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All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

orange1.1t03429.3
CDS Infomation

gene=orange1.1t03429
Sequence

ATGGCCAAAATAATCCATGAAGCTACTGAAAACATGACTCAGCTTTGCAGAAGAGTTGTT
CATGTGAATATTAGACGGAGTTTGTTTGATAGAGTGTCGATTTTCCGGAGGTTCTTTCGG
TTTATTTGGGAGAGGATTCTTGTTTGTTCGATTGGGAAGCAGCCGGCAGTTAGGTACCAG
AAGTTGACCCGCCGGTCGTCGTCGGAGTCTTCTCCGGCGCCGGATACTATGGAGGCCGGC
CTTGTGGAGCTTTCCAGGACGTTTAGTAGTGGGTATGATACGGATTCGGACTTGGTTTCT
TTGAAGATCAGTTTGTTGGGTGATTGCCAAATTGGCAAAACAAGCTTCGTGGTCAAGTAT
GTGGGAAATGAGCAAGAAAGAAGCTTGCAAATGGCAGGATTGAATCTGATAAATAAAACT
TTGATGGTTCAAGGTGCCAGAATTGCTTTTAGCATCTGGGATGTTGGAGGAGATAGCAGG
TCATTTGATCATGTTCCAATTGCTTGTAAAGATGCAGTAGCAATTTTATTCATGTTTGAT
CTTACTAGCAGATGCACCCTTAACAGTATTGTTGGGTGGTACAGTGAAGCCAGAAAGTGG
AACCAGACAGCGATTCCCATATTGATAGGGACCAAATTTGATGATTTTGTGAGACTCCCA
CCAGATTTGCAATGGACTATTGCAACTCAGGTAAAATCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

orange1.1t03429.3
PEP Infomation
Sequence

MAKIIHEATENMTQLCRRVVHVNIRRSLFDRVSIFRRFFRFIWERILVCSIGKQPAVRYQ
KLTRRSSSESSPAPDTMEAGLVELSRTFSSGYDTDSDLVSLKISLLGDCQIGKTSFVVKY
VGNEQERSLQMAGLNLINKTLMVQGARIAFSIWDVGGDSRSFDHVPIACKDAVAILFMFD
LTSRCTLNSIVGWYSEARKWNQTAIPILIGTKFDDFVRLPPDLQWTIATQVKS*

Transcript Sequence

Transcript ID

orange1.1t03429.3
Transcript Infomation

gene=orange1.1t03429 CDS=294-995
Sequence

TTCCCACAGCACACGGTCCTTAAAACCAGAACATTGGATTGGACTCCAGAAATTGACCCA
AATGCCCATGCTACGTGCTACCCGAGAGACGCCGGCAATTTGGACCTTTTCGGTATCCTA
AATCAAATTAAAAAAACCGGTCAACCGTTAGGACACGGTCACCTTTCAACAACAGAAGCT
GAAGTCTTATTAGTTTAGTTCTTTGGTCCGTCTCAAAATCAAAATATAAACCATTTTTTT
TTTTAATTTTTTAAAGAAACTATGATGCTGCTGCCGCTGCAACAGCAACAATAATGGCCA
AAATAATCCATGAAGCTACTGAAAACATGACTCAGCTTTGCAGAAGAGTTGTTCATGTGA
ATATTAGACGGAGTTTGTTTGATAGAGTGTCGATTTTCCGGAGGTTCTTTCGGTTTATTT
GGGAGAGGATTCTTGTTTGTTCGATTGGGAAGCAGCCGGCAGTTAGGTACCAGAAGTTGA
CCCGCCGGTCGTCGTCGGAGTCTTCTCCGGCGCCGGATACTATGGAGGCCGGCCTTGTGG
AGCTTTCCAGGACGTTTAGTAGTGGGTATGATACGGATTCGGACTTGGTTTCTTTGAAGA
TCAGTTTGTTGGGTGATTGCCAAATTGGCAAAACAAGCTTCGTGGTCAAGTATGTGGGAA
ATGAGCAAGAAAGAAGCTTGCAAATGGCAGGATTGAATCTGATAAATAAAACTTTGATGG
TTCAAGGTGCCAGAATTGCTTTTAGCATCTGGGATGTTGGAGGAGATAGCAGGTCATTTG
ATCATGTTCCAATTGCTTGTAAAGATGCAGTAGCAATTTTATTCATGTTTGATCTTACTA
GCAGATGCACCCTTAACAGTATTGTTGGGTGGTACAGTGAAGCCAGAAAGTGGAACCAGA
CAGCGATTCCCATATTGATAGGGACCAAATTTGATGATTTTGTGAGACTCCCACCAGATT
TGCAATGGACTATTGCAACTCAGGTAAAATCTTGAACCTCTTAACGCATAACTAAGATAA
AAATTATTCTTCTGTTTCGAACCCACTGCTTAACAGTATCCTTTAGTATATTTATTGCCA
AAAAAGGGAGTTTTCTAGTGCCCTTGTGCTGGAAGAAAGAAAAAGACAGTGAAATGCTTG
TCAATTTATATAAAATCCCAATTATTAATAGTTAAGTTGATCAATTTTGAGCTTAATTGT
GCCATAGACCGATTGACATGTGAATTTGAAGAATGTCTTGGAGGACTTGGAGACTTGGAG
TCTTTGACAATTCTGGATTAAATTGACATCTGTGACATCTTTTTCTCTCTCTCTCACCGC
GTTATAAGATAAGCAGCAACACAGAGGGGCCACGTGTTCATTAAAGTTTAAACTTAGAAT
TCATACAATTTCACTTACTTTTGAAACTTTCTCTAAAGAGAGCATAAAATTTATCGTATG
CTTTTAGAGAATTATGATGTGGTTCCCTTCTATTTGTGGGTATCTGACGTTCAAATCTCT
ATTTTGAAGTGCTAAGAATGTGACAATTTATACAACTTTGTGCAGGCGAGGGCATATGCA
AAGGCAATGAAAGCAACCCTTTTCTTCTCAAGTGCTACGCACAACATAAATGTCAACAAA
ATTTTCAAGTTCATAATGGCCAAGCTTTTTAACTTGCCGTGGACGGTAAAGAGAAACTTG
ACTATCGGAGAGCCGATTATCGACTTCTGAAAATTCACTTCACAGTGATGATTTTTCTTC
ATTTTCTTGTACATACCCAGAAAGAGAGAAAATGAAAAAGGCAAAAGATAGCAGCAAGTC
AATATTTTCCTAGAAAATTAACTCCATAGCCCACCTAGGTGTCCTTTTTTAAATATTCTG
TCCTTGTTTCGGCATGGAATCAGATGCCACATGGGTGCTTGAGTGCCACAAGGAATTAAT
ATATGATTTCAGTTGATTCTTCGTGCATTTCAAAAGTTTAACATCAACGGTACCAGGAAA
CATTTACATTTGTGTAAGGGCAAACAATCCAATCACATTCCACTGCACCAACAAATTCCA
TTACTGTGTAGAAACTAGTATTTGTATGTCAATTATTTGAATCAAGCAGACCTATATGAT
TAGTAACGTCAGGACAGAATGGAACAGGCCCTCTTAATATATTGATATGCTCAGGTTAAC
CGAGGC