Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

orange1.1t02105.1
CDS Infomation

gene=orange1.1t02105
Sequence

ATGGAACAACAACAGTCTTCAAATGCTTTAAGAGGGTTTCGAGTTCAAGCTCCATTGGTT
GATTCTGTTTCATGCTATTGCAAAGTAGATGCTGGGCTAAAAACCGTTGCTGAAGCAAGG
AAATTTGTTCCAGGATCTAAACTATGTATCCAGCCTGATATCAATCCTAATGCACACAAA
AGCAAAAACTCAAGGAGGGAGAGGAGCAGAATCCAGCCACCACTCTTGCCTGGCCTTCCT
GATGATCTGGCGATTGCATGTTTGATTCGAGTTCCTCGCGCTGAACATCGAAAACTTCGT
CTTGTTTGTAAGAGATGGTACCGCCTGCTCGCTGGAAACTACTTTTATTCTCTTAGAAAA
AGTCTAGGAATGGCTGAAGAGTGGGTTTATGTCTTCAAGCGAGATCGTGATGGAAAGATA
TCATGGAATGCTTTCGACCCTGTCTATCAGCTCTGGCAACCACTTCCACCAGTTCCCAAA
GAATATTCTGAGGCCCTTGGTTTCGGCTGTGCTGTTCTAAGCGGCTGCCATCTATACTTA
TTTGGAGGAAAGGATCCACTTAGGGGGTCCATGAGACGGGTCATTTTCTACAGTGCCCGA
ACAAATAAATGGCATAGGGCGCCTGATATGCTTCGGAAACGTCATTTCTTTGGTTCTTGT
GTCCTAAATAACTGTCTCTATGTGGCCGGTGGGGAATGCGAAGGAATTCAAAGGACTCTC
CGCTCTGCTGAAATCTATGACCCTAACAAAAACCGATGGAGCTTTATTGCAGACATGAGC
ACAGCAATGGTGCCCTTCATAGGAGTCATTTATGATGGAAAATGGTTTCTAAAAGGTCTA
GGGTCCCACCGTGAGGTCATGAGTGAAGCCTATGATCCTGAAACTAATAGCTGGACTCCA
ATTAGTGATGGCCTGGTTGCAGGTTGGCGTAACCCTAGTGTCTCTTTAAATGGTAGGCTT
TATGCTTTGGATTGCCGGGATGGGTGCAAGCTGAGGGTTTATGATGAAGCCACTGATTCA
TGGAACAAATTTATGGATAGCAAGCTTCATCTAGGGAGCTCCCGCGCATTGGAGGCTGCA
GCAATTGTTCCCCTGAATGGGAAACTTTGTATCATTCGTAACAACATGAGCATTAGTATG
GTTGATGTTTCTAGTCCTGACAAACATGTGGAGAGTAATCCACACATATGGGAAAATATT
GCTGGGAAAGGTCATTTCAGGACTCTTGTCACAAATTTACTGTCTAGCATAGCAGGCCGG
AGTGGTTTGAAAAGTCACATTGTGCACTGTCAGGTGCTTCAAGCGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

orange1.1t02105.1
PEP Infomation
Sequence

MEQQQSSNALRGFRVQAPLVDSVSCYCKVDAGLKTVAEARKFVPGSKLCIQPDINPNAHK
SKNSRRERSRIQPPLLPGLPDDLAIACLIRVPRAEHRKLRLVCKRWYRLLAGNYFYSLRK
SLGMAEEWVYVFKRDRDGKISWNAFDPVYQLWQPLPPVPKEYSEALGFGCAVLSGCHLYL
FGGKDPLRGSMRRVIFYSARTNKWHRAPDMLRKRHFFGSCVLNNCLYVAGGECEGIQRTL
RSAEIYDPNKNRWSFIADMSTAMVPFIGVIYDGKWFLKGLGSHREVMSEAYDPETNSWTP
ISDGLVAGWRNPSVSLNGRLYALDCRDGCKLRVYDEATDSWNKFMDSKLHLGSSRALEAA
AIVPLNGKLCIIRNNMSISMVDVSSPDKHVESNPHIWENIAGKGHFRTLVTNLLSSIAGR
SGLKSHIVHCQVLQA*

Transcript Sequence

Transcript ID

orange1.1t02105.1
Transcript Infomation

gene=orange1.1t02105 CDS=280-1587
Sequence

AATGTCCAGCTGGTGCACGCTTTCAATTTTCAACAAGACAAAAGACTCAAGCTTTGAGTT
TTAAGAGAGAGAGAGAAAAAGGCTCTTCAGTTAAGTTTTGTTTTTGTCAACTCTTTGTTT
GCATTTGCAGAGGCAAAAAAAGGCAACATTTTTAACAATTACAGACAGTAAAGCAAGGCC
TCTTTGGATCAAGTCTCTTTTTCTTGATCTAAATTTGAAGATTGGAGCTATTTGAGCTTG
TTTTGGGTTCTGGGTGTCTATGAATTTTTGCTTGTGAAGATGGAACAACAACAGTCTTCA
AATGCTTTAAGAGGGTTTCGAGTTCAAGCTCCATTGGTTGATTCTGTTTCATGCTATTGC
AAAGTAGATGCTGGGCTAAAAACCGTTGCTGAAGCAAGGAAATTTGTTCCAGGATCTAAA
CTATGTATCCAGCCTGATATCAATCCTAATGCACACAAAAGCAAAAACTCAAGGAGGGAG
AGGAGCAGAATCCAGCCACCACTCTTGCCTGGCCTTCCTGATGATCTGGCGATTGCATGT
TTGATTCGAGTTCCTCGCGCTGAACATCGAAAACTTCGTCTTGTTTGTAAGAGATGGTAC
CGCCTGCTCGCTGGAAACTACTTTTATTCTCTTAGAAAAAGTCTAGGAATGGCTGAAGAG
TGGGTTTATGTCTTCAAGCGAGATCGTGATGGAAAGATATCATGGAATGCTTTCGACCCT
GTCTATCAGCTCTGGCAACCACTTCCACCAGTTCCCAAAGAATATTCTGAGGCCCTTGGT
TTCGGCTGTGCTGTTCTAAGCGGCTGCCATCTATACTTATTTGGAGGAAAGGATCCACTT
AGGGGGTCCATGAGACGGGTCATTTTCTACAGTGCCCGAACAAATAAATGGCATAGGGCG
CCTGATATGCTTCGGAAACGTCATTTCTTTGGTTCTTGTGTCCTAAATAACTGTCTCTAT
GTGGCCGGTGGGGAATGCGAAGGAATTCAAAGGACTCTCCGCTCTGCTGAAATCTATGAC
CCTAACAAAAACCGATGGAGCTTTATTGCAGACATGAGCACAGCAATGGTGCCCTTCATA
GGAGTCATTTATGATGGAAAATGGTTTCTAAAAGGTCTAGGGTCCCACCGTGAGGTCATG
AGTGAAGCCTATGATCCTGAAACTAATAGCTGGACTCCAATTAGTGATGGCCTGGTTGCA
GGTTGGCGTAACCCTAGTGTCTCTTTAAATGGTAGGCTTTATGCTTTGGATTGCCGGGAT
GGGTGCAAGCTGAGGGTTTATGATGAAGCCACTGATTCATGGAACAAATTTATGGATAGC
AAGCTTCATCTAGGGAGCTCCCGCGCATTGGAGGCTGCAGCAATTGTTCCCCTGAATGGG
AAACTTTGTATCATTCGTAACAACATGAGCATTAGTATGGTTGATGTTTCTAGTCCTGAC
AAACATGTGGAGAGTAATCCACACATATGGGAAAATATTGCTGGGAAAGGTCATTTCAGG
ACTCTTGTCACAAATTTACTGTCTAGCATAGCAGGCCGGAGTGGTTTGAAAAGTCACATT
GTGCACTGTCAGGTGCTTCAAGCGTGAAGCCCATAATTGATTTTGCTCATGCTTACCATA
GCAATTTGTGCATTTCCTTCACTTGGCTGTGATGGGTTTTCATATTTGCAGTTAACCTAT
ATGGGAATTCTGCATTTTTTGTTCCAGAAAGCTTCATATACTCTCTGTTACTGCTCTGAT
CTTCAATTTTGCAGAGATTGAATTGACAATGATGTGCCTGGGGAGTTATTGGATTTTTTC
TTGTTAGATTGTTTTGCTCATGCTGAGGCTTGGGAAAGTGAAAATGATAAATGTTCTTCA
GGTTGTTGTCGATAAGGTGCCGTGAATATGGAGATGGCAAAATTATCCCTGACATTTCAT
GTGAGAGGTATGGTGAAACTTTTCGGGTGGTAATCCCTTATTTGGAGGCAAGGCAGAGTT
ACCGTTGATTTGGGTAATAGAGTTATGGGCCATTTGATTACATTCAGGAAGAGAGCAGAT
ACATGTAAATCTTAGTCAATTTGGTTTTTAGGGCGGAGTCTTTCTTTGTATTTTGGAGTC
TTTTATCTTAGTTGTATGTAGAATGTAGTCTTTGAGATGCTTTTGTGAATGTACATGGGT
TACATAAGATGAGTCAATATATACTTAGATCACATCTCTATGGCTATGAAATGTTACTTC
ATTGTGTTGTCCCTAAACTACCATCACAGGTAATATGCGTCATACTAGATTTGATCCATA
TAATTTTCTATACCTTTTTGTATTGCAACTTCTTCTGAACCCAGA