Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs9g17500.3
CDS Infomation

gene=Cs9g17500
Sequence

ATGGGAACATCAGTGCAAGTAACGCCACTGAGCGGAGTGTTCAACGAGAATCCGTTATCA
TACTTAGTCTCAATCGACGGATTCAACTTCTTAATCGACTGCGGATGGAACGACCACTTC
GATCCTTCTCTCCTTCAACCTCTCTCCAAAGTAGCTTCTACTATCGACGCAGTGCTTCTT
TCGCATCCCGACACATTGCACCTCGGAGCCCTTCCTTATGCGATGAAGCAACTCGGCCTC
TCCGCTCCGGTTTTTTCAACTGAACCGGTTTATCGATTAGGTCTTCTCACTATGTACGAT
CAGTACCTTTCTCGTCGGCAAGTGTCAGAGTTTGATTTATTTACGCTAGATGATATTGAT
TCTGCTTTCCAGAGTGTGACCAGGCTAACCTACTCTCAGAATTATCATCTATCTGGGAAA
GGAGAGGGGATTGTGGTTGCACCACATGTGGCTGGCCATCTCTTGGGAGGTACTGTGTGG
AAGATAACAAAGGATGGAGAAGATGTTATATATGCTGTTGACTATAACCGTCGCAAGGAG
AAGCATTTGAATGGAACTGTTCTAGAGTCCTTTGTTCGGCCTGCTGTTTTAATCACTGAT
GCCTATAATGCTTTGCACAATCAACCTCCGAGACAACAGAGAGAGATGTTTCAAGATGCT
ATTTCGAAGACTCTAAGAGCGGGTGGAAATGTATTACTTCCTGTGGATTCTGCTGGGAGA
GTGTTGGAACTCCTCTTGATATTGGAAGATTATTGGGCAGAACATTCCTTGAATTATCCT
ATCTACTTCCTCACATATGTTTCATCAAGCACGATTGATTATGTCAAGAGTTTCTTGGAG
TGGATGGGTGATTCCATAACAAAGTCCTTCGAAACATCACGTGATAATGCTTTTCTTCTC
AAGCACGTCACCCTCTTAATTAACAAGAGTGAACTTGATAATGCTCCTGATGGGCCAAAG
CTGGTTCTAGCATCCATGGCCAGTTTGGAAGCAGGGTTTTCTCATGACATATTTGTGGAA
TGGGCAAGTGATGTCAAGAATCTTGTTCTGTTTACTGAAAGAGGCCAGTTTGGCACACTA
GCTCGCATGCTTCAGGCTGATCCACCTCCGAAAGCTGTTAAAGTCACTATGTCCAGGAGG
GTTCCCTTGGTTGGTGAGGAGTTAATTGCTTATGAAGAAGAGCAAACCCGACTAAAAAAG
GAAGAAGCTTTGAAAGCTAGTCTTGTTAAAGAGGAGGAATCTAAAGCATCTCTTGGGCCT
GATAATAATTTGAGTGGTGACCCAATGGTCATTGATGCTAATAATGCAAATGCTTCAGCA
GATGTGGTTGAACCTCATGGGGGCAGATACCGGGACATTTTAATTGATGGATTTGTTCCT
CCTTCCACCAGTGTTGCCCCGATGTTTCCCTTTTATGAGAATAACTCTGAGTGGGATGAT
TTTGGTGAAGTCATAAATCCTGATGATTATATAATCAAGGACGAAGACATGGATCAAGCA
GCTATGCACATTGGTGGTGATGATGGAAAACTCGATGAAGGTTCTGCCAGTTTGATTCTT
GATGCGAAGCCTTCAAAAGTTGTATCCAATGAGTTAACTGTGCAAGTGAAGTGCTTGCTG
ATTTTTATAGACTATGAGGGGCGTGCAGATGGCCGCTCAATCAAAACAATTCTCTCCCAT
GTTGCCCCTTTGAAGCTGGTTTTGGTACATGGATCAGCGGAGGCCACTGAACATTTGAAA
CAACACTGCTTGAAGCATGTTTGTCCTCATGTTTATACTCCTCAAATTGAAGAAACAATT
GATGTCACGTCAGACTTATGTGCTTATAAGGTGCAACTATCTGAGAAGTTGATGAGTAAT
GTGCTCTTTAAGAAGTTAGGAGATTATGAAATTGCTTGGGTTGATGCTGAAGTAGGAAAG
ACGGAGAATGGCATGCTGTCTTTACTGCCAATCTCAACCCCAGCTCCACCCCATAAATCA
GTCCTTGTTGGTGATCTAAAAATGGCTGATTTAAAGCCATTTCTTAGCAGTAAGGGTATC
CAGGTACTTTTCTTTTTAAATTTATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs9g17500.3
PEP Infomation
Sequence

MGTSVQVTPLSGVFNENPLSYLVSIDGFNFLIDCGWNDHFDPSLLQPLSKVASTIDAVLL
SHPDTLHLGALPYAMKQLGLSAPVFSTEPVYRLGLLTMYDQYLSRRQVSEFDLFTLDDID
SAFQSVTRLTYSQNYHLSGKGEGIVVAPHVAGHLLGGTVWKITKDGEDVIYAVDYNRRKE
KHLNGTVLESFVRPAVLITDAYNALHNQPPRQQREMFQDAISKTLRAGGNVLLPVDSAGR
VLELLLILEDYWAEHSLNYPIYFLTYVSSSTIDYVKSFLEWMGDSITKSFETSRDNAFLL
KHVTLLINKSELDNAPDGPKLVLASMASLEAGFSHDIFVEWASDVKNLVLFTERGQFGTL
ARMLQADPPPKAVKVTMSRRVPLVGEELIAYEEEQTRLKKEEALKASLVKEEESKASLGP
DNNLSGDPMVIDANNANASADVVEPHGGRYRDILIDGFVPPSTSVAPMFPFYENNSEWDD
FGEVINPDDYIIKDEDMDQAAMHIGGDDGKLDEGSASLILDAKPSKVVSNELTVQVKCLL
IFIDYEGRADGRSIKTILSHVAPLKLVLVHGSAEATEHLKQHCLKHVCPHVYTPQIEETI
DVTSDLCAYKVQLSEKLMSNVLFKKLGDYEIAWVDAEVGKTENGMLSLLPISTPAPPHKS
VLVGDLKMADLKPFLSSKGIQVLFFLNL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs9g17500.3
Transcript Infomation

gene=Cs9g17500 CDS=149-2215
Sequence

TTCCATTTAGGATGAATATAACAAATTGCAAGACCCAAAGGATAGTTCGATAAAAGCCCG
CGCCTCAAACGCCAAGCTCTGTCCGGTTAAACCGCAGAAGAGAGAAGGCAAGAGTTGGTG
AACTTGCATTTCGGTCGTTATCGGAATAATGGGAACATCAGTGCAAGTAACGCCACTGAG
CGGAGTGTTCAACGAGAATCCGTTATCATACTTAGTCTCAATCGACGGATTCAACTTCTT
AATCGACTGCGGATGGAACGACCACTTCGATCCTTCTCTCCTTCAACCTCTCTCCAAAGT
AGCTTCTACTATCGACGCAGTGCTTCTTTCGCATCCCGACACATTGCACCTCGGAGCCCT
TCCTTATGCGATGAAGCAACTCGGCCTCTCCGCTCCGGTTTTTTCAACTGAACCGGTTTA
TCGATTAGGTCTTCTCACTATGTACGATCAGTACCTTTCTCGTCGGCAAGTGTCAGAGTT
TGATTTATTTACGCTAGATGATATTGATTCTGCTTTCCAGAGTGTGACCAGGCTAACCTA
CTCTCAGAATTATCATCTATCTGGGAAAGGAGAGGGGATTGTGGTTGCACCACATGTGGC
TGGCCATCTCTTGGGAGGTACTGTGTGGAAGATAACAAAGGATGGAGAAGATGTTATATA
TGCTGTTGACTATAACCGTCGCAAGGAGAAGCATTTGAATGGAACTGTTCTAGAGTCCTT
TGTTCGGCCTGCTGTTTTAATCACTGATGCCTATAATGCTTTGCACAATCAACCTCCGAG
ACAACAGAGAGAGATGTTTCAAGATGCTATTTCGAAGACTCTAAGAGCGGGTGGAAATGT
ATTACTTCCTGTGGATTCTGCTGGGAGAGTGTTGGAACTCCTCTTGATATTGGAAGATTA
TTGGGCAGAACATTCCTTGAATTATCCTATCTACTTCCTCACATATGTTTCATCAAGCAC
GATTGATTATGTCAAGAGTTTCTTGGAGTGGATGGGTGATTCCATAACAAAGTCCTTCGA
AACATCACGTGATAATGCTTTTCTTCTCAAGCACGTCACCCTCTTAATTAACAAGAGTGA
ACTTGATAATGCTCCTGATGGGCCAAAGCTGGTTCTAGCATCCATGGCCAGTTTGGAAGC
AGGGTTTTCTCATGACATATTTGTGGAATGGGCAAGTGATGTCAAGAATCTTGTTCTGTT
TACTGAAAGAGGCCAGTTTGGCACACTAGCTCGCATGCTTCAGGCTGATCCACCTCCGAA
AGCTGTTAAAGTCACTATGTCCAGGAGGGTTCCCTTGGTTGGTGAGGAGTTAATTGCTTA
TGAAGAAGAGCAAACCCGACTAAAAAAGGAAGAAGCTTTGAAAGCTAGTCTTGTTAAAGA
GGAGGAATCTAAAGCATCTCTTGGGCCTGATAATAATTTGAGTGGTGACCCAATGGTCAT
TGATGCTAATAATGCAAATGCTTCAGCAGATGTGGTTGAACCTCATGGGGGCAGATACCG
GGACATTTTAATTGATGGATTTGTTCCTCCTTCCACCAGTGTTGCCCCGATGTTTCCCTT
TTATGAGAATAACTCTGAGTGGGATGATTTTGGTGAAGTCATAAATCCTGATGATTATAT
AATCAAGGACGAAGACATGGATCAAGCAGCTATGCACATTGGTGGTGATGATGGAAAACT
CGATGAAGGTTCTGCCAGTTTGATTCTTGATGCGAAGCCTTCAAAAGTTGTATCCAATGA
GTTAACTGTGCAAGTGAAGTGCTTGCTGATTTTTATAGACTATGAGGGGCGTGCAGATGG
CCGCTCAATCAAAACAATTCTCTCCCATGTTGCCCCTTTGAAGCTGGTTTTGGTACATGG
ATCAGCGGAGGCCACTGAACATTTGAAACAACACTGCTTGAAGCATGTTTGTCCTCATGT
TTATACTCCTCAAATTGAAGAAACAATTGATGTCACGTCAGACTTATGTGCTTATAAGGT
GCAACTATCTGAGAAGTTGATGAGTAATGTGCTCTTTAAGAAGTTAGGAGATTATGAAAT
TGCTTGGGTTGATGCTGAAGTAGGAAAGACGGAGAATGGCATGCTGTCTTTACTGCCAAT
CTCAACCCCAGCTCCACCCCATAAATCAGTCCTTGTTGGTGATCTAAAAATGGCTGATTT
AAAGCCATTTCTTAGCAGTAAGGGTATCCAGGTACTTTTCTTTTTAAATTTATGAAATAC
C