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All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

orange1.1t00166.3
CDS Infomation

gene=orange1.1t00166
Sequence

ATGCCTGTGAATCTAACGCCAAACTCAATCTCGTTGATAAATGGCGGAGATGTGAACTCG
AAGCCGCTGGTTCAGGTCATGGATATAAAGCTGATTGGAAGTACTCAGGAACGTTACCGG
TTCTTGATCTCAGATTCGGTGTCGACTCAGCACGCAATGCTCGCCACTCAGCTCAATGAC
AGAGTCAAGACCGGCCAAGTTAAGAAAGGATCCGTCGTTCAGTTGATCGATTACATTTGC
AGCACTGTGCAGAATCGGAAAATTATTGTTGTGTTGAACATGGAGACTATAATATTGGAT
TGCGAACCAATTGGGAATCCAAAAATATTTTCCGAATCTGAGTTAACTGCTCAAAAAACT
ATTCCTAGTAACAATTTGCCGCAGCCAGTTAGAGTTAATAATTACAGTGCTCCAAATTCC
GGCACATTTAATCTGCAGAATTCTGGTACATTTAATTCTCAAAATCCAGGTTCATTCAGT
ACTCCAAATTCTGGGACATTTAGAGCTCCAAATGCTGGTAGTATTGTGCGGAGTTTCCAA
CCCACTGTTCAGCCACCTTATCAACCGCCCCCAAATTTCAGAAATCACGGTCCAATATTG
AAGAATGAAGCTCCAGCACGCATCATTCCTATTGCTGCTTTGAATCCTTATCAGGGGAGG
TGGGCTATCAAGGCCAGAGTGACTGCAAAGGGAGATCTTCGCCGCTACAACAATGCTCGA
GGAGATGGGAAGGTCTTCTCTTTTGACCTCCTTGACTCTGATGGAGGGGAGATAAGAGTT
ACCTGCTTTAATGCTGTTGTTGACCGCTTCTATGAAATTATTGAGGTTGGTAGAGTCTAT
TTGATCTCAAAAGGTAGCTTGAAACCTGCACAAAAGAATTTCAACCATCTGAAGAATGAA
TGGGAGATATTTTTGGAGGCAACTTCAACTGTGGATCTCTGCACTGAGGAGGATGATTCA
ATACCAAAACAGCAGTTCTCCTTCAGACATATCAGTGAAATTGAGAGTGCTGAAAATAAT
TCCATAGTTGATGTTATTGGTATTGTGATATCTGTTAACCCTTCAGTTCCTATCTTAAGG
AAGAATGGTATGGAAACTCAGAGAAGAATTTTGAATCTCAAGGATACATCTGGCAGGAGT
GTTGAGCTAACTCTTTGGGGAGATTTCTGCAATAAGGAAGGTCAAAAGCTGCAGGAGATG
GTTGACGTTGGGTTCTTCCCTGTTTTGTCTGTTAAATCTGGAAAGGTTAATGATTTCAGT
GGAAAATCAATTGGGACTATCCCTTCTACCCAGCTCTTTATAAATCCAGATTTTGCTGAG
GCTCACGAGCTGAGAGAGTGGTTTGATAGTGGAGGGAAGAATGCTGCTACTGTGTCCATT
TCAAGAGAAATTGCTGCAGGTGGGGCTAAGAATGAGATACACAAAACTGTGTCCCAGATT
AAGAATGAAGGTCTTGGAAGATCAGAAAAGCCTGACTGGGTGACAGTGCGGGCTTTCATA
ACTTTTATTAAATCAGATAGTTTCTGCTACACAGCTTGCCCTTTGATGATAGGGGATAGA
CAGTGCAATAAGAAAGTAACACAGTCTGGAAACAGATGGCAATGCGACAGGTGCAATCAA
GAAATTGACGAATGTGATTATAGATATCTTCTTCAAGCCCAGATTCAAGACCAGACAGGA
TTGACTTGGGTAACGGCTTTCCAGGAGTCTGGTGAAGAGATCTTGGGCTGCCCAGCAAAG
GAGTTGTACATGTTGAAATATGAATTGCAGGATGATGTTAGATTTGGGGAGATAATTCGG
AGTAGAGTCTTTAACCAATATCTTTTCAGGCTTAAGATCAAAGAGGAATTGTATGGTGAT
GAGCAGAGGGTGAAGATCACAGTTATTAGGGCAGACCAGGTTAACTATTCTTCTGAAAGC
AGATACTTGCTTGATTTGATTTCAAAGTCCTTTAGGAAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

orange1.1t00166.3
PEP Infomation
Sequence

MPVNLTPNSISLINGGDVNSKPLVQVMDIKLIGSTQERYRFLISDSVSTQHAMLATQLND
RVKTGQVKKGSVVQLIDYICSTVQNRKIIVVLNMETIILDCEPIGNPKIFSESELTAQKT
IPSNNLPQPVRVNNYSAPNSGTFNLQNSGTFNSQNPGSFSTPNSGTFRAPNAGSIVRSFQ
PTVQPPYQPPPNFRNHGPILKNEAPARIIPIAALNPYQGRWAIKARVTAKGDLRRYNNAR
GDGKVFSFDLLDSDGGEIRVTCFNAVVDRFYEIIEVGRVYLISKGSLKPAQKNFNHLKNE
WEIFLEATSTVDLCTEEDDSIPKQQFSFRHISEIESAENNSIVDVIGIVISVNPSVPILR
KNGMETQRRILNLKDTSGRSVELTLWGDFCNKEGQKLQEMVDVGFFPVLSVKSGKVNDFS
GKSIGTIPSTQLFINPDFAEAHELREWFDSGGKNAATVSISREIAAGGAKNEIHKTVSQI
KNEGLGRSEKPDWVTVRAFITFIKSDSFCYTACPLMIGDRQCNKKVTQSGNRWQCDRCNQ
EIDECDYRYLLQAQIQDQTGLTWVTAFQESGEEILGCPAKELYMLKYELQDDVRFGEIIR
SRVFNQYLFRLKIKEELYGDEQRVKITVIRADQVNYSSESRYLLDLISKSFRK*

Transcript Sequence

Transcript ID

orange1.1t00166.3
Transcript Infomation

gene=orange1.1t00166 CDS=129-2090
Sequence

ATCAAAATTAAAGTCGGTTACACGGTGCCCCTCTTACCCCGGCAATTACAACCTCCAAAA
TTCATACCATTTTCTAATTTCTAGGGTTTTGGACTCTCTCAATCTATCTCACGGTGACTG
CAGCAACGATGCCTGTGAATCTAACGCCAAACTCAATCTCGTTGATAAATGGCGGAGATG
TGAACTCGAAGCCGCTGGTTCAGGTCATGGATATAAAGCTGATTGGAAGTACTCAGGAAC
GTTACCGGTTCTTGATCTCAGATTCGGTGTCGACTCAGCACGCAATGCTCGCCACTCAGC
TCAATGACAGAGTCAAGACCGGCCAAGTTAAGAAAGGATCCGTCGTTCAGTTGATCGATT
ACATTTGCAGCACTGTGCAGAATCGGAAAATTATTGTTGTGTTGAACATGGAGACTATAA
TATTGGATTGCGAACCAATTGGGAATCCAAAAATATTTTCCGAATCTGAGTTAACTGCTC
AAAAAACTATTCCTAGTAACAATTTGCCGCAGCCAGTTAGAGTTAATAATTACAGTGCTC
CAAATTCCGGCACATTTAATCTGCAGAATTCTGGTACATTTAATTCTCAAAATCCAGGTT
CATTCAGTACTCCAAATTCTGGGACATTTAGAGCTCCAAATGCTGGTAGTATTGTGCGGA
GTTTCCAACCCACTGTTCAGCCACCTTATCAACCGCCCCCAAATTTCAGAAATCACGGTC
CAATATTGAAGAATGAAGCTCCAGCACGCATCATTCCTATTGCTGCTTTGAATCCTTATC
AGGGGAGGTGGGCTATCAAGGCCAGAGTGACTGCAAAGGGAGATCTTCGCCGCTACAACA
ATGCTCGAGGAGATGGGAAGGTCTTCTCTTTTGACCTCCTTGACTCTGATGGAGGGGAGA
TAAGAGTTACCTGCTTTAATGCTGTTGTTGACCGCTTCTATGAAATTATTGAGGTTGGTA
GAGTCTATTTGATCTCAAAAGGTAGCTTGAAACCTGCACAAAAGAATTTCAACCATCTGA
AGAATGAATGGGAGATATTTTTGGAGGCAACTTCAACTGTGGATCTCTGCACTGAGGAGG
ATGATTCAATACCAAAACAGCAGTTCTCCTTCAGACATATCAGTGAAATTGAGAGTGCTG
AAAATAATTCCATAGTTGATGTTATTGGTATTGTGATATCTGTTAACCCTTCAGTTCCTA
TCTTAAGGAAGAATGGTATGGAAACTCAGAGAAGAATTTTGAATCTCAAGGATACATCTG
GCAGGAGTGTTGAGCTAACTCTTTGGGGAGATTTCTGCAATAAGGAAGGTCAAAAGCTGC
AGGAGATGGTTGACGTTGGGTTCTTCCCTGTTTTGTCTGTTAAATCTGGAAAGGTTAATG
ATTTCAGTGGAAAATCAATTGGGACTATCCCTTCTACCCAGCTCTTTATAAATCCAGATT
TTGCTGAGGCTCACGAGCTGAGAGAGTGGTTTGATAGTGGAGGGAAGAATGCTGCTACTG
TGTCCATTTCAAGAGAAATTGCTGCAGGTGGGGCTAAGAATGAGATACACAAAACTGTGT
CCCAGATTAAGAATGAAGGTCTTGGAAGATCAGAAAAGCCTGACTGGGTGACAGTGCGGG
CTTTCATAACTTTTATTAAATCAGATAGTTTCTGCTACACAGCTTGCCCTTTGATGATAG
GGGATAGACAGTGCAATAAGAAAGTAACACAGTCTGGAAACAGATGGCAATGCGACAGGT
GCAATCAAGAAATTGACGAATGTGATTATAGATATCTTCTTCAAGCCCAGATTCAAGACC
AGACAGGATTGACTTGGGTAACGGCTTTCCAGGAGTCTGGTGAAGAGATCTTGGGCTGCC
CAGCAAAGGAGTTGTACATGTTGAAATATGAATTGCAGGATGATGTTAGATTTGGGGAGA
TAATTCGGAGTAGAGTCTTTAACCAATATCTTTTCAGGCTTAAGATCAAAGAGGAATTGT
ATGGTGATGAGCAGAGGGTGAAGATCACAGTTATTAGGGCAGACCAGGTTAACTATTCTT
CTGAAAGCAGATACTTGCTTGATTTGATTTCAAAGTCCTTTAGGAAATGAGTGATTTTAA
GCCCAGGCAAGTGATAAAGATTTAGTAGCTTTATTTCTGCAGAGTTGAGTTGACTTGACT
TGATCGAATTGGTAAATGAAAATTATACTAGTAGTTTCGTGAATTTCGGTCAGGTTATCA
ATGCTTGTAGGTATCATTTAATCCTCAATCTGGCTCCCCGTTGTATGCATAATGCATTCC
CTTATTTGAATTTCAATTTTTTATCTTTATTCTTTTCCAATCTGATTCTGGTTTGTTGAT
TTCTTTCTTGAGCTTAATTGCTGAAGGAAAGGAACAAGATTTTTCTTGGAGATTTGAGTT
AGATTCCTTGATTGGTTTGCTGAGCTTTTGGTACTTGTTAAAAACAATTTTGAAGATGAT
GAATGAAATGATATTCCCATTGAGTTGCGCCCCAACGGAAATGGAAATGAAAATTTTCAG
AGTTCACAATTCTTTGGGCTCAATTACACAAACGACATAAAGTCCATAGCTAAAAACATC
AAACAACACATAAAATGGAAGATACATGCCAACGTCATCTGAATTTGATAGCTCTTAGAT
TCTTTTGATGGGGTCAAAATTGGATACGCCAATGACAGCACCGATGAGAGCAGCAAGCAC
AACACCACCAGCTGCAATGCTGAGCAAGAAATTCGTGAGTGATGAAGAAACCCCAGGGCC
AGCAGCTTCAGCCACCTCAGGAATCACCATGGAAGCCGCAAGGGCACCAGCCATCAACGC
GGTGACAGCTTTCTCTTTCAACGAAGAAGCCTCGACTTCAAACCTGCCACTGGATTTTGA
TGCTGCTGCCAATACTTTTGATGGCTTCACCGGCAATGGCTTGAAGAACGCTTCAGAGTT
TACAACCATCTTTTGGCTTGCACGAGTTAACGGAATAGCCATTGAAATAGCTGAAGATGA
AGTCATTTATTCCTTCTTCTGAGTTATTCCTTTTGCGTTCTGTGCTGTTTCTTCCACTGC
TTTCTCTTCGGCAGATTTTGAGTGTTAAATTTGAAGAATGTGGACTTGGTTGAGCTCAGC
CTTAGATAGAGGTAGTGGAGCAAGGGAGTGTAATGAGAGGAGGAGGAGGCGCTGGCCAAC
TTTATCTCTGTTCCACGTGGCAGCTTCTCCAGCTGGGACGGTGGATAATGTTGTCTCAAT
GGCTCAATCACATTCACACCATCAAGTTTGAAATTAGGGAAAGAGGTGACTTAAGGAATT
TCGCTGCCCTCATAAATTTAACCTTTTTCTAATTATCTCATCAATCTTAATTTTTTAATT
TATTTTATTACTTTTCAAAATTATCCTTCCGTGACCATCACCCTCACTACCTCATCGATA
ATAACTGCATCGTCATTACCACTAATTATTTTCTTCATTATTAATCTGGCATCTCCACTA
GCATGTGATGAATTTTAATAAATTTTATTGATAAACAATGTATTTTGTTGTTATTGATGA
TATTTGTTTGATTTCGTGATAATCTAAGATTTGAGATTTGACACAAATTATGAATCGATT
AAAAAATAAAAAAGATTTGAGAGTTGTAAAGTTTATAAAGTTTTTTTTTATCAATGTATA
CCGCTGTAGGGCTAGTGGTTGCATGCAAAATTCCAAGTACACACTATAAGTTGTAAGGTT
TTAACCTTTAAGAGTGTTTTGGAGATATCTGATTTATGATGTAGCCATGCCTTTATATAG
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AATATATCAACTTTGTGATATATTACATAAGTCGTGATTTCTCCACGTTACTATCTG