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All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

orange1.1t03955.1
CDS Infomation

gene=orange1.1t03955
Sequence

ATGAACTCAAGTCTCAGCTTCATCGCTAAAAGCATAGTCATTTTTCTTTTTATCAATAGT
TCTACTCAAGGTGTCGTTCAGTATCAGATAGAGGGTGCAATTGGACCTGAAAGTCTTGCA
TTTGATGCACTTGGAGAGGGTCCTTATACCGGCGTATCCGATGGCCGTATTATTAAATGG
CACCAAGACCAACGCCGCTGGCTTCATTTTGCTCGAACCTCTCCAAACAGGGATGGTTGT
GAAGGGGCATATGAATATGATCATGCGGCAAAGGAGCACATATGTGGGCGTCCGTTAGGT
TTGTGCTTCAATAAAACCAACGGTGATCTCTACATCGCTGACGCTTATTTTGGATTGCTT
AAAGTGGGACCCGAAGGAGGATTGGCCACTGCCGTTGCTACTCAATCAGAGGGCATTCCT
TTCAGATTCTGTAATAGTCTAGACATCGATCAATCCACCGGAATCATCTATTTTACCGAC
AGCAGTTCACAGTTTCAAAGGAGGAACCACATTTCTGTAATACTAAGTGGTGATAAAACA
GGAAGGCTAATGAAGTATGACCCAGCAACAAAACAAGTAACTGTTCTTCTTGGGAATCTC
TCATTTCCAAATGGGGTGGCTTTGAGTGAAGATGGCAACTACATATTACTTGCAGAGACA
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GTTGGTATACATTCGAGAAGGAAAGGGATCTCTAAATTGGTTCTTTCATTTCCTTGGATA
GGAAATGTTCTGATTAAACTACCAATTGACATTGTTAAAATTCATTCAAGTTTGGTTAAG
CTAAGTGGGAATGGTGGAATGGCTATGAGGATAAGTGAACAAGGGAATGTATTGGAGATT
TTGGAAGAAATAGGTAGAAAGATGTGGAGATCTATTAGTGAAGTTGAAGAGAAAGATGGG
AATTTGTGGATTGGATCAGTTAATATGCCTTATGCAGGCTTATACAATTATTCATCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

orange1.1t03955.1
PEP Infomation
Sequence

MNSSLSFIAKSIVIFLFINSSTQGVVQYQIEGAIGPESLAFDALGEGPYTGVSDGRIIKW
HQDQRRWLHFARTSPNRDGCEGAYEYDHAAKEHICGRPLGLCFNKTNGDLYIADAYFGLL
KVGPEGGLATAVATQSEGIPFRFCNSLDIDQSTGIIYFTDSSSQFQRRNHISVILSGDKT
GRLMKYDPATKQVTVLLGNLSFPNGVALSEDGNYILLAETTSCRILRYWLKTSKAGTIEI
VAQLPGFPDNIKRSPRGGFWVGIHSRRKGISKLVLSFPWIGNVLIKLPIDIVKIHSSLVK
LSGNGGMAMRISEQGNVLEILEEIGRKMWRSISEVEEKDGNLWIGSVNMPYAGLYNYSS*

Transcript Sequence

Transcript ID

orange1.1t03955.1
Transcript Infomation

gene=orange1.1t03955 CDS=621-1700
Sequence

TGACGCGATCTTGTGTTCTGTATAAGCCTTTAATTATTTGGTTTTCATATTTGTTTTTAG
TTGAATTGAATTGAAGATTTCTTAAGTCGTGTTTGAAGGTAACAGCGAAGCAAATACATT
TGATATTCCACTGGAAAAAAAAAAAAAAAACTTTAAGACTTAAGGAAAAAAAAAGGATAA
TTATTGACAGATTTTCAAATAGTTTAAAATGAATGTAGAAAATAAAAATATTTTTATTGA
ATTATATTAGTTTGTATATACTCCTAACTTATATTAGGGATATTATATTAGCTTGTCTAT
ATTTATAATTTATATTATGAGTATTTTAATAATAAAAATTATATTTTATAAAAAAATTAA
TTGATAAAATATTTTAATGAATTCAAATAACCTTACTTAAATTAATAATATCTCCACGAA
CCAAAATTCTAGTTCTGCCCTTCCATACAAACATAGCATTTCTTCTCTTTCTTCCATGCC
CCACCCACCGCTCACTTGAAACATGCGGCAGCTCTACAATCGGCCACGCAAATACCCTTT
TTTGATTAGCTCCTCTATAAATAAATTTGCCCATTTCCGCAACTCAATACCGTTTGTTAT
TTCTCTCTATCACCATCACCATGAACTCAAGTCTCAGCTTCATCGCTAAAAGCATAGTCA
TTTTTCTTTTTATCAATAGTTCTACTCAAGGTGTCGTTCAGTATCAGATAGAGGGTGCAA
TTGGACCTGAAAGTCTTGCATTTGATGCACTTGGAGAGGGTCCTTATACCGGCGTATCCG
ATGGCCGTATTATTAAATGGCACCAAGACCAACGCCGCTGGCTTCATTTTGCTCGAACCT
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TATGTGGGCGTCCGTTAGGTTTGTGCTTCAATAAAACCAACGGTGATCTCTACATCGCTG
ACGCTTATTTTGGATTGCTTAAAGTGGGACCCGAAGGAGGATTGGCCACTGCCGTTGCTA
CTCAATCAGAGGGCATTCCTTTCAGATTCTGTAATAGTCTAGACATCGATCAATCCACCG
GAATCATCTATTTTACCGACAGCAGTTCACAGTTTCAAAGGAGGAACCACATTTCTGTAA
TACTAAGTGGTGATAAAACAGGAAGGCTAATGAAGTATGACCCAGCAACAAAACAAGTAA
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ACATATTACTTGCAGAGACAACAAGCTGCAGAATTCTAAGGTATTGGCTAAAAACATCGA
AAGCCGGAACAATAGAAATCGTCGCTCAACTCCCAGGGTTTCCAGATAACATAAAAAGAA
GCCCCAGAGGAGGATTTTGGGTTGGTATACATTCGAGAAGGAAAGGGATCTCTAAATTGG
TTCTTTCATTTCCTTGGATAGGAAATGTTCTGATTAAACTACCAATTGACATTGTTAAAA
TTCATTCAAGTTTGGTTAAGCTAAGTGGGAATGGTGGAATGGCTATGAGGATAAGTGAAC
AAGGGAATGTATTGGAGATTTTGGAAGAAATAGGTAGAAAGATGTGGAGATCTATTAGTG
AAGTTGAAGAGAAAGATGGGAATTTGTGGATTGGATCAGTTAATATGCCTTATGCAGGCT
TATACAATTATTCATCTTAACGATGATTTTCGAAGATAATATCTGATCAGCAAACTCTTC
ACTGGACGTCCGCACGAGATAAAATGTGCAGCTGATGTTTTACGCTATCGTTTATCGCTT
TTGCAATGGCGAAAATAATTTTGGTAAACAATAAAATACTGTAACTTATATTATATTTCG
TGAGGACGGCTTAGAAGAGAATTTGCAC