Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs9g16210.1
CDS Infomation

gene=Cs9g16210
Sequence

ATGTCCAAGAAACTTCAAATGGTCAGTTATTCATTGTTGAATTCTCCCGCCAAAGTTTCA
CCTCCTAACAAAGAATCCACTAAGCTTATTCTCAGAAATGCAATCGATGAATGCAAGAAC
ATGAGAGAGCTAAAAGAGATACATACCCAAATCATAAAATCTCCATGTCTACAAACAAAC
GATCACCATTCCCTCATTACCCGCCTCCTCTTCTTTTGCGCCTTATCTGTTTCTGGCTCT
CTAAGCTACGCCACCAATGTTTTTAGTCACATAAAAAGGTCTGATCTTTATACATATAAC
ATCATGATCAGAGCCAATGCGTGTAAATCCAGTGAAACAAATGATACCCATTCGGGTAAA
TGTCTGAAACTGTACAAGCAAATGCTTTGCACTGGCATTTCACCTGATTGCCTCACGTTT
CCATTTCTTTTAAAAGAATGTACTAAGAGGCTTGATGGTCTTGTAGGAGCTAGTGTTTAC
GGCCAAGTTGTTAAATTTGGAGTGTGTGATGATGTTTTTGTGCAAAATTCTGTAATAAGT
TTGTTCATGGCTTGTGGGTTTGTGACTAGTGCAAGGATGTTGTTTGATGAAATGTCGAAT
AGAGATGTGGTTTCTTGGAATGCCATGATTATTGGCTATTTGAGAAGTGGGGATCTCGAT
GTCGCATTGGATTTGTTCAGGAGGATGAAGAAGAGAAATATTTTTTCTTGGAATTCGATT
ATTACGGGGTTTGTTCAAGGCGGCAGGGCAAGGGAGGCATTGGAACTTTTTCAAGAAATG
CAAAGTTCAAGTGTTGAGGAAATGGTTAAACCAGATAAGATTACTATTGCTAGTGTACTT
TCGGCCTGTGCTTATCTTGGTGCTATTGATCATGGAAAATGGGTGCATGGTTACTTGAGG
AGAAGTGGACTTGATTGTGACGTGGTTATTGGCACAGCGTTGGTTGATATGTATGGTAAA
TGTGGTTGTGTGGAAAGAGCTTATGGAGTCTTTAAGGAAATGCCTAAGAAGGATACCTTG
GCATGGACAGCAATGATTTCTGTGTTTGCGCTTAATGGGTATGGCAAGGAGGCTTTTGAT
ACTTTTAGGGAGATGGAAGCAGAAGGGGTGAGGCCGAACCACGTGACATTTGTTGGGCTC
TTGTCGGCTTGTGCTCATTCTGGTTTAGTAGAGAAAGGTCGCTGGTGTTTTGTCATGATG
AGGCATGTTTACTTGGTGGAACCACATGTCTACCACTATGCTTGCATGATCGACATTCTT
AGTCGAGCTGGTCTCTTTAGTGAGGCAGAGCGGCTTATAAGAAGCATGCCAATGGAGCCA
GATGTGTTTGTTTGGGGTGCATTGCTTGGGGGCTGTCAAATGCACGGAAATGTGGAGTTA
GGCGAAAAGGTAGCTCAATATTTAATTGATTTGGATCCTCTAAACCATGCTTTCTATGTG
AACTTGTGTGATATGTATGCCAAAGCTGGTAGATTTGATGATGTAAAGAAAACTAGAAAC
TTAATGAAAGAAAGAGGAATTAGAAAGGAAGTCCCTGGCTGTAGCTCGGTCGAAGTAGAT
GGGGTTGTTCATGAATTTTCGATGAAAGGGTCGCCTAAGGTTGTGAAAGAGGAGCTTGTG
TTGATCTTGAATGGATTAAGTAAAATTATGAAGAATGGAGGTTTTGGGCAGTATATCAGA
GGGTTATCGATGGAGGCACAGGTTTCATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs9g16210.1
PEP Infomation
Sequence

MSKKLQMVSYSLLNSPAKVSPPNKESTKLILRNAIDECKNMRELKEIHTQIIKSPCLQTN
DHHSLITRLLFFCALSVSGSLSYATNVFSHIKRSDLYTYNIMIRANACKSSETNDTHSGK
CLKLYKQMLCTGISPDCLTFPFLLKECTKRLDGLVGASVYGQVVKFGVCDDVFVQNSVIS
LFMACGFVTSARMLFDEMSNRDVVSWNAMIIGYLRSGDLDVALDLFRRMKKRNIFSWNSI
ITGFVQGGRAREALELFQEMQSSSVEEMVKPDKITIASVLSACAYLGAIDHGKWVHGYLR
RSGLDCDVVIGTALVDMYGKCGCVERAYGVFKEMPKKDTLAWTAMISVFALNGYGKEAFD
TFREMEAEGVRPNHVTFVGLLSACAHSGLVEKGRWCFVMMRHVYLVEPHVYHYACMIDIL
SRAGLFSEAERLIRSMPMEPDVFVWGALLGGCQMHGNVELGEKVAQYLIDLDPLNHAFYV
NLCDMYAKAGRFDDVKKTRNLMKERGIRKEVPGCSSVEVDGVVHEFSMKGSPKVVKEELV
LILNGLSKIMKNGGFGQYIRGLSMEAQVS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs9g16210.1
Transcript Infomation

gene=Cs9g16210 CDS=65-1774
Sequence

CTTTTTGTGAAATAACAAAAAGAAGTCGGCTTCTCATGGTTCACTTAATCCGTCGCCAGT
GTCAATGTCCAAGAAACTTCAAATGGTCAGTTATTCATTGTTGAATTCTCCCGCCAAAGT
TTCACCTCCTAACAAAGAATCCACTAAGCTTATTCTCAGAAATGCAATCGATGAATGCAA
GAACATGAGAGAGCTAAAAGAGATACATACCCAAATCATAAAATCTCCATGTCTACAAAC
AAACGATCACCATTCCCTCATTACCCGCCTCCTCTTCTTTTGCGCCTTATCTGTTTCTGG
CTCTCTAAGCTACGCCACCAATGTTTTTAGTCACATAAAAAGGTCTGATCTTTATACATA
TAACATCATGATCAGAGCCAATGCGTGTAAATCCAGTGAAACAAATGATACCCATTCGGG
TAAATGTCTGAAACTGTACAAGCAAATGCTTTGCACTGGCATTTCACCTGATTGCCTCAC
GTTTCCATTTCTTTTAAAAGAATGTACTAAGAGGCTTGATGGTCTTGTAGGAGCTAGTGT
TTACGGCCAAGTTGTTAAATTTGGAGTGTGTGATGATGTTTTTGTGCAAAATTCTGTAAT
AAGTTTGTTCATGGCTTGTGGGTTTGTGACTAGTGCAAGGATGTTGTTTGATGAAATGTC
GAATAGAGATGTGGTTTCTTGGAATGCCATGATTATTGGCTATTTGAGAAGTGGGGATCT
CGATGTCGCATTGGATTTGTTCAGGAGGATGAAGAAGAGAAATATTTTTTCTTGGAATTC
GATTATTACGGGGTTTGTTCAAGGCGGCAGGGCAAGGGAGGCATTGGAACTTTTTCAAGA
AATGCAAAGTTCAAGTGTTGAGGAAATGGTTAAACCAGATAAGATTACTATTGCTAGTGT
ACTTTCGGCCTGTGCTTATCTTGGTGCTATTGATCATGGAAAATGGGTGCATGGTTACTT
GAGGAGAAGTGGACTTGATTGTGACGTGGTTATTGGCACAGCGTTGGTTGATATGTATGG
TAAATGTGGTTGTGTGGAAAGAGCTTATGGAGTCTTTAAGGAAATGCCTAAGAAGGATAC
CTTGGCATGGACAGCAATGATTTCTGTGTTTGCGCTTAATGGGTATGGCAAGGAGGCTTT
TGATACTTTTAGGGAGATGGAAGCAGAAGGGGTGAGGCCGAACCACGTGACATTTGTTGG
GCTCTTGTCGGCTTGTGCTCATTCTGGTTTAGTAGAGAAAGGTCGCTGGTGTTTTGTCAT
GATGAGGCATGTTTACTTGGTGGAACCACATGTCTACCACTATGCTTGCATGATCGACAT
TCTTAGTCGAGCTGGTCTCTTTAGTGAGGCAGAGCGGCTTATAAGAAGCATGCCAATGGA
GCCAGATGTGTTTGTTTGGGGTGCATTGCTTGGGGGCTGTCAAATGCACGGAAATGTGGA
GTTAGGCGAAAAGGTAGCTCAATATTTAATTGATTTGGATCCTCTAAACCATGCTTTCTA
TGTGAACTTGTGTGATATGTATGCCAAAGCTGGTAGATTTGATGATGTAAAGAAAACTAG
AAACTTAATGAAAGAAAGAGGAATTAGAAAGGAAGTCCCTGGCTGTAGCTCGGTCGAAGT
AGATGGGGTTGTTCATGAATTTTCGATGAAAGGGTCGCCTAAGGTTGTGAAAGAGGAGCT
TGTGTTGATCTTGAATGGATTAAGTAAAATTATGAAGAATGGAGGTTTTGGGCAGTATAT
CAGAGGGTTATCGATGGAGGCACAGGTTTCATGATGAGGTTGCTGATCTTCCAGCAAATT
GTTAACTTATTTTTGAACTGGGAACCATCAATTATCTATGAATGTTCTCAATCTTTCTAC
GTAAACCTTTGAGCATATACCTGAGAGGAATTTCTTTTTTGGAAGAAATCTCAAAAGGAT
TTGTGGAGTTTTTTCTTATTCTCTTTGACGACATCAGGTAAACGTAAGACTCAAAATTCA
GAGATCATATACAAACAACCATTCTTGTTACAAGTTTACATTAGAAGCACTCAATCTAGC
TGGGAAATTCTGTAAATCAAGATTTTGTAGAAGTTATTACATTTTTTAAAATTATCTTAA
TTTTCT