Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

orange1.1t00405.1
CDS Infomation

gene=orange1.1t00405
Sequence

ATGTCTATGTACGACGCCGCATTTGTGAACACAGAACTGTCAAAGCGGACATCAATTTTC
GGGCTTCGGCTTTGGGTCGTAATCGGAATCTTACTCGGTTCACTAATCGTTCTCGCTCTC
TTTCTGCTGTCTCTCTGCTTAACCTCTCGCCGGAAAAAACACAATCATCTTCAACAACAA
CAACAATCCAAACAAATCCTTAACACGCCGCCAATCTCCAAGGAAATTCAAGAAATCGTG
CACCATCCGGCACCTGTTCCGGAGATTCAAGTCGACATCGGGAAGATCGAGCACCGCGTG
GTGTTTTCTGACAGGGCGTCGAGTGGGGAGAGTAGGGGAACGGGGAGTGCGTGTGAGACG
GCGTCCTTTGGGAGCGGGAGCGTGGGGCCCGAAGTTTCGCATCTTGGGTGGGGCCGTTGG
TATACGTTGAGAGAACTTGAAGCTGCTACCAGTGGGCTGTGTGAAGAGAATGTTATTGGT
GAAGGTGGTTATGGGATTGTCTATCGTGGGATTTTGAGTGATGGTACTAAAGTTGCTGTC
AAAAATTTATTAAATAACAGGGGTCAGGCTGAGAAGGAATTTAAAGTTGAGGTAGAAGTA
ATTGGACGTGTTCGACACAAGAATCTAGTTAGATTGCTTGGATACTGTGTTGAGGGTGCA
TATAGGATGCTTGTGTATGAGTATGTTGACAATGGCAATTTGGATCAGTGGCTGCATGGG
GATGTTGGGGATGTCAGCCCACTAACATGGGATATTAGGATGAACATCATACTGGGAACA
GCTAAAGGATTGGCCTACCTTCATGAGGGTCTTGAACCAAAGGTTGTCCATCGAGATGTA
AAATCCAGTAACATACTACTTGATCGCCAATGGAATGCTAGGGTTTCTGATTTTGGGCTT
GCTAAGCTTTTATGTTCAGAGAGGAGTTATGTAACAACCCGTGTGATGGGAACGTTTGGT
TATGTTGCACCAGAGTATGCATGCACTGGGATGCTGAATGAGAAGAGTGATGTTTATAGT
TTTGGTATACTTATAATGGAGATAATTACTGGGAGAAATCCTGTTGATTATAGTCGACCA
CAAGGAGAGGTGAATTTGGTTGATTGGTTAAAAACCATGGTTGGGAGTCGAAAATCTGAG
GAGGTAGTTGATCCTAAACTGCCCAAGATGCCTGCTTCTAAAGCACTTAAACGTGTTCTG
TTGGTTGCTCTGCGATGTGTGGATCCTGATGCAACAAAGAGGCCCAAAATGGGGCATGTA
ATACACATGCTTGAGGCAGATGACTTGTTATTTCGTGATGAACGTCGAATCGGAAGAGAA
CCTTCAAACTCATATGGTGAAGAGAATCGTGATTTTGCAAGAAAAGTAGGTGATAAACAA
TTGGGTGAAGGCGCTTCGGATACAAGTGAAGGTGATGGCAGTAGGAACAATCATCGACCA
ACCATGCGGCGATAG

Peptide Sequence

PEP ID

orange1.1t00405.1
PEP Infomation
Sequence

MSMYDAAFVNTELSKRTSIFGLRLWVVIGILLGSLIVLALFLLSLCLTSRRKKHNHLQQQ
QQSKQILNTPPISKEIQEIVHHPAPVPEIQVDIGKIEHRVVFSDRASSGESRGTGSACET
ASFGSGSVGPEVSHLGWGRWYTLRELEAATSGLCEENVIGEGGYGIVYRGILSDGTKVAV
KNLLNNRGQAEKEFKVEVEVIGRVRHKNLVRLLGYCVEGAYRMLVYEYVDNGNLDQWLHG
DVGDVSPLTWDIRMNIILGTAKGLAYLHEGLEPKVVHRDVKSSNILLDRQWNARVSDFGL
AKLLCSERSYVTTRVMGTFGYVAPEYACTGMLNEKSDVYSFGILIMEIITGRNPVDYSRP
QGEVNLVDWLKTMVGSRKSEEVVDPKLPKMPASKALKRVLLVALRCVDPDATKRPKMGHV
IHMLEADDLLFRDERRIGREPSNSYGEENRDFARKVGDKQLGEGASDTSEGDGSRNNHRP
TMRR*

Transcript Sequence

Transcript ID

orange1.1t00405.1
Transcript Infomation

gene=orange1.1t00405 CDS=315-1769
Sequence

ACTCACAGAGTCACAGTCACGGACAGAACATAGGCGTCCCATTAGCGTATCCAACGGCAC
TTTTTTAAGTTTTAACATTTTACAGAACTCCAGCTAGACAGAAGCAGACAGCTCATTTAT
GCTCGACAACAACCGGAACGAACGAAACTCTCATCCTCTTGGCTCTTGCCTCACCACCAT
CACCATAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCCCCATAATTCAATACGAACACACAAG
TCTTTCACTCGAAGCCATGCCTGAAAGCCTCTAATTCATTTTCAGTTTCTTCATTTAAAT
AAACGGGAACAAATATGTCTATGTACGACGCCGCATTTGTGAACACAGAACTGTCAAAGC
GGACATCAATTTTCGGGCTTCGGCTTTGGGTCGTAATCGGAATCTTACTCGGTTCACTAA
TCGTTCTCGCTCTCTTTCTGCTGTCTCTCTGCTTAACCTCTCGCCGGAAAAAACACAATC
ATCTTCAACAACAACAACAATCCAAACAAATCCTTAACACGCCGCCAATCTCCAAGGAAA
TTCAAGAAATCGTGCACCATCCGGCACCTGTTCCGGAGATTCAAGTCGACATCGGGAAGA
TCGAGCACCGCGTGGTGTTTTCTGACAGGGCGTCGAGTGGGGAGAGTAGGGGAACGGGGA
GTGCGTGTGAGACGGCGTCCTTTGGGAGCGGGAGCGTGGGGCCCGAAGTTTCGCATCTTG
GGTGGGGCCGTTGGTATACGTTGAGAGAACTTGAAGCTGCTACCAGTGGGCTGTGTGAAG
AGAATGTTATTGGTGAAGGTGGTTATGGGATTGTCTATCGTGGGATTTTGAGTGATGGTA
CTAAAGTTGCTGTCAAAAATTTATTAAATAACAGGGGTCAGGCTGAGAAGGAATTTAAAG
TTGAGGTAGAAGTAATTGGACGTGTTCGACACAAGAATCTAGTTAGATTGCTTGGATACT
GTGTTGAGGGTGCATATAGGATGCTTGTGTATGAGTATGTTGACAATGGCAATTTGGATC
AGTGGCTGCATGGGGATGTTGGGGATGTCAGCCCACTAACATGGGATATTAGGATGAACA
TCATACTGGGAACAGCTAAAGGATTGGCCTACCTTCATGAGGGTCTTGAACCAAAGGTTG
TCCATCGAGATGTAAAATCCAGTAACATACTACTTGATCGCCAATGGAATGCTAGGGTTT
CTGATTTTGGGCTTGCTAAGCTTTTATGTTCAGAGAGGAGTTATGTAACAACCCGTGTGA
TGGGAACGTTTGGTTATGTTGCACCAGAGTATGCATGCACTGGGATGCTGAATGAGAAGA
GTGATGTTTATAGTTTTGGTATACTTATAATGGAGATAATTACTGGGAGAAATCCTGTTG
ATTATAGTCGACCACAAGGAGAGGTGAATTTGGTTGATTGGTTAAAAACCATGGTTGGGA
GTCGAAAATCTGAGGAGGTAGTTGATCCTAAACTGCCCAAGATGCCTGCTTCTAAAGCAC
TTAAACGTGTTCTGTTGGTTGCTCTGCGATGTGTGGATCCTGATGCAACAAAGAGGCCCA
AAATGGGGCATGTAATACACATGCTTGAGGCAGATGACTTGTTATTTCGTGATGAACGTC
GAATCGGAAGAGAACCTTCAAACTCATATGGTGAAGAGAATCGTGATTTTGCAAGAAAAG
TAGGTGATAAACAATTGGGTGAAGGCGCTTCGGATACAAGTGAAGGTGATGGCAGTAGGA
ACAATCATCGACCAACCATGCGGCGATAGCACCAGCAGAGAATTAGGTGACTAATTATTA
TCGTCTCCACTTTGGAAAGTTTGCTTTTCTTATTCTATTAGTTAGATTTCTTCTTGTACC
TTAAAATCAAAGATACCTATGATTTGCAAATTCTTTTACATATATATTTTTTTTCTTTTT
TCAGTTTTACATTCCTCAAATTGGGATGCATTTTGTATAATTTAAAGAATTCTTTCAATC
ATTCTTACAGGAACTGTATAATTAATGCTCGGTATATTTGTTTGTCAAACAAAAGCTGTT
TTAGCAATTTTTCTGTCGTTTTACGAAGAACAAACATAAGTAGTATTGTTCCCCAAAAAA
AAAAAAACCCTTTTTATTGAGATTTTACCTACCTATTCAGCTTGATTGTATAATCCTTAA
ATTTTACATCTAGATATCCATTACTTGGCATGCTTCAGTGTTAAGACTTGTTGGCATCAC
TGCCAGCCTCTAGAAACAGATGTTAACGGGTGATGGCCCCAAACGCCAGCGACTTTGCTG
GAATTTACTTGGTTTACATCCAGCATCAGGACCAACTCCTAAGTGGGACGGCACTGTGAA
ATCGACCCGCCAGCCAGCTAATAGAATGAAACATCTACATTTGGATGTAGTTTTGCTTAT
CCTAATTGGACCGGCTGCCAGCTGTGCTGCCCGAATCAGATATTGGAACGGGTCTTGCCA
TGTTTAACGATCACTGTCAAAAGTATTGCCTTTGGCCCAGAGTTTAACTGAAGCAAGCCG
GTTGTTTGTGTTTTGCGTTTGGACCCATCTGTCTCCGTATTCTGTTCTGAAAGCTCGAGT
TCCCATTTAGCTATTGGCAGTCTTACCGACTTAACCCCCTGTCAGCTTTCTTTTGGTACT
GCGGTGGGACAGTTATAGTTGTCCTCGTCATAGTACTTTTAAATATTTAGCAAACACGCT
CCACTGGTTGATTTTGTCGTTGGAACACTTACAATGATTTTATTTTATTTTATTTCGAAA
ATTGTGTCTAAATATCATATTTATCATATACTATGATTTTTTTTTTTTAAATAGCCTGCA
TCATTTTACCTCAATATCAAATTGGGCCCG