Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

orange1.1t00485.4
CDS Infomation

gene=orange1.1t00485
Sequence

ATGAATTGGTTGAGGGAATTTGCTATGTCTATTGTTTTGTCCAGGTTTGACGATTGGAAT
TCAGAGAATTCTTATTCAGAACAGAAACCATCCAATGATGATGGATTTTATCCAAGAGTA
ATGAGACCAACTCTAAGTGCCGTTATGGATAGTATTCGGAGAGGATATGAAATGGGTTCA
GAAAGAATTAAAAGCTGGAAGAAGCCATTGAGCTTTCGTTCCCATGTTATGCAATCTGAA
AAAAAATCTGTCTCTGAGAAGAGAATTCTCGACCCACAAGGTCCATTTCTTCAGTGGTGG
AACAAAATATTTGTGCTCTCTTGTGTAATTGCATTGTCAATAGATCCATTGTTCTTTTAC
ATGCCAGTGATTGATGGCAAAAGGAAATGCCTTGGTTTGGATAAGACTTTGGAAATCACT
GCTTGTGTCCTTCGTTCATTCATTGATACCTTTTACATACTACGCATAATCTTTCAATTC
CGCACTGGGTTTATTGCCCGTTCTTCTCGAGTATTTGGTAGGGGTGAGTTGGTTGATGAT
CCTAAGGCTATAGCCAAAAGATACTTAATGTCATACTTCATTGTTGACATCCTTGCCATT
CTTCCTCTACCACAGCTGGTAGTTTTAATTATCGTCCCTGCAGTGAAAGGCCCAGTTCCA
TTGGTGGCAAAGGAGATGTTGAAAACTATTATTTTCTGCCAGTATGTTCCAAGAATTGCT
CGGATTTATCCACTGTACAATGATGTAAAAAGAACTTCTGGCATACTCACTGAAACGGCA
TGGGCTGGAGCTGCTTTAAATCTCTTTCTTTATATGCTAGCCAGTCATATATTTGGGGCT
TGTTGGTACTTGTACTCCATAGAACGGCAAGATAGTTGCTGGCGTGATGTATGTCGGAAG
TTGAATGATACGAGTAATTGTACTACGAATTTGTACTGTGGAGAATTCCATGGATCAAAT
AATACACTTCTGCACGGTTCATGTCCGTTTATAAGTCCAGATGAGATAAAGAATTCATCC
ATGTTCAACTTTGGAATATCTATCGATGCTCTCCAATCAAGGGTGGTGGAGGAACATGAT
TTTCCGAAGAAATTCTTTTACTGCTTTTGGTGGGGTCTGCGTAATCTTAGTTCCCTGGGC
CAAAATCTCAAAACAAGCACTTTTGTTGGGGAGGTTTTCTTTGCCATCTTCATATCCATT
TCGGGATTGGTTTTATTTGCCTTACTTATTGGCAACATGCAGAAATATCTGGAATCTACA
ACTGTAAGATTAGAGGAAATGAGAGTGAAAAGGCAAGATGCAGAACAGTGGATGTCCCAC
CGTATGCTCCCCGAAAATCTGAGGGACAGAATTAGGCGGTATGAACAGTATAAATGGCAA
GAAACAAGAGGTGTTGAGGAAGAGGGTTTGCTTCGTAATCTCCCTAAAGATCTCAGAAGA
GATATTAAGCGCCATCTTTGCTGGGATCTCCTAATGAGGGTGCCAATGTTTGAGAAAATG
GATGATCAATTGTTGGATGCAATGTGTGATCACCTCAAGCCAGTTCTTTACACAGAGAAG
AGCTTCATTGTTCGTGAGGGTGATCCAGTTGAGGAGATGCTTTTTGTTATGAGAGGCAAT
CTAGTGAGTACGACCACTTATGGTGGAAGAACCGGTTTCTTTAATGCTGTTTATCTCAAG
GCTGGTGACTTCTGTGGAGAAGCACTCCTTACATGGGCATTGGATCCTCAATCATCTTCC
AATCGTCCTCTTTCAACTAGGACCGTACAAGCTTTAACAGAGGTTGAAGCTTTTTCTCTC
ATGGCTGATGACTTGAAGTCTGTTGCCTCTCAGTTTCGGCGTCTTCATAGCAAGCAGCTT
CAGCACGCTTTCAGGTTCCACTCGGTGCAGTGGAGGACATGGGCAGCATGCTTTATACAA
GCAGCATGGCGCCGGCACAGTAAGAAGAAGCTTGCTCAATCCTTACAAGAAGCTGAAGAC
AGGCTGCAAGATGCTTTGGCAACAGAGGCTGGGGCTTTAACGAGCCTTGGTGCCACCATG
TATGCGTCAAAATTTGCTGCCAATCTATTACACCCGTTGCGGTTGCGGCAGAATGGTTCC
AGTGGCACTAGATTGCCGCAGAGATTACTGCCTCCACTAATTCCTCAGAAGCCAGCAGAG
CCTGACTTCACTGCCAAAGATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

orange1.1t00485.4
PEP Infomation
Sequence

MNWLREFAMSIVLSRFDDWNSENSYSEQKPSNDDGFYPRVMRPTLSAVMDSIRRGYEMGS
ERIKSWKKPLSFRSHVMQSEKKSVSEKRILDPQGPFLQWWNKIFVLSCVIALSIDPLFFY
MPVIDGKRKCLGLDKTLEITACVLRSFIDTFYILRIIFQFRTGFIARSSRVFGRGELVDD
PKAIAKRYLMSYFIVDILAILPLPQLVVLIIVPAVKGPVPLVAKEMLKTIIFCQYVPRIA
RIYPLYNDVKRTSGILTETAWAGAALNLFLYMLASHIFGACWYLYSIERQDSCWRDVCRK
LNDTSNCTTNLYCGEFHGSNNTLLHGSCPFISPDEIKNSSMFNFGISIDALQSRVVEEHD
FPKKFFYCFWWGLRNLSSLGQNLKTSTFVGEVFFAIFISISGLVLFALLIGNMQKYLEST
TVRLEEMRVKRQDAEQWMSHRMLPENLRDRIRRYEQYKWQETRGVEEEGLLRNLPKDLRR
DIKRHLCWDLLMRVPMFEKMDDQLLDAMCDHLKPVLYTEKSFIVREGDPVEEMLFVMRGN
LVSTTTYGGRTGFFNAVYLKAGDFCGEALLTWALDPQSSSNRPLSTRTVQALTEVEAFSL
MADDLKSVASQFRRLHSKQLQHAFRFHSVQWRTWAACFIQAAWRRHSKKKLAQSLQEAED
RLQDALATEAGALTSLGATMYASKFAANLLHPLRLRQNGSSGTRLPQRLLPPLIPQKPAE
PDFTAKD*

Transcript Sequence

Transcript ID

orange1.1t00485.4
Transcript Infomation

gene=orange1.1t00485 CDS=38-2221
Sequence

CTTTCTCATATTCTTTTTCTGGGCTTGCCTCCTATTGATGAATTGGTTGAGGGAATTTGC
TATGTCTATTGTTTTGTCCAGGTTTGACGATTGGAATTCAGAGAATTCTTATTCAGAACA
GAAACCATCCAATGATGATGGATTTTATCCAAGAGTAATGAGACCAACTCTAAGTGCCGT
TATGGATAGTATTCGGAGAGGATATGAAATGGGTTCAGAAAGAATTAAAAGCTGGAAGAA
GCCATTGAGCTTTCGTTCCCATGTTATGCAATCTGAAAAAAAATCTGTCTCTGAGAAGAG
AATTCTCGACCCACAAGGTCCATTTCTTCAGTGGTGGAACAAAATATTTGTGCTCTCTTG
TGTAATTGCATTGTCAATAGATCCATTGTTCTTTTACATGCCAGTGATTGATGGCAAAAG
GAAATGCCTTGGTTTGGATAAGACTTTGGAAATCACTGCTTGTGTCCTTCGTTCATTCAT
TGATACCTTTTACATACTACGCATAATCTTTCAATTCCGCACTGGGTTTATTGCCCGTTC
TTCTCGAGTATTTGGTAGGGGTGAGTTGGTTGATGATCCTAAGGCTATAGCCAAAAGATA
CTTAATGTCATACTTCATTGTTGACATCCTTGCCATTCTTCCTCTACCACAGCTGGTAGT
TTTAATTATCGTCCCTGCAGTGAAAGGCCCAGTTCCATTGGTGGCAAAGGAGATGTTGAA
AACTATTATTTTCTGCCAGTATGTTCCAAGAATTGCTCGGATTTATCCACTGTACAATGA
TGTAAAAAGAACTTCTGGCATACTCACTGAAACGGCATGGGCTGGAGCTGCTTTAAATCT
CTTTCTTTATATGCTAGCCAGTCATATATTTGGGGCTTGTTGGTACTTGTACTCCATAGA
ACGGCAAGATAGTTGCTGGCGTGATGTATGTCGGAAGTTGAATGATACGAGTAATTGTAC
TACGAATTTGTACTGTGGAGAATTCCATGGATCAAATAATACACTTCTGCACGGTTCATG
TCCGTTTATAAGTCCAGATGAGATAAAGAATTCATCCATGTTCAACTTTGGAATATCTAT
CGATGCTCTCCAATCAAGGGTGGTGGAGGAACATGATTTTCCGAAGAAATTCTTTTACTG
CTTTTGGTGGGGTCTGCGTAATCTTAGTTCCCTGGGCCAAAATCTCAAAACAAGCACTTT
TGTTGGGGAGGTTTTCTTTGCCATCTTCATATCCATTTCGGGATTGGTTTTATTTGCCTT
ACTTATTGGCAACATGCAGAAATATCTGGAATCTACAACTGTAAGATTAGAGGAAATGAG
AGTGAAAAGGCAAGATGCAGAACAGTGGATGTCCCACCGTATGCTCCCCGAAAATCTGAG
GGACAGAATTAGGCGGTATGAACAGTATAAATGGCAAGAAACAAGAGGTGTTGAGGAAGA
GGGTTTGCTTCGTAATCTCCCTAAAGATCTCAGAAGAGATATTAAGCGCCATCTTTGCTG
GGATCTCCTAATGAGGGTGCCAATGTTTGAGAAAATGGATGATCAATTGTTGGATGCAAT
GTGTGATCACCTCAAGCCAGTTCTTTACACAGAGAAGAGCTTCATTGTTCGTGAGGGTGA
TCCAGTTGAGGAGATGCTTTTTGTTATGAGAGGCAATCTAGTGAGTACGACCACTTATGG
TGGAAGAACCGGTTTCTTTAATGCTGTTTATCTCAAGGCTGGTGACTTCTGTGGAGAAGC
ACTCCTTACATGGGCATTGGATCCTCAATCATCTTCCAATCGTCCTCTTTCAACTAGGAC
CGTACAAGCTTTAACAGAGGTTGAAGCTTTTTCTCTCATGGCTGATGACTTGAAGTCTGT
TGCCTCTCAGTTTCGGCGTCTTCATAGCAAGCAGCTTCAGCACGCTTTCAGGTTCCACTC
GGTGCAGTGGAGGACATGGGCAGCATGCTTTATACAAGCAGCATGGCGCCGGCACAGTAA
GAAGAAGCTTGCTCAATCCTTACAAGAAGCTGAAGACAGGCTGCAAGATGCTTTGGCAAC
AGAGGCTGGGGCTTTAACGAGCCTTGGTGCCACCATGTATGCGTCAAAATTTGCTGCCAA
TCTATTACACCCGTTGCGGTTGCGGCAGAATGGTTCCAGTGGCACTAGATTGCCGCAGAG
ATTACTGCCTCCACTAATTCCTCAGAAGCCAGCAGAGCCTGACTTCACTGCCAAAGATTG
AGAATGAGGTGTACCTGTTGTAGAGAAATGATTTTAGTGATTTGACCCAAATGTAGTGTG
TACATAATAACAATAACATCTGCCCTGCTACTACAGATGTGCTTTAATGTGCTCTTGCAG
AGGAAGCTATCTTAGATAATTAATGGGGCAAATCCAGTCACATACTAGGTCTTAATTTAT
TAGTTTTCGAACAAACAGTATCTCAAATAATGCAGCTAAAAGAGAATGAATTTTGTGTGC
CTGTTTTGGTTCTATTTTCTCCCTCCAAAATAAAAAAAAAAAAAACATGA