Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

orange1.1t02856.1
CDS Infomation

gene=orange1.1t02856
Sequence

ATGTGGGCTCTTCAATCTCCCCAAACTCCTCAATTACTCCGCTCTCCCTACCACACCAAC
TCTATCGCTCATCTCCCTCCAAAACCATCCTCAGTTTGTTGCTGCGTGTCCTTAAACTCC
TCAACCACTCCCACTTCATTATCAAGCAGAAACAAAAACGAACTAATTCAATCTCTATGC
AAACAGGGCAACCTCAGGCAAGCCCTCGATGTCCTCTCCATCGAGCCGAACCCGACCCAG
CACACTTACGAGCTCCTCCTCCTCTCTTGCACCCACCACAACTCCTTATCCGACGCCCTA
AACGTTCACAGCCACCTTACTGATAATGGGTTTGATCAGGACCCGTTCTTGGTGACCAAA
CTTATTAATGTTTACAGCCATTTTGACTCCGTCGATGATGCACGCCATGTGTTTGATAAA
ACGCGGAGAAGAACTATTTATGTCTGGAATGCGCTGTTTCGTGCGCTCACGTTGGCGGGG
CGTGGGGAGGAGGTGTTGGAGTTGTATCGGAGAATGAATGGGACTGGGACTGGGATTCGG
TCTGATAGGTTTACTTATACTTATGTGCTTAAGGCATGTGTCGCGTCGAGTTGCGGCTTT
TCGTTATTGAAACATGGGAAGGAGATTCATGCGAGTGTATTGCGACATGGGTATAATGGG
ATTGTGCATATTATGACTACCTTGATTGATATGTATGCGAGGTTTGGGTGTGTGATGTAT
GCTGGTTTCGTTTTCAGTCAGATGGCTGTGAAAAATGTGGTCTCTTGGAGTGCTATGATT
GCTTGTTATGCTAGAAATGGGATGGCTTTTGAGGCGTTGGAGCTTTTTCGAGAAATGATA
ATGGAGTCTCACGATTTATGTCCGAATTCAGTGACTATGGTTAGTGTGCTTCAAGCTTGC
GCGGCTCTTGCTGCTTTAGAACAAGGGAAGATGATACATGGGTACATATTAAGGAGGGGT
CTTGATTCTATTTTGCCTGTTGTAAGTGCATTGGTGACAATGTATGCGAGATGTGGAAAG
CTTGAATTAGGTCAATGTGTTTTTGATCATATGGATAAGAGGGATGTCGTTTCTTGGAAT
TCTTTAATTTCAAGCTATGGGGTTCATGGATATGGAGGGAAAGCAATTCAAATTTTTAAA
GAGATGATTTATCATGGAGTTTCACCGAGTCCTATATCTTTTGTTAGTGTTTTGGGAGCT
TGCAGTCATGCAGGGCTTGTTGAGGAGGGGAAGATGTTATTTGAATCTATGCGTAAAGAG
CATATGATACGTCCTAGCGTGGAGCATTATGCTTGTATGGTAGATCTTCTTGGTCGTGCT
AATAAGTTAGAAGAAGCAGCCAAGATTATAGAAGATTTGAGAATTGAACCGGGACCTAAG
GTTTGGGGTTCATTGCTTGGATCGTGTCGGATTCATTGTAATGTTGAGCTTGCTGAGAGA
GCAAGCAAAAGGCTTTTTGAGCTTGAGCCTACAAATGCAGGGAATTATGTACTTCTAGCT
GATGTATATGCAGCAGCTGATATGTGGGATGAGGTAAAAAGAGTGAAAAGGCTTCTTGAA
GCAAGGGGTCTGCAGAAAGTCCCAGGTCGAAGTAGGATTGAAGTTAAGAGGAAAATGTAC
TCATTTGTGTCCGTTGATGAGTTCCACCCGCAGTTTGAACAGCTGCATGCACTGTTAATC
AATCTGTCAGCCGAGATGAAGGAGAAGGGCTATGTGCCACAAACCAAAGTTGTGCTTTAC
GACCTTGATGCAGAAGAAAAGGAACGTATTGTATTAGGCCATAGCGAAAAACTAGCAGTT
GCTTTTGGACTCATAAACACTAGCAAAGGGGAGACAATTCGGATCACAAAGAACTTGAGG
TTATGTGAGGATTGCCATTCTTTTACAAAATTCATTTCCAAGTTTGCCAATAAAGAGATT
CTGGTTCGCGATGTTAACCGGTTTCACCATTTCCGTAATGGTGTTTGCTCATGTGGGGAT
TATTGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

orange1.1t02856.1
PEP Infomation
Sequence

MWALQSPQTPQLLRSPYHTNSIAHLPPKPSSVCCCVSLNSSTTPTSLSSRNKNELIQSLC
KQGNLRQALDVLSIEPNPTQHTYELLLLSCTHHNSLSDALNVHSHLTDNGFDQDPFLVTK
LINVYSHFDSVDDARHVFDKTRRRTIYVWNALFRALTLAGRGEEVLELYRRMNGTGTGIR
SDRFTYTYVLKACVASSCGFSLLKHGKEIHASVLRHGYNGIVHIMTTLIDMYARFGCVMY
AGFVFSQMAVKNVVSWSAMIACYARNGMAFEALELFREMIMESHDLCPNSVTMVSVLQAC
AALAALEQGKMIHGYILRRGLDSILPVVSALVTMYARCGKLELGQCVFDHMDKRDVVSWN
SLISSYGVHGYGGKAIQIFKEMIYHGVSPSPISFVSVLGACSHAGLVEEGKMLFESMRKE
HMIRPSVEHYACMVDLLGRANKLEEAAKIIEDLRIEPGPKVWGSLLGSCRIHCNVELAER
ASKRLFELEPTNAGNYVLLADVYAAADMWDEVKRVKRLLEARGLQKVPGRSRIEVKRKMY
SFVSVDEFHPQFEQLHALLINLSAEMKEKGYVPQTKVVLYDLDAEEKERIVLGHSEKLAV
AFGLINTSKGETIRITKNLRLCEDCHSFTKFISKFANKEILVRDVNRFHHFRNGVCSCGD
YW*

Transcript Sequence

Transcript ID

orange1.1t02856.1
Transcript Infomation

gene=orange1.1t02856 CDS=153-2141
Sequence

GGCAAAGCAAAGTGCATTCTCTCATTGAGAGAACAACCCACAGAGCCTTTGTAAGATTGA
GACTTGAGAGCGGCTAGGCCGACTAAAATAGCAGCAACACTGTTATATATATAAACTCGC
TGTTTACGCAACAAAACATCAAAAGCAAACTCATGTGGGCTCTTCAATCTCCCCAAACTC
CTCAATTACTCCGCTCTCCCTACCACACCAACTCTATCGCTCATCTCCCTCCAAAACCAT
CCTCAGTTTGTTGCTGCGTGTCCTTAAACTCCTCAACCACTCCCACTTCATTATCAAGCA
GAAACAAAAACGAACTAATTCAATCTCTATGCAAACAGGGCAACCTCAGGCAAGCCCTCG
ATGTCCTCTCCATCGAGCCGAACCCGACCCAGCACACTTACGAGCTCCTCCTCCTCTCTT
GCACCCACCACAACTCCTTATCCGACGCCCTAAACGTTCACAGCCACCTTACTGATAATG
GGTTTGATCAGGACCCGTTCTTGGTGACCAAACTTATTAATGTTTACAGCCATTTTGACT
CCGTCGATGATGCACGCCATGTGTTTGATAAAACGCGGAGAAGAACTATTTATGTCTGGA
ATGCGCTGTTTCGTGCGCTCACGTTGGCGGGGCGTGGGGAGGAGGTGTTGGAGTTGTATC
GGAGAATGAATGGGACTGGGACTGGGATTCGGTCTGATAGGTTTACTTATACTTATGTGC
TTAAGGCATGTGTCGCGTCGAGTTGCGGCTTTTCGTTATTGAAACATGGGAAGGAGATTC
ATGCGAGTGTATTGCGACATGGGTATAATGGGATTGTGCATATTATGACTACCTTGATTG
ATATGTATGCGAGGTTTGGGTGTGTGATGTATGCTGGTTTCGTTTTCAGTCAGATGGCTG
TGAAAAATGTGGTCTCTTGGAGTGCTATGATTGCTTGTTATGCTAGAAATGGGATGGCTT
TTGAGGCGTTGGAGCTTTTTCGAGAAATGATAATGGAGTCTCACGATTTATGTCCGAATT
CAGTGACTATGGTTAGTGTGCTTCAAGCTTGCGCGGCTCTTGCTGCTTTAGAACAAGGGA
AGATGATACATGGGTACATATTAAGGAGGGGTCTTGATTCTATTTTGCCTGTTGTAAGTG
CATTGGTGACAATGTATGCGAGATGTGGAAAGCTTGAATTAGGTCAATGTGTTTTTGATC
ATATGGATAAGAGGGATGTCGTTTCTTGGAATTCTTTAATTTCAAGCTATGGGGTTCATG
GATATGGAGGGAAAGCAATTCAAATTTTTAAAGAGATGATTTATCATGGAGTTTCACCGA
GTCCTATATCTTTTGTTAGTGTTTTGGGAGCTTGCAGTCATGCAGGGCTTGTTGAGGAGG
GGAAGATGTTATTTGAATCTATGCGTAAAGAGCATATGATACGTCCTAGCGTGGAGCATT
ATGCTTGTATGGTAGATCTTCTTGGTCGTGCTAATAAGTTAGAAGAAGCAGCCAAGATTA
TAGAAGATTTGAGAATTGAACCGGGACCTAAGGTTTGGGGTTCATTGCTTGGATCGTGTC
GGATTCATTGTAATGTTGAGCTTGCTGAGAGAGCAAGCAAAAGGCTTTTTGAGCTTGAGC
CTACAAATGCAGGGAATTATGTACTTCTAGCTGATGTATATGCAGCAGCTGATATGTGGG
ATGAGGTAAAAAGAGTGAAAAGGCTTCTTGAAGCAAGGGGTCTGCAGAAAGTCCCAGGTC
GAAGTAGGATTGAAGTTAAGAGGAAAATGTACTCATTTGTGTCCGTTGATGAGTTCCACC
CGCAGTTTGAACAGCTGCATGCACTGTTAATCAATCTGTCAGCCGAGATGAAGGAGAAGG
GCTATGTGCCACAAACCAAAGTTGTGCTTTACGACCTTGATGCAGAAGAAAAGGAACGTA
TTGTATTAGGCCATAGCGAAAAACTAGCAGTTGCTTTTGGACTCATAAACACTAGCAAAG
GGGAGACAATTCGGATCACAAAGAACTTGAGGTTATGTGAGGATTGCCATTCTTTTACAA
AATTCATTTCCAAGTTTGCCAATAAAGAGATTCTGGTTCGCGATGTTAACCGGTTTCACC
ATTTCCGTAATGGTGTTTGCTCATGTGGGGATTATTGGTAGTTCAAAAATCAAAATGCCG
CTTGCAATACTCAATCCTGATTGTTTTTCCTTTCTTTTGAAATAACAAAGAGAGAACACA
GAATTTTGAGGATGTACAGTACTCACATTGTTTAAACAATAATATACATGTATCTTGTAA
TGGTTATGTATTTGTTGTATGCTACTATGCTTGTACCATTTATTTTAATAGGACAGGCCA
ATTACATCTGGCTCTATTAAATTTGAAGCTGAATTCAAATTTATTTGTAT