Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

orange1.1t03815.1
CDS Infomation

gene=orange1.1t03815
Sequence

ATGGCTGTGCTTTGCGGTTCGTGGAGGGAGAGGTGCGGTCAACGCTACATCGCCATTGGT
GAAGATGGGTGGTGGAGAGACGGAGGAAGATCCAATTTTGACAATGGGTTGTTGGATTTC
TTCACATGCATGGGACAACAATTTGTGGTACAATTATCAATGAGAGGGGGTGGATTTGAT
AATGAAAAATCAAACCCACAATGGGCATATATTTACTTCGCTCACATTTGTGGCAAAGAT
TATTTACCCCTCCCCAATTATGAGAAAACAATAAGAGTCCCTACAATCGTAAGGATTCAA
ACCTACTCTGTTAACCTTGTTGAAAGGAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAATCTCA
TTCCGATGTCCTATCTGCATGCTATCCCTTGTTCCCGGCATCAGTCTCTCCTCCCTACGC
ATGAAATCCTCTCACCCTCTCCTGCACAGGCTTTGCAAAACCCATACATTCAGAAAACAC
GTCACCATTTCCGCAGCAAGCAGCTTTCTCGATACTCATGAAGATCCAGCCAAAATCGTA
GCAACCCAATTGTCAAAATGTACCAACTTACTCCAACTGAACCAAATTTATGCCCATATT
ATCCGCACTCACATGCTGCATTCTTACTCTGCCGCATTTCATTGGAACAATATTATTAGA
TTATACACTAGGCTAGAGGCTCCTAAGAAAGCTCTGGACATCTACATTTTCATGTCACGA
GCTGGTGTCTTGCCCGATTGTTACACTCTTCCCATTGTATTAAAGGCCTCGTGCCAATTG
TTCGCTTTAGAGATTGGCAGGCAGCTTCACTCGCTTGCTGTCCGACTTGGACTCGAGTCA
AATGAGTTCTGTGAGAGCGGTTTCATCAGCTTGTATTCCAAAGCCGGTGATTTTGAGAAG
GCGCGGAAGGTGTTTGATGAAAATCCAGAAAGAAAGTTAGGTTCGTGGAATGCGATCATT
GCTGGGCTTTCTCAAGATGGGCGTGCCAAGGAAGCGATTGATATGTTTATTGGGTTAAAA
AAATGTGGGTTCGAGCCTGATGATGTGACAATGGTTAGTGTAACTTCCGCTTGTGGTAGT
TTAGGAGATTTGGAGTTGGCTCTTCAAGTGCACAAGTACGTTTTCCAAGTTAAAAGTAAG
CAAAAATCGGATACTTTAATGTTGAATTCACTTATAGACATGTATGGGAAATGTGGCCGG
ATGGACTTAGCTTATAAGGTGTTTTGGGAGATTGACCAACCAAACGTGTCATCGTGGACA
TCCATGATTGTGGGTTATGCTGCGAATGGACTTGCCAATGAAGCACTCGATTGTTTTCAT
TACATGAGAGAATCCGGCATTAGACCTAATCATGTGACTTTCGTTGGAGTTCTAAGTGCA
TGCGTGCATGGCGGGAAAGTGCAAGAAGGGAAGCATTTCTTTGAAATGATGAAGAATGTA
TATCAAATAGAGCCTCGGTTTGCACATTATGGGTGCATGGTGGATCTGCTTGGTCGAGCA
GGCTTGCTCGAGGAGGCTAGAGCGATGGTGGAAGGGATGCCAATGAAGGCGAATGTGGTG
ATATGGGGGTGTTTGATGGGTGCCTGTGAGAAATTTGGGAATGTGAAGATGGGGGAGTGG
GTGGCTAAGCATTTGCAAGAATTGGAACCTTGGAGTGATGGAGCTTATGTGGTTTTATCG
AATATTTATGCTAGTAGAGGTTTGTGGGAGGAGGTTGAGAGGATAAGAGCTGTTATGAAG
CATAGAAATCTTGCAAAGATCCCTGCTTACAGCTTGGCAACAAGATTGGATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

orange1.1t03815.1
PEP Infomation
Sequence

MAVLCGSWRERCGQRYIAIGEDGWWRDGGRSNFDNGLLDFFTCMGQQFVVQLSMRGGGFD
NEKSNPQWAYIYFAHICGKDYLPLPNYEKTIRVPTIVRIQTYSVNLVERRDRDRDRDRIS
FRCPICMLSLVPGISLSSLRMKSSHPLLHRLCKTHTFRKHVTISAASSFLDTHEDPAKIV
ATQLSKCTNLLQLNQIYAHIIRTHMLHSYSAAFHWNNIIRLYTRLEAPKKALDIYIFMSR
AGVLPDCYTLPIVLKASCQLFALEIGRQLHSLAVRLGLESNEFCESGFISLYSKAGDFEK
ARKVFDENPERKLGSWNAIIAGLSQDGRAKEAIDMFIGLKKCGFEPDDVTMVSVTSACGS
LGDLELALQVHKYVFQVKSKQKSDTLMLNSLIDMYGKCGRMDLAYKVFWEIDQPNVSSWT
SMIVGYAANGLANEALDCFHYMRESGIRPNHVTFVGVLSACVHGGKVQEGKHFFEMMKNV
YQIEPRFAHYGCMVDLLGRAGLLEEARAMVEGMPMKANVVIWGCLMGACEKFGNVKMGEW
VAKHLQELEPWSDGAYVVLSNIYASRGLWEEVERIRAVMKHRNLAKIPAYSLATRLD*

Transcript Sequence

Transcript ID

orange1.1t03815.1
Transcript Infomation

gene=orange1.1t03815 CDS=1-1794
Sequence

ATGGCTGTGCTTTGCGGTTCGTGGAGGGAGAGGTGCGGTCAACGCTACATCGCCATTGGT
GAAGATGGGTGGTGGAGAGACGGAGGAAGATCCAATTTTGACAATGGGTTGTTGGATTTC
TTCACATGCATGGGACAACAATTTGTGGTACAATTATCAATGAGAGGGGGTGGATTTGAT
AATGAAAAATCAAACCCACAATGGGCATATATTTACTTCGCTCACATTTGTGGCAAAGAT
TATTTACCCCTCCCCAATTATGAGAAAACAATAAGAGTCCCTACAATCGTAAGGATTCAA
ACCTACTCTGTTAACCTTGTTGAAAGGAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAATCTCA
TTCCGATGTCCTATCTGCATGCTATCCCTTGTTCCCGGCATCAGTCTCTCCTCCCTACGC
ATGAAATCCTCTCACCCTCTCCTGCACAGGCTTTGCAAAACCCATACATTCAGAAAACAC
GTCACCATTTCCGCAGCAAGCAGCTTTCTCGATACTCATGAAGATCCAGCCAAAATCGTA
GCAACCCAATTGTCAAAATGTACCAACTTACTCCAACTGAACCAAATTTATGCCCATATT
ATCCGCACTCACATGCTGCATTCTTACTCTGCCGCATTTCATTGGAACAATATTATTAGA
TTATACACTAGGCTAGAGGCTCCTAAGAAAGCTCTGGACATCTACATTTTCATGTCACGA
GCTGGTGTCTTGCCCGATTGTTACACTCTTCCCATTGTATTAAAGGCCTCGTGCCAATTG
TTCGCTTTAGAGATTGGCAGGCAGCTTCACTCGCTTGCTGTCCGACTTGGACTCGAGTCA
AATGAGTTCTGTGAGAGCGGTTTCATCAGCTTGTATTCCAAAGCCGGTGATTTTGAGAAG
GCGCGGAAGGTGTTTGATGAAAATCCAGAAAGAAAGTTAGGTTCGTGGAATGCGATCATT
GCTGGGCTTTCTCAAGATGGGCGTGCCAAGGAAGCGATTGATATGTTTATTGGGTTAAAA
AAATGTGGGTTCGAGCCTGATGATGTGACAATGGTTAGTGTAACTTCCGCTTGTGGTAGT
TTAGGAGATTTGGAGTTGGCTCTTCAAGTGCACAAGTACGTTTTCCAAGTTAAAAGTAAG
CAAAAATCGGATACTTTAATGTTGAATTCACTTATAGACATGTATGGGAAATGTGGCCGG
ATGGACTTAGCTTATAAGGTGTTTTGGGAGATTGACCAACCAAACGTGTCATCGTGGACA
TCCATGATTGTGGGTTATGCTGCGAATGGACTTGCCAATGAAGCACTCGATTGTTTTCAT
TACATGAGAGAATCCGGCATTAGACCTAATCATGTGACTTTCGTTGGAGTTCTAAGTGCA
TGCGTGCATGGCGGGAAAGTGCAAGAAGGGAAGCATTTCTTTGAAATGATGAAGAATGTA
TATCAAATAGAGCCTCGGTTTGCACATTATGGGTGCATGGTGGATCTGCTTGGTCGAGCA
GGCTTGCTCGAGGAGGCTAGAGCGATGGTGGAAGGGATGCCAATGAAGGCGAATGTGGTG
ATATGGGGGTGTTTGATGGGTGCCTGTGAGAAATTTGGGAATGTGAAGATGGGGGAGTGG
GTGGCTAAGCATTTGCAAGAATTGGAACCTTGGAGTGATGGAGCTTATGTGGTTTTATCG
AATATTTATGCTAGTAGAGGTTTGTGGGAGGAGGTTGAGAGGATAAGAGCTGTTATGAAG
CATAGAAATCTTGCAAAGATCCCTGCTTACAGCTTGGCAACAAGATTGGATTGA