAGGGTTCAGACAGTGATTGGTGACCTTGCAACTCAAGGGGAAAGG
TTTCAGTCTCTGATAAGCTGGAGAGACCCAAGAGCAACCACTCTTTTTGTCACTTTCTGC
TTGATTGCTGCTATAGTCCTCTATGTTACTCCATTCCAAGTTGTTGCCCTCCTTGCAGGC
ATTTACGTGCTAAGGCATCCCAGGTTTCGCCACAAGCTTCCATCGGTTCCTCTCAACTTC
TTCAGGAGGTTGCCAGCAAGGTCAGACAGCATGCTATAA

Peptide Sequence

PEP ID

orange1.1t04379.2

PEP Infomation

Sequence

MQKSPQAIDFALKETSPKIGAGSITGDKLSCTYDLVEQMQYLYVRVVKAKDLPGKDVTGS
CDPYVEVKLGNYKGTTKHFEKKSNPEWNQCFAFSKDRIQASVLEVLVKDKDVVLDDLIGR
VMFDLNEVPKRIPPDSPLAPQWYRLEDRKGDKVKTGELMLAVWMGTQADEAFPDAWHSDA
ATVSGEGVANIRSKVYLSPKLWYVRVNIIEAQDLLPSDKSRFPEVFVKAILGNQASRTRI
SPSKTINPMWNEDLMFVAAEPFEEPLILTVEDRVAPNKDEVLGKCLIPLQAVQRRLDHKP
VNTRWFNLEKHVIVDGEKKETKFSSRIHLRICLDGGYHVLDESTHYSSDLRPTAKQLWKP
SIGILELGVLSAHGLTPMKTKDGRGTTDAYCVAKYGQKWVRTRTIVDSFGPRWNEQYTWE
VFDPCTVITVGVFDNGHIHGQGGGGKDSRIGKVRIRLSTLETDRVYTHSYPLLVLHPSGV
RKMGEVQLAVRFTCSSLINMLHMYSQPLLPKMHYIHPLSVIQLDSLRHQAMQIVSIRLNR
AEPPLRKEVVEYMLDVDSHMWSMRRSKANFFRIMGVLSSLISVGKWFDQICNWKNPLTTI
LIHILFIILVLYPELILPTVFLYLFLIGIWNFRWRPRHPPHMDTRLSHAEAAHPDELDEE
FDTFPTTKGSDIVRMRYDRLRSIAGRVQTVIGDLATQGERFQSLISWRDPRATTLFVTFC
LIAAIVLYVTPFQVVALLAGIYVLRHPRFRHKLPSVPLNFFRRLPARSDSML*

Transcript Sequence

Transcript ID

orange1.1t04379.2

Transcript Infomation

gene=orange1.1t04379 CDS=650-2968

Sequence

AAAAAAAAAAAAGTTGGTGGTGGCTGAGTAGGCTCTCTGTGTGCTTTTTATAGATTAGAT
TCAGTCTCTTTCCGTAGATCTCACATTTTTTTTTTATTACATGATTCAACTCTTCAGTCT
TCACTAGCTATCTTTGTCTCTTCACTGCTTCATAACTCACTGCCCATTATTCATTTCCCA
ACACCCAATAAAATAAAATTAAAAAAAGGATTTTGATTTTTCATTGCTGCAACTTCACAA
CTTAGCTGAGCATTACGCACATTGTGCTAAAGGTTCTTGGTGCTTTCTGCTCAAATGCAT
TGACTGAAGTGCCCAGTGTTTACTCTATTATGGTTGACGAGGTCCTTTAATCTTTTTCCT
TTCTCATCATGCACTAGAGATCTGAAATTTAGAATCCAGAAACTATGTTTGATTTTCTTT
CCTTGATTTATGCCTTATCATATCTTTTAGCTTCATTACACTTGTGTCCTCAACTTTCTG
ATCTCTGGTTTGTACAATAGCCTACTAGCTACAACAAAAGAGTTGGGGTTTCGATCATTG
GAGACATTCATTGTGAGGTTGAACTTGACTTAGAAAATCTTTGTTTCTTCTTGTGTAACT
GTAATATTCTTCTGGGTAGCCTTGGTTTTGTTATTACATATTAGTGAAGATGCAGAAGTC
TCCACAAGCTATAGACTTTGCTCTGAAGGAAACCTCCCCCAAGATTGGTGCGGGGTCTAT
CACAGGCGATAAGCTTTCATGCACCTATGACCTTGTCGAACAAATGCAATACCTTTATGT
CCGGGTTGTCAAGGCAAAGGATTTACCTGGAAAAGATGTTACTGGTAGCTGTGATCCCTA
TGTTGAAGTAAAACTCGGAAACTATAAGGGAACTACGAAGCATTTTGAGAAGAAGTCCAA
TCCTGAATGGAATCAGTGTTTTGCTTTCTCGAAAGATAGGATTCAGGCTTCAGTTTTGGA
AGTGTTGGTGAAGGACAAGGATGTTGTTTTGGATGATTTAATTGGCAGGGTAATGTTTGA
CCTCAATGAAGTGCCGAAAAGGATTCCTCCAGACAGTCCTTTGGCACCCCAGTGGTACAG
ATTGGAAGATCGTAAGGGAGATAAGGTTAAAACTGGAGAGCTGATGTTGGCTGTTTGGAT
GGGAACTCAAGCAGATGAGGCGTTTCCTGATGCATGGCACTCAGATGCAGCAACAGTCAG
CGGTGAAGGAGTTGCAAATATTCGATCAAAGGTATATCTATCCCCCAAGCTTTGGTATGT
GAGGGTCAACATTATTGAAGCTCAGGACCTGCTACCTAGTGATAAAAGTAGGTTTCCTGA
AGTTTTTGTGAAGGCTATCCTCGGAAATCAGGCATCGAGAACTAGAATTTCTCCAAGTAA
GACTATAAACCCAATGTGGAATGAAGATTTGATGTTTGTAGCAGCCGAGCCTTTTGAGGA
ACCCTTGATTCTGACCGTCGAAGATAGGGTAGCACCAAACAAGGATGAAGTGTTAGGTAA
GTGTCTGATCCCATTGCAGGCAGTGCAGAGGAGGTTGGACCATAAGCCTGTGAACACTAG
GTGGTTTAACCTTGAGAAGCATGTTATTGTAGACGGGGAAAAGAAAGAGACTAAATTTTC
CAGCAGAATTCATCTGAGGATATGTCTGGATGGTGGATATCATGTTTTGGATGAATCGAC
CCACTACAGCAGTGATCTGAGGCCAACTGCAAAACAGTTGTGGAAACCCAGCATTGGAAT
ATTGGAGCTTGGCGTTCTCAGTGCTCATGGGCTGACGCCAATGAAGACAAAAGATGGACG
AGGAACCACAGATGCTTATTGTGTGGCCAAATATGGGCAGAAATGGGTGCGAACACGGAC
AATTGTTGACAGCTTCGGGCCACGATGGAATGAGCAGTACACTTGGGAAGTTTTTGACCC
ATGTACTGTCATTACTGTAGGGGTATTTGATAATGGCCACATCCATGGACAAGGTGGCGG
TGGGAAGGATTCAAGAATTGGTAAAGTGAGGATTCGATTATCAACACTTGAAACTGATAG
GGTTTACACACACTCTTATCCTCTTTTAGTTTTGCATCCTTCAGGGGTGAGGAAAATGGG
CGAGGTTCAATTGGCCGTGAGGTTTACTTGCTCGTCTTTGATTAACATGCTGCATATGTA
CTCACAACCATTGCTGCCCAAAATGCACTACATTCATCCATTGTCTGTTATTCAGCTTGA
TAGCTTGAGGCACCAGGCTATGCAGATTGTCTCCATTAGGCTGAACCGAGCTGAGCCACC
ATTGAGGAAAGAGGTTGTGGAGTACATGCTTGATGTAGACTCTCATATGTGGAGTATGAG
GAGAAGCAAGGCTAATTTCTTTAGAATAATGGGTGTTCTAAGTTCGTTGATTTCTGTTGG
TAAATGGTTCGATCAAATCTGCAATTGGAAAAACCCTCTTACAACCATTTTGATTCACAT
CCTTTTCATCATATTGGTCCTTTATCCTGAGCTCATACTCCCCACCGTATTTCTCTACCT
TTTCTTGATTGGCATTTGGAACTTCCGTTGGAGGCCAAGGCACCCTCCTCACATGGACAC
TCGATTGTCGCATGCCGAAGCTGCTCACCCTGATGAACTAGATGAAGAATTCGACACATT
CCCCACTACCAAGGGATCAGACATTGTTCGCATGAGATATGACCGCCTGAGAAGCATAGC
AGGGAGGGTTCAGACAGTGATTGGTGACCTTGCAACTCAAGGGGAAAGGTTTCAGTCTCT
GATAAGCTGGAGAGACCCAAGAGCAACCACTCTTTTTGTCACTTTCTGCTTGATTGCTGC
TATAGTCCTCTATGTTACTCCATTCCAAGTTGTTGCCCTCCTTGCAGGCATTTACGTGCT
AAGGCATCCCAGGTTTCGCCACAAGCTTCCATCGGTTCCTCTCAACTTCTTCAGGAGGTT
GCCAGCAAGGTCAGACAGCATGCTATAAGGACAGCCAACTTTTGCTTGGCCTTTGCTGTC
TTTGGATCTCACATTTAGCCGCCCAGATTCTGAAGCAGCATGCCAATGTACTGCACCAGC
GACTCAACATCTCTCTGTTTCTTTATGTGATGTAATTTTTATCTGCACAATCTGGTAAAT
TTCATGAAAACTCAGCAGGCAGCTTGTTCAAGTTGATTTGATTCTGTTCATTTGTAATAT
GTAAACTCTAATTTTAATTAGTTTATGCAAACCTGTCACCTAAATTATGCCACCTACATT
GTTCTGTGCAAGTAATATAATTTAACTGCTCGTCTTGGTTGTGCTTCG