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All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

orange1.1t00072.1
CDS Infomation

gene=orange1.1t00072
Sequence

ATGGCAGTAACAATGCTGCTTAGATCTCTACTCGCTCTCTTGCTCACCACCATCGTCCTC
TTCTCTCACAATATCAAAGCTACAACAATCACATTATTCAACAAATGCGAGCACCCAGTT
TGGCCCGGAATACAAGCGAGCGCAGGCAAGCCACTACTGGCACGTGGCGGCTTCAAGCTC
CCACCAAACAAGGCCTACACCATACGCCTACCGCCCCTCTGGTCCGGGCGCTTCTGGGGT
CGCCATGGATGCAGGTTCGACGCCTCAGGCCGGGGCCGCTGCGCCACCGGGGACTGCGGC
GGATCGCTCTTCTGCAACGGCATAGGCGGCAGCCCGCCGGCCACCCTCGCCGAAATCACG
CTGGGGCAGCAGCAGGACTTCTACGACGTGAGCCTGGTCGACGGTTACAACATCGCAATG
TCGATTTTGCCCATCAGAGGCTCCGGGAAATGCAGCTACGCTGGGTGTGTGAGTGACCTG
AACTTGATGTGTCCCGCGGGGCTACAAGTGAGGTCCAACAGCAGAGTGGTGGCCTGCAAA
AGTGCTTGTTTCGCTTTCAACTCGCCCAGGTATTGCTGCACTGGGAGCTTTGGGAATCCT
CAATCCTGCAAGCCCACTGCTTACTCCAGGATTTTCAAGGCCGCTTGTCCCAGAGCTTAC
AGCTATGCTTATGATGATCCCACTAGTATTGCTACTTGCACCGGCAGCAACTACTTGCTC
ACTTTCTGCCCCCGCCATCGCCGTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

orange1.1t00072.1
PEP Infomation
Sequence

MAVTMLLRSLLALLLTTIVLFSHNIKATTITLFNKCEHPVWPGIQASAGKPLLARGGFKL
PPNKAYTIRLPPLWSGRFWGRHGCRFDASGRGRCATGDCGGSLFCNGIGGSPPATLAEIT
LGQQQDFYDVSLVDGYNIAMSILPIRGSGKCSYAGCVSDLNLMCPAGLQVRSNSRVVACK
SACFAFNSPRYCCTGSFGNPQSCKPTAYSRIFKAACPRAYSYAYDDPTSIATCTGSNYLL
TFCPRHRR*

Transcript Sequence

Transcript ID

orange1.1t00072.1
Transcript Infomation

gene=orange1.1t00072 CDS=691-1437
Sequence

CTAAGTTAAGATGATTAGTATTTTTATCTATTAAGTGTAGTCATTTTCTCTTTTATTGTT
GTAATAGGTGATGTAAGATAACTGTTTGGTGTTTTAAATAGAGCTAATAATATTAGATTT
TGGTATAATATATCAATTTGAAGTTTTTAATAAGAGAAGGAGAAGTACAACAATCTTGTT
TTGTATTAAATTCTATTGTTTAAGGACTCTTGTCATCTCTTTCACTTAATATATATATAT
ATTAATATTTATTAAAAAATTAATTAATTTTATATTCTAATCTAATAACTACTTATTGTA
TCTTTTTTTAAAAAAACTAACTAAAAGATCAATTGAGTTTGGCTTTGAATTTTTAACATT
TGAAAAAAGAAAAACTTGGCTAAGTAAATTTTCGGAAAATTTATTAGTTTTTTTATCATT
TTTTTGGTAATTCAGATTTACAACTGGAAGCACTAAAATTTCAATTCATCCACTAGGCCG
ACATTTCAACTTTTTCTTTATTTTTCACCCAAAAAAAAAAAAACAAATTCTAACCCTAGT
AAATTGCTTACCGCCCGTTATTTGTGGTCTATAAAAGCTCTATTGTGGTTAAGGCTTTTG
CTGATAGATAACAGTCCGCTGTCCCCAGTTCACACACTCTCCTCTCACTCACTGCCTTCA
AAATCTTTTGCTTTTTGCTGAGTTTCAGCCATGGCAGTAACAATGCTGCTTAGATCTCTA
CTCGCTCTCTTGCTCACCACCATCGTCCTCTTCTCTCACAATATCAAAGCTACAACAATC
ACATTATTCAACAAATGCGAGCACCCAGTTTGGCCCGGAATACAAGCGAGCGCAGGCAAG
CCACTACTGGCACGTGGCGGCTTCAAGCTCCCACCAAACAAGGCCTACACCATACGCCTA
CCGCCCCTCTGGTCCGGGCGCTTCTGGGGTCGCCATGGATGCAGGTTCGACGCCTCAGGC
CGGGGCCGCTGCGCCACCGGGGACTGCGGCGGATCGCTCTTCTGCAACGGCATAGGCGGC
AGCCCGCCGGCCACCCTCGCCGAAATCACGCTGGGGCAGCAGCAGGACTTCTACGACGTG
AGCCTGGTCGACGGTTACAACATCGCAATGTCGATTTTGCCCATCAGAGGCTCCGGGAAA
TGCAGCTACGCTGGGTGTGTGAGTGACCTGAACTTGATGTGTCCCGCGGGGCTACAAGTG
AGGTCCAACAGCAGAGTGGTGGCCTGCAAAAGTGCTTGTTTCGCTTTCAACTCGCCCAGG
TATTGCTGCACTGGGAGCTTTGGGAATCCTCAATCCTGCAAGCCCACTGCTTACTCCAGG
ATTTTCAAGGCCGCTTGTCCCAGAGCTTACAGCTATGCTTATGATGATCCCACTAGTATT
GCTACTTGCACCGGCAGCAACTACTTGCTCACTTTCTGCCCCCGCCATCGCCGTTAGATT
TTTATACCCATTATCTACCACTACTACTACATACGCTATCAAGTTCATTTGTAATAAGAT
AAGATTATTATTATTATATCATATGTTATGTTATGTTTACTAGTAATAATATCATGGTAC
GGTAGTTTGTTGGTATCAGATGATAATGTTGAATTGGCCATTATTATTAGTTAATGGAAA
TTATTAATTATTAACTATTACTATTTGAGTTGTTGAATGTAAAATAATTAAGTTTGAAAC
TAGGCTATTGATAGT