Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs6g16900.2
CDS Infomation

gene=Cs6g16900
Sequence

ATGAGGGAGATCCTTCACGTTCAGGGTGGACAATGTGGTAACCAGATTGGTTCCAAGTTC
TGGGAGGTTGTCTGTGATGAACATGGCATCGACCCAACCGGAAGATACATTGGCACCTCA
GATCTGCAGTTGGAGCGTGTCAATGTCTACTACAATGAGGCCTCCTGTGGGCGGTTTGTT
CCTCGTGCAGTTCTCATGGATTTGGAGCCTGGCACCATGGACAGTGTTAGAACTGGTCCA
TACGGCCAGATTTTCAGGCCTGATAACTTTGTGTTTGGACAGTCTGGTGCTGGAAACAAT
TGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCTGAGCTTATTGATGCTGTTCTTGATGTTGTG
AGAAAAGAGGCTGAGAACTGTGACTGTCTTCAAGGTTTCCAAGTCTGCCACTCTTTGGGT
GGAGGAACTGGTTCTGGAATGGGTACCTTGTTGATCTCAAAAATTAGGGAGGAGTATCCT
GACAGGATGATGCTCACTTTCTCAGTGTTCCCTTCTCCAAAGGTCTCCGATACAGTTGTT
GAGCCCTACAATGCAACCCTCTCTGTTCACCAGCTTGTTGAGAATGCAGATGAGTGCATG
GTCCTTGATAATGAGGCTTTGTATGACATCTGCTTCAGAACTCTTAAATTGACCACACCA
AGCTTTGGTGACTTGAACCACTTGATTTCTGCAACCATGAGTGGCGTCACTTGCTGCCTC
AGGTTTCCTGGTCAACTGAACTCTGACCTTCGAAAGCTTGCTGTTAACTTGATTCCTTTC
CCTCGCCTGCACTTCTTCATGGTTGGGTTTGCTCCCCTTACCTCCCGTGGTTCTCAGCAG
TACCGTGCCTTGACAGTCCCAGAACTTACCCAACAAATGTGGGATGCCAAGAACATGATG
TGTGCTGCCGACCCAAGGCATGGTCGTTACCTCACTGCTTCTGCCATGTTCAGGGGTAAA
ATGAGCACCAAGGAAGTTGACGAGCAGATGATCAATGTTCAAAACAAAAACTCTTCCTAC
TTTGTGGAGTGGATTCCAAACAATGTGAAGTCCAGTGTTTGTGACATTCCTCCCAGAGGT
CTCTCCATGGCATCCACCTTCATCGGGAACTCAACATCCATCCAAGAAATGTTCCGAAGA
GTGAGTGAGCAATTCACAGCTATGTTTAGGAGAAAGGCTTTCCTTCACTGGTACACTGGT
GAAGGGATGGATGAAATGGAGTTCACTGAAGCTGAGAGCAATATGAATGACCTCGTGTCT
GAGTACCAGCAGTACCAGGATGCCACCGCCGATGAGGAAGGCGAGTATGAAGATGAGGAA
GAGGGAGAATTGGAGCATCATATTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs6g16900.2
PEP Infomation
Sequence

MREILHVQGGQCGNQIGSKFWEVVCDEHGIDPTGRYIGTSDLQLERVNVYYNEASCGRFV
PRAVLMDLEPGTMDSVRTGPYGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELIDAVLDVV
RKEAENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVV
EPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCL
RFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMM
CAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRG
LSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
EYQQYQDATADEEGEYEDEEEGELEHHI*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs6g16900.2
Transcript Infomation

gene=Cs6g16900 CDS=125-1471
Sequence

CTCCACTCTCTGCATATATAGACAAGTTTAGGGTTCAGTCTCTTGCTCACAACTCTCATT
TGAATTTTATCTCACTCTCATTTTTTCTCTCTCTAGCGAAAATCTTCAGTAAGTCTCAGG
AAAAATGAGGGAGATCCTTCACGTTCAGGGTGGACAATGTGGTAACCAGATTGGTTCCAA
GTTCTGGGAGGTTGTCTGTGATGAACATGGCATCGACCCAACCGGAAGATACATTGGCAC
CTCAGATCTGCAGTTGGAGCGTGTCAATGTCTACTACAATGAGGCCTCCTGTGGGCGGTT
TGTTCCTCGTGCAGTTCTCATGGATTTGGAGCCTGGCACCATGGACAGTGTTAGAACTGG
TCCATACGGCCAGATTTTCAGGCCTGATAACTTTGTGTTTGGACAGTCTGGTGCTGGAAA
CAATTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCTGAGCTTATTGATGCTGTTCTTGATGT
TGTGAGAAAAGAGGCTGAGAACTGTGACTGTCTTCAAGGTTTCCAAGTCTGCCACTCTTT
GGGTGGAGGAACTGGTTCTGGAATGGGTACCTTGTTGATCTCAAAAATTAGGGAGGAGTA
TCCTGACAGGATGATGCTCACTTTCTCAGTGTTCCCTTCTCCAAAGGTCTCCGATACAGT
TGTTGAGCCCTACAATGCAACCCTCTCTGTTCACCAGCTTGTTGAGAATGCAGATGAGTG
CATGGTCCTTGATAATGAGGCTTTGTATGACATCTGCTTCAGAACTCTTAAATTGACCAC
ACCAAGCTTTGGTGACTTGAACCACTTGATTTCTGCAACCATGAGTGGCGTCACTTGCTG
CCTCAGGTTTCCTGGTCAACTGAACTCTGACCTTCGAAAGCTTGCTGTTAACTTGATTCC
TTTCCCTCGCCTGCACTTCTTCATGGTTGGGTTTGCTCCCCTTACCTCCCGTGGTTCTCA
GCAGTACCGTGCCTTGACAGTCCCAGAACTTACCCAACAAATGTGGGATGCCAAGAACAT
GATGTGTGCTGCCGACCCAAGGCATGGTCGTTACCTCACTGCTTCTGCCATGTTCAGGGG
TAAAATGAGCACCAAGGAAGTTGACGAGCAGATGATCAATGTTCAAAACAAAAACTCTTC
CTACTTTGTGGAGTGGATTCCAAACAATGTGAAGTCCAGTGTTTGTGACATTCCTCCCAG
AGGTCTCTCCATGGCATCCACCTTCATCGGGAACTCAACATCCATCCAAGAAATGTTCCG
AAGAGTGAGTGAGCAATTCACAGCTATGTTTAGGAGAAAGGCTTTCCTTCACTGGTACAC
TGGTGAAGGGATGGATGAAATGGAGTTCACTGAAGCTGAGAGCAATATGAATGACCTCGT
GTCTGAGTACCAGCAGTACCAGGATGCCACCGCCGATGAGGAAGGCGAGTATGAAGATGA
GGAAGAGGGAGAATTGGAGCATCATATTTGAAGAAGTTGTGTATGATGCATATTTGTCTG
TGTAGCTGGTTTTGTCAACCTTGCTTGGGATTGCAAAAAATGATCTATGATGTGTTATAG
TTTTTCTTTCTCGAGTTTTTTACATCAAGTAGCAGTAAAGTGAGTGATGGATGATGGGAT
CGATGAGGATCGACTATTGAGGATGGAGAAATTAAAGGATGGATGCATGTTTTGAAAGTA
GTAGTGTGTGCTACCTTTACCTTGCTATCTATTCTGGATTTGATCTATTTTTGTATTCTA
TTATCCTTAGCCATTGTCTTCTTATGTTCTGTGGTCGATGATGTTATTATGTTACTGTCT
ATTATGCCATAATGTGATATGCTATTTCTTTTCCTTGGTATAATTCTGCTATTTGATTTT
TTTTTTTTTTCTTTTGCCTTTCGGAACAAATTTAAGCATCTCATAGGCCCTTGGAAGCCC