Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs7g10420.4
CDS Infomation

gene=Cs7g10420
Sequence

ATGGCACCCATGAAGGGCGTTTTATCCCTGCAAAGGGCATCATTGGTTAGATGCTACAGT
GAGAGGTTGAGTGTGGGCTTAAGATCATTTAGCACTCAAGGTGCATCAACTGCCAGTACT
CCACAACCTCCGCCACCTCCCCCACCTCCAGAGAAAACCCATTTTGGTGGCCTGAAAGAT
GAAGACAGGATTTTCACCAACTTATATGGGATGCATGACCCTTTTCTCAAAGGTGCCATG
AAACGGGGTGATTGGCACAGAACTAAAGACTTGGTACTCAAGGGTGCAGATTGGATTGTC
AATGAAGTCAAGAAGTCTGGTCTCCGCGGACGTGGTGGTGCTGGTTTTCCCTCTGGCCTC
AAGTGGTCCTTCATGCCCAAGGTGTCTGATGGCCGTCCTTCGTATCTTGTTGTCAATGCT
GATGAAAGTGAACCTGGAACCTGTAAAGACAGGGAAATTATGCGGCATGATCCACATAAG
TTGTTGGAGGGCTGCTTGATTGCTGGCGTAGGAATGAGGGCTTCTGCTGCTTACATTTAC
ATAAGGGGTGAATATGTAAATGAACGTAAAAACCTTGAAAGAGCGAGGCAAGAAGCTTAT
GCTGCTGGATTGTTGGGCAAGAATGCCTGCGGATCTGGTTATGATTTTGATGTGCATATC
CACTATGGTGCTGGTGCTTATATTTGTGGTGAAGAGACAGCTCTTTTGGAAAGCCTTGAA
GGTAAACAGGGGAAACCAAGATTGAAGCCTCCTTTCCCTGCTAATGCAGGTTTATATGGT
TGTCCCACCACTGTCACCAATGTGGAAACTGTGGCCGTTTCTCCCACCATTTTAAGGCGT
GGACCGGACTGGTTTGCCAGTTTTGGCAGGAAGAACAATTCTGGTACAAAATTGTTTTGT
GTGTCGGGCCATGTGAATAAGCCTTGCACAGTTGAAGAGGAGATGAGTATTCCCCTCAAG
GAGTTGATAGATAGACACTGTGGTGGTGTTCGAGGTGGATGGGATAATTTACTTGCAGTA
ATACCAGGGGGTTCTTCAGTTCCTTTGCTTCCCAAACATATATGTGATGATGTGCTGATG
GATTATGATGCTCTGAAGGCTGTTCAATCAGGATTGGGAACTGCTGCTGTGATTGTCATG
GACAAATCAACTGACGTTGTCGATGCAATTGCTAGGCTCTCATACTTCTATAAGCACGAA
AGCTGTGGGCAGTGCACTCCATGCAGGGAGGGAACAGGATGGCTTTGGATGATCATGGAA
AGATTGAAGGTTGGAAATGCAAAGTTGGAGGAGATTGATATGCTTCAGGAGGTGACCAAG
CAGATTGAAGGGCACACAATCTGTGCACTGGGTGATGCAGCTGCTTGGCCTGTTCAGGGT
CTCATACGACATTTTAGGCCTGAGCTTGAGAGAAGGATCAAAGAGCATGCTGAGAGGGAG
CTGCTGGAGGCCACAGCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs7g10420.4
PEP Infomation
Sequence

MAPMKGVLSLQRASLVRCYSERLSVGLRSFSTQGASTASTPQPPPPPPPPEKTHFGGLKD
EDRIFTNLYGMHDPFLKGAMKRGDWHRTKDLVLKGADWIVNEVKKSGLRGRGGAGFPSGL
KWSFMPKVSDGRPSYLVVNADESEPGTCKDREIMRHDPHKLLEGCLIAGVGMRASAAYIY
IRGEYVNERKNLERARQEAYAAGLLGKNACGSGYDFDVHIHYGAGAYICGEETALLESLE
GKQGKPRLKPPFPANAGLYGCPTTVTNVETVAVSPTILRRGPDWFASFGRKNNSGTKLFC
VSGHVNKPCTVEEEMSIPLKELIDRHCGGVRGGWDNLLAVIPGGSSVPLLPKHICDDVLM
DYDALKAVQSGLGTAAVIVMDKSTDVVDAIARLSYFYKHESCGQCTPCREGTGWLWMIME
RLKVGNAKLEEIDMLQEVTKQIEGHTICALGDAAAWPVQGLIRHFRPELERRIKEHAERE
LLEATA*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs7g10420.4
Transcript Infomation

gene=Cs7g10420 CDS=213-1673
Sequence

CACAAGCCTTACCGACTTACATATCCACCGCCCGATTCATTGCGGGTGAGTTGATGTTCG
CGATCAATAAATCTCCACCGTCCATCTAACAACTCCAGTGCTGTCGAGAGTAGGAAACAA
TTGCCTCCTTCAAATCTCCTCTCCATTTCTTCTGTGGTTTCTCGATTTTGAGCTAGAGCT
TAATCGGCGACTCTTCTTCGACGTTTCATGCTATGGCACCCATGAAGGGCGTTTTATCCC
TGCAAAGGGCATCATTGGTTAGATGCTACAGTGAGAGGTTGAGTGTGGGCTTAAGATCAT
TTAGCACTCAAGGTGCATCAACTGCCAGTACTCCACAACCTCCGCCACCTCCCCCACCTC
CAGAGAAAACCCATTTTGGTGGCCTGAAAGATGAAGACAGGATTTTCACCAACTTATATG
GGATGCATGACCCTTTTCTCAAAGGTGCCATGAAACGGGGTGATTGGCACAGAACTAAAG
ACTTGGTACTCAAGGGTGCAGATTGGATTGTCAATGAAGTCAAGAAGTCTGGTCTCCGCG
GACGTGGTGGTGCTGGTTTTCCCTCTGGCCTCAAGTGGTCCTTCATGCCCAAGGTGTCTG
ATGGCCGTCCTTCGTATCTTGTTGTCAATGCTGATGAAAGTGAACCTGGAACCTGTAAAG
ACAGGGAAATTATGCGGCATGATCCACATAAGTTGTTGGAGGGCTGCTTGATTGCTGGCG
TAGGAATGAGGGCTTCTGCTGCTTACATTTACATAAGGGGTGAATATGTAAATGAACGTA
AAAACCTTGAAAGAGCGAGGCAAGAAGCTTATGCTGCTGGATTGTTGGGCAAGAATGCCT
GCGGATCTGGTTATGATTTTGATGTGCATATCCACTATGGTGCTGGTGCTTATATTTGTG
GTGAAGAGACAGCTCTTTTGGAAAGCCTTGAAGGTAAACAGGGGAAACCAAGATTGAAGC
CTCCTTTCCCTGCTAATGCAGGTTTATATGGTTGTCCCACCACTGTCACCAATGTGGAAA
CTGTGGCCGTTTCTCCCACCATTTTAAGGCGTGGACCGGACTGGTTTGCCAGTTTTGGCA
GGAAGAACAATTCTGGTACAAAATTGTTTTGTGTGTCGGGCCATGTGAATAAGCCTTGCA
CAGTTGAAGAGGAGATGAGTATTCCCCTCAAGGAGTTGATAGATAGACACTGTGGTGGTG
TTCGAGGTGGATGGGATAATTTACTTGCAGTAATACCAGGGGGTTCTTCAGTTCCTTTGC
TTCCCAAACATATATGTGATGATGTGCTGATGGATTATGATGCTCTGAAGGCTGTTCAAT
CAGGATTGGGAACTGCTGCTGTGATTGTCATGGACAAATCAACTGACGTTGTCGATGCAA
TTGCTAGGCTCTCATACTTCTATAAGCACGAAAGCTGTGGGCAGTGCACTCCATGCAGGG
AGGGAACAGGATGGCTTTGGATGATCATGGAAAGATTGAAGGTTGGAAATGCAAAGTTGG
AGGAGATTGATATGCTTCAGGAGGTGACCAAGCAGATTGAAGGGCACACAATCTGTGCAC
TGGGTGATGCAGCTGCTTGGCCTGTTCAGGGTCTCATACGACATTTTAGGCCTGAGCTTG
AGAGAAGGATCAAAGAGCATGCTGAGAGGGAGCTGCTGGAGGCCACAGCTTAAATTTTTC
TTCTCAGGTTGCTTCTTGGATCCTTTTTGCTAACATTACTTAAAGTGGACATTTCCCCCA
AGAATAAATTACCGTGAACTTGTGTGATTTGGATAATTAATTATTACAAACATGAAATGT
GTTTGGAAATATTATCTGGTTATGTATGCAATTCCATGATCGAGGCCATTCTTTTCGTTG
CATTTATCCCTCAGATAATGGTTCTGTTTTTTCTTTGGCTGTAAGATGTTTGTCCATAAT
CACAGAATGGTATAAGGTTCTAAATGATGTATGGATAAATTGTCAAAGAATTACCTTATT
TGTTCAAATAATTTGACAGTAATTTCAGGAATGTAATCTGTTTTCTTTTGCCCTCGGATG
TCAGGCATCTTGAAGGGTGCTCCAGTGCTTTAGATGCCTACAAGGTGAATAGACCTCAGC
ATTTGTGAGCAAATTGCGGGCAAATATTATGTTTCGTACTTTCATGTAGTTAAACTTCAT
TTTCTATGTTGGTCTTCTTTTGGAAAGGACAGTATATCAGACATAACATATTGAATAAAT
GTTTCACATATTGTCTCAC