Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

orange1.1t03681.2
CDS Infomation

gene=orange1.1t03681
Sequence

ATGAATTTTTCTGGCTACATTTCATCTTCTACCATAGGTTATATTAGTGCGACAGTTAAT
GATGGTCCGGGGTGCCTGATGCTTAGATGTCCTGATCCATCTTGCTGTGCTGCTGTTGGT
CAAGACATGATTGATATGTTGGCCTCTGATGAAGACAAGAAAAAGTATTCTCGTTACCTT
CTTAGATCTTATGTCGAAGACAATAGAAAGACCAAGTGGTGTCCTGCTCCAGGGTGCGAG
CATGCTATTGATTTTGCTGCTGGAAGTGGAAATTTTGATGTTTCCTGCTTATGCTCATAT
AACTTCTGCTGGAATTGCACTGAGGAAGCTCACCGTCCAGTGGATTGCGGCACTGTGGCA
AAGTGGATTTTGAAGAACTGTGCCGAGTCTGAAAACATGAATTGGATACTAGCCAATTCT
AAACCTTGTCCCAAGTGCAAGCGACCGATTGAGAAAAATCAAGGGTGTATGCACATGACA
TGCTCTCCACCTTGTAAATTTGAATTTTGCTGGCTATGCCTTGGAGCATGGTCAGATCAT
GGTGAGAGAACTGGTGGTTTCTATGCTTGTAACCGTTATGAGACTGCTAAGCAACAGGGA
GATTATGATGAGACTGAGAGAAGGAGAGAGATGGCCAAAAATTCTCTGGAGAAATACACT
CATTATTATGAACGTTGGGCGAGCAATCAATCGTCAAGGCAAAAAGCTCTGGCAGATTTA
CACCAAATGCAGACTGTGCATCTTGAGAAGCTTAGTGACATCCAGTGCACGCCTGAGTCT
CAGCTCAAGTTCATTATAGATGCGTGGCTTCAGATAGTTGAATGTCGGAGAGTTCTGAAA
TGGACCTATGCTTATGGATATTACCTACCTGAGCACGAGCATGCCAAGAGACAGTTTTTT
GAGTACCTGCAAGGTGAAGCAGAGTCGGGTTTGGAAAGGCTTCATCAATGTGCGGAGAAG
GAACTACTACAATTCTTAAACGATGAGAGCCAATCAAAAGAGTTCAATGATTTCCGTACG
AAGTTAGCTGGATTGACGAGTGTTACCAAAAATTACTTCGAGAACCTTGTTAGAGCTCTA
GAGAATGGATTAGCAGATGTAGACTCCCATGCAGCTTGTAGCAAGACGACAAACTCTAAG
TATGGCGGAGGGGGTGGGGCTAGCAAGGGAAAAAGTGGAAGGGGAAAAGGAAGTGGTAAA
ATTGGTGGTTCACACGATGCAGGCAGATGA

Peptide Sequence

PEP ID

orange1.1t03681.2
PEP Infomation
Sequence

MNFSGYISSSTIGYISATVNDGPGCLMLRCPDPSCCAAVGQDMIDMLASDEDKKKYSRYL
LRSYVEDNRKTKWCPAPGCEHAIDFAAGSGNFDVSCLCSYNFCWNCTEEAHRPVDCGTVA
KWILKNCAESENMNWILANSKPCPKCKRPIEKNQGCMHMTCSPPCKFEFCWLCLGAWSDH
GERTGGFYACNRYETAKQQGDYDETERRREMAKNSLEKYTHYYERWASNQSSRQKALADL
HQMQTVHLEKLSDIQCTPESQLKFIIDAWLQIVECRRVLKWTYAYGYYLPEHEHAKRQFF
EYLQGEAESGLERLHQCAEKELLQFLNDESQSKEFNDFRTKLAGLTSVTKNYFENLVRAL
ENGLADVDSHAACSKTTNSKYGGGGGASKGKSGRGKGSGKIGGSHDAGR*

Transcript Sequence

Transcript ID

orange1.1t03681.2
Transcript Infomation

gene=orange1.1t03681 CDS=17-1246
Sequence

ACCACCAACATTTTTTATGAATTTTTCTGGCTACATTTCATCTTCTACCATAGGTTATAT
TAGTGCGACAGTTAATGATGGTCCGGGGTGCCTGATGCTTAGATGTCCTGATCCATCTTG
CTGTGCTGCTGTTGGTCAAGACATGATTGATATGTTGGCCTCTGATGAAGACAAGAAAAA
GTATTCTCGTTACCTTCTTAGATCTTATGTCGAAGACAATAGAAAGACCAAGTGGTGTCC
TGCTCCAGGGTGCGAGCATGCTATTGATTTTGCTGCTGGAAGTGGAAATTTTGATGTTTC
CTGCTTATGCTCATATAACTTCTGCTGGAATTGCACTGAGGAAGCTCACCGTCCAGTGGA
TTGCGGCACTGTGGCAAAGTGGATTTTGAAGAACTGTGCCGAGTCTGAAAACATGAATTG
GATACTAGCCAATTCTAAACCTTGTCCCAAGTGCAAGCGACCGATTGAGAAAAATCAAGG
GTGTATGCACATGACATGCTCTCCACCTTGTAAATTTGAATTTTGCTGGCTATGCCTTGG
AGCATGGTCAGATCATGGTGAGAGAACTGGTGGTTTCTATGCTTGTAACCGTTATGAGAC
TGCTAAGCAACAGGGAGATTATGATGAGACTGAGAGAAGGAGAGAGATGGCCAAAAATTC
TCTGGAGAAATACACTCATTATTATGAACGTTGGGCGAGCAATCAATCGTCAAGGCAAAA
AGCTCTGGCAGATTTACACCAAATGCAGACTGTGCATCTTGAGAAGCTTAGTGACATCCA
GTGCACGCCTGAGTCTCAGCTCAAGTTCATTATAGATGCGTGGCTTCAGATAGTTGAATG
TCGGAGAGTTCTGAAATGGACCTATGCTTATGGATATTACCTACCTGAGCACGAGCATGC
CAAGAGACAGTTTTTTGAGTACCTGCAAGGTGAAGCAGAGTCGGGTTTGGAAAGGCTTCA
TCAATGTGCGGAGAAGGAACTACTACAATTCTTAAACGATGAGAGCCAATCAAAAGAGTT
CAATGATTTCCGTACGAAGTTAGCTGGATTGACGAGTGTTACCAAAAATTACTTCGAGAA
CCTTGTTAGAGCTCTAGAGAATGGATTAGCAGATGTAGACTCCCATGCAGCTTGTAGCAA
GACGACAAACTCTAAGTATGGCGGAGGGGGTGGGGCTAGCAAGGGAAAAAGTGGAAGGGG
AAAAGGAAGTGGTAAAATTGGTGGTTCACACGATGCAGGCAGATGATCTCACAACTGAAG
TCCCTTCTTTTGGTTTGAGGGCTGCTCAGTACATATCATTGTGTCAGCTTTGTCCCGGAA
AATCAGTTGTCTGCGTTGTGGGATCTATGTTGAAAGGAAACCATTTCGGGGATTCTCTTG
TTAACATGTGAATTCGGCCGAAGTCTGGTACAGGTCTGACGGTTCCGTATGTAATCTTGT
ATCTTTAAGTTTCTTTTTGGAGGCTGTTTGTTTAACTTGTTCAAGGTAAGTGGACATTAA
AGGACCAAAAGTTAATGGAGAAAAAGAAAAACAGCCTTTCTTGAACTCTTGTTTGTGGAG
CCTGTAACTCTATGTGGTTTAATGTATATATCAAGTTATCATTTTCAATAACGAGCTCCT
ACAACTTGTGATGATATAAAATATTTATGTGCACCTAATGGAAAGACAAATGAGTTATAG
TGAAACTACATGTAAGATGCTTGCAGTTGCTATTGTG