Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs7g05550.1
CDS Infomation

gene=Cs7g05550
Sequence

ATGGCGTCTAATTCATCGAAAAGTCCGATGCTCCCCGTGTCGGAACCTGCAAGAGGCGAT
GAAGGAGAGAAAGAACGACTCCTCAAAGGCGACGAGAAACTCTTCAGAGGATCCGCCATG
ACCAGGCGTGGCGCCAATGCCGCTATCTCTTACATGGCCTGTGCTGTGCTTCTCGTAATG
TTCAATAAGGCAGCTCTTTCTTCTTATAATTTCCCGTGTGCAAATGTCATAACACTTCTT
CAGATGATAAGTTCTTGTTCTTTTCTCTATTTCTTGAGGCGCTGGAAGATTATTAATTTC
ACCATGGGTGATTCTTTAATGACATCTGATAGCAGCTCTACCTTTGTACCCTTGAAGACA
TTGATGCATACCCTTCCTCTGGCAGTGGCCTATTTGCTTTACATGGTGGTCAGTGTGGAG
TCTGTCCGCGGAGTAAATGTTCCCATGTACACTACCCTTAGGCGTACCACAGTGGCATTT
ACTATGATTATGGAGTATTTTCTGGCTGGGCAAAAGTATACACCTCCTGTTGTAGGAAGT
GTTGGGTTGATAATTCTTGGTGCATTTGTTGCTGGAGCTCGGGATTTGTCATTTGACTTC
TTTGGATATGCCGTTGTTTTCTTAGCCAACATCACCACAGCAATATATCTTGCAACCATA
GCTCGCATTGGGAAGTCTAGTGGCCTTAATAGCTTTGGCCTTATGTGGTGCAATGGTGTT
ATATGTGGACCGCTTTTGCTGCTTTGGACATTTCTTCGAGGTGACTTGGAGACAACCATC
AACTTTCCATACCTGCTTTCCCCTGGCTTCTTGGTTGTGCTGTGTTTTTCCTGTATACTG
GCCTTCTTCTTGAATTACAGTATATTCCTGAATACAACTCTTAATTCGGCAGTCACACAG
ACAATTTGCGGTAATCTGAAGGATCTTTTTACCATTGGACTCGGCTGGATACTATTTGGT
GGGCTTCCGTTTGATTTTCTGAATGTTTTTGGGCAATTGCTTGGTTTTCTTGGCTCTGGT
TTGTATGCCTACTATAAACTTGTAGGGAAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs7g05550.1
PEP Infomation
Sequence

MASNSSKSPMLPVSEPARGDEGEKERLLKGDEKLFRGSAMTRRGANAAISYMACAVLLVM
FNKAALSSYNFPCANVITLLQMISSCSFLYFLRRWKIINFTMGDSLMTSDSSSTFVPLKT
LMHTLPLAVAYLLYMVVSVESVRGVNVPMYTTLRRTTVAFTMIMEYFLAGQKYTPPVVGS
VGLIILGAFVAGARDLSFDFFGYAVVFLANITTAIYLATIARIGKSSGLNSFGLMWCNGV
ICGPLLLLWTFLRGDLETTINFPYLLSPGFLVVLCFSCILAFFLNYSIFLNTTLNSAVTQ
TICGNLKDLFTIGLGWILFGGLPFDFLNVFGQLLGFLGSGLYAYYKLVGK*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs7g05550.1
Transcript Infomation

gene=Cs7g05550 CDS=117-1169
Sequence

ATTCTGAATAATGAAATGTTGAATCCATCGCCCGCCTCACCTCCAGTCCAGGTCAGTGTA
TCGCTAATTAATTAAATAAATAAATTTACAATTCTCCGAAGCAGAGGCGGAGGCAGATGG
CGTCTAATTCATCGAAAAGTCCGATGCTCCCCGTGTCGGAACCTGCAAGAGGCGATGAAG
GAGAGAAAGAACGACTCCTCAAAGGCGACGAGAAACTCTTCAGAGGATCCGCCATGACCA
GGCGTGGCGCCAATGCCGCTATCTCTTACATGGCCTGTGCTGTGCTTCTCGTAATGTTCA
ATAAGGCAGCTCTTTCTTCTTATAATTTCCCGTGTGCAAATGTCATAACACTTCTTCAGA
TGATAAGTTCTTGTTCTTTTCTCTATTTCTTGAGGCGCTGGAAGATTATTAATTTCACCA
TGGGTGATTCTTTAATGACATCTGATAGCAGCTCTACCTTTGTACCCTTGAAGACATTGA
TGCATACCCTTCCTCTGGCAGTGGCCTATTTGCTTTACATGGTGGTCAGTGTGGAGTCTG
TCCGCGGAGTAAATGTTCCCATGTACACTACCCTTAGGCGTACCACAGTGGCATTTACTA
TGATTATGGAGTATTTTCTGGCTGGGCAAAAGTATACACCTCCTGTTGTAGGAAGTGTTG
GGTTGATAATTCTTGGTGCATTTGTTGCTGGAGCTCGGGATTTGTCATTTGACTTCTTTG
GATATGCCGTTGTTTTCTTAGCCAACATCACCACAGCAATATATCTTGCAACCATAGCTC
GCATTGGGAAGTCTAGTGGCCTTAATAGCTTTGGCCTTATGTGGTGCAATGGTGTTATAT
GTGGACCGCTTTTGCTGCTTTGGACATTTCTTCGAGGTGACTTGGAGACAACCATCAACT
TTCCATACCTGCTTTCCCCTGGCTTCTTGGTTGTGCTGTGTTTTTCCTGTATACTGGCCT
TCTTCTTGAATTACAGTATATTCCTGAATACAACTCTTAATTCGGCAGTCACACAGACAA
TTTGCGGTAATCTGAAGGATCTTTTTACCATTGGACTCGGCTGGATACTATTTGGTGGGC
TTCCGTTTGATTTTCTGAATGTTTTTGGGCAATTGCTTGGTTTTCTTGGCTCTGGTTTGT
ATGCCTACTATAAACTTGTAGGGAAGTGACTGCACAAGCTTGAGACAGCTGGTACTTATT
GAAGGTTATGAGTAGCTTCCATTCTTTCGGCTGCCCCCTAGCCTGGTTAGTGTTGGATCA
TTATAGAAATACGATTTCTGTATAGGATATTCTTGCAAAGTGAGAAGGGAATTCCAAATT
TCTTGAGAGAATCAAAAACCGGTTGGCCTTTCGGCAAATTTGCAGCAACCACCCTGATAT
ATCGATGTATTTGTAAATGATGTTGCTTTATCATCCCTCTTAATCTACTTTCTTTAACAA
CAAATGTGCAGAAATTTTTGAAGACAGACTACATCAGTTGAAGCGACTTCTAATGATCAT
ATATTTGTTCAGTTTATCATTTTTTGTTTTTGGAGATGGTTTCAGATTCTTTCCCCATTT
TTAGATAATAATACTTACTGATAATAAAAGCCGTTGTGCTTCAGTTTCAAAGAAGCCTTA
GGGATGAGGTTTATTTTTTTCTCTCTCTCACTGAATACGACCATGTATTACAATAGAAAT
TTGAATTATTGAAAGAAAATCGCTC