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All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

orange1.1t03818.3
CDS Infomation

gene=orange1.1t03818
Sequence

ATGGCGGCCGCAGCTAAGGCCGGCGAGGCGACCTTGCGTCACGCCTTTGGAAATGTTCTC
TCATTCTTCATTCTCCTTTTGATCGGAGTTCTCGCTTTCTCGATCCGTCTCTTCTCTGTT
ATAAAGTATGAAAGTGTCATTCATGAGTTTGACCCGTACTTCAATTACAGGGTCACTCAG
TTCCTAACGAAGAATGGCATATATGATTTTTGGAACTGGTTTGATGATAGAACCTGGTAT
CCTCTTGGTCGTGTTATTGGTGGAACTGTTTACCCTGGGTTAACCTTGACAGCAGGCACC
ATATGGTGGTTATTGAACTCCTTGAATATTCCTCTGTCAGTGGAGACAGTTTGTGTGTTC
ACTGCACCTATATTCTCTGCTTTTGCTTCGTGGGCAACTTACCTTCTAACTAAGGAAGTT
AAGGGTGCTGGTGCAGGACTGACAGCTGCAGCTCTTCTGGCAATGGTTCCATCATACATA
TCTCGATCTGTGGCCGGAAGCTACGATAATGAAGCAGTAGCAATATTTGCTTTGATTATC
ACTTTTTATCTTTATATAAAGACACTGAATACTGGATCCCTCTTTTATGCCACTTTAAAT
GCGATTGCATACTTTTACATGGTTTGCTCTTGGGGAGGTTATACCTTTATTATTAATCTT
ATTCCAATGCATGTGCTTCTGTGCATTGTAACTGGTCGCTACTCTTCTCGATTGTACATC
GCATATGCTCCTCTGGTTGTCCTGGGAACGTTGCTGGCCGCATTGGTGCCTGTGGTTGGA
TTTAATGCAGTCATGACTTCTGAACATTTTGCATCATTTTTGGTTTTTATTATCCTCCAT
GTGGTGGCTCTCGTATATTATATCAAGGGGATTCTCTCTCCCAAAATGTTTAAAGTAGCT
GTCACACTTGTGGTATCAGTTGGCCTGGTAGTCTGTTGTGCTGTGATAGCAATTCTTGTA
GCATTGGTAGCTTCTAGTCCAACAAAAGGATGGAGTGGGAGAAGTTTGAGTCTGCTTGAT
CCAACCTATGCAAGCAAGTACATACCAATTATTGCTAGTGTCAGTGAACATCAGCCCCCT
ACTTGGCCGTCTTACTTCATGGACATCAATGTTTTGGCATTCTTGGTTCCAGCTGGCATT
ATTGCGTGCTTCTTGCCTTTATCTGATGCAAGCTCCTTCGTAGTCCTATATATTGTGACA
TCTGTTTACTTTTCGGGAGTGATGGTGCGCCTTATGCTTGTATTTGCCCCAGCGGCATGC
ATCATGTCTGGGATTGCTCTGTCTCAAGCTTTTGATGTTTTCACAAGATCAATCAAGTTT
CAGCTGCTTAGAATACTAGGATTTTCTGAAGCTGATGCAGGGGATGGTAGCTCTGCTAAT
GTTGTACCAGAAAATGATGCTGTAAAGGTTGATAAAAGTGAAGAAACAATAAAGGAACGA
CCCTCGAGAAAGAACAAGAAGAAGGAAAAGGAGCAAATGGAAAAGGCTCAAGCAGAAAAG
ACTTCGGCCAAGTCCAAAACTGAAAAGAGGCTTCTGGTTTTACCAATGGAGCTGTCTGTG
ATTGGTCTTCTTTTACTTGTGTTCATGGGTGCATTTTATGTGGTTCATTGTGTCTGGGCA
GCTGCAGAAGCTTATTCAGCCCCCTCTATTGTTTTAACATCTTATACACATGAAGGCCTG
CATGTTTTTGATGATTTTCGTGAGGCTTATGCTTGGTTGCGCCACAATACAGAAGTGGAT
GACAAAGTTGCATCATGGTGGGATTATGGTTACCAAACGACTGCCATGGCTAACCGGACA
GTCATTGTTGATAATAATACTTGGAACAACACTCATATTGCAACTGTTGGCACTGCCATG
TCTTCTCCTGAGAAGGCAGCATGGGAAATTTTTAACTCACTGGATGTAAAATATGTGCTT
GTCGTCTTTGGAGGTTTGCTTCCTTCTTGTGTGTTTCAGAATTCATGCCTAAAATAA

Peptide Sequence

PEP ID

orange1.1t03818.3
PEP Infomation
Sequence

MAAAAKAGEATLRHAFGNVLSFFILLLIGVLAFSIRLFSVIKYESVIHEFDPYFNYRVTQ
FLTKNGIYDFWNWFDDRTWYPLGRVIGGTVYPGLTLTAGTIWWLLNSLNIPLSVETVCVF
TAPIFSAFASWATYLLTKEVKGAGAGLTAAALLAMVPSYISRSVAGSYDNEAVAIFALII
TFYLYIKTLNTGSLFYATLNAIAYFYMVCSWGGYTFIINLIPMHVLLCIVTGRYSSRLYI
AYAPLVVLGTLLAALVPVVGFNAVMTSEHFASFLVFIILHVVALVYYIKGILSPKMFKVA
VTLVVSVGLVVCCAVIAILVALVASSPTKGWSGRSLSLLDPTYASKYIPIIASVSEHQPP
TWPSYFMDINVLAFLVPAGIIACFLPLSDASSFVVLYIVTSVYFSGVMVRLMLVFAPAAC
IMSGIALSQAFDVFTRSIKFQLLRILGFSEADAGDGSSANVVPENDAVKVDKSEETIKER
PSRKNKKKEKEQMEKAQAEKTSAKSKTEKRLLVLPMELSVIGLLLLVFMGAFYVVHCVWA
AAEAYSAPSIVLTSYTHEGLHVFDDFREAYAWLRHNTEVDDKVASWWDYGYQTTAMANRT
VIVDNNTWNNTHIATVGTAMSSPEKAAWEIFNSLDVKYVLVVFGGLLPSCVFQNSCLK*

Transcript Sequence

Transcript ID

orange1.1t03818.3
Transcript Infomation

gene=orange1.1t03818 CDS=145-2121
Sequence

CGCAAATCTTCTCCCTCGCAAGTCTACGAAGTCTTCTCCTCTCACTCTCTACACTCGAGA
CCTACACGATACAAAAACCGCTTCATTCTCTCTTTAAGATTAACCTTTTAAGTTAACTAA
AATCAGTGAGCAAATTGGTCGTCAATGGCGGCCGCAGCTAAGGCCGGCGAGGCGACCTTG
CGTCACGCCTTTGGAAATGTTCTCTCATTCTTCATTCTCCTTTTGATCGGAGTTCTCGCT
TTCTCGATCCGTCTCTTCTCTGTTATAAAGTATGAAAGTGTCATTCATGAGTTTGACCCG
TACTTCAATTACAGGGTCACTCAGTTCCTAACGAAGAATGGCATATATGATTTTTGGAAC
TGGTTTGATGATAGAACCTGGTATCCTCTTGGTCGTGTTATTGGTGGAACTGTTTACCCT
GGGTTAACCTTGACAGCAGGCACCATATGGTGGTTATTGAACTCCTTGAATATTCCTCTG
TCAGTGGAGACAGTTTGTGTGTTCACTGCACCTATATTCTCTGCTTTTGCTTCGTGGGCA
ACTTACCTTCTAACTAAGGAAGTTAAGGGTGCTGGTGCAGGACTGACAGCTGCAGCTCTT
CTGGCAATGGTTCCATCATACATATCTCGATCTGTGGCCGGAAGCTACGATAATGAAGCA
GTAGCAATATTTGCTTTGATTATCACTTTTTATCTTTATATAAAGACACTGAATACTGGA
TCCCTCTTTTATGCCACTTTAAATGCGATTGCATACTTTTACATGGTTTGCTCTTGGGGA
GGTTATACCTTTATTATTAATCTTATTCCAATGCATGTGCTTCTGTGCATTGTAACTGGT
CGCTACTCTTCTCGATTGTACATCGCATATGCTCCTCTGGTTGTCCTGGGAACGTTGCTG
GCCGCATTGGTGCCTGTGGTTGGATTTAATGCAGTCATGACTTCTGAACATTTTGCATCA
TTTTTGGTTTTTATTATCCTCCATGTGGTGGCTCTCGTATATTATATCAAGGGGATTCTC
TCTCCCAAAATGTTTAAAGTAGCTGTCACACTTGTGGTATCAGTTGGCCTGGTAGTCTGT
TGTGCTGTGATAGCAATTCTTGTAGCATTGGTAGCTTCTAGTCCAACAAAAGGATGGAGT
GGGAGAAGTTTGAGTCTGCTTGATCCAACCTATGCAAGCAAGTACATACCAATTATTGCT
AGTGTCAGTGAACATCAGCCCCCTACTTGGCCGTCTTACTTCATGGACATCAATGTTTTG
GCATTCTTGGTTCCAGCTGGCATTATTGCGTGCTTCTTGCCTTTATCTGATGCAAGCTCC
TTCGTAGTCCTATATATTGTGACATCTGTTTACTTTTCGGGAGTGATGGTGCGCCTTATG
CTTGTATTTGCCCCAGCGGCATGCATCATGTCTGGGATTGCTCTGTCTCAAGCTTTTGAT
GTTTTCACAAGATCAATCAAGTTTCAGCTGCTTAGAATACTAGGATTTTCTGAAGCTGAT
GCAGGGGATGGTAGCTCTGCTAATGTTGTACCAGAAAATGATGCTGTAAAGGTTGATAAA
AGTGAAGAAACAATAAAGGAACGACCCTCGAGAAAGAACAAGAAGAAGGAAAAGGAGCAA
ATGGAAAAGGCTCAAGCAGAAAAGACTTCGGCCAAGTCCAAAACTGAAAAGAGGCTTCTG
GTTTTACCAATGGAGCTGTCTGTGATTGGTCTTCTTTTACTTGTGTTCATGGGTGCATTT
TATGTGGTTCATTGTGTCTGGGCAGCTGCAGAAGCTTATTCAGCCCCCTCTATTGTTTTA
ACATCTTATACACATGAAGGCCTGCATGTTTTTGATGATTTTCGTGAGGCTTATGCTTGG
TTGCGCCACAATACAGAAGTGGATGACAAAGTTGCATCATGGTGGGATTATGGTTACCAA
ACGACTGCCATGGCTAACCGGACAGTCATTGTTGATAATAATACTTGGAACAACACTCAT
ATTGCAACTGTTGGCACTGCCATGTCTTCTCCTGAGAAGGCAGCATGGGAAATTTTTAAC
TCACTGGATGTAAAATATGTGCTTGTCGTCTTTGGAGGTTTGCTTCCTTCTTGTGTGTTT
CAGAATTCATGCCTAAAATAATGTGTCTCACGGGTACTTCACTCTTTAGGTCTTGTTGGT
TACCCCAGTGATGATATCAATAAGTTCCTGTGGATGGTCCGTATAGGAGGGGGTGTTTTC
CCTCATATTAAAGAACCTGATTATCTGGTAGGTTTCTGTTTAGATATAATTACCTAAAAA
TGAATTCTTGTTTTT