Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs7g06400.1
CDS Infomation

gene=Cs7g06400
Sequence

ATGAAACCCAGATACAGAACCAGCCTGTCCCTTGTTATCTTCATCTTGTTCACTCTCTAT
TTGCCAGATATCACCACCTCTTCATCATCATCAAGAACCAAATGCAAAGCGTGGTTGGTA
CAATCAATACCCACGGACATGCCCCACCTGCCTCGTGTTCCTGGAATTGTTTCTTCTGGG
AATGTGTTGAAGTGGTTGGCTGGTAACTCTACAAAGAGACTTGATATAATAGCTCAGTAT
TGGCAACTAATTGCACGTCCAAATAATTCTCGTTCTGGGGATTATGGTTACTCTGAAGAT
GATATGAAGAGATTTGGTGCACAAGAAGGCTTTGATGTTTATAAGTCCATTGAGAATGCT
GCTGACCGTAATGTCAGAGTCAGGCTACTACAGCACTTAGGGGTATATCCCGACTTCACT
ACTGAAGCATCTAATCTTGCTTCAGGTAGAAAAAATGTGGAAAATGTGACTCTATTACTT
GGTGATTGGTGGGGTTCAGGCATTGTCCATGCCAAAGTTTGGATATCAGATTGCCGTGAT
GTGTATATTGGATCTGCTAATAATGACTGGAAATCTCTAACTCAGGTGAAGGAAGTTGGA
ATTTATCTTGTTGGTTGTCCAACAATAGCAAAAAAGGTTGAGGTTTACTTTGAAAATCTT
TGGACACTTTCGTCTCTTAATTCTTCAACTTATACAAGAACTGTATCAGACCAACAATGG
CAGGCTAATAGAACAGTTCCCTGCTGGTCTCATTTTCTTGATCCTAAGGGTAGGTGCAGG
TCACCTCTCCCTCCAGTTCTTGAGGTTCCTCATGTGGAAGGCTACCCTATACTGTCAGAC
CCTTATATGTTCCGAGAGACAATGGAGACTCCTGGAAGCAATTATTCTACTTTGCAACCT
CATTACAGCTACCTCTCATTTGCTCCCCCAGAGCTATCATTTGGCAAGTATATGGCTGAT
GAACAAGCTTGGGTGGATACAATCAAATCTGTAGGAACCAGAGCTACACTTAGGATTAGT
ACAATGGATTGGCTTGGTCAATCCCAATATTTGAAGCAAACTGTTTATTGGTCAGCACTT
TCCTCTGCAGTTTCAGAGGTTGTCTTCTCCAAGCATGCGAATGTGAAGATACTAGTAGCA
TATTGGGCACATTTTATCAACAACACAGATGAGTATCTCAAGTCTCTTCTATACTCCAAT
GTCCTTTGCAATTCTTCGAAGTACAACAAATGTTCTGGCAAAGTTGAGATCAAATACTAT
AAGGTGCCAGGATACAACTTGACAGGACCTGCCATTCAAAATGGAAGCAATACTGGAAAT
ATTTATCCAGGCTTTACGAGAGTCAATCATGGAAAATATGCAGTGAGTGATTCACGAGCT
CATATCGGAACAAGCAACCTTGTGTGGGATTACTTCTATACAACAGCTGGTGTCAGCTTT
GGAACATACAATCCTGCGATTGTTTCACAGCTTCAAGAGATCTTTGATGCTGACTGGAAC
TCACCATATGCTTTTCCTGTCGAAGAGTTGGGTGACGGCCATGCTCATGCTTCTAGCATT
TAA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs7g06400.1
PEP Infomation
Sequence

MKPRYRTSLSLVIFILFTLYLPDITTSSSSSRTKCKAWLVQSIPTDMPHLPRVPGIVSSG
NVLKWLAGNSTKRLDIIAQYWQLIARPNNSRSGDYGYSEDDMKRFGAQEGFDVYKSIENA
ADRNVRVRLLQHLGVYPDFTTEASNLASGRKNVENVTLLLGDWWGSGIVHAKVWISDCRD
VYIGSANNDWKSLTQVKEVGIYLVGCPTIAKKVEVYFENLWTLSSLNSSTYTRTVSDQQW
QANRTVPCWSHFLDPKGRCRSPLPPVLEVPHVEGYPILSDPYMFRETMETPGSNYSTLQP
HYSYLSFAPPELSFGKYMADEQAWVDTIKSVGTRATLRISTMDWLGQSQYLKQTVYWSAL
SSAVSEVVFSKHANVKILVAYWAHFINNTDEYLKSLLYSNVLCNSSKYNKCSGKVEIKYY
KVPGYNLTGPAIQNGSNTGNIYPGFTRVNHGKYAVSDSRAHIGTSNLVWDYFYTTAGVSF
GTYNPAIVSQLQEIFDADWNSPYAFPVEELGDGHAHASSI*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs7g06400.1
Transcript Infomation

gene=Cs7g06400 CDS=278-1840
Sequence

TATTCGGAAAAGGGACGTAGATGAGGTGGAATCTCTATTTCCTCCCCTCCCCTCTCCTCC
CCAATGCCATCCCTAAGATTACCAAAGCGGCAAAGGCCTAAACAAGTTTAATGAGTTTGC
TCATGTATGTGTTTGTCCAGTTTCAAGTTCCGTTGACTTTCTGTATTTGACCCATTGGTT
TCTCCCCATAACACATACAAAGCAACACAACTAGCTAACAGATAAAACAAAACATTCGGA
GATCATCATTGCAACACAGACGGATTAAGATTTAAAGATGAAACCCAGATACAGAACCAG
CCTGTCCCTTGTTATCTTCATCTTGTTCACTCTCTATTTGCCAGATATCACCACCTCTTC
ATCATCATCAAGAACCAAATGCAAAGCGTGGTTGGTACAATCAATACCCACGGACATGCC
CCACCTGCCTCGTGTTCCTGGAATTGTTTCTTCTGGGAATGTGTTGAAGTGGTTGGCTGG
TAACTCTACAAAGAGACTTGATATAATAGCTCAGTATTGGCAACTAATTGCACGTCCAAA
TAATTCTCGTTCTGGGGATTATGGTTACTCTGAAGATGATATGAAGAGATTTGGTGCACA
AGAAGGCTTTGATGTTTATAAGTCCATTGAGAATGCTGCTGACCGTAATGTCAGAGTCAG
GCTACTACAGCACTTAGGGGTATATCCCGACTTCACTACTGAAGCATCTAATCTTGCTTC
AGGTAGAAAAAATGTGGAAAATGTGACTCTATTACTTGGTGATTGGTGGGGTTCAGGCAT
TGTCCATGCCAAAGTTTGGATATCAGATTGCCGTGATGTGTATATTGGATCTGCTAATAA
TGACTGGAAATCTCTAACTCAGGTGAAGGAAGTTGGAATTTATCTTGTTGGTTGTCCAAC
AATAGCAAAAAAGGTTGAGGTTTACTTTGAAAATCTTTGGACACTTTCGTCTCTTAATTC
TTCAACTTATACAAGAACTGTATCAGACCAACAATGGCAGGCTAATAGAACAGTTCCCTG
CTGGTCTCATTTTCTTGATCCTAAGGGTAGGTGCAGGTCACCTCTCCCTCCAGTTCTTGA
GGTTCCTCATGTGGAAGGCTACCCTATACTGTCAGACCCTTATATGTTCCGAGAGACAAT
GGAGACTCCTGGAAGCAATTATTCTACTTTGCAACCTCATTACAGCTACCTCTCATTTGC
TCCCCCAGAGCTATCATTTGGCAAGTATATGGCTGATGAACAAGCTTGGGTGGATACAAT
CAAATCTGTAGGAACCAGAGCTACACTTAGGATTAGTACAATGGATTGGCTTGGTCAATC
CCAATATTTGAAGCAAACTGTTTATTGGTCAGCACTTTCCTCTGCAGTTTCAGAGGTTGT
CTTCTCCAAGCATGCGAATGTGAAGATACTAGTAGCATATTGGGCACATTTTATCAACAA
CACAGATGAGTATCTCAAGTCTCTTCTATACTCCAATGTCCTTTGCAATTCTTCGAAGTA
CAACAAATGTTCTGGCAAAGTTGAGATCAAATACTATAAGGTGCCAGGATACAACTTGAC
AGGACCTGCCATTCAAAATGGAAGCAATACTGGAAATATTTATCCAGGCTTTACGAGAGT
CAATCATGGAAAATATGCAGTGAGTGATTCACGAGCTCATATCGGAACAAGCAACCTTGT
GTGGGATTACTTCTATACAACAGCTGGTGTCAGCTTTGGAACATACAATCCTGCGATTGT
TTCACAGCTTCAAGAGATCTTTGATGCTGACTGGAACTCACCATATGCTTTTCCTGTCGA
AGAGTTGGGTGACGGCCATGCTCATGCTTCTAGCATTTAAATGCTTGCTATTGTTTCTCA
ATTTAAAGTCAGTTCAACCTGTATCTTGCCCTAGTAACTGTACATGGATGAGTTGATCAT
AGTTTCATTTTCTTTTCTTGTTAACAGCATAGTTGTATTTGCTTTGCAGTAGATGCTTCC
TAGCTTGGTACTAATTTCATTTATTTGAGAATTGACTATAATGAACAAAATAATGGTTGC
ATAAGCCTAATCTCCATGCTTCTA